MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 88957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_008148	GAG	2	6	435877	435882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803255
12502	NC_008148	TGG	2	6	435905	435910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803255
12503	NC_008148	CAT	2	6	435918	435923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803255
12504	NC_008148	CGA	2	6	435930	435935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803255
12505	NC_008148	GAG	2	6	435988	435993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803255
12506	NC_008148	GCC	2	6	436003	436008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803255
12507	NC_008148	GAG	2	6	436024	436029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803255
12508	NC_008148	GGA	2	6	436038	436043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803255
12509	NC_008148	CGGGG	2	10	436059	436068	0 %	0 %	80 %	20 %	108803256
12510	NC_008148	ACT	2	6	436123	436128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803256
12511	NC_008148	CGGCGC	2	12	436208	436219	0 %	0 %	50 %	50 %	108803256
12512	NC_008148	CG	3	6	436247	436252	0 %	0 %	50 %	50 %	108803256
12513	NC_008148	TGA	2	6	436255	436260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803256
12514	NC_008148	CTG	2	6	436266	436271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803256
12515	NC_008148	CACC	2	8	436391	436398	25 %	0 %	0 %	75 %	108803256
12516	NC_008148	TCC	2	6	436435	436440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803256
12517	NC_008148	CTT	2	6	436472	436477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803256
12518	NC_008148	CTG	2	6	436515	436520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803256
12519	NC_008148	TGG	2	6	436546	436551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803256
12520	NC_008148	CAT	2	6	436559	436564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803256
12521	NC_008148	GCC	2	6	436566	436571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803256
12522	NC_008148	TGC	2	6	436573	436578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803256
12523	NC_008148	CAG	2	6	436602	436607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803256
12524	NC_008148	TCC	2	6	436623	436628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803256
12525	NC_008148	TGC	2	6	436633	436638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803256
12526	NC_008148	CTA	2	6	436652	436657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803256
12527	NC_008148	TGC	2	6	436669	436674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803256
12528	NC_008148	CGC	2	6	436736	436741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803256
12529	NC_008148	GGGC	2	8	436753	436760	0 %	0 %	75 %	25 %	108803256
12530	NC_008148	CTC	2	6	436827	436832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803256
12531	NC_008148	AGCGG	2	10	436879	436888	20 %	0 %	60 %	20 %	108803256
12532	NC_008148	CGC	2	6	436930	436935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803257
12533	NC_008148	CGT	2	6	436998	437003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803257
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12535	NC_008148	CAG	2	6	437065	437070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803257
12536	NC_008148	CTC	2	6	437089	437094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803257
12537	NC_008148	CG	3	6	437133	437138	0 %	0 %	50 %	50 %	108803257
12538	NC_008148	GTG	2	6	437170	437175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803257
12539	NC_008148	TCC	2	6	437177	437182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803257
12540	NC_008148	GCA	3	9	437262	437270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803257
12541	NC_008148	TCC	2	6	437282	437287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803257
12542	NC_008148	CTC	2	6	437302	437307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803257
12543	NC_008148	GCTC	2	8	437316	437323	0 %	25 %	25 %	50 %	108803257
12544	NC_008148	CGT	2	6	437331	437336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803257
12545	NC_008148	TCG	2	6	437378	437383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803257
12546	NC_008148	GCG	2	6	437451	437456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803257
12547	NC_008148	GCA	2	6	437457	437462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803257
12548	NC_008148	GAA	2	6	437470	437475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108803257
12549	NC_008148	CTC	2	6	437488	437493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803257
12550	NC_008148	GAG	2	6	437522	437527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803257
12551	NC_008148	AGG	2	6	437558	437563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803257
12552	NC_008148	GCG	2	6	437564	437569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803257
12553	NC_008148	GGT	2	6	437682	437687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803257
12554	NC_008148	GGC	2	6	437724	437729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803257
12555	NC_008148	CTC	2	6	437731	437736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803257
12556	NC_008148	GAA	2	6	437890	437895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108803257
12557	NC_008148	CTG	2	6	437908	437913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803257
12558	NC_008148	GGTCC	2	10	437925	437934	0 %	20 %	40 %	40 %	108803257
12559	NC_008148	GAC	2	6	437986	437991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803257
12560	NC_008148	TTC	2	6	437996	438001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803257
12561	NC_008148	GAG	2	6	438022	438027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803257
12562	NC_008148	TCG	2	6	438044	438049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803257
12563	NC_008148	CCT	2	6	438075	438080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803257
12564	NC_008148	CTC	2	6	438088	438093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803257
12565	NC_008148	GGA	2	6	438201	438206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803257
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12567	NC_008148	TTG	2	6	438239	438244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108803257
12568	NC_008148	CCT	2	6	438297	438302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803257
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12570	NC_008148	GAG	2	6	438376	438381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803257
12571	NC_008148	GCC	2	6	438386	438391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803257
12572	NC_008148	CGC	2	6	438409	438414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803257
12573	NC_008148	CAG	2	6	438427	438432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803257
12574	NC_008148	GCG	2	6	438458	438463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803257
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12581	NC_008148	ATC	2	6	438644	438649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803257
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12583	NC_008148	GC	3	6	438797	438802	0 %	0 %	50 %	50 %	108803258
12584	NC_008148	GCCGAG	2	12	438841	438852	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	108803258
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12587	NC_008148	CAC	3	9	439039	439047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803258
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12589	NC_008148	GC	3	6	439165	439170	0 %	0 %	50 %	50 %	108803258
12590	NC_008148	AGG	2	6	439193	439198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803258
12591	NC_008148	AGG	2	6	439241	439246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803258
12592	NC_008148	GGC	2	6	439251	439256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803258
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12602	NC_008148	AGT	2	6	439728	439733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803258
12603	NC_008148	CCG	2	6	439744	439749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803258
12604	NC_008148	GGC	2	6	439788	439793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803258
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12611	NC_008148	CAG	2	6	440011	440016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803258
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