MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 88957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_008148	CAC	2	6	419322	419327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803241
12002	NC_008148	G	6	6	419360	419365	0 %	0 %	100 %	0 %	108803241
12003	NC_008148	CGC	2	6	419370	419375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803241
12004	NC_008148	GCT	2	6	419376	419381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803241
12005	NC_008148	GGGT	2	8	419386	419393	0 %	25 %	75 %	0 %	108803241
12006	NC_008148	TCT	2	6	419408	419413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803241
12007	NC_008148	CGT	2	6	419436	419441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803241
12008	NC_008148	G	6	6	419443	419448	0 %	0 %	100 %	0 %	108803241
12009	NC_008148	TGG	2	6	419452	419457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803241
12010	NC_008148	GCC	2	6	419464	419469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803241
12011	NC_008148	G	7	7	419472	419478	0 %	0 %	100 %	0 %	108803241
12012	NC_008148	CGC	2	6	419544	419549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803241
12013	NC_008148	G	6	6	419572	419577	0 %	0 %	100 %	0 %	108803241
12014	NC_008148	GGGGA	2	10	419579	419588	20 %	0 %	80 %	0 %	108803241
12015	NC_008148	GCC	2	6	419591	419596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803241
12016	NC_008148	GGC	3	9	419598	419606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803241
12017	NC_008148	ACC	2	6	419612	419617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803241
12018	NC_008148	GGC	2	6	419638	419643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803241
12019	NC_008148	GC	3	6	419642	419647	0 %	0 %	50 %	50 %	108803241
12020	NC_008148	GCT	2	6	419740	419745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803242
12021	NC_008148	CCA	2	6	419748	419753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803242
12022	NC_008148	CG	3	6	419775	419780	0 %	0 %	50 %	50 %	108803242
12023	NC_008148	CGT	2	6	419784	419789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803242
12024	NC_008148	CGG	2	6	419831	419836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803242
12025	NC_008148	GC	3	6	419837	419842	0 %	0 %	50 %	50 %	108803242
12026	NC_008148	CGC	3	9	419845	419853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803242
12027	NC_008148	CCGG	2	8	419903	419910	0 %	0 %	50 %	50 %	108803242
12028	NC_008148	CGC	2	6	419920	419925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803242
12029	NC_008148	CCT	2	6	419931	419936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803242
12030	NC_008148	AGG	2	6	419996	420001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803242
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12032	NC_008148	GTT	2	6	420064	420069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108803242
12033	NC_008148	CTC	2	6	420070	420075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803242
12034	NC_008148	GAG	2	6	420092	420097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803242
12035	NC_008148	CGCCC	2	10	420112	420121	0 %	0 %	20 %	80 %	108803242
12036	NC_008148	GAG	2	6	420133	420138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803242
12037	NC_008148	CGT	3	9	420144	420152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803242
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12039	NC_008148	CGA	2	6	420168	420173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803242
12040	NC_008148	GGT	2	6	420175	420180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803242
12041	NC_008148	CGG	2	6	420267	420272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803242
12042	NC_008148	AGGG	2	8	420281	420288	25 %	0 %	75 %	0 %	108803242
12043	NC_008148	GTCCTC	2	12	420313	420324	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	108803242
12044	NC_008148	AGCC	2	8	420338	420345	25 %	0 %	25 %	50 %	108803242
12045	NC_008148	CGA	2	6	420357	420362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803242
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12047	NC_008148	GC	3	6	420479	420484	0 %	0 %	50 %	50 %	108803242
12048	NC_008148	CCCG	2	8	420545	420552	0 %	0 %	25 %	75 %	108803242
12049	NC_008148	CTC	3	9	420619	420627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803242
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12051	NC_008148	TCC	2	6	420675	420680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803242
12052	NC_008148	CGGAG	2	10	420705	420714	20 %	0 %	60 %	20 %	108803242
12053	NC_008148	GGA	2	6	420730	420735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803242
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12056	NC_008148	CTC	2	6	420854	420859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803243
12057	NC_008148	GGC	2	6	420866	420871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803243
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12063	NC_008148	GAG	2	6	421095	421100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803243
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12065	NC_008148	CGA	2	6	421195	421200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803243
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12117	NC_008148	GC	3	6	422835	422840	0 %	0 %	50 %	50 %	108803244
12118	NC_008148	GAG	2	6	422870	422875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803244
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12120	NC_008148	GCCG	2	8	422950	422957	0 %	0 %	50 %	50 %	108803244
12121	NC_008148	CGG	2	6	422962	422967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803244
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12126	NC_008148	CTGC	2	8	423146	423153	0 %	25 %	25 %	50 %	108803245
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12232	NC_008148	CGAG	2	8	426152	426159	25 %	0 %	50 %	25 %	108803247
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12241	NC_008148	GCGG	2	8	426330	426337	0 %	0 %	75 %	25 %	108803247
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12244	NC_008148	GAG	2	6	426372	426377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803247
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12356	NC_008148	GCCC	2	8	430114	430121	0 %	0 %	25 %	75 %	108803250
12357	NC_008148	GAG	2	6	430183	430188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803250
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12360	NC_008148	CGG	2	6	430338	430343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803251
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12479	NC_008148	GCA	2	6	434623	434628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803253
12480	NC_008148	ACC	2	6	435058	435063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803254
12481	NC_008148	GGA	2	6	435079	435084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803254
12482	NC_008148	GGC	2	6	435143	435148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803254
12483	NC_008148	GAG	2	6	435165	435170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803254
12484	NC_008148	AGG	2	6	435219	435224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803254
12485	NC_008148	TGG	2	6	435263	435268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803255
12486	NC_008148	AGG	2	6	435304	435309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803255
12487	NC_008148	G	6	6	435314	435319	0 %	0 %	100 %	0 %	108803255
12488	NC_008148	GGT	2	6	435321	435326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803255
12489	NC_008148	CGG	2	6	435358	435363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803255
12490	NC_008148	GGT	2	6	435369	435374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803255
12491	NC_008148	CTT	2	6	435537	435542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803255
12492	NC_008148	AAG	2	6	435544	435549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108803255
12493	NC_008148	GCC	2	6	435664	435669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803255
12494	NC_008148	GCA	2	6	435699	435704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803255
12495	NC_008148	CTC	2	6	435727	435732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803255
12496	NC_008148	CATGCT	2	12	435741	435752	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	108803255
12497	NC_008148	ACC	2	6	435766	435771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803255
12498	NC_008148	CCG	2	6	435813	435818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803255
12499	NC_008148	CTC	2	6	435837	435842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803255
12500	NC_008148	CTG	2	6	435847	435852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803255

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