MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 88957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_008148	CCGG	2	8	384013	384020	0 %	0 %	50 %	50 %	108803208
11002	NC_008148	GCG	2	6	384050	384055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803208
11003	NC_008148	TCG	2	6	384101	384106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803208
11004	NC_008148	GTAC	2	8	384161	384168	25 %	25 %	25 %	25 %	108803208
11005	NC_008148	GGC	2	6	384184	384189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803208
11006	NC_008148	GGC	2	6	384211	384216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803208
11007	NC_008148	GAG	2	6	384274	384279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803208
11008	NC_008148	AGG	2	6	384287	384292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803208
11009	NC_008148	GGT	2	6	384309	384314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803208
11010	NC_008148	TCC	2	6	384350	384355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803208
11011	NC_008148	CCG	2	6	384384	384389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803208
11012	NC_008148	CCGG	2	8	384468	384475	0 %	0 %	50 %	50 %	108803209
11013	NC_008148	GAG	2	6	384518	384523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803209
11014	NC_008148	AGC	2	6	384585	384590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803209
11015	NC_008148	TCC	2	6	384615	384620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803209
11016	NC_008148	TCGGCG	2	12	384639	384650	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	108803209
11017	NC_008148	CGA	2	6	384718	384723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803209
11018	NC_008148	CCG	2	6	384789	384794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803209
11019	NC_008148	CCT	2	6	384823	384828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803209
11020	NC_008148	CTC	2	6	384833	384838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803209
11021	NC_008148	AGC	2	6	384841	384846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803209
11022	NC_008148	CGC	2	6	384877	384882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803209
11023	NC_008148	GCA	2	6	384883	384888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803209
11024	NC_008148	G	7	7	384929	384935	0 %	0 %	100 %	0 %	108803209
11025	NC_008148	GGT	2	6	384982	384987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803209
11026	NC_008148	CG	3	6	385005	385010	0 %	0 %	50 %	50 %	108803209
11027	NC_008148	GAGG	2	8	385013	385020	25 %	0 %	75 %	0 %	108803209
11028	NC_008148	CCT	2	6	385057	385062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803209
11029	NC_008148	AGG	2	6	385077	385082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803209
11030	NC_008148	CGGCGA	2	12	385123	385134	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	108803209
11031	NC_008148	CG	3	6	385155	385160	0 %	0 %	50 %	50 %	108803209
11032	NC_008148	GCT	2	6	385234	385239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803209
11033	NC_008148	TGGA	2	8	385245	385252	25 %	25 %	50 %	0 %	108803209
11034	NC_008148	CCT	2	6	385300	385305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803209
11035	NC_008148	CT	3	6	385356	385361	0 %	50 %	0 %	50 %	108803209
11036	NC_008148	GTA	2	6	385400	385405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803209
11037	NC_008148	AGG	2	6	385411	385416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803209
11038	NC_008148	GGT	2	6	385480	385485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803209
11039	NC_008148	CGG	2	6	385510	385515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803209
11040	NC_008148	TCT	2	6	385516	385521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803209
11041	NC_008148	TGA	2	6	385594	385599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803209
11042	NC_008148	CGAG	2	8	385618	385625	25 %	0 %	50 %	25 %	108803209
11043	NC_008148	CTC	2	6	385638	385643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803209
11044	NC_008148	GCA	2	6	385702	385707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803209
11045	NC_008148	CCT	2	6	385732	385737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803209
11046	NC_008148	GCG	2	6	385770	385775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803209
11047	NC_008148	CGG	2	6	385831	385836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803209
11048	NC_008148	ACG	2	6	385845	385850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803209
11049	NC_008148	CTT	2	6	385923	385928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803210
11050	NC_008148	AGC	2	6	385944	385949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803210
11051	NC_008148	CGAG	2	8	386119	386126	25 %	0 %	50 %	25 %	108803210
11052	NC_008148	CAG	2	6	386141	386146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803210
11053	NC_008148	GC	4	8	386164	386171	0 %	0 %	50 %	50 %	108803210
11054	NC_008148	CTG	3	9	386186	386194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803210
11055	NC_008148	GCC	2	6	386195	386200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803210
11056	NC_008148	GGC	2	6	386210	386215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803210
11057	NC_008148	CCTC	2	8	386260	386267	0 %	25 %	0 %	75 %	108803210
11058	NC_008148	CCT	2	6	386272	386277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803210
11059	NC_008148	CGG	2	6	386287	386292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803210
11060	NC_008148	GCC	2	6	386303	386308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803210
11061	NC_008148	GCC	2	6	386336	386341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803210
11062	NC_008148	TGC	2	6	386434	386439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803210
11063	NC_008148	GCCC	2	8	386489	386496	0 %	0 %	25 %	75 %	108803210
11064	NC_008148	GAT	2	6	386507	386512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803210
11065	NC_008148	GCCG	2	8	386576	386583	0 %	0 %	50 %	50 %	108803210
11066	NC_008148	CCT	2	6	386657	386662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803211
11067	NC_008148	GTG	2	6	386691	386696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803211
11068	NC_008148	CGG	2	6	386729	386734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803211
11069	NC_008148	GAG	2	6	386751	386756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803211
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11071	NC_008148	ACC	2	6	386797	386802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803211
11072	NC_008148	CGG	2	6	386813	386818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803211
11073	NC_008148	CAG	2	6	386844	386849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803211
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11076	NC_008148	CGG	2	6	386980	386985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803211
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11078	NC_008148	GGCG	2	8	387092	387099	0 %	0 %	75 %	25 %	108803211
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11084	NC_008148	ACG	2	6	387378	387383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803212
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11090	NC_008148	TGGA	2	8	387567	387574	25 %	25 %	50 %	0 %	108803212
11091	NC_008148	AGA	2	6	387610	387615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108803212
11092	NC_008148	CGG	2	6	387643	387648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803212
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11106	NC_008148	CGG	2	6	388096	388101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803212
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11114	NC_008148	GCGG	2	8	388347	388354	0 %	0 %	75 %	25 %	108803213
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11119	NC_008148	ACG	2	6	388502	388507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803213
11120	NC_008148	GGT	2	6	388534	388539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803213
11121	NC_008148	CGC	3	9	388576	388584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803213
11122	NC_008148	CACG	2	8	388585	388592	25 %	0 %	25 %	50 %	108803213
11123	NC_008148	TCC	2	6	388623	388628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803213
11124	NC_008148	CGC	2	6	388648	388653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803213
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11128	NC_008148	GCG	2	6	388863	388868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803213
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11148	NC_008148	GTA	2	6	389857	389862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803214
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11231	NC_008148	CTG	2	6	393513	393518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803217
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11240	NC_008148	GCC	2	6	393771	393776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803218
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11475	NC_008148	G	6	6	401679	401684	0 %	0 %	100 %	0 %	108803225
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11477	NC_008148	TCT	2	6	401707	401712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803225
11478	NC_008148	CAT	2	6	401720	401725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803225
11479	NC_008148	CTG	2	6	401730	401735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803225
11480	NC_008148	ATC	2	6	401790	401795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803225
11481	NC_008148	GCC	2	6	401857	401862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803225
11482	NC_008148	ATC	2	6	401868	401873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803225
11483	NC_008148	GGC	2	6	401874	401879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803225
11484	NC_008148	GC	3	6	401878	401883	0 %	0 %	50 %	50 %	108803225
11485	NC_008148	CGG	2	6	401890	401895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803225
11486	NC_008148	CTT	2	6	401909	401914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803225
11487	NC_008148	GCT	2	6	401918	401923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803225
11488	NC_008148	GCG	2	6	401929	401934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803225
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11491	NC_008148	CTG	2	6	402009	402014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803225
11492	NC_008148	CGG	3	9	402083	402091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803225
11493	NC_008148	CCTGG	2	10	402119	402128	0 %	20 %	40 %	40 %	108803225
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11497	NC_008148	ACCT	2	8	402195	402202	25 %	25 %	0 %	50 %	108803225
11498	NC_008148	GCGG	2	8	402218	402225	0 %	0 %	75 %	25 %	108803225
11499	NC_008148	GGA	2	6	402233	402238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803225
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