MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 88957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_008148	GCC	2	6	279076	279081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803122
8002	NC_008148	GC	3	6	279109	279114	0 %	0 %	50 %	50 %	108803122
8003	NC_008148	CTG	2	6	279134	279139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803122
8004	NC_008148	TCG	2	6	279180	279185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803122
8005	NC_008148	TCC	3	9	279219	279227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803122
8006	NC_008148	AGC	2	6	279258	279263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803122
8007	NC_008148	GGC	2	6	279335	279340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803122
8008	NC_008148	TGA	2	6	279364	279369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803122
8009	NC_008148	CCA	2	6	279411	279416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803122
8010	NC_008148	GTC	2	6	279461	279466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803122
8011	NC_008148	GTA	2	6	279491	279496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803122
8012	NC_008148	CTG	2	6	279500	279505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803122
8013	NC_008148	CTC	2	6	279539	279544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803122
8014	NC_008148	GGC	2	6	279550	279555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803122
8015	NC_008148	TCC	3	9	279559	279567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803122
8016	NC_008148	CTC	2	6	279581	279586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803122
8017	NC_008148	AGG	2	6	279595	279600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803122
8018	NC_008148	AGA	2	6	279652	279657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108803122
8019	NC_008148	CTC	2	6	279710	279715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803122
8020	NC_008148	TCC	2	6	279726	279731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803122
8021	NC_008148	CTG	2	6	279924	279929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803122
8022	NC_008148	CTT	2	6	279953	279958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803122
8023	NC_008148	GTA	2	6	279995	280000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803122
8024	NC_008148	GGT	2	6	280025	280030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803122
8025	NC_008148	CTC	2	6	280067	280072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803122
8026	NC_008148	GC	3	6	280073	280078	0 %	0 %	50 %	50 %	108803122
8027	NC_008148	CCA	2	6	280138	280143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803122
8028	NC_008148	TCCAGC	2	12	280155	280166	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	108803122
8029	NC_008148	CGC	2	6	280177	280182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803122
8030	NC_008148	CCTG	2	8	280195	280202	0 %	25 %	25 %	50 %	108803122
8031	NC_008148	CCT	2	6	280267	280272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803122
8032	NC_008148	GCG	2	6	280337	280342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803122
8033	NC_008148	CGC	2	6	280351	280356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803122
8034	NC_008148	GCTC	2	8	280369	280376	0 %	25 %	25 %	50 %	108803122
8035	NC_008148	CCTCC	2	10	280451	280460	0 %	20 %	0 %	80 %	108803122
8036	NC_008148	AGG	2	6	280464	280469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803122
8037	NC_008148	GTT	2	6	280502	280507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108803122
8038	NC_008148	GGT	2	6	280508	280513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803122
8039	NC_008148	GTC	2	6	280526	280531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803122
8040	NC_008148	CGGC	2	8	280537	280544	0 %	0 %	50 %	50 %	108803122
8041	NC_008148	GCGG	2	8	280565	280572	0 %	0 %	75 %	25 %	108803122
8042	NC_008148	TTC	2	6	280578	280583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803122
8043	NC_008148	GCGG	2	8	280622	280629	0 %	0 %	75 %	25 %	108803122
8044	NC_008148	GCGA	2	8	280689	280696	25 %	0 %	50 %	25 %	108803122
8045	NC_008148	CGC	2	6	280717	280722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803122
8046	NC_008148	CCT	2	6	280723	280728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803122
8047	NC_008148	TCC	2	6	280773	280778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803123
8048	NC_008148	GGTGG	2	10	280783	280792	0 %	20 %	80 %	0 %	108803123
8049	NC_008148	ATC	2	6	280802	280807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803123
8050	NC_008148	ACG	2	6	280907	280912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803123
8051	NC_008148	TCC	3	9	280985	280993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803123
8052	NC_008148	GCC	2	6	281000	281005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803123
8053	NC_008148	CTC	3	9	281059	281067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803123
8054	NC_008148	GCG	2	6	281070	281075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803123
8055	NC_008148	AGT	3	9	281076	281084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803123
8056	NC_008148	TCT	2	6	281088	281093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803123
8057	NC_008148	GTG	2	6	281117	281122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803123
8058	NC_008148	GGCTCG	2	12	281180	281191	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	108803123
8059	NC_008148	CCT	2	6	281199	281204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803123
8060	NC_008148	GCC	2	6	281241	281246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803123
8061	NC_008148	GCC	2	6	281329	281334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803123
8062	NC_008148	GCG	2	6	281386	281391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803123
8063	NC_008148	TGT	2	6	281412	281417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108803123
8064	NC_008148	AT	3	6	281452	281457	50 %	50 %	0 %	0 %	108803123
8065	NC_008148	TGT	2	6	281475	281480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108803123
8066	NC_008148	GCAGGT	2	12	281490	281501	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	108803123
8067	NC_008148	CCT	2	6	281675	281680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803124
8068	NC_008148	GCT	2	6	281681	281686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803124
8069	NC_008148	AGT	2	6	281738	281743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803124
8070	NC_008148	GAG	2	6	281769	281774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803124
8071	NC_008148	GCA	2	6	281798	281803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803124
8072	NC_008148	CGA	2	6	281819	281824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803124
8073	NC_008148	GGGA	2	8	281842	281849	25 %	0 %	75 %	0 %	108803124
8074	NC_008148	GC	3	6	281909	281914	0 %	0 %	50 %	50 %	108803124
8075	NC_008148	AGC	2	6	281926	281931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803124
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8077	NC_008148	CGAGG	2	10	282057	282066	20 %	0 %	60 %	20 %	108803124
8078	NC_008148	CGG	2	6	282102	282107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803124
8079	NC_008148	GCC	2	6	282114	282119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803124
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8081	NC_008148	GAA	2	6	282192	282197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108803124
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8083	NC_008148	AGC	2	6	282232	282237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803124
8084	NC_008148	GCG	2	6	282262	282267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803124
8085	NC_008148	GC	3	6	282281	282286	0 %	0 %	50 %	50 %	108803124
8086	NC_008148	GCG	2	6	282289	282294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803124
8087	NC_008148	CAC	2	6	282333	282338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803124
8088	NC_008148	GACGGC	2	12	282360	282371	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	108803124
8089	NC_008148	CT	3	6	282426	282431	0 %	50 %	0 %	50 %	108803124
8090	NC_008148	GC	3	6	282582	282587	0 %	0 %	50 %	50 %	108803125
8091	NC_008148	CCA	2	6	282670	282675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803125
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8093	NC_008148	CGA	2	6	282706	282711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803125
8094	NC_008148	CGA	2	6	282718	282723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803125
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8102	NC_008148	CCGC	2	8	282949	282956	0 %	0 %	25 %	75 %	108803125
8103	NC_008148	TCC	2	6	282981	282986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803125
8104	NC_008148	CGC	2	6	283027	283032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803125
8105	NC_008148	ACC	2	6	283035	283040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803125
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8108	NC_008148	CCA	2	6	283174	283179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803125
8109	NC_008148	AGG	2	6	283182	283187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803125
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8111	NC_008148	TGC	2	6	283270	283275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803125
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8116	NC_008148	CG	3	6	283603	283608	0 %	0 %	50 %	50 %	108803125
8117	NC_008148	GGA	2	6	283609	283614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803125
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8119	NC_008148	GGCG	2	8	283672	283679	0 %	0 %	75 %	25 %	108803125
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8121	NC_008148	TCG	2	6	283716	283721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803125
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8153	NC_008148	CG	3	6	284948	284953	0 %	0 %	50 %	50 %	108803126
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8234	NC_008148	TCGGCA	2	12	287690	287701	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	108803129
8235	NC_008148	CGCAG	2	10	287741	287750	20 %	0 %	40 %	40 %	108803129
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8237	NC_008148	CAT	2	6	287811	287816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803129
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8240	NC_008148	GCG	2	6	287942	287947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803129
8241	NC_008148	CGA	2	6	287970	287975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803129
8242	NC_008148	GCC	2	6	287999	288004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803129
8243	NC_008148	AGGGC	2	10	288017	288026	20 %	0 %	60 %	20 %	108803129
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8245	NC_008148	CGA	2	6	288066	288071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803129
8246	NC_008148	GTC	2	6	288094	288099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803129
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8351	NC_008148	TCCG	2	8	291983	291990	0 %	25 %	25 %	50 %	108803134
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8359	NC_008148	CGCCC	2	10	292159	292168	0 %	0 %	20 %	80 %	108803134
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8487	NC_008148	G	7	7	296217	296223	0 %	0 %	100 %	0 %	108803138
8488	NC_008148	GC	3	6	296347	296352	0 %	0 %	50 %	50 %	108803138
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8491	NC_008148	GGC	2	6	296423	296428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803138
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