MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 58485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008044	CTG	2	6	226643	226648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080050
4002	NC_008044	CTGG	2	8	226681	226688	0 %	25 %	50 %	25 %	99080050
4003	NC_008044	GC	3	6	226733	226738	0 %	0 %	50 %	50 %	99080050
4004	NC_008044	GATGC	2	10	226805	226814	20 %	20 %	40 %	20 %	99080050
4005	NC_008044	CGG	3	9	226881	226889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080050
4006	NC_008044	TGC	2	6	226900	226905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080050
4007	NC_008044	GT	3	6	226970	226975	0 %	50 %	50 %	0 %	99080051
4008	NC_008044	CG	4	8	227131	227138	0 %	0 %	50 %	50 %	99080051
4009	NC_008044	GGCGC	2	10	227163	227172	0 %	0 %	60 %	40 %	99080051
4010	NC_008044	GAC	2	6	227196	227201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080051
4011	NC_008044	CCA	2	6	227228	227233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080051
4012	NC_008044	GC	4	8	227279	227286	0 %	0 %	50 %	50 %	99080051
4013	NC_008044	TTC	2	6	227298	227303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080051
4014	NC_008044	ATG	2	6	227323	227328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080051
4015	NC_008044	AG	3	6	227351	227356	50 %	0 %	50 %	0 %	99080051
4016	NC_008044	GCG	2	6	227398	227403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080051
4017	NC_008044	CAG	2	6	227430	227435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080051
4018	NC_008044	GC	3	6	227503	227508	0 %	0 %	50 %	50 %	99080051
4019	NC_008044	GAG	2	6	227514	227519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080051
4020	NC_008044	GAC	2	6	227552	227557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080051
4021	NC_008044	GC	3	6	227732	227737	0 %	0 %	50 %	50 %	99080052
4022	NC_008044	TGC	2	6	227749	227754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080052
4023	NC_008044	GTGC	2	8	227888	227895	0 %	25 %	50 %	25 %	99080052
4024	NC_008044	CCG	2	6	227915	227920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080052
4025	NC_008044	GC	3	6	228002	228007	0 %	0 %	50 %	50 %	99080052
4026	NC_008044	GGT	2	6	228095	228100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080052
4027	NC_008044	G	6	6	228131	228136	0 %	0 %	100 %	0 %	99080052
4028	NC_008044	GAA	2	6	228240	228245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080052
4029	NC_008044	CGG	2	6	228275	228280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080052
4030	NC_008044	GCG	2	6	228306	228311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080052
4031	NC_008044	GCC	2	6	228318	228323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080052
4032	NC_008044	CG	3	6	228325	228330	0 %	0 %	50 %	50 %	99080052
4033	NC_008044	ATC	2	6	228351	228356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080052
4034	NC_008044	CG	3	6	228447	228452	0 %	0 %	50 %	50 %	99080052
4035	NC_008044	GC	3	6	228476	228481	0 %	0 %	50 %	50 %	99080052
4036	NC_008044	CTG	2	6	228531	228536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080052
4037	NC_008044	CGG	2	6	228623	228628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080053
4038	NC_008044	GCT	2	6	228743	228748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080053
4039	NC_008044	CGG	2	6	228755	228760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080053
4040	NC_008044	GTC	2	6	228975	228980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080053
4041	NC_008044	CGG	2	6	228996	229001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080053
4042	NC_008044	CGG	2	6	229043	229048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080053
4043	NC_008044	GA	3	6	229079	229084	50 %	0 %	50 %	0 %	99080053
4044	NC_008044	G	6	6	229091	229096	0 %	0 %	100 %	0 %	99080053
4045	NC_008044	ATG	2	6	229105	229110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080053
4046	NC_008044	AATG	2	8	229190	229197	50 %	25 %	25 %	0 %	99080054
4047	NC_008044	GAA	2	6	229252	229257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080054
4048	NC_008044	CG	3	6	229270	229275	0 %	0 %	50 %	50 %	99080054
4049	NC_008044	AGC	2	6	229331	229336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080054
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4052	NC_008044	GCG	2	6	229422	229427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080054
4053	NC_008044	GAG	2	6	229432	229437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080054
4054	NC_008044	CG	3	6	229460	229465	0 %	0 %	50 %	50 %	99080054
4055	NC_008044	TGA	2	6	229544	229549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080054
4056	NC_008044	CGC	2	6	229586	229591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080054
4057	NC_008044	GC	3	6	229594	229599	0 %	0 %	50 %	50 %	99080054
4058	NC_008044	AGG	2	6	229691	229696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080054
4059	NC_008044	TGCT	2	8	229702	229709	0 %	50 %	25 %	25 %	99080054
4060	NC_008044	GAT	2	6	229798	229803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080054
4061	NC_008044	GCT	2	6	229920	229925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080054
4062	NC_008044	GCG	2	6	229942	229947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080054
4063	NC_008044	GC	3	6	229975	229980	0 %	0 %	50 %	50 %	99080054
4064	NC_008044	GC	3	6	230039	230044	0 %	0 %	50 %	50 %	99080054
4065	NC_008044	GTC	2	6	230065	230070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080054
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4070	NC_008044	CCGC	2	8	230395	230402	0 %	0 %	25 %	75 %	99080055
4071	NC_008044	GCC	2	6	230423	230428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080055
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4074	NC_008044	GCC	3	9	230608	230616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080055
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4082	NC_008044	CTG	2	6	231239	231244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080056
4083	NC_008044	GCCA	2	8	231246	231253	25 %	0 %	25 %	50 %	99080056
4084	NC_008044	GCA	2	6	231260	231265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080056
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4088	NC_008044	GCG	2	6	231474	231479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080056
4089	NC_008044	ACTG	2	8	231483	231490	25 %	25 %	25 %	25 %	99080056
4090	NC_008044	CG	4	8	231528	231535	0 %	0 %	50 %	50 %	99080056
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4092	NC_008044	TC	3	6	231543	231548	0 %	50 %	0 %	50 %	99080056
4093	NC_008044	CGG	3	9	231558	231566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080056
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4096	NC_008044	CGAT	2	8	231805	231812	25 %	25 %	25 %	25 %	99080057
4097	NC_008044	TGC	2	6	231821	231826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080057
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4099	NC_008044	CTT	2	6	231986	231991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080057
4100	NC_008044	TGA	2	6	231995	232000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080057
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4102	NC_008044	GTGG	2	8	232059	232066	0 %	25 %	75 %	0 %	99080057
4103	NC_008044	CACG	2	8	232109	232116	25 %	0 %	25 %	50 %	99080057
4104	NC_008044	TCG	2	6	232117	232122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080057
4105	NC_008044	CAG	2	6	232182	232187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080057
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4107	NC_008044	ACA	2	6	232237	232242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99080057
4108	NC_008044	ACG	2	6	232260	232265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080057
4109	NC_008044	TGC	2	6	232266	232271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080057
4110	NC_008044	GCG	2	6	232276	232281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080057
4111	NC_008044	CG	3	6	232296	232301	0 %	0 %	50 %	50 %	99080057
4112	NC_008044	CTCTG	2	10	232502	232511	0 %	40 %	20 %	40 %	99080058
4113	NC_008044	GAT	2	6	232589	232594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080058
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4117	NC_008044	TCT	2	6	232734	232739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080058
4118	NC_008044	CGG	2	6	232917	232922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080058
4119	NC_008044	GT	3	6	232941	232946	0 %	50 %	50 %	0 %	99080058
4120	NC_008044	GGT	2	6	233003	233008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080058
4121	NC_008044	GCG	2	6	233044	233049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080058
4122	NC_008044	GGC	2	6	233126	233131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080058
4123	NC_008044	GC	3	6	233130	233135	0 %	0 %	50 %	50 %	99080058
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4125	NC_008044	CGCGC	2	10	233341	233350	0 %	0 %	40 %	60 %	99080059
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4249	NC_008044	GC	3	6	240186	240191	0 %	0 %	50 %	50 %	99080065
4250	NC_008044	CTT	2	6	240234	240239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080065
4251	NC_008044	ATC	2	6	240252	240257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080065
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4253	NC_008044	TCA	2	6	240419	240424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080066
4254	NC_008044	CGA	2	6	240444	240449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080066
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4258	NC_008044	CGA	2	6	240654	240659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080066
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4277	NC_008044	CTG	2	6	241599	241604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080067
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4282	NC_008044	GGT	2	6	241918	241923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080068
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4284	NC_008044	CGA	2	6	242012	242017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080068
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4353	NC_008044	GCGCG	2	10	245290	245299	0 %	0 %	60 %	40 %	99080072
4354	NC_008044	CGA	2	6	245329	245334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080072
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4359	NC_008044	A	6	6	245573	245578	100 %	0 %	0 %	0 %	99080072
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4361	NC_008044	GTCCG	2	10	245658	245667	0 %	20 %	40 %	40 %	99080072
4362	NC_008044	CG	3	6	245669	245674	0 %	0 %	50 %	50 %	99080072
4363	NC_008044	AG	3	6	245711	245716	50 %	0 %	50 %	0 %	99080072
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4366	NC_008044	GC	4	8	245871	245878	0 %	0 %	50 %	50 %	99080072
4367	NC_008044	CG	3	6	245919	245924	0 %	0 %	50 %	50 %	99080072
4368	NC_008044	GCA	2	6	245957	245962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080072
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4495	NC_008044	GC	3	6	252516	252521	0 %	0 %	50 %	50 %	99080076
4496	NC_008044	AAG	2	6	252556	252561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080076
4497	NC_008044	ATC	2	6	252562	252567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080076
4498	NC_008044	TCCT	2	8	252589	252596	0 %	50 %	0 %	50 %	99080076
4499	NC_008044	GAT	2	6	252621	252626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080076
4500	NC_008044	CCG	2	6	252649	252654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080076

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