MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 58485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_008044	CAC	2	6	2416764	2416769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99082137
44002	NC_008044	TGA	2	6	2416781	2416786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082137
44003	NC_008044	CG	3	6	2416950	2416955	0 %	0 %	50 %	50 %	99082137
44004	NC_008044	AGCGC	2	10	2417021	2417030	20 %	0 %	40 %	40 %	99082137
44005	NC_008044	GCG	2	6	2417074	2417079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082137
44006	NC_008044	GAT	2	6	2417089	2417094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082137
44007	NC_008044	CCA	2	6	2417175	2417180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99082137
44008	NC_008044	AC	3	6	2417318	2417323	50 %	0 %	0 %	50 %	99082138
44009	NC_008044	C	6	6	2417326	2417331	0 %	0 %	0 %	100 %	99082138
44010	NC_008044	GGAA	2	8	2417387	2417394	50 %	0 %	50 %	0 %	99082138
44011	NC_008044	CGA	2	6	2417406	2417411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082138
44012	NC_008044	CTA	2	6	2417421	2417426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082138
44013	NC_008044	CG	3	6	2417546	2417551	0 %	0 %	50 %	50 %	99082138
44014	NC_008044	TGA	2	6	2417640	2417645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082139
44015	NC_008044	GGC	2	6	2417675	2417680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082139
44016	NC_008044	GCG	2	6	2417711	2417716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082139
44017	NC_008044	CAC	2	6	2417758	2417763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99082139
44018	NC_008044	CAC	2	6	2417791	2417796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99082139
44019	NC_008044	CTC	2	6	2417822	2417827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99082139
44020	NC_008044	GCG	2	6	2417864	2417869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082139
44021	NC_008044	CAT	2	6	2417887	2417892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082139
44022	NC_008044	GTG	2	6	2417924	2417929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082139
44023	NC_008044	TGC	2	6	2417941	2417946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082139
44024	NC_008044	GCG	2	6	2417995	2418000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082139
44025	NC_008044	GC	3	6	2418151	2418156	0 %	0 %	50 %	50 %	99082139
44026	NC_008044	ACC	2	6	2418194	2418199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99082139
44027	NC_008044	CACG	2	8	2418232	2418239	25 %	0 %	25 %	50 %	99082139
44028	NC_008044	GGC	2	6	2418281	2418286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082139
44029	NC_008044	CTC	2	6	2418328	2418333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99082139
44030	NC_008044	TGGA	2	8	2418344	2418351	25 %	25 %	50 %	0 %	99082139
44031	NC_008044	TGC	2	6	2418376	2418381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082139
44032	NC_008044	CAT	2	6	2418475	2418480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082139
44033	NC_008044	CAGC	2	8	2418481	2418488	25 %	0 %	25 %	50 %	99082139
44034	NC_008044	GC	3	6	2418487	2418492	0 %	0 %	50 %	50 %	99082139
44035	NC_008044	GCC	2	6	2418547	2418552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082139
44036	NC_008044	CG	3	6	2418719	2418724	0 %	0 %	50 %	50 %	99082139
44037	NC_008044	GAT	2	6	2418727	2418732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082139
44038	NC_008044	GGA	2	6	2418764	2418769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99082139
44039	NC_008044	AGC	2	6	2418912	2418917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082140
44040	NC_008044	CAT	2	6	2418958	2418963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082140
44041	NC_008044	GCA	2	6	2419041	2419046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082140
44042	NC_008044	ATC	2	6	2419094	2419099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082140
44043	NC_008044	GC	3	6	2419123	2419128	0 %	0 %	50 %	50 %	99082140
44044	NC_008044	CGG	2	6	2419138	2419143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082140
44045	NC_008044	CGTC	2	8	2419273	2419280	0 %	25 %	25 %	50 %	99082140
44046	NC_008044	TGG	2	6	2419285	2419290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082140
44047	NC_008044	GCC	2	6	2419304	2419309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082140
44048	NC_008044	GGT	2	6	2419370	2419375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082140
44049	NC_008044	CTC	2	6	2419376	2419381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99082140
44050	NC_008044	GC	3	6	2419393	2419398	0 %	0 %	50 %	50 %	99082140
44051	NC_008044	GCG	2	6	2419551	2419556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082140
44052	NC_008044	GGGTGC	2	12	2419673	2419684	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	99082140
44053	NC_008044	GCC	2	6	2419748	2419753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082140
44054	NC_008044	CAC	2	6	2419799	2419804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99082140
44055	NC_008044	GCC	3	9	2419859	2419867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082140
44056	NC_008044	CTG	2	6	2419934	2419939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082140
44057	NC_008044	CGGT	2	8	2419968	2419975	0 %	25 %	50 %	25 %	99082140
44058	NC_008044	ACC	2	6	2419980	2419985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99082140
44059	NC_008044	GCG	2	6	2420173	2420178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082141
44060	NC_008044	TTC	2	6	2420179	2420184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99082141
44061	NC_008044	CCG	3	9	2420236	2420244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082141
44062	NC_008044	CG	3	6	2420271	2420276	0 %	0 %	50 %	50 %	99082141
44063	NC_008044	GC	3	6	2420351	2420356	0 %	0 %	50 %	50 %	99082141
44064	NC_008044	TGG	2	6	2420385	2420390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082141
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44067	NC_008044	GCCC	2	8	2420528	2420535	0 %	0 %	25 %	75 %	99082141
44068	NC_008044	GTG	2	6	2420632	2420637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082142
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44070	NC_008044	CCG	2	6	2420807	2420812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082142
44071	NC_008044	CCGC	2	8	2420906	2420913	0 %	0 %	25 %	75 %	99082142
44072	NC_008044	C	6	6	2420929	2420934	0 %	0 %	0 %	100 %	99082142
44073	NC_008044	GAC	2	6	2420968	2420973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082142
44074	NC_008044	GGGTC	2	10	2421011	2421020	0 %	20 %	60 %	20 %	99082142
44075	NC_008044	GTCG	2	8	2421044	2421051	0 %	25 %	50 %	25 %	99082142
44076	NC_008044	TCA	2	6	2421055	2421060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082142
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44078	NC_008044	TCA	2	6	2421241	2421246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082143
44079	NC_008044	AAGAA	2	10	2421247	2421256	80 %	0 %	20 %	0 %	99082143
44080	NC_008044	AGCCGA	2	12	2421371	2421382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082143
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44085	NC_008044	AAG	2	6	2421562	2421567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99082143
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44087	NC_008044	GCG	2	6	2421616	2421621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082143
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44091	NC_008044	CAT	2	6	2421737	2421742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082143
44092	NC_008044	GCAG	2	8	2421788	2421795	25 %	0 %	50 %	25 %	99082143
44093	NC_008044	TG	3	6	2421799	2421804	0 %	50 %	50 %	0 %	99082143
44094	NC_008044	TCG	2	6	2421811	2421816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082143
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44102	NC_008044	CCA	2	6	2422105	2422110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99082143
44103	NC_008044	CCG	2	6	2422121	2422126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082143
44104	NC_008044	ACG	2	6	2422132	2422137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082143
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44116	NC_008044	CCG	2	6	2422862	2422867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082144
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44118	NC_008044	TTC	2	6	2422884	2422889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99082144
44119	NC_008044	GCC	2	6	2422901	2422906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082144
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44121	NC_008044	GCG	2	6	2422933	2422938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082144
44122	NC_008044	CTGC	2	8	2422969	2422976	0 %	25 %	25 %	50 %	99082144
44123	NC_008044	CTGG	2	8	2422980	2422987	0 %	25 %	50 %	25 %	99082144
44124	NC_008044	CGCC	2	8	2423000	2423007	0 %	0 %	25 %	75 %	99082144
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44226	NC_008044	CAT	2	6	2428778	2428783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082149
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44230	NC_008044	GCCT	2	8	2428857	2428864	0 %	25 %	25 %	50 %	99082149
44231	NC_008044	CAGCCC	2	12	2428944	2428955	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	99082149
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44474	NC_008044	CAT	2	6	2440823	2440828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082160
44475	NC_008044	GTG	2	6	2440842	2440847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082160
44476	NC_008044	GCC	2	6	2440859	2440864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082160
44477	NC_008044	CGCC	2	8	2440898	2440905	0 %	0 %	25 %	75 %	99082160
44478	NC_008044	TGG	2	6	2440950	2440955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082160
44479	NC_008044	CTGAT	2	10	2440966	2440975	20 %	40 %	20 %	20 %	99082160
44480	NC_008044	GC	3	6	2440979	2440984	0 %	0 %	50 %	50 %	99082160
44481	NC_008044	AGT	2	6	2441176	2441181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082161
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44484	NC_008044	GTCG	2	8	2441423	2441430	0 %	25 %	50 %	25 %	99082161
44485	NC_008044	CG	3	6	2441514	2441519	0 %	0 %	50 %	50 %	99082161
44486	NC_008044	GGTC	2	8	2441578	2441585	0 %	25 %	50 %	25 %	99082161
44487	NC_008044	CAC	2	6	2441681	2441686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99082161
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44498	NC_008044	CG	3	6	2442094	2442099	0 %	0 %	50 %	50 %	99082161
44499	NC_008044	GAT	2	6	2442125	2442130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082161
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