MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 58485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_008044	AT	3	6	110402	110407	50 %	50 %	0 %	0 %	99079944
2003	NC_008044	CCG	2	6	110422	110427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079944
2004	NC_008044	CAC	2	6	110537	110542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99079944
2005	NC_008044	GGCG	2	8	110603	110610	0 %	0 %	75 %	25 %	99079944
2006	NC_008044	CTG	2	6	110631	110636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079944
2007	NC_008044	AG	3	6	110792	110797	50 %	0 %	50 %	0 %	99079944
2008	NC_008044	GTT	2	6	110808	110813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99079944
2009	NC_008044	CGCAC	2	10	110855	110864	20 %	0 %	20 %	60 %	99079945
2010	NC_008044	GCGG	2	8	110896	110903	0 %	0 %	75 %	25 %	99079945
2011	NC_008044	TCG	2	6	110931	110936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079945
2012	NC_008044	TGG	2	6	110949	110954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079945
2013	NC_008044	TCT	2	6	110955	110960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99079945
2014	NC_008044	ACC	2	6	110977	110982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99079945
2015	NC_008044	GAG	2	6	110984	110989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99079945
2016	NC_008044	GC	3	6	111077	111082	0 %	0 %	50 %	50 %	99079945
2017	NC_008044	GAT	2	6	111103	111108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079945
2018	NC_008044	GGT	2	6	111115	111120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079945
2019	NC_008044	TGGG	2	8	111155	111162	0 %	25 %	75 %	0 %	99079945
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2022	NC_008044	GTG	2	6	111227	111232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079945
2023	NC_008044	TG	3	6	111278	111283	0 %	50 %	50 %	0 %	99079945
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2034	NC_008044	GCG	3	9	112025	112033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079945
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2106	NC_008044	C	6	6	116389	116394	0 %	0 %	0 %	100 %	99079951
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2109	NC_008044	CGGG	2	8	116454	116461	0 %	0 %	75 %	25 %	99079951
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2111	NC_008044	CATC	2	8	116702	116709	25 %	25 %	0 %	50 %	99079952
2112	NC_008044	CCG	3	9	116734	116742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079952
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2114	NC_008044	GC	3	6	116759	116764	0 %	0 %	50 %	50 %	99079952
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2122	NC_008044	GC	3	6	117342	117347	0 %	0 %	50 %	50 %	99079953
2123	NC_008044	CG	3	6	117388	117393	0 %	0 %	50 %	50 %	99079953
2124	NC_008044	TCA	2	6	117423	117428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079953
2125	NC_008044	TCA	2	6	117554	117559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079953
2126	NC_008044	TGG	2	6	117564	117569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079953
2127	NC_008044	GCC	2	6	117655	117660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079953
2128	NC_008044	GCC	2	6	117662	117667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079953
2129	NC_008044	C	7	7	117738	117744	0 %	0 %	0 %	100 %	99079953
2130	NC_008044	TGG	2	6	117804	117809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079953
2131	NC_008044	CG	3	6	117945	117950	0 %	0 %	50 %	50 %	99079953
2132	NC_008044	GCC	2	6	117984	117989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079953
2133	NC_008044	TGT	2	6	118020	118025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99079953
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2137	NC_008044	GAT	2	6	118258	118263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079953
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2140	NC_008044	GGC	3	9	118428	118436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079953
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2142	NC_008044	GGTGC	2	10	118494	118503	0 %	20 %	60 %	20 %	99079953
2143	NC_008044	GGC	2	6	118516	118521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079953
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2146	NC_008044	GTG	2	6	118715	118720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079953
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2152	NC_008044	GC	3	6	118878	118883	0 %	0 %	50 %	50 %	99079953
2153	NC_008044	TCGA	2	8	118886	118893	25 %	25 %	25 %	25 %	99079953
2154	NC_008044	TCA	2	6	118985	118990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079953
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2158	NC_008044	GA	3	6	119532	119537	50 %	0 %	50 %	0 %	99079954
2159	NC_008044	GAAA	2	8	119609	119616	75 %	0 %	25 %	0 %	99079954
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2162	NC_008044	TGA	2	6	119650	119655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079954
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2171	NC_008044	AGCTC	2	10	119995	120004	20 %	20 %	20 %	40 %	99079954
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2235	NC_008044	CTGGT	2	10	123065	123074	0 %	40 %	40 %	20 %	99079956
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2240	NC_008044	GA	3	6	123240	123245	50 %	0 %	50 %	0 %	99079956
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2372	NC_008044	GCC	2	6	130018	130023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079963
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2494	NC_008044	TCG	2	6	137193	137198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079970
2495	NC_008044	CTT	2	6	137257	137262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99079970
2496	NC_008044	GCG	2	6	137265	137270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079970
2497	NC_008044	CAC	2	6	137273	137278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99079970
2498	NC_008044	GCCC	2	8	137428	137435	0 %	0 %	25 %	75 %	99079970
2499	NC_008044	TTGCG	2	10	137872	137881	0 %	40 %	40 %	20 %	99079971
2500	NC_008044	CCA	2	6	137888	137893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99079971

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