MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 58485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_008044	TGC	2	6	829804	829809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080616
15002	NC_008044	TAC	2	6	829869	829874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080616
15003	NC_008044	GAA	2	6	829950	829955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080616
15004	NC_008044	AAG	2	6	830013	830018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080616
15005	NC_008044	A	6	6	830115	830120	100 %	0 %	0 %	0 %	99080616
15006	NC_008044	GC	4	8	830129	830136	0 %	0 %	50 %	50 %	99080616
15007	NC_008044	TCG	2	6	830188	830193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080616
15008	NC_008044	CAG	2	6	830208	830213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080616
15009	NC_008044	TTG	2	6	830248	830253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99080616
15010	NC_008044	CGA	2	6	830345	830350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080616
15011	NC_008044	CCG	2	6	830369	830374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080616
15012	NC_008044	ATT	2	6	830403	830408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99080616
15013	NC_008044	GAC	2	6	830429	830434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080616
15014	NC_008044	CGA	2	6	830453	830458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080616
15015	NC_008044	ACC	2	6	830595	830600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080616
15016	NC_008044	ACA	2	6	830611	830616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99080616
15017	NC_008044	AGC	2	6	830695	830700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080616
15018	NC_008044	GAA	2	6	830720	830725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080616
15019	NC_008044	ATC	2	6	830778	830783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080616
15020	NC_008044	GGCG	2	8	830801	830808	0 %	0 %	75 %	25 %	99080616
15021	NC_008044	AAG	2	6	830868	830873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080616
15022	NC_008044	ACC	2	6	831060	831065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080616
15023	NC_008044	TGA	2	6	831082	831087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080616
15024	NC_008044	GCA	2	6	831102	831107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080616
15025	NC_008044	CGC	2	6	831130	831135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080616
15026	NC_008044	ACC	2	6	831149	831154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080616
15027	NC_008044	G	6	6	831333	831338	0 %	0 %	100 %	0 %	99080616
15028	NC_008044	GAAA	2	8	831341	831348	75 %	0 %	25 %	0 %	99080616
15029	NC_008044	AAG	2	6	831439	831444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080616
15030	NC_008044	ATC	2	6	831453	831458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080616
15031	NC_008044	GAG	2	6	831528	831533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080616
15032	NC_008044	GCC	3	9	831543	831551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080616
15033	NC_008044	GCC	2	6	832390	832395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080617
15034	NC_008044	TTC	2	6	832414	832419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080617
15035	NC_008044	GCC	2	6	832425	832430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080617
15036	NC_008044	GCG	2	6	832459	832464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080617
15037	NC_008044	GTC	2	6	832539	832544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080617
15038	NC_008044	TGA	2	6	832556	832561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080617
15039	NC_008044	TTC	2	6	832692	832697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080617
15040	NC_008044	GATG	2	8	832743	832750	25 %	25 %	50 %	0 %	99080617
15041	NC_008044	GAT	2	6	832761	832766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080617
15042	NC_008044	GTG	2	6	832882	832887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080617
15043	NC_008044	GTGC	2	8	833083	833090	0 %	25 %	50 %	25 %	99080617
15044	NC_008044	GCA	2	6	833506	833511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080618
15045	NC_008044	CTG	2	6	833567	833572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080618
15046	NC_008044	GGA	2	6	833585	833590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080618
15047	NC_008044	TGCA	2	8	833597	833604	25 %	25 %	25 %	25 %	99080618
15048	NC_008044	TCT	2	6	833729	833734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080618
15049	NC_008044	CT	3	6	833748	833753	0 %	50 %	0 %	50 %	99080618
15050	NC_008044	CCA	2	6	833813	833818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080618
15051	NC_008044	CTT	2	6	833936	833941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080619
15052	NC_008044	ATG	2	6	833961	833966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080619
15053	NC_008044	GTG	2	6	834040	834045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080619
15054	NC_008044	CGC	3	9	834100	834108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080619
15055	NC_008044	GGCT	2	8	834155	834162	0 %	25 %	50 %	25 %	99080619
15056	NC_008044	TGC	2	6	834210	834215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080619
15057	NC_008044	AGG	2	6	834257	834262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080619
15058	NC_008044	ACC	2	6	834288	834293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080619
15059	NC_008044	GCC	2	6	834297	834302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080619
15060	NC_008044	TCC	2	6	834303	834308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080619
15061	NC_008044	GTG	2	6	834357	834362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080619
15062	NC_008044	GCC	2	6	834429	834434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080619
15063	NC_008044	TTC	2	6	834473	834478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080619
15064	NC_008044	CGA	2	6	834501	834506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080619
15065	NC_008044	AAG	2	6	834515	834520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080619
15066	NC_008044	CGG	2	6	834703	834708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080619
15067	NC_008044	CCG	2	6	834727	834732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080619
15068	NC_008044	TCC	2	6	834756	834761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080619
15069	NC_008044	ATC	2	6	834771	834776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080619
15070	NC_008044	CG	3	6	834787	834792	0 %	0 %	50 %	50 %	99080619
15071	NC_008044	TGC	2	6	834868	834873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080619
15072	NC_008044	GCC	2	6	834890	834895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080620
15073	NC_008044	CGG	2	6	834973	834978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080620
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15075	NC_008044	ACC	2	6	835110	835115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080620
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15077	NC_008044	GTGC	2	8	835161	835168	0 %	25 %	50 %	25 %	99080620
15078	NC_008044	GCGT	2	8	835272	835279	0 %	25 %	50 %	25 %	99080620
15079	NC_008044	CGG	2	6	835285	835290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080620
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15081	NC_008044	GTC	2	6	835387	835392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080620
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15083	NC_008044	CG	4	8	835455	835462	0 %	0 %	50 %	50 %	99080620
15084	NC_008044	CA	3	6	835480	835485	50 %	0 %	0 %	50 %	99080620
15085	NC_008044	TGC	2	6	835524	835529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080620
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15088	NC_008044	GCC	2	6	835793	835798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080621
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15093	NC_008044	GAC	2	6	836027	836032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080621
15094	NC_008044	AG	3	6	836087	836092	50 %	0 %	50 %	0 %	99080621
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15099	NC_008044	GTCC	2	8	836271	836278	0 %	25 %	25 %	50 %	99080621
15100	NC_008044	TCT	2	6	836335	836340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080621
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15106	NC_008044	GGTC	2	8	836833	836840	0 %	25 %	50 %	25 %	99080623
15107	NC_008044	TGC	2	6	836842	836847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080623
15108	NC_008044	TCT	2	6	836861	836866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080623
15109	NC_008044	GC	3	6	836942	836947	0 %	0 %	50 %	50 %	99080623
15110	NC_008044	CAC	2	6	836977	836982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080623
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15112	NC_008044	CCT	2	6	837042	837047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080623
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15119	NC_008044	TGC	2	6	837772	837777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080624
15120	NC_008044	CA	4	8	837824	837831	50 %	0 %	0 %	50 %	99080624
15121	NC_008044	GTC	2	6	837862	837867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080624
15122	NC_008044	TCA	3	9	837872	837880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080624
15123	NC_008044	CCT	2	6	837958	837963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080625
15124	NC_008044	CTT	2	6	837986	837991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080625
15125	NC_008044	TCA	2	6	838158	838163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080625
15126	NC_008044	TGC	2	6	838252	838257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080625
15127	NC_008044	ACG	2	6	838329	838334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080625
15128	NC_008044	TGT	3	9	838435	838443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99080625
15129	NC_008044	CGT	2	6	838528	838533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080625
15130	NC_008044	CGA	2	6	838831	838836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080626
15131	NC_008044	ATC	2	6	838839	838844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080626
15132	NC_008044	GCC	2	6	838889	838894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080626
15133	NC_008044	TGG	2	6	838897	838902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080626
15134	NC_008044	CGG	2	6	838947	838952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080626
15135	NC_008044	GTG	2	6	838971	838976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080626
15136	NC_008044	GCC	2	6	838983	838988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080626
15137	NC_008044	CTG	2	6	839245	839250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080627
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15139	NC_008044	TGA	2	6	839305	839310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080627
15140	NC_008044	CGC	2	6	839317	839322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080627
15141	NC_008044	GCG	2	6	839390	839395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080627
15142	NC_008044	GA	3	6	839410	839415	50 %	0 %	50 %	0 %	99080627
15143	NC_008044	ACC	2	6	839483	839488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080627
15144	NC_008044	CGCA	2	8	839497	839504	25 %	0 %	25 %	50 %	99080627
15145	NC_008044	GTC	2	6	839558	839563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080627
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15147	NC_008044	AGCT	2	8	839919	839926	25 %	25 %	25 %	25 %	99080628
15148	NC_008044	CAT	2	6	839936	839941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080628
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15150	NC_008044	TGA	2	6	839978	839983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080628
15151	NC_008044	GCG	2	6	840051	840056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080628
15152	NC_008044	GA	4	8	840141	840148	50 %	0 %	50 %	0 %	99080628
15153	NC_008044	TG	3	6	840155	840160	0 %	50 %	50 %	0 %	99080628
15154	NC_008044	GT	4	8	840252	840259	0 %	50 %	50 %	0 %	99080628
15155	NC_008044	AGC	2	6	840336	840341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080628
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15157	NC_008044	CAG	2	6	840496	840501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080628
15158	NC_008044	AGCG	2	8	840531	840538	25 %	0 %	50 %	25 %	99080628
15159	NC_008044	CCT	2	6	840584	840589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080628
15160	NC_008044	GCT	2	6	840597	840602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080628
15161	NC_008044	CAG	2	6	840665	840670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080628
15162	NC_008044	AGG	3	9	840686	840694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080629
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15164	NC_008044	CTTG	2	8	840780	840787	0 %	50 %	25 %	25 %	99080629
15165	NC_008044	CGCA	2	8	840995	841002	25 %	0 %	25 %	50 %	99080629
15166	NC_008044	TTC	2	6	841223	841228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080630
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15174	NC_008044	GCT	2	6	841749	841754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080630
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15178	NC_008044	GA	3	6	841850	841855	50 %	0 %	50 %	0 %	99080630
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15200	NC_008044	TGC	2	6	843629	843634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080633
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15211	NC_008044	CGTTT	2	10	843925	843934	0 %	60 %	20 %	20 %	99080634
15212	NC_008044	CGC	4	12	843948	843959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080634
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15214	NC_008044	CGAT	2	8	843994	844001	25 %	25 %	25 %	25 %	99080634
15215	NC_008044	TGA	2	6	844025	844030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080634
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15217	NC_008044	GCCA	2	8	844108	844115	25 %	0 %	25 %	50 %	99080634
15218	NC_008044	CAT	2	6	844126	844131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080635
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15222	NC_008044	GAGC	2	8	844265	844272	25 %	0 %	50 %	25 %	99080635
15223	NC_008044	C	6	6	844382	844387	0 %	0 %	0 %	100 %	99080635
15224	NC_008044	CAC	2	6	844431	844436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080635
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15226	NC_008044	CAT	2	6	844495	844500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080635
15227	NC_008044	GAG	2	6	844640	844645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080635
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15230	NC_008044	TGGC	2	8	844779	844786	0 %	25 %	50 %	25 %	99080635
15231	NC_008044	CGG	2	6	844798	844803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080635
15232	NC_008044	GGC	2	6	844814	844819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080635
15233	NC_008044	GAA	2	6	844979	844984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080636
15234	NC_008044	GCTG	2	8	845020	845027	0 %	25 %	50 %	25 %	99080636
15235	NC_008044	CTC	2	6	845099	845104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080636
15236	NC_008044	CGT	2	6	845173	845178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080636
15237	NC_008044	TG	3	6	845197	845202	0 %	50 %	50 %	0 %	99080636
15238	NC_008044	CGC	2	6	845220	845225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080636
15239	NC_008044	CGC	2	6	845234	845239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080636
15240	NC_008044	CAA	2	6	845284	845289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99080636
15241	NC_008044	GCT	2	6	845361	845366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080636
15242	NC_008044	ATG	2	6	845394	845399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080636
15243	NC_008044	ATG	2	6	845629	845634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080637
15244	NC_008044	TGC	2	6	845939	845944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080637
15245	NC_008044	GGC	2	6	846019	846024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080637
15246	NC_008044	GCG	2	6	846038	846043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080637
15247	NC_008044	CGATGA	2	12	846084	846095	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	99080637
15248	NC_008044	GTT	2	6	846180	846185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99080638
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15250	NC_008044	AGCA	2	8	846212	846219	50 %	0 %	25 %	25 %	99080638
15251	NC_008044	CG	4	8	846252	846259	0 %	0 %	50 %	50 %	99080638
15252	NC_008044	ACC	2	6	846269	846274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080638
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15254	NC_008044	TGA	2	6	846438	846443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080639
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15256	NC_008044	ATC	2	6	846574	846579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080639
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15260	NC_008044	ACG	2	6	846872	846877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080639
15261	NC_008044	CTG	2	6	847507	847512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080640
15262	NC_008044	GCG	2	6	847521	847526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080640
15263	NC_008044	CG	3	6	847576	847581	0 %	0 %	50 %	50 %	99080640
15264	NC_008044	TGGC	2	8	847603	847610	0 %	25 %	50 %	25 %	99080640
15265	NC_008044	CA	3	6	847782	847787	50 %	0 %	0 %	50 %	99080641
15266	NC_008044	GGC	2	6	847852	847857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080641
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15268	NC_008044	A	6	6	847913	847918	100 %	0 %	0 %	0 %	99080641
15269	NC_008044	TGC	2	6	847992	847997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080641
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15273	NC_008044	GCG	2	6	848193	848198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080641
15274	NC_008044	GAT	2	6	848285	848290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080641
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15277	NC_008044	GC	3	6	848365	848370	0 %	0 %	50 %	50 %	99080641
15278	NC_008044	GCA	2	6	848480	848485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080642
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15283	NC_008044	GAT	2	6	848667	848672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080642
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15361	NC_008044	AGC	2	6	852830	852835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080645
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15363	NC_008044	CCTG	2	8	852903	852910	0 %	25 %	25 %	50 %	99080645
15364	NC_008044	CAT	2	6	852966	852971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080646
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15484	NC_008044	GGA	2	6	860154	860159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080660
15485	NC_008044	CG	3	6	860166	860171	0 %	0 %	50 %	50 %	99080660
15486	NC_008044	GGC	3	9	860216	860224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080660
15487	NC_008044	TTC	2	6	860304	860309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080660
15488	NC_008044	GATG	2	8	860423	860430	25 %	25 %	50 %	0 %	99080660
15489	NC_008044	TGG	2	6	860473	860478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080660
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15491	NC_008044	G	6	6	860608	860613	0 %	0 %	100 %	0 %	99080660
15492	NC_008044	GTG	2	6	860643	860648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080660
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