MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 58485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_008044	ATG	2	6	721569	721574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080515
13002	NC_008044	TTC	2	6	721595	721600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080515
13003	NC_008044	TGC	2	6	721734	721739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080515
13004	NC_008044	CCT	2	6	721749	721754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080515
13005	NC_008044	CTG	2	6	721783	721788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080515
13006	NC_008044	T	7	7	721816	721822	0 %	100 %	0 %	0 %	99080515
13007	NC_008044	TTGT	3	12	721952	721963	0 %	75 %	25 %	0 %	99080516
13008	NC_008044	TCC	2	6	722068	722073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080516
13009	NC_008044	GCC	2	6	722093	722098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080516
13010	NC_008044	CG	4	8	722099	722106	0 %	0 %	50 %	50 %	99080516
13011	NC_008044	GGA	2	6	722149	722154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080516
13012	NC_008044	TTTGA	2	10	722165	722174	20 %	60 %	20 %	0 %	99080516
13013	NC_008044	GGC	2	6	722263	722268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080516
13014	NC_008044	GATG	2	8	722318	722325	25 %	25 %	50 %	0 %	99080516
13015	NC_008044	GCA	2	6	722345	722350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080516
13016	NC_008044	AGGC	2	8	722533	722540	25 %	0 %	50 %	25 %	99080517
13017	NC_008044	ATC	2	6	722558	722563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080517
13018	NC_008044	TGCC	2	8	722589	722596	0 %	25 %	25 %	50 %	99080517
13019	NC_008044	CCA	2	6	722757	722762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080517
13020	NC_008044	GTC	2	6	722800	722805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080517
13021	NC_008044	TTG	2	6	722816	722821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99080517
13022	NC_008044	CTG	2	6	722842	722847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080517
13023	NC_008044	CG	3	6	722864	722869	0 %	0 %	50 %	50 %	99080517
13024	NC_008044	GCA	2	6	722874	722879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080517
13025	NC_008044	TCG	2	6	722909	722914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080517
13026	NC_008044	CCA	2	6	722940	722945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080517
13027	NC_008044	CCA	2	6	722961	722966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080517
13028	NC_008044	TCAA	2	8	723152	723159	50 %	25 %	0 %	25 %	99080517
13029	NC_008044	GCTC	2	8	723225	723232	0 %	25 %	25 %	50 %	99080517
13030	NC_008044	GATCC	2	10	723309	723318	20 %	20 %	20 %	40 %	99080517
13031	NC_008044	CGG	2	6	723354	723359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080517
13032	NC_008044	GCTG	2	8	723360	723367	0 %	25 %	50 %	25 %	99080517
13033	NC_008044	GCT	2	6	723860	723865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080518
13034	NC_008044	AGGCAG	2	12	724006	724017	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	99080518
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13036	NC_008044	GCAT	2	8	724245	724252	25 %	25 %	25 %	25 %	99080519
13037	NC_008044	TCG	2	6	724285	724290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080519
13038	NC_008044	GC	3	6	724535	724540	0 %	0 %	50 %	50 %	99080519
13039	NC_008044	CGG	2	6	724666	724671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080519
13040	NC_008044	GCAGA	2	10	724689	724698	40 %	0 %	40 %	20 %	99080519
13041	NC_008044	CGGCAT	2	12	724754	724765	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	99080519
13042	NC_008044	GCCC	2	8	724799	724806	0 %	0 %	25 %	75 %	99080519
13043	NC_008044	TGG	2	6	724843	724848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080519
13044	NC_008044	ACG	2	6	724858	724863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080519
13045	NC_008044	CAT	2	6	724892	724897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080519
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13049	NC_008044	GGT	2	6	724994	724999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080519
13050	NC_008044	GTG	2	6	725139	725144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080519
13051	NC_008044	ATG	2	6	725218	725223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080519
13052	NC_008044	CCG	2	6	725251	725256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080519
13053	NC_008044	GGTTT	2	10	725263	725272	0 %	60 %	40 %	0 %	99080519
13054	NC_008044	CGAG	2	8	725324	725331	25 %	0 %	50 %	25 %	99080519
13055	NC_008044	CAC	2	6	725351	725356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080519
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13057	NC_008044	CCG	2	6	725531	725536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080519
13058	NC_008044	CAG	2	6	725544	725549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080519
13059	NC_008044	TGG	2	6	725578	725583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080519
13060	NC_008044	GGT	2	6	725606	725611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080519
13061	NC_008044	GAT	2	6	725672	725677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080519
13062	NC_008044	CG	3	6	725685	725690	0 %	0 %	50 %	50 %	99080519
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13065	NC_008044	TGG	2	6	725855	725860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080519
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13111	NC_008044	GC	4	8	727982	727989	0 %	0 %	50 %	50 %	99080521
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13489	NC_008044	TGC	2	6	747365	747370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080537
13490	NC_008044	GGCAA	2	10	747418	747427	40 %	0 %	40 %	20 %	99080537
13491	NC_008044	GTG	2	6	747494	747499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080537
13492	NC_008044	TCTT	2	8	747518	747525	0 %	75 %	0 %	25 %	99080537
13493	NC_008044	GCG	2	6	747703	747708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080538
13494	NC_008044	GCT	2	6	747719	747724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080538
13495	NC_008044	TGA	2	6	747803	747808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080538
13496	NC_008044	T	6	6	748027	748032	0 %	100 %	0 %	0 %	99080539
13497	NC_008044	CAA	2	6	748078	748083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99080539
13498	NC_008044	TTG	2	6	748101	748106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99080539
13499	NC_008044	GCA	2	6	748149	748154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080539
13500	NC_008044	GAC	2	6	748245	748250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080539

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