MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 58485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_008044	GCG	2	6	636774	636779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080436
11502	NC_008044	GCC	2	6	636784	636789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080436
11503	NC_008044	TCA	2	6	636832	636837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080436
11504	NC_008044	CGC	2	6	636941	636946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080436
11505	NC_008044	GC	3	6	636970	636975	0 %	0 %	50 %	50 %	99080436
11506	NC_008044	G	7	7	637091	637097	0 %	0 %	100 %	0 %	99080436
11507	NC_008044	GTG	2	6	637104	637109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080436
11508	NC_008044	TGA	2	6	637113	637118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080436
11509	NC_008044	ACCA	2	8	637235	637242	50 %	0 %	0 %	50 %	99080436
11510	NC_008044	GAA	2	6	637686	637691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080437
11511	NC_008044	A	6	6	637690	637695	100 %	0 %	0 %	0 %	99080437
11512	NC_008044	GGT	2	6	637701	637706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080437
11513	NC_008044	GTT	2	6	637749	637754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99080437
11514	NC_008044	GC	4	8	637771	637778	0 %	0 %	50 %	50 %	99080437
11515	NC_008044	GCG	2	6	637786	637791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080437
11516	NC_008044	ACA	2	6	637822	637827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99080437
11517	NC_008044	GCT	2	6	637877	637882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080437
11518	NC_008044	GAT	2	6	637883	637888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080437
11519	NC_008044	AG	3	6	637892	637897	50 %	0 %	50 %	0 %	99080437
11520	NC_008044	CAT	2	6	637901	637906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080437
11521	NC_008044	AAT	2	6	637979	637984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	99080438
11522	NC_008044	GCT	2	6	637986	637991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080438
11523	NC_008044	GT	3	6	638140	638145	0 %	50 %	50 %	0 %	99080438
11524	NC_008044	GAAG	2	8	638204	638211	50 %	0 %	50 %	0 %	99080438
11525	NC_008044	ACG	2	6	638227	638232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080438
11526	NC_008044	CAC	3	9	638246	638254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080438
11527	NC_008044	GC	3	6	638385	638390	0 %	0 %	50 %	50 %	99080438
11528	NC_008044	CGA	2	6	638405	638410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080438
11529	NC_008044	GCC	2	6	638458	638463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080438
11530	NC_008044	ACG	2	6	638494	638499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080438
11531	NC_008044	TCA	2	6	638503	638508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080438
11532	NC_008044	GAA	2	6	638514	638519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080438
11533	NC_008044	TGT	2	6	638546	638551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99080438
11534	NC_008044	GAA	2	6	638654	638659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080438
11535	NC_008044	CTC	2	6	638663	638668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080438
11536	NC_008044	CTC	2	6	638721	638726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080438
11537	NC_008044	ATC	2	6	638727	638732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080438
11538	NC_008044	GGC	2	6	638787	638792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080438
11539	NC_008044	CGC	2	6	638832	638837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080438
11540	NC_008044	TGC	2	6	638845	638850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080438
11541	NC_008044	CGG	2	6	638870	638875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080438
11542	NC_008044	ACC	2	6	638970	638975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080438
11543	NC_008044	GAA	2	6	639042	639047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080438
11544	NC_008044	CGG	2	6	639125	639130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080438
11545	NC_008044	CGAAGT	2	12	639137	639148	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	99080438
11546	NC_008044	TCG	2	6	639217	639222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080438
11547	NC_008044	GTG	3	9	639223	639231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080438
11548	NC_008044	CG	3	6	639315	639320	0 %	0 %	50 %	50 %	99080438
11549	NC_008044	GAA	2	6	639432	639437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080438
11550	NC_008044	GATC	2	8	639464	639471	25 %	25 %	25 %	25 %	99080438
11551	NC_008044	CTG	2	6	639522	639527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080438
11552	NC_008044	AAG	2	6	639565	639570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080438
11553	NC_008044	GGC	2	6	639603	639608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080438
11554	NC_008044	ATG	2	6	639618	639623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080438
11555	NC_008044	T	6	6	639690	639695	0 %	100 %	0 %	0 %	99080439
11556	NC_008044	T	6	6	639718	639723	0 %	100 %	0 %	0 %	99080439
11557	NC_008044	G	6	6	639724	639729	0 %	0 %	100 %	0 %	99080439
11558	NC_008044	GCA	2	6	639736	639741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080439
11559	NC_008044	C	6	6	639743	639748	0 %	0 %	0 %	100 %	99080439
11560	NC_008044	A	7	7	639749	639755	100 %	0 %	0 %	0 %	99080439
11561	NC_008044	ATG	2	6	639880	639885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080439
11562	NC_008044	GGCA	2	8	639975	639982	25 %	0 %	50 %	25 %	99080439
11563	NC_008044	CTG	2	6	639984	639989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080439
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11565	NC_008044	CTGCC	2	10	640222	640231	0 %	20 %	20 %	60 %	99080440
11566	NC_008044	CG	3	6	640256	640261	0 %	0 %	50 %	50 %	99080440
11567	NC_008044	TCG	2	6	640264	640269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080440
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11569	NC_008044	GCG	2	6	640301	640306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080440
11570	NC_008044	CG	5	10	640346	640355	0 %	0 %	50 %	50 %	99080440
11571	NC_008044	GC	3	6	640378	640383	0 %	0 %	50 %	50 %	99080440
11572	NC_008044	GCC	2	6	640430	640435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080440
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11578	NC_008044	TGC	2	6	640979	640984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080441
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11581	NC_008044	GCG	2	6	641125	641130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080441
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11584	NC_008044	CTT	2	6	641160	641165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080441
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11586	NC_008044	CGT	2	6	641247	641252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080441
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11588	NC_008044	CCG	2	6	641512	641517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080441
11589	NC_008044	TGT	2	6	641564	641569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99080442
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11592	NC_008044	CCT	2	6	641690	641695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080442
11593	NC_008044	CTG	2	6	641698	641703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080442
11594	NC_008044	GGA	2	6	641706	641711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080442
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11597	NC_008044	CG	3	6	641801	641806	0 %	0 %	50 %	50 %	99080442
11598	NC_008044	GGC	2	6	641857	641862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080442
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11602	NC_008044	CTG	2	6	641986	641991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080442
11603	NC_008044	TCT	2	6	642104	642109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080442
11604	NC_008044	GAT	2	6	642130	642135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080442
11605	NC_008044	ATC	2	6	642184	642189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080442
11606	NC_008044	TGA	2	6	642212	642217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080442
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11608	NC_008044	CGG	2	6	642318	642323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080442
11609	NC_008044	TGG	2	6	642377	642382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080443
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11611	NC_008044	GC	3	6	642396	642401	0 %	0 %	50 %	50 %	99080443
11612	NC_008044	AG	3	6	642469	642474	50 %	0 %	50 %	0 %	99080443
11613	NC_008044	CCT	2	6	642495	642500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080443
11614	NC_008044	C	6	6	642548	642553	0 %	0 %	0 %	100 %	99080443
11615	NC_008044	TTCGA	2	10	642752	642761	20 %	40 %	20 %	20 %	99080443
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11620	NC_008044	GC	3	6	643046	643051	0 %	0 %	50 %	50 %	99080443
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11622	NC_008044	GC	3	6	643079	643084	0 %	0 %	50 %	50 %	99080443
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11988	NC_008044	GC	3	6	664524	664529	0 %	0 %	50 %	50 %	99080467
11989	NC_008044	CAG	2	6	664533	664538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080467
11990	NC_008044	TGT	2	6	664550	664555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99080467
11991	NC_008044	GCA	2	6	664580	664585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080467
11992	NC_008044	AGT	2	6	664616	664621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080467
11993	NC_008044	GCC	2	6	665245	665250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080468
11994	NC_008044	GCG	2	6	665359	665364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080468
11995	NC_008044	GAA	2	6	665400	665405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080468
11996	NC_008044	TCC	2	6	665422	665427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080468
11997	NC_008044	GCC	2	6	665486	665491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080468
11998	NC_008044	TGAG	2	8	665507	665514	25 %	25 %	50 %	0 %	99080468
11999	NC_008044	CAT	2	6	665538	665543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080468
12000	NC_008044	CTG	2	6	665566	665571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080468

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