MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 58485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_008044	AAG	2	6	610015	610020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080414
11002	NC_008044	GCC	2	6	610032	610037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080414
11003	NC_008044	CCG	2	6	610095	610100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080414
11004	NC_008044	TGC	2	6	610113	610118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080414
11005	NC_008044	GGT	2	6	610119	610124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080414
11006	NC_008044	GCC	2	6	610277	610282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080414
11007	NC_008044	CG	3	6	610327	610332	0 %	0 %	50 %	50 %	99080414
11008	NC_008044	GAG	2	6	610387	610392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080414
11009	NC_008044	ACC	2	6	610415	610420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080414
11010	NC_008044	CGC	2	6	610427	610432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080414
11011	NC_008044	TCGA	2	8	610474	610481	25 %	25 %	25 %	25 %	99080414
11012	NC_008044	CTG	2	6	610525	610530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080414
11013	NC_008044	GC	3	6	610534	610539	0 %	0 %	50 %	50 %	99080414
11014	NC_008044	GAT	2	6	610546	610551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080414
11015	NC_008044	GCG	2	6	610609	610614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080414
11016	NC_008044	TGT	2	6	610625	610630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99080414
11017	NC_008044	GGT	2	6	610720	610725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080414
11018	NC_008044	GAT	2	6	610735	610740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080414
11019	NC_008044	TCG	2	6	610758	610763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080414
11020	NC_008044	AGA	2	6	610896	610901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080414
11021	NC_008044	CG	3	6	610923	610928	0 %	0 %	50 %	50 %	99080414
11022	NC_008044	GCG	2	6	610971	610976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080414
11023	NC_008044	AGG	2	6	610988	610993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080414
11024	NC_008044	TCG	2	6	611045	611050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080414
11025	NC_008044	ACC	2	6	611150	611155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080414
11026	NC_008044	GC	3	6	611157	611162	0 %	0 %	50 %	50 %	99080414
11027	NC_008044	GCC	2	6	611336	611341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080414
11028	NC_008044	GCA	2	6	611343	611348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080414
11029	NC_008044	TTC	2	6	611465	611470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080414
11030	NC_008044	CG	4	8	611471	611478	0 %	0 %	50 %	50 %	99080414
11031	NC_008044	GC	3	6	611522	611527	0 %	0 %	50 %	50 %	99080414
11032	NC_008044	GCCC	2	8	611571	611578	0 %	0 %	25 %	75 %	99080414
11033	NC_008044	CGTCTG	2	12	611599	611610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080414
11034	NC_008044	TTG	2	6	611611	611616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99080414
11035	NC_008044	GCG	2	6	611731	611736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080414
11036	NC_008044	GAT	2	6	611745	611750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080414
11037	NC_008044	CTG	2	6	611782	611787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080414
11038	NC_008044	GATG	2	8	611979	611986	25 %	25 %	50 %	0 %	99080414
11039	NC_008044	GCA	2	6	612016	612021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080414
11040	NC_008044	CTG	2	6	612023	612028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080414
11041	NC_008044	CCG	2	6	612116	612121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080414
11042	NC_008044	CTG	2	6	612152	612157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080414
11043	NC_008044	TGC	2	6	612177	612182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080414
11044	NC_008044	CG	3	6	612329	612334	0 %	0 %	50 %	50 %	99080414
11045	NC_008044	GGT	2	6	612358	612363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080414
11046	NC_008044	GCC	2	6	612374	612379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080414
11047	NC_008044	CGG	2	6	612387	612392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080414
11048	NC_008044	TCC	2	6	612423	612428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080414
11049	NC_008044	GAA	2	6	612429	612434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080414
11050	NC_008044	CG	3	6	612556	612561	0 %	0 %	50 %	50 %	99080415
11051	NC_008044	CT	3	6	612577	612582	0 %	50 %	0 %	50 %	99080415
11052	NC_008044	CAAG	2	8	612589	612596	50 %	0 %	25 %	25 %	99080415
11053	NC_008044	GCG	2	6	612727	612732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080415
11054	NC_008044	AAGA	2	8	612833	612840	75 %	0 %	25 %	0 %	99080415
11055	NC_008044	CGT	2	6	612959	612964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080416
11056	NC_008044	ATCC	2	8	613053	613060	25 %	25 %	0 %	50 %	99080416
11057	NC_008044	GCG	2	6	613078	613083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080416
11058	NC_008044	GTGG	2	8	613145	613152	0 %	25 %	75 %	0 %	99080416
11059	NC_008044	AAGA	2	8	613197	613204	75 %	0 %	25 %	0 %	99080416
11060	NC_008044	GAG	2	6	613221	613226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080416
11061	NC_008044	GGT	2	6	613281	613286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080416
11062	NC_008044	GAA	2	6	613578	613583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080417
11063	NC_008044	TCGA	2	8	613645	613652	25 %	25 %	25 %	25 %	99080417
11064	NC_008044	ATCA	2	8	613783	613790	50 %	25 %	0 %	25 %	99080417
11065	NC_008044	AAGGC	2	10	613808	613817	40 %	0 %	40 %	20 %	99080417
11066	NC_008044	GC	3	6	613827	613832	0 %	0 %	50 %	50 %	99080417
11067	NC_008044	AGA	2	6	613865	613870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080417
11068	NC_008044	GATCT	2	10	613882	613891	20 %	40 %	20 %	20 %	99080417
11069	NC_008044	GTG	2	6	613903	613908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080417
11070	NC_008044	GAT	2	6	613927	613932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080417
11071	NC_008044	CGA	2	6	614019	614024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080417
11072	NC_008044	CGG	2	6	614030	614035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080417
11073	NC_008044	TGA	2	6	614046	614051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080417
11074	NC_008044	TGC	2	6	614189	614194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080418
11075	NC_008044	CCG	2	6	614222	614227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080418
11076	NC_008044	AGC	2	6	614258	614263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080418
11077	NC_008044	GCC	2	6	614282	614287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080418
11078	NC_008044	GCC	2	6	614299	614304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080418
11079	NC_008044	ACTG	2	8	614375	614382	25 %	25 %	25 %	25 %	99080418
11080	NC_008044	CG	4	8	614397	614404	0 %	0 %	50 %	50 %	99080418
11081	NC_008044	CAT	2	6	614419	614424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080418
11082	NC_008044	AC	3	6	614541	614546	50 %	0 %	0 %	50 %	99080418
11083	NC_008044	CGC	2	6	614585	614590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080418
11084	NC_008044	GCC	2	6	614602	614607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080418
11085	NC_008044	CATG	2	8	614643	614650	25 %	25 %	25 %	25 %	99080418
11086	NC_008044	CGG	2	6	614688	614693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080418
11087	NC_008044	ACC	2	6	614744	614749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080418
11088	NC_008044	ACG	2	6	614753	614758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080418
11089	NC_008044	GA	3	6	614816	614821	50 %	0 %	50 %	0 %	99080418
11090	NC_008044	GCGGCA	2	12	614823	614834	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	99080418
11091	NC_008044	AGC	2	6	614858	614863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080418
11092	NC_008044	T	6	6	614885	614890	0 %	100 %	0 %	0 %	99080418
11093	NC_008044	TGC	2	6	614998	615003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080419
11094	NC_008044	GAC	2	6	615011	615016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080419
11095	NC_008044	CG	5	10	615068	615077	0 %	0 %	50 %	50 %	99080419
11096	NC_008044	GC	4	8	615188	615195	0 %	0 %	50 %	50 %	99080419
11097	NC_008044	CG	3	6	615233	615238	0 %	0 %	50 %	50 %	99080419
11098	NC_008044	AGGC	2	8	615292	615299	25 %	0 %	50 %	25 %	99080419
11099	NC_008044	GCG	2	6	615303	615308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080419
11100	NC_008044	GC	3	6	615336	615341	0 %	0 %	50 %	50 %	99080419
11101	NC_008044	GCTGGA	2	12	615356	615367	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	99080419
11102	NC_008044	CTG	2	6	615417	615422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080419
11103	NC_008044	CTGG	2	8	615436	615443	0 %	25 %	50 %	25 %	99080419
11104	NC_008044	GCGA	2	8	615459	615466	25 %	0 %	50 %	25 %	99080419
11105	NC_008044	GTG	2	6	615474	615479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080419
11106	NC_008044	GAC	2	6	615579	615584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080419
11107	NC_008044	GGCG	2	8	615672	615679	0 %	0 %	75 %	25 %	99080419
11108	NC_008044	GCA	2	6	615687	615692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080419
11109	NC_008044	GCG	2	6	615711	615716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080419
11110	NC_008044	TGC	2	6	615721	615726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080419
11111	NC_008044	CTG	2	6	615755	615760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080419
11112	NC_008044	CT	3	6	615773	615778	0 %	50 %	0 %	50 %	99080419
11113	NC_008044	GC	3	6	615780	615785	0 %	0 %	50 %	50 %	99080419
11114	NC_008044	TCA	2	6	615842	615847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080419
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11116	NC_008044	GGC	2	6	615917	615922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080419
11117	NC_008044	CAG	2	6	616070	616075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080420
11118	NC_008044	CT	3	6	616100	616105	0 %	50 %	0 %	50 %	99080420
11119	NC_008044	CG	3	6	616106	616111	0 %	0 %	50 %	50 %	99080420
11120	NC_008044	GCC	2	6	616218	616223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080420
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11122	NC_008044	TCG	2	6	616422	616427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080420
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11244	NC_008044	TCG	2	6	623108	623113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080424
11245	NC_008044	TGG	2	6	623152	623157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080424
11246	NC_008044	GAT	2	6	623170	623175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080424
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11252	NC_008044	GGC	2	6	623368	623373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080424
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11362	NC_008044	GC	3	6	630119	630124	0 %	0 %	50 %	50 %	99080431
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11485	NC_008044	GC	3	6	635946	635951	0 %	0 %	50 %	50 %	99080435
11486	NC_008044	TCA	2	6	635962	635967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080435
11487	NC_008044	GC	4	8	636003	636010	0 %	0 %	50 %	50 %	99080435
11488	NC_008044	GCC	2	6	636060	636065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080435
11489	NC_008044	GC	3	6	636093	636098	0 %	0 %	50 %	50 %	99080435
11490	NC_008044	CTC	2	6	636116	636121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080435
11491	NC_008044	GCC	2	6	636243	636248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080435
11492	NC_008044	CGA	2	6	636327	636332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080435
11493	NC_008044	CGC	2	6	636334	636339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080435
11494	NC_008044	CG	3	6	636361	636366	0 %	0 %	50 %	50 %	99080435
11495	NC_008044	GGCGC	2	10	636414	636423	0 %	0 %	60 %	40 %	99080435
11496	NC_008044	GGC	2	6	636449	636454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080435
11497	NC_008044	GA	3	6	636504	636509	50 %	0 %	50 %	0 %	99080435
11498	NC_008044	GC	3	6	636577	636582	0 %	0 %	50 %	50 %	99080435
11499	NC_008044	GCT	2	6	636709	636714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080436
11500	NC_008044	GTC	2	6	636761	636766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080436

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