MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 58485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_008044	CCG	2	6	549485	549490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080364
10002	NC_008044	CCA	3	9	549563	549571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080364
10003	NC_008044	TGA	2	6	549572	549577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080364
10004	NC_008044	GCA	2	6	549596	549601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080364
10005	NC_008044	TCG	2	6	549613	549618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080364
10006	NC_008044	CA	3	6	549637	549642	50 %	0 %	0 %	50 %	99080364
10007	NC_008044	CTG	2	6	549696	549701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080364
10008	NC_008044	ACC	2	6	549733	549738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080364
10009	NC_008044	GAA	2	6	549741	549746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080364
10010	NC_008044	ACC	2	6	549793	549798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080364
10011	NC_008044	GC	3	6	549825	549830	0 %	0 %	50 %	50 %	99080364
10012	NC_008044	ATC	3	9	549862	549870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080364
10013	NC_008044	GCG	2	6	549931	549936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080364
10014	NC_008044	GCCG	2	8	549978	549985	0 %	0 %	50 %	50 %	99080364
10015	NC_008044	AG	3	6	550061	550066	50 %	0 %	50 %	0 %	99080365
10016	NC_008044	ATC	2	6	550095	550100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080365
10017	NC_008044	AGGC	2	8	550116	550123	25 %	0 %	50 %	25 %	99080365
10018	NC_008044	GCC	2	6	550174	550179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080365
10019	NC_008044	GTA	2	6	550196	550201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080365
10020	NC_008044	CATC	2	8	550210	550217	25 %	25 %	0 %	50 %	99080365
10021	NC_008044	GAG	2	6	550266	550271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080365
10022	NC_008044	GGCGCG	2	12	550332	550343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080365
10023	NC_008044	CAC	2	6	550352	550357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080365
10024	NC_008044	GCC	2	6	550371	550376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080365
10025	NC_008044	CAG	2	6	550388	550393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080365
10026	NC_008044	CG	3	6	550407	550412	0 %	0 %	50 %	50 %	99080365
10027	NC_008044	GCG	2	6	550459	550464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080365
10028	NC_008044	CCG	2	6	550465	550470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080365
10029	NC_008044	GAT	2	6	550490	550495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080365
10030	NC_008044	GAA	2	6	550523	550528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080365
10031	NC_008044	CGC	2	6	550529	550534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080365
10032	NC_008044	CA	3	6	550602	550607	50 %	0 %	0 %	50 %	99080365
10033	NC_008044	CG	3	6	550609	550614	0 %	0 %	50 %	50 %	99080365
10034	NC_008044	GCC	2	6	550635	550640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080365
10035	NC_008044	GCCCA	2	10	550814	550823	20 %	0 %	20 %	60 %	99080365
10036	NC_008044	AGCCC	2	10	550825	550834	20 %	0 %	20 %	60 %	99080365
10037	NC_008044	CTT	2	6	550891	550896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080365
10038	NC_008044	AGC	2	6	551034	551039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080365
10039	NC_008044	CCA	2	6	551041	551046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080365
10040	NC_008044	GTC	2	6	551076	551081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080365
10041	NC_008044	GCA	2	6	551094	551099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080365
10042	NC_008044	CCG	2	6	551107	551112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080365
10043	NC_008044	GC	3	6	551218	551223	0 %	0 %	50 %	50 %	99080365
10044	NC_008044	GGC	2	6	551270	551275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080365
10045	NC_008044	CACC	2	8	551313	551320	25 %	0 %	0 %	75 %	99080366
10046	NC_008044	ATC	2	6	551321	551326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080366
10047	NC_008044	CCA	2	6	551334	551339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080366
10048	NC_008044	CGTTC	2	10	551392	551401	0 %	40 %	20 %	40 %	99080366
10049	NC_008044	CCT	2	6	551517	551522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99080366
10050	NC_008044	GGT	2	6	551548	551553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080366
10051	NC_008044	CG	4	8	551556	551563	0 %	0 %	50 %	50 %	99080366
10052	NC_008044	GTGA	2	8	551582	551589	25 %	25 %	50 %	0 %	99080366
10053	NC_008044	GGT	3	9	551677	551685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080366
10054	NC_008044	GC	5	10	551710	551719	0 %	0 %	50 %	50 %	99080366
10055	NC_008044	GCA	2	6	551814	551819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080366
10056	NC_008044	GTG	2	6	551846	551851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080366
10057	NC_008044	CGC	2	6	551923	551928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080366
10058	NC_008044	T	6	6	551963	551968	0 %	100 %	0 %	0 %	99080366
10059	NC_008044	AGA	2	6	552170	552175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080366
10060	NC_008044	GT	3	6	552345	552350	0 %	50 %	50 %	0 %	99080367
10061	NC_008044	GTC	2	6	552360	552365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080367
10062	NC_008044	AGGGC	2	10	552404	552413	20 %	0 %	60 %	20 %	99080367
10063	NC_008044	CTG	2	6	552453	552458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080367
10064	NC_008044	GGC	2	6	552564	552569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080367
10065	NC_008044	GC	3	6	552640	552645	0 %	0 %	50 %	50 %	99080367
10066	NC_008044	TGC	2	6	552668	552673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080367
10067	NC_008044	CCG	2	6	552722	552727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080367
10068	NC_008044	ATGTC	2	10	552854	552863	20 %	40 %	20 %	20 %	99080367
10069	NC_008044	GCA	2	6	552900	552905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080367
10070	NC_008044	GAC	2	6	553024	553029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080367
10071	NC_008044	TC	3	6	553064	553069	0 %	50 %	0 %	50 %	99080367
10072	NC_008044	GCG	2	6	553092	553097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080367
10073	NC_008044	GCTT	2	8	553762	553769	0 %	50 %	25 %	25 %	99080368
10074	NC_008044	CAG	2	6	553815	553820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99080368
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10077	NC_008044	GTG	2	6	554029	554034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080368
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10080	NC_008044	CT	3	6	554182	554187	0 %	50 %	0 %	50 %	99080368
10081	NC_008044	CGG	2	6	554245	554250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080368
10082	NC_008044	GCC	2	6	554328	554333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080368
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10086	NC_008044	GC	3	6	554690	554695	0 %	0 %	50 %	50 %	99080369
10087	NC_008044	CG	3	6	554744	554749	0 %	0 %	50 %	50 %	99080369
10088	NC_008044	CGG	2	6	554776	554781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080369
10089	NC_008044	TCA	2	6	554943	554948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080369
10090	NC_008044	CAC	2	6	554957	554962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080369
10091	NC_008044	TGA	2	6	555016	555021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99080369
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10093	NC_008044	TCG	2	6	555135	555140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080369
10094	NC_008044	TCT	2	6	555202	555207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080369
10095	NC_008044	TTC	2	6	555240	555245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99080369
10096	NC_008044	GCG	2	6	555275	555280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080369
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10098	NC_008044	GC	3	6	555313	555318	0 %	0 %	50 %	50 %	99080369
10099	NC_008044	GTC	2	6	555446	555451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080369
10100	NC_008044	GCC	2	6	555545	555550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99080369
10101	NC_008044	GAG	3	9	555579	555587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080369
10102	NC_008044	GC	3	6	555603	555608	0 %	0 %	50 %	50 %	99080369
10103	NC_008044	CCA	2	6	555667	555672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080369
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10105	NC_008044	C	6	6	555748	555753	0 %	0 %	0 %	100 %	99080370
10106	NC_008044	TCG	2	6	555773	555778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080370
10107	NC_008044	CAA	2	6	555861	555866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99080370
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10109	NC_008044	CGAC	2	8	555960	555967	25 %	0 %	25 %	50 %	99080370
10110	NC_008044	GC	3	6	555985	555990	0 %	0 %	50 %	50 %	99080370
10111	NC_008044	CG	3	6	556059	556064	0 %	0 %	50 %	50 %	99080370
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10113	NC_008044	CG	3	6	556221	556226	0 %	0 %	50 %	50 %	99080370
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10117	NC_008044	GAGCG	2	10	556573	556582	20 %	0 %	60 %	20 %	99080370
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10123	NC_008044	CCGC	2	8	556852	556859	0 %	0 %	25 %	75 %	99080370
10124	NC_008044	TGG	2	6	556863	556868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99080370
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10126	NC_008044	CCA	2	6	556973	556978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99080370
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10132	NC_008044	TCTG	2	8	557382	557389	0 %	50 %	25 %	25 %	99080370
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10139	NC_008044	TCA	2	6	557700	557705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99080370
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10155	NC_008044	AG	3	6	558376	558381	50 %	0 %	50 %	0 %	99080371
10156	NC_008044	GCG	2	6	558382	558387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080371
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10161	NC_008044	GGC	2	6	558684	558689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080371
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10226	NC_008044	AATGT	2	10	562126	562135	40 %	40 %	20 %	0 %	99080372
10227	NC_008044	CCGCG	2	10	562147	562156	0 %	0 %	40 %	60 %	99080372
10228	NC_008044	AT	3	6	562282	562287	50 %	50 %	0 %	0 %	99080372
10229	NC_008044	TGCTCA	2	12	562295	562306	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	99080372
10230	NC_008044	CG	3	6	563047	563052	0 %	0 %	50 %	50 %	99080373
10231	NC_008044	GGA	2	6	563249	563254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99080373
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10234	NC_008044	GGCG	2	8	563414	563421	0 %	0 %	75 %	25 %	99080373
10235	NC_008044	GAA	3	9	563490	563498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99080373
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10241	NC_008044	GCT	2	6	563828	563833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99080373
10242	NC_008044	CGAA	2	8	563914	563921	50 %	0 %	25 %	25 %	99080373
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10490	NC_008044	T	6	6	579048	579053	0 %	100 %	0 %	0 %	99080386
10491	NC_008044	GCG	2	6	579088	579093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99080386
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