MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 58485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52238	NC_008044	TCGA	2	8	2856512	2856519	25 %	25 %	25 %	25 %	99082552
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52242	NC_008044	TTC	3	9	2856751	2856759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99082552
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52352	NC_008044	GTG	2	6	2861921	2861926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082556
52353	NC_008044	CCA	2	6	2861932	2861937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99082556
52354	NC_008044	CAT	3	9	2861951	2861959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082556
52355	NC_008044	CGC	2	6	2862084	2862089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082557
52356	NC_008044	GGT	2	6	2862103	2862108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082557
52357	NC_008044	TCG	2	6	2862150	2862155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082557
52358	NC_008044	CG	3	6	2862188	2862193	0 %	0 %	50 %	50 %	99082557
52359	NC_008044	GC	3	6	2862300	2862305	0 %	0 %	50 %	50 %	99082557
52360	NC_008044	GAT	2	6	2862313	2862318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082557
52361	NC_008044	TGA	2	6	2862351	2862356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082557
52362	NC_008044	TGC	2	6	2862438	2862443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082557
52363	NC_008044	GTG	2	6	2862473	2862478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082557
52364	NC_008044	GGT	2	6	2862503	2862508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082557
52365	NC_008044	CAT	2	6	2862520	2862525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082557
52366	NC_008044	ATG	2	6	2862533	2862538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082557
52367	NC_008044	CTG	2	6	2862557	2862562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082557
52368	NC_008044	CGA	2	6	2862625	2862630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082557
52369	NC_008044	CTGATC	2	12	2862656	2862667	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	99082557
52370	NC_008044	TGG	2	6	2862684	2862689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082557
52371	NC_008044	GCTGC	2	10	2862741	2862750	0 %	20 %	40 %	40 %	99082557
52372	NC_008044	CTG	2	6	2862791	2862796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082557
52373	NC_008044	GCG	2	6	2862797	2862802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082557
52374	NC_008044	AGA	2	6	2862814	2862819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99082557
52375	NC_008044	CG	3	6	2862822	2862827	0 %	0 %	50 %	50 %	99082557
52376	NC_008044	GGT	2	6	2862918	2862923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99082558
52377	NC_008044	GAGC	2	8	2863167	2863174	25 %	0 %	50 %	25 %	99082558
52378	NC_008044	TGGGC	2	10	2863188	2863197	0 %	20 %	60 %	20 %	99082558
52379	NC_008044	CGC	2	6	2863227	2863232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082558
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52381	NC_008044	CGGG	2	8	2863280	2863287	0 %	0 %	75 %	25 %	99082558
52382	NC_008044	GC	4	8	2863309	2863316	0 %	0 %	50 %	50 %	99082558
52383	NC_008044	TGA	2	6	2863347	2863352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082558
52384	NC_008044	A	6	6	2863405	2863410	100 %	0 %	0 %	0 %	99082558
52385	NC_008044	CGC	2	6	2863414	2863419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99082558
52386	NC_008044	CCTG	2	8	2863455	2863462	0 %	25 %	25 %	50 %	99082558
52387	NC_008044	TGA	2	6	2863493	2863498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082558
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52391	NC_008044	CA	3	6	2863633	2863638	50 %	0 %	0 %	50 %	99082559
52392	NC_008044	GC	3	6	2863639	2863644	0 %	0 %	50 %	50 %	99082559
52393	NC_008044	CCA	2	6	2863673	2863678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99082559
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52420	NC_008044	GAT	2	6	2865571	2865576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082562
52421	NC_008044	TGC	2	6	2865599	2865604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082562
52422	NC_008044	TCG	2	6	2865608	2865613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082562
52423	NC_008044	CAGA	2	8	2865648	2865655	50 %	0 %	25 %	25 %	99082562
52424	NC_008044	TGC	2	6	2865746	2865751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082562
52425	NC_008044	GCT	2	6	2865802	2865807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082562
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52430	NC_008044	GCCTG	2	10	2866004	2866013	0 %	20 %	40 %	40 %	99082562
52431	NC_008044	GACA	2	8	2866343	2866350	50 %	0 %	25 %	25 %	99082563
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52443	NC_008044	TGC	2	6	2866710	2866715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99082563
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52449	NC_008044	CGCA	2	8	2866945	2866952	25 %	0 %	25 %	50 %	99082564
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52451	NC_008044	CG	3	6	2866990	2866995	0 %	0 %	50 %	50 %	99082564
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52457	NC_008044	GCG	2	6	2867342	2867347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082564
52458	NC_008044	ACT	2	6	2867357	2867362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082564
52459	NC_008044	TGGC	2	8	2867435	2867442	0 %	25 %	50 %	25 %	99082564
52460	NC_008044	TCAT	2	8	2867507	2867514	25 %	50 %	0 %	25 %	99082564
52461	NC_008044	GA	3	6	2867597	2867602	50 %	0 %	50 %	0 %	99082564
52462	NC_008044	GC	3	6	2867620	2867625	0 %	0 %	50 %	50 %	99082564
52463	NC_008044	CT	3	6	2867660	2867665	0 %	50 %	0 %	50 %	99082564
52464	NC_008044	GC	3	6	2867816	2867821	0 %	0 %	50 %	50 %	99082564
52465	NC_008044	T	7	7	2867831	2867837	0 %	100 %	0 %	0 %	99082564
52466	NC_008044	ATC	2	6	2867903	2867908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082564
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52469	NC_008044	CAC	2	6	2868118	2868123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99082564
52470	NC_008044	CAT	2	6	2868156	2868161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99082564
52471	NC_008044	GCG	3	9	2868199	2868207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99082564
52472	NC_008044	TCT	2	6	2868300	2868305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99082564
52473	NC_008044	ACC	2	6	2868343	2868348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99082564
52474	NC_008044	GAC	2	6	2868504	2868509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082564
52475	NC_008044	GGAC	2	8	2868516	2868523	25 %	0 %	50 %	25 %	99082564
52476	NC_008044	TGA	2	6	2868533	2868538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082564
52477	NC_008044	CCA	2	6	2868548	2868553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99082564
52478	NC_008044	ATG	2	6	2868554	2868559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99082564
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52481	NC_008044	CAG	2	6	2868965	2868970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99082565
52482	NC_008044	C	6	6	2868981	2868986	0 %	0 %	0 %	100 %	99082565
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