MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 14281

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008043	TCA	2	6	229068	229073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078208
4002	NC_008043	CTG	2	6	229176	229181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078208
4003	NC_008043	CGA	2	6	229210	229215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078208
4004	NC_008043	CTT	2	6	229334	229339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078208
4005	NC_008043	AACA	2	8	229377	229384	75 %	0 %	0 %	25 %	99078208
4006	NC_008043	ATG	2	6	229407	229412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078208
4007	NC_008043	CAG	2	6	229448	229453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078208
4008	NC_008043	CCG	2	6	229467	229472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078208
4009	NC_008043	GGCG	2	8	229498	229505	0 %	0 %	75 %	25 %	99078208
4010	NC_008043	GAC	2	6	229616	229621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078208
4011	NC_008043	GTG	2	6	229626	229631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078208
4012	NC_008043	CTA	2	6	229633	229638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078208
4013	NC_008043	GACA	2	8	229840	229847	50 %	0 %	25 %	25 %	99078208
4014	NC_008043	TGG	2	6	229871	229876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078208
4015	NC_008043	GCACAC	2	12	229888	229899	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	99078208
4016	NC_008043	ATG	2	6	229919	229924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078208
4017	NC_008043	GCC	2	6	229931	229936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078208
4018	NC_008043	CAA	2	6	229990	229995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078208
4019	NC_008043	GCGCA	2	10	230000	230009	20 %	0 %	40 %	40 %	99078208
4020	NC_008043	GGCA	2	8	230062	230069	25 %	0 %	50 %	25 %	99078208
4021	NC_008043	GTC	2	6	230120	230125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078208
4022	NC_008043	CGA	2	6	230143	230148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078208
4023	NC_008043	ATGCG	2	10	230256	230265	20 %	20 %	40 %	20 %	99078208
4024	NC_008043	TGG	2	6	230284	230289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078208
4025	NC_008043	CTG	2	6	230373	230378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078208
4026	NC_008043	ACCG	2	8	230383	230390	25 %	0 %	25 %	50 %	99078208
4027	NC_008043	ACA	2	6	230797	230802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078209
4028	NC_008043	CG	3	6	230828	230833	0 %	0 %	50 %	50 %	99078209
4029	NC_008043	GC	3	6	230843	230848	0 %	0 %	50 %	50 %	99078209
4030	NC_008043	CAT	2	6	230906	230911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078209
4031	NC_008043	GCGCA	2	10	230986	230995	20 %	0 %	40 %	40 %	99078209
4032	NC_008043	GC	3	6	231002	231007	0 %	0 %	50 %	50 %	99078209
4033	NC_008043	ATC	3	9	231051	231059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078209
4034	NC_008043	ACC	2	6	231081	231086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078209
4035	NC_008043	AGA	2	6	231087	231092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078209
4036	NC_008043	TGT	2	6	231104	231109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078209
4037	NC_008043	CCG	2	6	231187	231192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078209
4038	NC_008043	CCA	2	6	231212	231217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078209
4039	NC_008043	CCG	2	6	231241	231246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078209
4040	NC_008043	A	6	6	231261	231266	100 %	0 %	0 %	0 %	99078209
4041	NC_008043	GCA	2	6	231284	231289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078209
4042	NC_008043	TCG	2	6	231313	231318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078209
4043	NC_008043	CT	3	6	231335	231340	0 %	50 %	0 %	50 %	99078209
4044	NC_008043	GAG	2	6	231522	231527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99078209
4045	NC_008043	TTGC	2	8	231582	231589	0 %	50 %	25 %	25 %	99078209
4046	NC_008043	CGT	2	6	231664	231669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078209
4047	NC_008043	AGG	2	6	231691	231696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99078209
4048	NC_008043	TGCGCT	2	12	231806	231817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078209
4049	NC_008043	CCG	2	6	231916	231921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078209
4050	NC_008043	CCG	2	6	231931	231936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078209
4051	NC_008043	GC	3	6	231968	231973	0 %	0 %	50 %	50 %	99078209
4052	NC_008043	GCA	2	6	232013	232018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078209
4053	NC_008043	GAT	2	6	232044	232049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078209
4054	NC_008043	CCG	2	6	232058	232063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078209
4055	NC_008043	CG	4	8	232208	232215	0 %	0 %	50 %	50 %	99078209
4056	NC_008043	GTGG	2	8	232216	232223	0 %	25 %	75 %	0 %	99078209
4057	NC_008043	GCC	2	6	232259	232264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078209
4058	NC_008043	GAG	2	6	232321	232326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99078209
4059	NC_008043	CGA	2	6	232334	232339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078209
4060	NC_008043	GC	3	6	232374	232379	0 %	0 %	50 %	50 %	99078209
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4062	NC_008043	CGC	2	6	232468	232473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078209
4063	NC_008043	GC	3	6	232515	232520	0 %	0 %	50 %	50 %	99078209
4064	NC_008043	GCCC	2	8	232550	232557	0 %	0 %	25 %	75 %	99078209
4065	NC_008043	C	7	7	232555	232561	0 %	0 %	0 %	100 %	99078209
4066	NC_008043	ACG	2	6	232567	232572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078209
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4068	NC_008043	CG	3	6	232649	232654	0 %	0 %	50 %	50 %	99078209
4069	NC_008043	CG	3	6	232687	232692	0 %	0 %	50 %	50 %	99078209
4070	NC_008043	CTG	2	6	232737	232742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078209
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4085	NC_008043	CG	3	6	233608	233613	0 %	0 %	50 %	50 %	99078210
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4089	NC_008043	GATC	2	8	233770	233777	25 %	25 %	25 %	25 %	99078210
4090	NC_008043	GCG	2	6	233794	233799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078210
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4094	NC_008043	TGCA	2	8	233952	233959	25 %	25 %	25 %	25 %	99078210
4095	NC_008043	TCA	2	6	234210	234215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078211
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4102	NC_008043	TGCAG	2	10	234487	234496	20 %	20 %	40 %	20 %	99078211
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4105	NC_008043	GCCGT	2	10	234593	234602	0 %	20 %	40 %	40 %	99078211
4106	NC_008043	CG	3	6	234750	234755	0 %	0 %	50 %	50 %	99078211
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4111	NC_008043	GC	4	8	235513	235520	0 %	0 %	50 %	50 %	99078212
4112	NC_008043	CGC	3	9	235518	235526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078212
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4124	NC_008043	CGC	2	6	235976	235981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078212
4125	NC_008043	AG	3	6	236083	236088	50 %	0 %	50 %	0 %	99078213
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4128	NC_008043	TGT	2	6	236274	236279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078213
4129	NC_008043	GGT	2	6	236327	236332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078213
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4131	NC_008043	ATC	3	9	236414	236422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078213
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4133	NC_008043	ATC	2	6	236453	236458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078213
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4244	NC_008043	GAT	2	6	244381	244386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078220
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4248	NC_008043	GAC	2	6	244741	244746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078220
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4494	NC_008043	AG	3	6	258575	258580	50 %	0 %	50 %	0 %	99078235
4495	NC_008043	ATC	2	6	258603	258608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078235
4496	NC_008043	CCA	2	6	258613	258618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078235
4497	NC_008043	ATC	2	6	258633	258638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078235
4498	NC_008043	AGA	2	6	258685	258690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078235
4499	NC_008043	TTGC	2	8	258696	258703	0 %	50 %	25 %	25 %	99078235
4500	NC_008043	TGC	2	6	258782	258787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078235

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