MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 14281

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008043	GTC	2	6	165298	165303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078157
3002	NC_008043	TCG	2	6	165311	165316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078157
3003	NC_008043	GC	3	6	165345	165350	0 %	0 %	50 %	50 %	99078157
3004	NC_008043	TGC	2	6	165548	165553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078158
3005	NC_008043	CAGA	2	8	165628	165635	50 %	0 %	25 %	25 %	99078158
3006	NC_008043	CAT	2	6	165636	165641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078158
3007	NC_008043	CGA	2	6	165687	165692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078158
3008	NC_008043	ACA	2	6	165743	165748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078158
3009	NC_008043	GCA	2	6	165762	165767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078158
3010	NC_008043	GCG	2	6	165780	165785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078158
3011	NC_008043	TCG	2	6	165789	165794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078158
3012	NC_008043	CG	3	6	165793	165798	0 %	0 %	50 %	50 %	99078158
3013	NC_008043	TCT	2	6	165824	165829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078158
3014	NC_008043	GAT	2	6	165952	165957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078158
3015	NC_008043	ATG	2	6	165976	165981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078158
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3017	NC_008043	GGC	2	6	166247	166252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078159
3018	NC_008043	GC	4	8	166277	166284	0 %	0 %	50 %	50 %	99078159
3019	NC_008043	CG	3	6	166375	166380	0 %	0 %	50 %	50 %	99078159
3020	NC_008043	GCA	2	6	166390	166395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078159
3021	NC_008043	GAC	2	6	166452	166457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078159
3022	NC_008043	GCA	2	6	166524	166529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078159
3023	NC_008043	CAA	2	6	166552	166557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078159
3024	NC_008043	CAGG	2	8	166582	166589	25 %	0 %	50 %	25 %	99078159
3025	NC_008043	CGC	2	6	166594	166599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078159
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3030	NC_008043	GC	3	6	166829	166834	0 %	0 %	50 %	50 %	99078159
3031	NC_008043	GT	3	6	167173	167178	0 %	50 %	50 %	0 %	99078160
3032	NC_008043	GCC	3	9	167270	167278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078160
3033	NC_008043	TCA	2	6	167389	167394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078160
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3036	NC_008043	CTGG	2	8	167663	167670	0 %	25 %	50 %	25 %	99078160
3037	NC_008043	GA	3	6	167718	167723	50 %	0 %	50 %	0 %	99078160
3038	NC_008043	CGCC	2	8	167770	167777	0 %	0 %	25 %	75 %	99078160
3039	NC_008043	CAT	2	6	167842	167847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078160
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3045	NC_008043	GCCA	2	8	168258	168265	25 %	0 %	25 %	50 %	99078161
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3050	NC_008043	TGC	2	6	168452	168457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078161
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3052	NC_008043	TGC	2	6	168566	168571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078161
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3054	NC_008043	CAT	2	6	168596	168601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078161
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3057	NC_008043	GCC	3	9	168936	168944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078161
3058	NC_008043	GCAG	2	8	168948	168955	25 %	0 %	50 %	25 %	99078161
3059	NC_008043	GCA	2	6	168965	168970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078161
3060	NC_008043	CAT	2	6	168978	168983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078161
3061	NC_008043	T	6	6	168987	168992	0 %	100 %	0 %	0 %	99078161
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3063	NC_008043	GC	3	6	169077	169082	0 %	0 %	50 %	50 %	99078161
3064	NC_008043	CTCAGC	2	12	169271	169282	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	99078162
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3067	NC_008043	CTCA	2	8	169350	169357	25 %	25 %	0 %	50 %	99078162
3068	NC_008043	TTG	2	6	169399	169404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078162
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3070	NC_008043	CCCG	2	8	169415	169422	0 %	0 %	25 %	75 %	99078162
3071	NC_008043	GAC	2	6	169464	169469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078162
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3074	NC_008043	GCG	2	6	169526	169531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078162
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3099	NC_008043	GC	3	6	170874	170879	0 %	0 %	50 %	50 %	99078163
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3107	NC_008043	CAT	2	6	171459	171464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078164
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3109	NC_008043	CAT	2	6	171509	171514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078164
3110	NC_008043	CCCA	2	8	171519	171526	25 %	0 %	0 %	75 %	99078164
3111	NC_008043	GCTG	2	8	171634	171641	0 %	25 %	50 %	25 %	99078164
3112	NC_008043	GC	3	6	171728	171733	0 %	0 %	50 %	50 %	99078164
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3114	NC_008043	CTCCG	2	10	171876	171885	0 %	20 %	20 %	60 %	99078164
3115	NC_008043	C	6	6	171920	171925	0 %	0 %	0 %	100 %	99078164
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3122	NC_008043	CT	3	6	172376	172381	0 %	50 %	0 %	50 %	99078165
3123	NC_008043	GCC	2	6	172434	172439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078165
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3496	NC_008043	TTG	2	6	201285	201290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078184
3497	NC_008043	CT	3	6	201291	201296	0 %	50 %	0 %	50 %	99078184
3498	NC_008043	CGT	2	6	201320	201325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078184
3499	NC_008043	GCG	2	6	201420	201425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078184
3500	NC_008043	TCC	2	6	201450	201455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99078184

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