MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 14281

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13003	NC_008043	CGA	2	6	749992	749997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078659
13004	NC_008043	GAT	2	6	750025	750030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078659
13005	NC_008043	CG	3	6	750041	750046	0 %	0 %	50 %	50 %	99078659
13006	NC_008043	CAA	2	6	750137	750142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078659
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13008	NC_008043	ATG	2	6	750368	750373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078660
13009	NC_008043	CGG	2	6	750428	750433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078660
13010	NC_008043	GC	3	6	750447	750452	0 %	0 %	50 %	50 %	99078660
13011	NC_008043	CGC	2	6	750487	750492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078660
13012	NC_008043	GGC	2	6	750513	750518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078660
13013	NC_008043	GCC	2	6	750525	750530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078660
13014	NC_008043	GC	3	6	750580	750585	0 %	0 %	50 %	50 %	99078660
13015	NC_008043	CGG	2	6	750680	750685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078660
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13017	NC_008043	GATCT	2	10	750769	750778	20 %	40 %	20 %	20 %	99078660
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13019	NC_008043	ATG	2	6	750853	750858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078660
13020	NC_008043	TGG	2	6	750872	750877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078660
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13022	NC_008043	CGC	2	6	750903	750908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078660
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13025	NC_008043	TGAT	2	8	751052	751059	25 %	50 %	25 %	0 %	99078660
13026	NC_008043	TGCG	2	8	751064	751071	0 %	25 %	50 %	25 %	99078660
13027	NC_008043	TGC	2	6	751085	751090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078660
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13032	NC_008043	GCGCA	2	10	751294	751303	20 %	0 %	40 %	40 %	99078660
13033	NC_008043	TCTGCG	2	12	751320	751331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078660
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13040	NC_008043	TAC	2	6	751668	751673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078661
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13043	NC_008043	GCC	2	6	751791	751796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078661
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13045	NC_008043	TGC	2	6	751921	751926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078661
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13051	NC_008043	GC	5	10	752344	752353	0 %	0 %	50 %	50 %	99078661
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13057	NC_008043	ACC	2	6	752440	752445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078661
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13070	NC_008043	GCCCC	2	10	752985	752994	0 %	0 %	20 %	80 %	99078662
13071	NC_008043	CG	3	6	753083	753088	0 %	0 %	50 %	50 %	99078662
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13103	NC_008043	TGC	2	6	754697	754702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078664
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13105	NC_008043	TGG	2	6	754834	754839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078664
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13107	NC_008043	CAG	2	6	754866	754871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078664
13108	NC_008043	CAT	2	6	754902	754907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078664
13109	NC_008043	TGC	2	6	754948	754953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078664
13110	NC_008043	TGAG	2	8	755007	755014	25 %	25 %	50 %	0 %	99078664
13111	NC_008043	TGC	2	6	755029	755034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078665
13112	NC_008043	GCC	2	6	755035	755040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078665
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13118	NC_008043	CGGG	2	8	755386	755393	0 %	0 %	75 %	25 %	99078665
13119	NC_008043	CG	3	6	755894	755899	0 %	0 %	50 %	50 %	99078666
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13121	NC_008043	GC	3	6	755915	755920	0 %	0 %	50 %	50 %	99078666
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13246	NC_008043	GCA	2	6	761524	761529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078672
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13488	NC_008043	ACC	2	6	775005	775010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078686
13489	NC_008043	A	6	6	775053	775058	100 %	0 %	0 %	0 %	99078686
13490	NC_008043	AAG	2	6	775139	775144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078686
13491	NC_008043	CTGG	2	8	775202	775209	0 %	25 %	50 %	25 %	99078686
13492	NC_008043	CCG	2	6	775253	775258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078686
13493	NC_008043	GCA	2	6	775399	775404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078687
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13495	NC_008043	AGA	2	6	775424	775429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078687
13496	NC_008043	GAT	2	6	775449	775454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078687
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13498	NC_008043	GTC	2	6	775572	775577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078687
13499	NC_008043	GTC	2	6	775602	775607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078687
13500	NC_008043	GGCAG	2	10	775610	775619	20 %	0 %	60 %	20 %	99078687

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