MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 14281

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_008043	CG	3	6	640414	640419	0 %	0 %	50 %	50 %	99078562
11002	NC_008043	TGA	2	6	640456	640461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078562
11003	NC_008043	CGGG	2	8	640463	640470	0 %	0 %	75 %	25 %	99078562
11004	NC_008043	A	6	6	640582	640587	100 %	0 %	0 %	0 %	99078562
11005	NC_008043	GCGG	2	8	640589	640596	0 %	0 %	75 %	25 %	99078562
11006	NC_008043	GC	3	6	640683	640688	0 %	0 %	50 %	50 %	99078562
11007	NC_008043	TGA	2	6	640729	640734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078563
11008	NC_008043	C	6	6	640764	640769	0 %	0 %	0 %	100 %	99078563
11009	NC_008043	CAT	2	6	640850	640855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078563
11010	NC_008043	CG	3	6	640875	640880	0 %	0 %	50 %	50 %	99078563
11011	NC_008043	CTG	2	6	640922	640927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078563
11012	NC_008043	GGA	2	6	640942	640947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99078563
11013	NC_008043	CCG	2	6	640970	640975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078563
11014	NC_008043	ATC	2	6	641001	641006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078563
11015	NC_008043	GGC	2	6	641047	641052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078563
11016	NC_008043	TCT	2	6	641141	641146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078563
11017	NC_008043	GAG	2	6	641231	641236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99078563
11018	NC_008043	CCGC	3	12	641237	641248	0 %	0 %	25 %	75 %	99078563
11019	NC_008043	TTG	2	6	641258	641263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078563
11020	NC_008043	TGC	2	6	641286	641291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078563
11021	NC_008043	GAT	2	6	641387	641392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078563
11022	NC_008043	GCG	2	6	641405	641410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078563
11023	NC_008043	GCT	2	6	641443	641448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078563
11024	NC_008043	AGC	2	6	641545	641550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078563
11025	NC_008043	CG	3	6	641551	641556	0 %	0 %	50 %	50 %	99078563
11026	NC_008043	TGG	2	6	641557	641562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078563
11027	NC_008043	TGC	2	6	641601	641606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078563
11028	NC_008043	GC	4	8	641711	641718	0 %	0 %	50 %	50 %	99078563
11029	NC_008043	GCG	2	6	641786	641791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078563
11030	NC_008043	GAC	2	6	641902	641907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078564
11031	NC_008043	GC	4	8	641978	641985	0 %	0 %	50 %	50 %	99078564
11032	NC_008043	AGGC	2	8	641991	641998	25 %	0 %	50 %	25 %	99078564
11033	NC_008043	GCC	2	6	642041	642046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078564
11034	NC_008043	GTGC	2	8	642047	642054	0 %	25 %	50 %	25 %	99078564
11035	NC_008043	CGC	2	6	642085	642090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078564
11036	NC_008043	GCA	2	6	642157	642162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078564
11037	NC_008043	GGC	2	6	642259	642264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078564
11038	NC_008043	TTA	2	6	642285	642290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99078564
11039	NC_008043	TCC	2	6	642383	642388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99078564
11040	NC_008043	TC	3	6	642427	642432	0 %	50 %	0 %	50 %	99078564
11041	NC_008043	TGG	2	6	642510	642515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078564
11042	NC_008043	CCG	2	6	642539	642544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078564
11043	NC_008043	TCC	2	6	642739	642744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99078565
11044	NC_008043	GGC	2	6	642763	642768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078565
11045	NC_008043	CGC	3	9	642808	642816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078565
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11048	NC_008043	CAGT	2	8	642891	642898	25 %	25 %	25 %	25 %	99078565
11049	NC_008043	GGC	2	6	642917	642922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078565
11050	NC_008043	GGT	2	6	642930	642935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078565
11051	NC_008043	CGA	2	6	642972	642977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078565
11052	NC_008043	ACCC	2	8	643097	643104	25 %	0 %	0 %	75 %	99078565
11053	NC_008043	TGG	2	6	643152	643157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078565
11054	NC_008043	GGT	2	6	643266	643271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078565
11055	NC_008043	ATC	2	6	643300	643305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078565
11056	NC_008043	CGC	2	6	643322	643327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078565
11057	NC_008043	GC	4	8	643384	643391	0 %	0 %	50 %	50 %	99078565
11058	NC_008043	ATCAC	2	10	643451	643460	40 %	20 %	0 %	40 %	99078565
11059	NC_008043	ATT	2	6	643493	643498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99078565
11060	NC_008043	GAT	2	6	643536	643541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078566
11061	NC_008043	GTC	2	6	643558	643563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078566
11062	NC_008043	GTC	2	6	643579	643584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078566
11063	NC_008043	CAG	2	6	643621	643626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078566
11064	NC_008043	GCG	2	6	643756	643761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078566
11065	NC_008043	TTC	2	6	643768	643773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078566
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11067	NC_008043	TTG	2	6	643839	643844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078566
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11070	NC_008043	GAT	2	6	644119	644124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078566
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11089	NC_008043	CG	4	8	645616	645623	0 %	0 %	50 %	50 %	99078568
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11092	NC_008043	GCCC	2	8	645909	645916	0 %	0 %	25 %	75 %	99078568
11093	NC_008043	ATG	2	6	645928	645933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078568
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11095	NC_008043	CTG	2	6	646047	646052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078568
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11111	NC_008043	CGGT	2	8	646727	646734	0 %	25 %	50 %	25 %	99078569
11112	NC_008043	GC	3	6	646748	646753	0 %	0 %	50 %	50 %	99078569
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11128	NC_008043	GCC	2	6	647415	647420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078569
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11233	NC_008043	GGT	2	6	653514	653519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078574
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11236	NC_008043	A	7	7	653729	653735	100 %	0 %	0 %	0 %	99078575
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11239	NC_008043	A	6	6	653849	653854	100 %	0 %	0 %	0 %	99078575
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11241	NC_008043	CAT	2	6	654069	654074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078575
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11243	NC_008043	CGTGA	2	10	654256	654265	20 %	20 %	40 %	20 %	99078575
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11364	NC_008043	CTCA	2	8	661360	661367	25 %	25 %	0 %	50 %	99078581
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11489	NC_008043	CGC	2	6	668450	668455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078584
11490	NC_008043	CAA	2	6	668459	668464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078584
11491	NC_008043	ACC	2	6	668472	668477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078584
11492	NC_008043	GCAAGC	2	12	668502	668513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078584
11493	NC_008043	CCA	2	6	668603	668608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078584
11494	NC_008043	GGC	2	6	668627	668632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078584
11495	NC_008043	AAG	2	6	668721	668726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078584
11496	NC_008043	CAAC	2	8	668734	668741	50 %	0 %	0 %	50 %	99078584
11497	NC_008043	CAG	2	6	668831	668836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078584
11498	NC_008043	CAGCGC	2	12	668879	668890	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	99078584
11499	NC_008043	GCG	2	6	668970	668975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078584
11500	NC_008043	GTC	2	6	669020	669025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078584

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