MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 14281

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8502	NC_008043	TCGACC	2	12	484114	484125	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	99078436
8503	NC_008043	TGA	2	6	484223	484228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078436
8504	NC_008043	GCC	2	6	484231	484236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078436
8505	NC_008043	TCG	2	6	484244	484249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078436
8506	NC_008043	ATC	2	6	484258	484263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078436
8507	NC_008043	CCT	2	6	484280	484285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99078436
8508	NC_008043	GTC	2	6	484291	484296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078436
8509	NC_008043	CGC	2	6	484423	484428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078436
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8511	NC_008043	GAG	2	6	484474	484479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99078436
8512	NC_008043	TTG	2	6	484508	484513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078436
8513	NC_008043	TTG	2	6	484523	484528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078436
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8519	NC_008043	GAT	2	6	485187	485192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078437
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8521	NC_008043	GAGC	2	8	485211	485218	25 %	0 %	50 %	25 %	99078437
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8523	NC_008043	CTG	2	6	485257	485262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078437
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8525	NC_008043	TGG	2	6	485309	485314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078437
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8534	NC_008043	CTG	2	6	485805	485810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078438
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8539	NC_008043	GCG	2	6	486054	486059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078438
8540	NC_008043	GCGCTT	2	12	486117	486128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078438
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8543	NC_008043	TCGA	2	8	486273	486280	25 %	25 %	25 %	25 %	99078438
8544	NC_008043	CG	3	6	486288	486293	0 %	0 %	50 %	50 %	99078438
8545	NC_008043	GC	3	6	486341	486346	0 %	0 %	50 %	50 %	99078438
8546	NC_008043	GAT	2	6	486365	486370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078438
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8556	NC_008043	GAC	2	6	486747	486752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078438
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8567	NC_008043	TGC	2	6	487222	487227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078438
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8604	NC_008043	CTG	2	6	488920	488925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078440
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8608	NC_008043	GC	3	6	489083	489088	0 %	0 %	50 %	50 %	99078440
8609	NC_008043	AGC	2	6	489089	489094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078440
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8992	NC_008043	ATC	2	6	516508	516513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078460
8993	NC_008043	TGATC	2	10	516531	516540	20 %	40 %	20 %	20 %	99078460
8994	NC_008043	GGT	2	6	516556	516561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078460
8995	NC_008043	GTC	2	6	516570	516575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078460
8996	NC_008043	GCC	2	6	516643	516648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078460
8997	NC_008043	TCA	2	6	516668	516673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078460
8998	NC_008043	AAG	2	6	516713	516718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078460
8999	NC_008043	G	6	6	516723	516728	0 %	0 %	100 %	0 %	99078460
9000	NC_008043	CGCC	2	8	516763	516770	0 %	0 %	25 %	75 %	99078461

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