MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 14281

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_008043	CAT	2	6	372260	372265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078336
6502	NC_008043	GCA	2	6	372405	372410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078337
6503	NC_008043	CAG	2	6	372426	372431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078337
6504	NC_008043	CTGCG	2	10	372445	372454	0 %	20 %	40 %	40 %	99078337
6505	NC_008043	CATC	2	8	372462	372469	25 %	25 %	0 %	50 %	99078337
6506	NC_008043	TCA	2	6	372495	372500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078337
6507	NC_008043	GCG	2	6	372516	372521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078337
6508	NC_008043	TGC	2	6	372545	372550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078337
6509	NC_008043	TGGT	2	8	372611	372618	0 %	50 %	50 %	0 %	99078337
6510	NC_008043	GTG	2	6	372624	372629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078337
6511	NC_008043	GC	3	6	372689	372694	0 %	0 %	50 %	50 %	99078337
6512	NC_008043	GCGCC	2	10	372723	372732	0 %	0 %	40 %	60 %	99078337
6513	NC_008043	ATG	2	6	372830	372835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078337
6514	NC_008043	GC	4	8	372837	372844	0 %	0 %	50 %	50 %	99078337
6515	NC_008043	GTA	2	6	372853	372858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078337
6516	NC_008043	CGA	2	6	372894	372899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078337
6517	NC_008043	GGT	2	6	373012	373017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078337
6518	NC_008043	GGC	2	6	373110	373115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078337
6519	NC_008043	CAGAT	2	10	373123	373132	40 %	20 %	20 %	20 %	99078337
6520	NC_008043	GCG	2	6	373155	373160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078338
6521	NC_008043	CTT	2	6	373271	373276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078338
6522	NC_008043	CG	3	6	373305	373310	0 %	0 %	50 %	50 %	99078338
6523	NC_008043	TCT	2	6	373319	373324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078338
6524	NC_008043	CAC	2	6	373376	373381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078338
6525	NC_008043	GC	3	6	373393	373398	0 %	0 %	50 %	50 %	99078338
6526	NC_008043	GGTTC	2	10	373415	373424	0 %	40 %	40 %	20 %	99078338
6527	NC_008043	TTC	2	6	373456	373461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078338
6528	NC_008043	TCT	2	6	373682	373687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99078338
6529	NC_008043	GGCCG	2	10	373786	373795	0 %	0 %	60 %	40 %	99078338
6530	NC_008043	GTG	2	6	373801	373806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99078338
6531	NC_008043	CGA	2	6	373877	373882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078338
6532	NC_008043	GAT	2	6	373944	373949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078338
6533	NC_008043	GC	3	6	373998	374003	0 %	0 %	50 %	50 %	99078338
6534	NC_008043	AGA	2	6	374044	374049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078338
6535	NC_008043	CAA	2	6	374081	374086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078338
6536	NC_008043	GAA	2	6	374116	374121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99078338
6537	NC_008043	TGT	2	6	374146	374151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99078338
6538	NC_008043	GCG	2	6	374245	374250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078338
6539	NC_008043	CGG	2	6	374279	374284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078338
6540	NC_008043	T	6	6	374382	374387	0 %	100 %	0 %	0 %	99078339
6541	NC_008043	GCAAG	2	10	374390	374399	40 %	0 %	40 %	20 %	99078339
6542	NC_008043	GCC	2	6	374516	374521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078339
6543	NC_008043	GCC	2	6	374535	374540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078339
6544	NC_008043	GGC	3	9	374694	374702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078339
6545	NC_008043	GAT	2	6	374748	374753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078339
6546	NC_008043	CCG	2	6	374792	374797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078339
6547	NC_008043	CTGG	2	8	374840	374847	0 %	25 %	50 %	25 %	99078339
6548	NC_008043	TC	3	6	374889	374894	0 %	50 %	0 %	50 %	99078339
6549	NC_008043	CTA	2	6	374900	374905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078339
6550	NC_008043	CG	3	6	374957	374962	0 %	0 %	50 %	50 %	99078339
6551	NC_008043	AG	3	6	374981	374986	50 %	0 %	50 %	0 %	99078339
6552	NC_008043	AT	3	6	375017	375022	50 %	50 %	0 %	0 %	99078339
6553	NC_008043	AGG	2	6	375118	375123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99078339
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6555	NC_008043	ATG	2	6	375167	375172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99078340
6556	NC_008043	CGC	2	6	375220	375225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078340
6557	NC_008043	GCAG	2	8	375250	375257	25 %	0 %	50 %	25 %	99078340
6558	NC_008043	GGC	2	6	375259	375264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078340
6559	NC_008043	TCG	2	6	375288	375293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078340
6560	NC_008043	CGA	2	6	375439	375444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078340
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6562	NC_008043	GCC	2	6	375517	375522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078340
6563	NC_008043	GGC	2	6	375560	375565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078340
6564	NC_008043	CGA	2	6	375616	375621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078340
6565	NC_008043	TGC	2	6	375668	375673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078340
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6567	NC_008043	CAT	2	6	375721	375726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99078340
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6569	NC_008043	CGA	2	6	375757	375762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078340
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6571	NC_008043	TCG	2	6	375810	375815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078340
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6587	NC_008043	GCC	2	6	376910	376915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99078341
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6603	NC_008043	GCG	2	6	377742	377747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99078342
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6607	NC_008043	A	6	6	378317	378322	100 %	0 %	0 %	0 %	99078343
6608	NC_008043	GCAAA	2	10	378324	378333	60 %	0 %	20 %	20 %	99078343
6609	NC_008043	GCA	2	6	378343	378348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99078343
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6996	NC_008043	CAC	2	6	398184	398189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99078358
6997	NC_008043	CG	3	6	398237	398242	0 %	0 %	50 %	50 %	99078358
6998	NC_008043	CTG	2	6	398245	398250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99078358
6999	NC_008043	GAAA	2	8	398345	398352	75 %	0 %	25 %	0 %	99078358
7000	NC_008043	ACA	2	6	398416	398421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99078358

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