MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisB5 chromosome

Total Repeats: 114045

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007958	GCC	2	6	173048	173053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974635
4002	NC_007958	CTG	2	6	173131	173136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974635
4003	NC_007958	TCG	2	6	173210	173215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974635
4004	NC_007958	CAG	2	6	173218	173223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974635
4005	NC_007958	AGAA	2	8	173282	173289	75 %	0 %	25 %	0 %	91974635
4006	NC_007958	CGA	2	6	173290	173295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974635
4007	NC_007958	C	6	6	173767	173772	0 %	0 %	0 %	100 %	91974636
4008	NC_007958	GAG	2	6	173928	173933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	91974636
4009	NC_007958	TCC	2	6	173937	173942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	91974636
4010	NC_007958	GAC	2	6	173943	173948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974636
4011	NC_007958	GATCGA	2	12	174038	174049	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	91974636
4012	NC_007958	CGA	2	6	174074	174079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974636
4013	NC_007958	TAC	2	6	174099	174104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974636
4014	NC_007958	ACG	2	6	174130	174135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974636
4015	NC_007958	TGGCGC	2	12	174178	174189	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	91974636
4016	NC_007958	GTG	2	6	174192	174197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974636
4017	NC_007958	GC	3	6	174231	174236	0 %	0 %	50 %	50 %	91974636
4018	NC_007958	TGC	3	9	174256	174264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974636
4019	NC_007958	CGA	2	6	174302	174307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974636
4020	NC_007958	TCG	2	6	174358	174363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974636
4021	NC_007958	GC	3	6	174471	174476	0 %	0 %	50 %	50 %	91974636
4022	NC_007958	CG	3	6	174478	174483	0 %	0 %	50 %	50 %	91974636
4023	NC_007958	GTC	2	6	174492	174497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974636
4024	NC_007958	CGG	2	6	174527	174532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974636
4025	NC_007958	CGG	2	6	174547	174552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974636
4026	NC_007958	GCC	2	6	174561	174566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974636
4027	NC_007958	CGC	2	6	174581	174586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974636
4028	NC_007958	TGC	2	6	174637	174642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974636
4029	NC_007958	GCG	2	6	174652	174657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974636
4030	NC_007958	CCG	3	9	174664	174672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974636
4031	NC_007958	AAG	2	6	174696	174701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91974636
4032	NC_007958	CG	3	6	174704	174709	0 %	0 %	50 %	50 %	91974636
4033	NC_007958	CGG	2	6	175035	175040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974637
4034	NC_007958	CGG	2	6	175085	175090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974637
4035	NC_007958	AGCG	2	8	175123	175130	25 %	0 %	50 %	25 %	91974637
4036	NC_007958	ATC	2	6	175192	175197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974637
4037	NC_007958	GAA	2	6	175209	175214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91974637
4038	NC_007958	GAT	2	6	175260	175265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91974637
4039	NC_007958	TCG	2	6	175273	175278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974637
4040	NC_007958	GCCG	2	8	175286	175293	0 %	0 %	50 %	50 %	91974637
4041	NC_007958	CAC	2	6	175317	175322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91974637
4042	NC_007958	CTG	2	6	175329	175334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974637
4043	NC_007958	CGA	2	6	175340	175345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974637
4044	NC_007958	GGT	2	6	175374	175379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974637
4045	NC_007958	CGA	2	6	175505	175510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974637
4046	NC_007958	CCTT	2	8	175540	175547	0 %	50 %	0 %	50 %	91974637
4047	NC_007958	TCG	2	6	175678	175683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974637
4048	NC_007958	TCG	2	6	175726	175731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974637
4049	NC_007958	CGG	2	6	175778	175783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974637
4050	NC_007958	CGA	2	6	175959	175964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974638
4051	NC_007958	CGGC	2	8	175971	175978	0 %	0 %	50 %	50 %	91974638
4052	NC_007958	GC	3	6	175980	175985	0 %	0 %	50 %	50 %	91974638
4053	NC_007958	CG	4	8	176182	176189	0 %	0 %	50 %	50 %	91974638
4054	NC_007958	CGG	2	6	176196	176201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974638
4055	NC_007958	CGT	2	6	176241	176246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974638
4056	NC_007958	ACC	2	6	176303	176308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91974638
4057	NC_007958	CGG	2	6	176358	176363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974638
4058	NC_007958	CGA	2	6	176451	176456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974638
4059	NC_007958	TCT	2	6	176490	176495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91974638
4060	NC_007958	GCCGAC	2	12	176512	176523	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	91974638
4061	NC_007958	CGG	2	6	176589	176594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974638
4062	NC_007958	CAG	2	6	176623	176628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974638
4063	NC_007958	CG	3	6	176652	176657	0 %	0 %	50 %	50 %	91974638
4064	NC_007958	GAA	2	6	176677	176682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91974638
4065	NC_007958	CAG	2	6	176719	176724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974638
4066	NC_007958	AAC	2	6	176810	176815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91974638
4067	NC_007958	GAT	2	6	176821	176826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91974638
4068	NC_007958	GCC	2	6	176834	176839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974638
4069	NC_007958	CAC	2	6	176843	176848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91974638
4070	NC_007958	ATC	2	6	176909	176914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974638
4071	NC_007958	GCCAGC	2	12	176921	176932	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	91974638
4072	NC_007958	GCA	2	6	176979	176984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974638
4073	NC_007958	CAC	2	6	177004	177009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91974638
4074	NC_007958	ACC	2	6	177044	177049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91974638
4075	NC_007958	GCG	2	6	177066	177071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974638
4076	NC_007958	GC	3	6	177120	177125	0 %	0 %	50 %	50 %	91974638
4077	NC_007958	CGC	3	9	177123	177131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974638
4078	NC_007958	GCG	2	6	177149	177154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974638
4079	NC_007958	CCGA	2	8	177203	177210	25 %	0 %	25 %	50 %	91974638
4080	NC_007958	GCC	2	6	177218	177223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974638
4081	NC_007958	AGC	2	6	177224	177229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974638
4082	NC_007958	GATC	2	8	177249	177256	25 %	25 %	25 %	25 %	91974638
4083	NC_007958	TC	3	6	177489	177494	0 %	50 %	0 %	50 %	91974639
4084	NC_007958	CTG	2	6	177558	177563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974639
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4086	NC_007958	TGC	2	6	177586	177591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974639
4087	NC_007958	CGG	2	6	177635	177640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974639
4088	NC_007958	CGA	2	6	177650	177655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974639
4089	NC_007958	CAC	2	6	177662	177667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91974639
4090	NC_007958	CGG	2	6	177710	177715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974639
4091	NC_007958	CGGC	2	8	177775	177782	0 %	0 %	50 %	50 %	91974639
4092	NC_007958	TGC	2	6	177784	177789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974639
4093	NC_007958	GCT	2	6	177851	177856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974639
4094	NC_007958	CGT	2	6	177866	177871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974639
4095	NC_007958	CGAC	2	8	177877	177884	25 %	0 %	25 %	50 %	91974639
4096	NC_007958	GCC	2	6	177885	177890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974639
4097	NC_007958	CTG	2	6	177900	177905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974639
4098	NC_007958	GCTGCG	2	12	177920	177931	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	91974639
4099	NC_007958	CGG	2	6	178025	178030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974639
4100	NC_007958	CGG	2	6	178100	178105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974639
4101	NC_007958	GTG	2	6	178113	178118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974639
4102	NC_007958	CAC	2	6	178169	178174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91974639
4103	NC_007958	CGC	2	6	178175	178180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974639
4104	NC_007958	TGG	2	6	178183	178188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974639
4105	NC_007958	TGC	2	6	178207	178212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974639
4106	NC_007958	ATC	2	6	178251	178256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974639
4107	NC_007958	CG	3	6	178272	178277	0 %	0 %	50 %	50 %	91974639
4108	NC_007958	GTG	2	6	178287	178292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974639
4109	NC_007958	CGC	2	6	178304	178309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974639
4110	NC_007958	CTGG	2	8	178313	178320	0 %	25 %	50 %	25 %	91974639
4111	NC_007958	CTG	2	6	178350	178355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974639
4112	NC_007958	CGC	2	6	178360	178365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974639
4113	NC_007958	TGA	3	9	178372	178380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91974639
4114	NC_007958	CGG	2	6	178390	178395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974639
4115	NC_007958	TGG	2	6	178399	178404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974639
4116	NC_007958	TGG	2	6	178420	178425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974639
4117	NC_007958	GCGCG	2	10	178508	178517	0 %	0 %	60 %	40 %	91974639
4118	NC_007958	CCTCG	2	10	178529	178538	0 %	20 %	20 %	60 %	91974639
4119	NC_007958	GAT	2	6	178544	178549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91974639
4120	NC_007958	GTG	3	9	178593	178601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974639
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4122	NC_007958	GCT	3	9	178610	178618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974639
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4492	NC_007958	CGG	2	6	194718	194723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974652
4493	NC_007958	CG	3	6	194727	194732	0 %	0 %	50 %	50 %	91974652
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4496	NC_007958	CCAGC	2	10	194815	194824	20 %	0 %	20 %	60 %	91974652
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4500	NC_007958	CCAG	2	8	194904	194911	25 %	0 %	25 %	50 %	91974652

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