MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisB5 chromosome

Total Repeats: 114045

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_007958	TCA	2	6	66763	66768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974536
1502	NC_007958	GCG	2	6	66781	66786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974536
1503	NC_007958	AGCA	2	8	66797	66804	50 %	0 %	25 %	25 %	91974536
1504	NC_007958	CCG	2	6	66805	66810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974536
1505	NC_007958	CGG	2	6	66823	66828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974536
1506	NC_007958	CGG	2	6	66842	66847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974536
1507	NC_007958	CG	3	6	66874	66879	0 %	0 %	50 %	50 %	91974536
1508	NC_007958	CGG	2	6	66883	66888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974536
1509	NC_007958	CAG	3	9	66908	66916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974536
1510	NC_007958	TGGCGT	2	12	66922	66933	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	91974536
1511	NC_007958	CAC	2	6	66938	66943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91974536
1512	NC_007958	CGG	3	9	67069	67077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974536
1513	NC_007958	TGA	2	6	67093	67098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91974536
1514	NC_007958	GC	3	6	67146	67151	0 %	0 %	50 %	50 %	91974536
1515	NC_007958	TCATA	2	10	67156	67165	40 %	40 %	0 %	20 %	91974536
1516	NC_007958	GTC	2	6	67193	67198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974536
1517	NC_007958	CGG	2	6	67199	67204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974536
1518	NC_007958	GC	3	6	67272	67277	0 %	0 %	50 %	50 %	91974536
1519	NC_007958	ATCGC	2	10	67305	67314	20 %	20 %	20 %	40 %	91974536
1520	NC_007958	ACTG	2	8	67408	67415	25 %	25 %	25 %	25 %	91974536
1521	NC_007958	CGT	2	6	67555	67560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974537
1522	NC_007958	CGA	2	6	67629	67634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974537
1523	NC_007958	GGTGCG	2	12	67671	67682	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	91974537
1524	NC_007958	T	6	6	67701	67706	0 %	100 %	0 %	0 %	91974537
1525	NC_007958	GC	4	8	67708	67715	0 %	0 %	50 %	50 %	91974537
1526	NC_007958	GCG	2	6	67737	67742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974537
1527	NC_007958	GCG	2	6	67784	67789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974537
1528	NC_007958	GCAA	2	8	67802	67809	50 %	0 %	25 %	25 %	91974537
1529	NC_007958	AAT	2	6	67822	67827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91974537
1530	NC_007958	CTT	2	6	68031	68036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91974538
1531	NC_007958	TCG	2	6	68090	68095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974538
1532	NC_007958	CTG	3	9	68098	68106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974538
1533	NC_007958	TGG	2	6	68218	68223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974538
1534	NC_007958	CCG	2	6	68237	68242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974538
1535	NC_007958	TCG	3	9	68264	68272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974538
1536	NC_007958	AGA	2	6	68273	68278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91974538
1537	NC_007958	CTT	2	6	68322	68327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91974538
1538	NC_007958	TGC	2	6	68387	68392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974538
1539	NC_007958	CAT	2	6	68397	68402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974538
1540	NC_007958	ATCGGC	2	12	68404	68415	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	91974538
1541	NC_007958	CGC	2	6	68457	68462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974538
1542	NC_007958	GACC	2	8	68511	68518	25 %	0 %	25 %	50 %	91974538
1543	NC_007958	CCG	3	9	68547	68555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974538
1544	NC_007958	CTT	2	6	68589	68594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91974538
1545	NC_007958	CGC	2	6	68642	68647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974538
1546	NC_007958	CTGATC	2	12	68659	68670	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	91974538
1547	NC_007958	CGG	2	6	68708	68713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974538
1548	NC_007958	TGCG	2	8	68777	68784	0 %	25 %	50 %	25 %	91974538
1549	NC_007958	GGC	2	6	68799	68804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974538
1550	NC_007958	CGCTT	2	10	68815	68824	0 %	40 %	20 %	40 %	91974538
1551	NC_007958	TGC	2	6	68846	68851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974538
1552	NC_007958	TCG	2	6	68876	68881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974538
1553	NC_007958	GCC	2	6	68911	68916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974538
1554	NC_007958	CGC	2	6	68946	68951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974538
1555	NC_007958	CCTCA	2	10	68992	69001	20 %	20 %	0 %	60 %	91974538
1556	NC_007958	ATG	2	6	69012	69017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91974538
1557	NC_007958	TGT	2	6	69025	69030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91974539
1558	NC_007958	CTGG	2	8	69110	69117	0 %	25 %	50 %	25 %	91974539
1559	NC_007958	CGA	2	6	69158	69163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974539
1560	NC_007958	CG	3	6	69212	69217	0 %	0 %	50 %	50 %	91974539
1561	NC_007958	GATGAC	2	12	69252	69263	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	91974539
1562	NC_007958	GGC	2	6	69280	69285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974539
1563	NC_007958	GCC	2	6	69391	69396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974540
1564	NC_007958	CCT	2	6	69407	69412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	91974540
1565	NC_007958	CAA	2	6	69435	69440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91974540
1566	NC_007958	GAAC	2	8	69446	69453	50 %	0 %	25 %	25 %	91974540
1567	NC_007958	TCG	2	6	69469	69474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974540
1568	NC_007958	GC	3	6	69481	69486	0 %	0 %	50 %	50 %	91974540
1569	NC_007958	TCG	2	6	69487	69492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974540
1570	NC_007958	CGA	2	6	69581	69586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974540
1571	NC_007958	CGAC	2	8	69625	69632	25 %	0 %	25 %	50 %	91974540
1572	NC_007958	CGC	2	6	69659	69664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974540
1573	NC_007958	TGC	2	6	69717	69722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974540
1574	NC_007958	CGC	3	9	69728	69736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974540
1575	NC_007958	GGC	2	6	69741	69746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974540
1576	NC_007958	GAG	2	6	69756	69761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	91974540
1577	NC_007958	CCGA	2	8	69804	69811	25 %	0 %	25 %	50 %	91974540
1578	NC_007958	GCTG	2	8	70133	70140	0 %	25 %	50 %	25 %	91974541
1579	NC_007958	CGC	2	6	70208	70213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974541
1580	NC_007958	CTG	2	6	70216	70221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974541
1581	NC_007958	GCCTT	2	10	70222	70231	0 %	40 %	20 %	40 %	91974541
1582	NC_007958	TTC	2	6	70243	70248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91974541
1583	NC_007958	CTT	2	6	70289	70294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91974541
1584	NC_007958	GGGCT	2	10	70298	70307	0 %	20 %	60 %	20 %	91974541
1585	NC_007958	TGTC	2	8	70317	70324	0 %	50 %	25 %	25 %	91974541
1586	NC_007958	ATC	2	6	70332	70337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974541
1587	NC_007958	CGATG	2	10	70385	70394	20 %	20 %	40 %	20 %	91974541
1588	NC_007958	TTG	2	6	70443	70448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91974541
1589	NC_007958	GCC	2	6	70683	70688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974541
1590	NC_007958	GCT	2	6	70797	70802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974542
1591	NC_007958	AAG	2	6	70849	70854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91974542
1592	NC_007958	AGG	2	6	70904	70909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	91974542
1593	NC_007958	TCA	2	6	70925	70930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974542
1594	NC_007958	GCC	3	9	70982	70990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974542
1595	NC_007958	ACT	2	6	71000	71005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974542
1596	NC_007958	ACGCG	2	10	71028	71037	20 %	0 %	40 %	40 %	91974542
1597	NC_007958	GAC	2	6	71056	71061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974542
1598	NC_007958	TCC	2	6	71084	71089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	91974542
1599	NC_007958	CT	3	6	71141	71146	0 %	50 %	0 %	50 %	91974543
1600	NC_007958	GCC	2	6	71161	71166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974543
1601	NC_007958	CAT	3	9	71181	71189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974543
1602	NC_007958	ATGGAA	2	12	71192	71203	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	91974543
1603	NC_007958	GTG	2	6	71272	71277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974543
1604	NC_007958	GCG	2	6	71281	71286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974543
1605	NC_007958	TATC	2	8	71385	71392	25 %	50 %	0 %	25 %	91974543
1606	NC_007958	AGC	3	9	71487	71495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974543
1607	NC_007958	GCG	2	6	71513	71518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974543
1608	NC_007958	ATT	2	6	71546	71551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91974543
1609	NC_007958	CGC	3	9	71574	71582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974543
1610	NC_007958	TCA	2	6	71666	71671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974543
1611	NC_007958	GA	3	6	71684	71689	50 %	0 %	50 %	0 %	91974543
1612	NC_007958	GAC	2	6	71773	71778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974543
1613	NC_007958	CGT	2	6	71795	71800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974543
1614	NC_007958	GGC	2	6	71824	71829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974543
1615	NC_007958	CGAT	2	8	71837	71844	25 %	25 %	25 %	25 %	91974543
1616	NC_007958	CCA	2	6	72051	72056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91974544
1617	NC_007958	CGG	2	6	72074	72079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974544
1618	NC_007958	GAC	2	6	72090	72095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974544
1619	NC_007958	ACG	2	6	72100	72105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974544
1620	NC_007958	TCG	2	6	72151	72156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974544
1621	NC_007958	CCTT	2	8	72169	72176	0 %	50 %	0 %	50 %	91974544
1622	NC_007958	CAT	2	6	72317	72322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974544
1623	NC_007958	CGA	2	6	72326	72331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974544
1624	NC_007958	GCG	2	6	72355	72360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974544
1625	NC_007958	GAA	2	6	72366	72371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91974544
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