MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisB5 chromosome

Total Repeats: 114045

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_007958	CCG	2	6	553578	553583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974959
13002	NC_007958	GCT	2	6	553593	553598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974959
13003	NC_007958	GCGCA	2	10	553622	553631	20 %	0 %	40 %	40 %	91974959
13004	NC_007958	CGCGG	2	10	553636	553645	0 %	0 %	60 %	40 %	91974959
13005	NC_007958	GGC	2	6	553711	553716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974959
13006	NC_007958	CAC	2	6	553741	553746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91974959
13007	NC_007958	GTC	2	6	553753	553758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974959
13008	NC_007958	CCTT	2	8	553760	553767	0 %	50 %	0 %	50 %	91974959
13009	NC_007958	GAC	2	6	553774	553779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974959
13010	NC_007958	GCC	2	6	553804	553809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974959
13011	NC_007958	TGT	2	6	553812	553817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91974959
13012	NC_007958	GGATCG	2	12	553833	553844	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	91974959
13013	NC_007958	TCTT	2	8	553955	553962	0 %	75 %	0 %	25 %	91974959
13014	NC_007958	CGC	2	6	553971	553976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974959
13015	NC_007958	CG	4	8	554002	554009	0 %	0 %	50 %	50 %	91974959
13016	NC_007958	CG	3	6	554019	554024	0 %	0 %	50 %	50 %	91974959
13017	NC_007958	GCC	2	6	554092	554097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974959
13018	NC_007958	CGC	2	6	554100	554105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974959
13019	NC_007958	GC	3	6	554192	554197	0 %	0 %	50 %	50 %	91974959
13020	NC_007958	CGC	2	6	554208	554213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974959
13021	NC_007958	AGG	2	6	554244	554249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	91974959
13022	NC_007958	GCC	2	6	554266	554271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974959
13023	NC_007958	TGG	2	6	554283	554288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974959
13024	NC_007958	CGT	2	6	554316	554321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974959
13025	NC_007958	CGC	2	6	554340	554345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974959
13026	NC_007958	GAA	2	6	554383	554388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91974959
13027	NC_007958	CGG	2	6	554403	554408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974959
13028	NC_007958	GCA	2	6	554439	554444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974959
13029	NC_007958	CGG	3	9	554463	554471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974959
13030	NC_007958	TGCGC	2	10	554478	554487	0 %	20 %	40 %	40 %	91974959
13031	NC_007958	GCC	2	6	554515	554520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974959
13032	NC_007958	CTT	2	6	554544	554549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91974959
13033	NC_007958	TCGA	2	8	554621	554628	25 %	25 %	25 %	25 %	91974959
13034	NC_007958	GTC	2	6	554686	554691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974959
13035	NC_007958	GCC	2	6	554722	554727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974959
13036	NC_007958	GCC	2	6	554732	554737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974959
13037	NC_007958	CAC	2	6	554806	554811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91974959
13038	NC_007958	CG	3	6	554812	554817	0 %	0 %	50 %	50 %	91974959
13039	NC_007958	GCC	2	6	554827	554832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974959
13040	NC_007958	ACG	2	6	554843	554848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974959
13041	NC_007958	CAT	2	6	554850	554855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974959
13042	NC_007958	GCCGTT	2	12	554902	554913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974959
13043	NC_007958	CGC	2	6	554914	554919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974959
13044	NC_007958	GAA	2	6	554986	554991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91974960
13045	NC_007958	TTG	2	6	554993	554998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91974960
13046	NC_007958	AGCTTC	2	12	555014	555025	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	91974960
13047	NC_007958	CAC	2	6	555049	555054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91974960
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13050	NC_007958	GCGCC	2	10	555138	555147	0 %	0 %	40 %	60 %	91974960
13051	NC_007958	AGC	2	6	555164	555169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974960
13052	NC_007958	ACC	4	12	555176	555187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91974960
13053	NC_007958	CAG	2	6	555199	555204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974960
13054	NC_007958	GCT	2	6	555228	555233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974960
13055	NC_007958	CGC	2	6	555339	555344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974960
13056	NC_007958	CAC	2	6	555396	555401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91974961
13057	NC_007958	GGC	2	6	555414	555419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974961
13058	NC_007958	CGG	2	6	555440	555445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974961
13059	NC_007958	CGC	2	6	555485	555490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974961
13060	NC_007958	AGG	2	6	555578	555583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	91974961
13061	NC_007958	CCA	2	6	555609	555614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91974961
13062	NC_007958	CAG	2	6	555618	555623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974961
13063	NC_007958	ATC	2	6	555730	555735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974961
13064	NC_007958	TGC	2	6	555991	555996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974962
13065	NC_007958	AGCG	2	8	556009	556016	25 %	0 %	50 %	25 %	91974962
13066	NC_007958	ACT	2	6	556037	556042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974962
13067	NC_007958	CGC	2	6	556072	556077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974962
13068	NC_007958	CACGAT	2	12	556125	556136	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	91974962
13069	NC_007958	GGC	2	6	556274	556279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974962
13070	NC_007958	GGCT	2	8	556284	556291	0 %	25 %	50 %	25 %	91974962
13071	NC_007958	GCT	2	6	556307	556312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974962
13072	NC_007958	CGG	2	6	556369	556374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974962
13073	NC_007958	CCG	2	6	556389	556394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974962
13074	NC_007958	TCG	2	6	556425	556430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974962
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13079	NC_007958	CGT	2	6	556688	556693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974962
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13081	NC_007958	ATC	2	6	556755	556760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974962
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13084	NC_007958	GCC	2	6	556858	556863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974962
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13087	NC_007958	GCA	2	6	556994	556999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974962
13088	NC_007958	GC	3	6	557056	557061	0 %	0 %	50 %	50 %	91974962
13089	NC_007958	GTG	2	6	557076	557081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974962
13090	NC_007958	TTC	2	6	557421	557426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91974963
13091	NC_007958	GTC	2	6	557456	557461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974963
13092	NC_007958	CTT	2	6	557474	557479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91974963
13093	NC_007958	TCG	2	6	557532	557537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974963
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13099	NC_007958	TGA	2	6	557758	557763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91974963
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13101	NC_007958	TCT	2	6	557794	557799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91974963
13102	NC_007958	CG	4	8	557899	557906	0 %	0 %	50 %	50 %	91974963
13103	NC_007958	GC	3	6	558023	558028	0 %	0 %	50 %	50 %	91974963
13104	NC_007958	CAG	2	6	558053	558058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974963
13105	NC_007958	TGC	2	6	558102	558107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974963
13106	NC_007958	GCA	2	6	558124	558129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974963
13107	NC_007958	CG	4	8	558167	558174	0 %	0 %	50 %	50 %	91974963
13108	NC_007958	GAT	2	6	558185	558190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91974963
13109	NC_007958	ATC	2	6	558219	558224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974963
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13111	NC_007958	CG	3	6	558231	558236	0 %	0 %	50 %	50 %	91974963
13112	NC_007958	CGT	2	6	558304	558309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974963
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13115	NC_007958	TCG	2	6	558429	558434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974963
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