MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisB5 chromosome

Total Repeats: 114045

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
114001	NC_007958	GCG	2	6	4889929	4889934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91978876
114002	NC_007958	CCGGG	2	10	4889950	4889959	0 %	0 %	60 %	40 %	91978876
114003	NC_007958	GGC	2	6	4889960	4889965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91978876
114004	NC_007958	GCC	3	9	4889969	4889977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91978876
114005	NC_007958	CCG	2	6	4890029	4890034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91978876
114006	NC_007958	GCC	2	6	4890041	4890046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91978876
114007	NC_007958	GAGCGC	2	12	4890047	4890058	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	91978876
114008	NC_007958	ATC	2	6	4890072	4890077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91978876
114009	NC_007958	GCC	2	6	4890301	4890306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91978877
114010	NC_007958	GCC	2	6	4890319	4890324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91978877
114011	NC_007958	TTC	2	6	4890329	4890334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91978877
114012	NC_007958	CCGG	2	8	4890377	4890384	0 %	0 %	50 %	50 %	91978877
114013	NC_007958	GGT	2	6	4890394	4890399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91978877
114014	NC_007958	GGC	2	6	4890418	4890423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91978877
114015	NC_007958	CTG	2	6	4890430	4890435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91978877
114016	NC_007958	CG	3	6	4890444	4890449	0 %	0 %	50 %	50 %	91978877
114017	NC_007958	CGG	2	6	4890456	4890461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91978877
114018	NC_007958	CAG	2	6	4890571	4890576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91978877
114019	NC_007958	CAC	2	6	4890616	4890621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91978877
114020	NC_007958	GCC	2	6	4890679	4890684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91978877
114021	NC_007958	ACCG	2	8	4890691	4890698	25 %	0 %	25 %	50 %	91978877
114022	NC_007958	C	6	6	4890744	4890749	0 %	0 %	0 %	100 %	91978877
114023	NC_007958	AGC	2	6	4890753	4890758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91978877
114024	NC_007958	GGC	2	6	4890797	4890802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91978877
114025	NC_007958	GC	3	6	4890832	4890837	0 %	0 %	50 %	50 %	91978877
114026	NC_007958	CAG	6	18	4891120	4891137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91978878
114027	NC_007958	CAG	3	9	4891174	4891182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91978878
114028	NC_007958	TGA	2	6	4891185	4891190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91978878
114029	NC_007958	GCTG	2	8	4891242	4891249	0 %	25 %	50 %	25 %	91978878
114030	NC_007958	TGG	2	6	4891253	4891258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91978878
114031	NC_007958	CGT	2	6	4891260	4891265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91978878
114032	NC_007958	C	6	6	4891345	4891350	0 %	0 %	0 %	100 %	91978878
114033	NC_007958	CAG	2	6	4891354	4891359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91978878
114034	NC_007958	CAA	2	6	4891360	4891365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91978878
114035	NC_007958	ATC	2	6	4891391	4891396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91978878
114036	NC_007958	GAA	2	6	4891791	4891796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91978879
114037	NC_007958	CAA	2	6	4891830	4891835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91978879
114038	NC_007958	CGC	2	6	4891840	4891845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91978879
114039	NC_007958	CGGTT	2	10	4891857	4891866	0 %	40 %	40 %	20 %	91978879
114040	NC_007958	GAA	2	6	4891876	4891881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91978879
114041	NC_007958	GCG	2	6	4891892	4891897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91978879
114042	NC_007958	GC	3	6	4891947	4891952	0 %	0 %	50 %	50 %	91978879
114043	NC_007958	CGC	2	6	4891980	4891985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91978879
114044	NC_007958	TC	3	6	4891997	4892002	0 %	50 %	0 %	50 %	91978879
114045	NC_007958	GTAA	2	8	4892030	4892037	50 %	25 %	25 %	0 %	91978879

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.