MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisB5 chromosome

Total Repeats: 114045

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007958	GC	3	6	24024	24029	0 %	0 %	50 %	50 %	91974500
502	NC_007958	CGC	2	6	24032	24037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974500
503	NC_007958	TGC	2	6	24058	24063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974500
504	NC_007958	GAAT	2	8	24065	24072	50 %	25 %	25 %	0 %	91974500
505	NC_007958	GGC	3	9	24155	24163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974500
506	NC_007958	CGA	2	6	24200	24205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974500
507	NC_007958	GCCC	2	8	24224	24231	0 %	0 %	25 %	75 %	91974500
508	NC_007958	GCG	3	9	24283	24291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974500
509	NC_007958	GTC	2	6	24303	24308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974500
510	NC_007958	CAC	2	6	24312	24317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91974500
511	NC_007958	GC	3	6	24319	24324	0 %	0 %	50 %	50 %	91974500
512	NC_007958	GC	3	6	24409	24414	0 %	0 %	50 %	50 %	91974500
513	NC_007958	GAT	2	6	24476	24481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91974500
514	NC_007958	GAG	2	6	24571	24576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	91974500
515	NC_007958	TC	3	6	24765	24770	0 %	50 %	0 %	50 %	91974501
516	NC_007958	GTTC	2	8	24780	24787	0 %	50 %	25 %	25 %	91974501
517	NC_007958	CGG	2	6	24802	24807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974501
518	NC_007958	TCG	3	9	24844	24852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974501
519	NC_007958	CGA	2	6	24857	24862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974501
520	NC_007958	CGT	2	6	24881	24886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974501
521	NC_007958	CGA	2	6	24941	24946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974501
522	NC_007958	CCG	2	6	24973	24978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974501
523	NC_007958	ATGCGA	2	12	25056	25067	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	91974501
524	NC_007958	CTGC	2	8	25109	25116	0 %	25 %	25 %	50 %	91974501
525	NC_007958	CG	3	6	25135	25140	0 %	0 %	50 %	50 %	91974501
526	NC_007958	CCG	2	6	25150	25155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974501
527	NC_007958	GCTCGA	2	12	25181	25192	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	91974501
528	NC_007958	CAT	2	6	25193	25198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91974501
529	NC_007958	GGC	2	6	25300	25305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974502
530	NC_007958	GAA	2	6	25312	25317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91974502
531	NC_007958	GCC	2	6	25318	25323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974502
532	NC_007958	GGCC	2	8	25342	25349	0 %	0 %	50 %	50 %	91974502
533	NC_007958	GC	3	6	25358	25363	0 %	0 %	50 %	50 %	91974502
534	NC_007958	GCT	2	6	25385	25390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974502
535	NC_007958	GAC	2	6	25411	25416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974502
536	NC_007958	AGC	2	6	25434	25439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974502
537	NC_007958	ATCCG	2	10	25474	25483	20 %	20 %	20 %	40 %	91974502
538	NC_007958	CGA	2	6	25545	25550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974502
539	NC_007958	AAG	2	6	25575	25580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91974502
540	NC_007958	GTC	4	12	25598	25609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974502
541	NC_007958	TCT	2	6	25677	25682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91974502
542	NC_007958	CGA	2	6	25687	25692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974502
543	NC_007958	GTC	2	6	25769	25774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974502
544	NC_007958	GCC	2	6	25801	25806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974502
545	NC_007958	GAC	2	6	25813	25818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974502
546	NC_007958	CCG	2	6	25867	25872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974502
547	NC_007958	GGA	2	6	25912	25917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	91974502
548	NC_007958	CGC	2	6	25924	25929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974502
549	NC_007958	CGG	2	6	25930	25935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974502
550	NC_007958	CTG	2	6	25949	25954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974502
551	NC_007958	CGA	2	6	26026	26031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974502
552	NC_007958	GCCG	2	8	26126	26133	0 %	0 %	50 %	50 %	91974502
553	NC_007958	TGC	2	6	26166	26171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974502
554	NC_007958	GTT	2	6	26197	26202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91974502
555	NC_007958	GC	4	8	26216	26223	0 %	0 %	50 %	50 %	91974502
556	NC_007958	CG	4	8	26307	26314	0 %	0 %	50 %	50 %	91974502
557	NC_007958	CGC	3	9	26326	26334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974502
558	NC_007958	CGA	2	6	26359	26364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974502
559	NC_007958	CG	3	6	26400	26405	0 %	0 %	50 %	50 %	91974502
560	NC_007958	TGG	2	6	26414	26419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974502
561	NC_007958	CTG	2	6	26441	26446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974502
562	NC_007958	CCAA	2	8	26466	26473	50 %	0 %	0 %	50 %	91974502
563	NC_007958	GTG	2	6	26486	26491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91974502
564	NC_007958	CAA	2	6	26503	26508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91974502
565	NC_007958	GCC	2	6	26544	26549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974502
566	NC_007958	CGAT	2	8	26555	26562	25 %	25 %	25 %	25 %	91974502
567	NC_007958	CCA	2	6	26608	26613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91974502
568	NC_007958	CCG	2	6	26634	26639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974502
569	NC_007958	ATG	2	6	26690	26695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91974502
570	NC_007958	CTCG	2	8	26717	26724	0 %	25 %	25 %	50 %	91974502
571	NC_007958	CCG	2	6	26731	26736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974502
572	NC_007958	GAG	2	6	26780	26785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	91974502
573	NC_007958	CTG	2	6	26798	26803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974502
574	NC_007958	GCA	2	6	26874	26879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974502
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576	NC_007958	TGC	2	6	26967	26972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974502
577	NC_007958	CG	3	6	26981	26986	0 %	0 %	50 %	50 %	91974502
578	NC_007958	CCA	2	6	27057	27062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91974502
579	NC_007958	TCG	2	6	27086	27091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974502
580	NC_007958	ACCT	2	8	27110	27117	25 %	25 %	0 %	50 %	91974502
581	NC_007958	GAT	2	6	27187	27192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91974502
582	NC_007958	CGA	2	6	27211	27216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974502
583	NC_007958	AGC	2	6	27258	27263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974502
584	NC_007958	GC	3	6	27269	27274	0 %	0 %	50 %	50 %	91974502
585	NC_007958	AGATG	2	10	27310	27319	40 %	20 %	40 %	0 %	91974502
586	NC_007958	GTC	2	6	27417	27422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974503
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589	NC_007958	CCGG	2	8	27564	27571	0 %	0 %	50 %	50 %	91974503
590	NC_007958	GT	3	6	27613	27618	0 %	50 %	50 %	0 %	91974503
591	NC_007958	GAG	2	6	27715	27720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	91974503
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593	NC_007958	GC	4	8	27823	27830	0 %	0 %	50 %	50 %	91974504
594	NC_007958	TTC	2	6	27844	27849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91974504
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596	NC_007958	CGC	2	6	27969	27974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974504
597	NC_007958	CGT	2	6	27996	28001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974504
598	NC_007958	CGA	2	6	28011	28016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974504
599	NC_007958	AGG	2	6	28130	28135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	91974504
600	NC_007958	CG	3	6	28164	28169	0 %	0 %	50 %	50 %	91974504
601	NC_007958	CCG	2	6	28301	28306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974504
602	NC_007958	TGA	2	6	28346	28351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91974504
603	NC_007958	GTGA	2	8	28819	28826	25 %	25 %	50 %	0 %	91974505
604	NC_007958	TG	3	6	28880	28885	0 %	50 %	50 %	0 %	91974505
605	NC_007958	CGT	2	6	28894	28899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974505
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607	NC_007958	TCG	2	6	28971	28976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974505
608	NC_007958	GCG	2	6	29037	29042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974505
609	NC_007958	CGA	2	6	29076	29081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974505
610	NC_007958	TGCC	2	8	29089	29096	0 %	25 %	25 %	50 %	91974505
611	NC_007958	CGA	2	6	29098	29103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974505
612	NC_007958	TGCGCA	2	12	29121	29132	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	91974505
613	NC_007958	CGC	2	6	29147	29152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91974505
614	NC_007958	CGT	2	6	29193	29198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974505
615	NC_007958	CGT	2	6	29217	29222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974505
616	NC_007958	GA	3	6	29247	29252	50 %	0 %	50 %	0 %	91974505
617	NC_007958	GTC	2	6	29362	29367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974506
618	NC_007958	AGC	2	6	29413	29418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974506
619	NC_007958	CGT	2	6	29421	29426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974506
620	NC_007958	GACC	2	8	29472	29479	25 %	0 %	25 %	50 %	91974506
621	NC_007958	AGC	2	6	29501	29506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974506
622	NC_007958	GTC	2	6	29574	29579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91974506
623	NC_007958	GAA	2	6	29619	29624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91974506
624	NC_007958	GCG	2	6	29659	29664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91974506
625	NC_007958	GACC	2	8	29700	29707	25 %	0 %	25 %	50 %	91974506
626	NC_007958	ACG	2	6	29764	29769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91974506
627	NC_007958	CCA	2	6	29804	29809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91974506
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