MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisB18 chromosome

Total Repeats: 127017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
123001	NC_007925	TGC	2	6	5342346	5342351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90426252
123002	NC_007925	ATC	2	6	5342378	5342383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90426252
123003	NC_007925	CGA	3	9	5342386	5342394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90426252
123004	NC_007925	CG	3	6	5342454	5342459	0 %	0 %	50 %	50 %	90426252
123005	NC_007925	CGAT	2	8	5342484	5342491	25 %	25 %	25 %	25 %	90426252
123006	NC_007925	TCGCC	2	10	5342502	5342511	0 %	20 %	20 %	60 %	90426252
123007	NC_007925	CGG	2	6	5342524	5342529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90426252
123008	NC_007925	CCA	2	6	5342547	5342552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90426252
123009	NC_007925	CCG	2	6	5342607	5342612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90426252
123010	NC_007925	CGATG	2	10	5342626	5342635	20 %	20 %	40 %	20 %	90426252
123011	NC_007925	GTC	2	6	5342638	5342643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90426252
123012	NC_007925	CGT	3	9	5342700	5342708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90426253
123013	NC_007925	GCG	2	6	5342717	5342722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90426253
123014	NC_007925	CGGT	2	8	5342735	5342742	0 %	25 %	50 %	25 %	90426253
123015	NC_007925	TCG	2	6	5342750	5342755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90426253
123016	NC_007925	TCG	2	6	5342792	5342797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90426253
123017	NC_007925	GGC	2	6	5342805	5342810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90426253
123018	NC_007925	CCA	2	6	5342838	5342843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90426253
123019	NC_007925	CGC	2	6	5342856	5342861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90426253
123020	NC_007925	CCA	2	6	5342877	5342882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90426253
123021	NC_007925	CCG	2	6	5342930	5342935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90426253
123022	NC_007925	GCT	2	6	5343000	5343005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90426253
123023	NC_007925	GCC	2	6	5343013	5343018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90426253
123024	NC_007925	CTG	2	6	5343052	5343057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90426253
123025	NC_007925	GGC	2	6	5343099	5343104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90426253
123026	NC_007925	TCG	2	6	5343125	5343130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90426253
123027	NC_007925	GAT	2	6	5343177	5343182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90426253
123028	NC_007925	GC	3	6	5343198	5343203	0 %	0 %	50 %	50 %	90426253
123029	NC_007925	CGA	2	6	5343222	5343227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90426253
123030	NC_007925	GCGCC	2	10	5343233	5343242	0 %	0 %	40 %	60 %	90426253
123031	NC_007925	CGA	2	6	5343255	5343260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90426253
123032	NC_007925	GCG	2	6	5343282	5343287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90426253
123033	NC_007925	CCG	2	6	5343716	5343721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90426254
123034	NC_007925	CCCGC	2	10	5343722	5343731	0 %	0 %	20 %	80 %	90426254
123035	NC_007925	GCG	2	6	5343803	5343808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90426254
123036	NC_007925	GCT	2	6	5343879	5343884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90426254
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123038	NC_007925	GCG	2	6	5343932	5343937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90426254
123039	NC_007925	CG	5	10	5344068	5344077	0 %	0 %	50 %	50 %	90426254
123040	NC_007925	GC	3	6	5344094	5344099	0 %	0 %	50 %	50 %	90426254
123041	NC_007925	GCCGAA	2	12	5344119	5344130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90426254
123042	NC_007925	AT	3	6	5344188	5344193	50 %	50 %	0 %	0 %	90426254
123043	NC_007925	ACT	2	6	5344208	5344213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90426254
123044	NC_007925	GCG	2	6	5344219	5344224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90426254
123045	NC_007925	TCA	2	6	5344280	5344285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90426254
123046	NC_007925	CGT	2	6	5344334	5344339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90426254
123047	NC_007925	TGA	2	6	5344361	5344366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90426254
123048	NC_007925	CTG	2	6	5344450	5344455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90426254
123049	NC_007925	A	6	6	5344783	5344788	100 %	0 %	0 %	0 %	90426255
123050	NC_007925	GGT	2	6	5344816	5344821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90426255
123051	NC_007925	GGCT	2	8	5344826	5344833	0 %	25 %	50 %	25 %	90426255
123052	NC_007925	ACC	2	6	5344859	5344864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90426255
123053	NC_007925	ACCA	2	8	5344876	5344883	50 %	0 %	0 %	50 %	90426255
123054	NC_007925	GCA	2	6	5344896	5344901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90426255
123055	NC_007925	CGC	2	6	5344908	5344913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90426255
123056	NC_007925	CGG	2	6	5344938	5344943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90426255
123057	NC_007925	GCCG	2	8	5345013	5345020	0 %	0 %	50 %	50 %	90426255
123058	NC_007925	CGC	2	6	5345052	5345057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90426255
123059	NC_007925	GCGCC	2	10	5345077	5345086	0 %	0 %	40 %	60 %	90426255
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123063	NC_007925	ACG	2	6	5345258	5345263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90426255
123064	NC_007925	CGC	2	6	5345265	5345270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90426255
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123066	NC_007925	CAG	2	6	5345365	5345370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90426255
123067	NC_007925	CAG	2	6	5345383	5345388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90426255
123068	NC_007925	CAC	2	6	5345452	5345457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90426255
123069	NC_007925	CCA	2	6	5345460	5345465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90426255
123070	NC_007925	GCGCC	2	10	5345497	5345506	0 %	0 %	40 %	60 %	90426255
123071	NC_007925	CAT	2	6	5345512	5345517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90426255
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123074	NC_007925	CGT	2	6	5345652	5345657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90426256
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123078	NC_007925	GC	3	6	5345724	5345729	0 %	0 %	50 %	50 %	90426256
123079	NC_007925	GCC	3	9	5345803	5345811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90426256
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123082	NC_007925	CGAGG	2	10	5345842	5345851	20 %	0 %	60 %	20 %	90426256
123083	NC_007925	CG	3	6	5345865	5345870	0 %	0 %	50 %	50 %	90426256
123084	NC_007925	CGG	2	6	5345930	5345935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90426256
123085	NC_007925	TCA	2	6	5345958	5345963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90426256
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123087	NC_007925	GCA	2	6	5346074	5346079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90426256
123088	NC_007925	CGC	2	6	5346112	5346117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90426256
123089	NC_007925	CTG	2	6	5346121	5346126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90426256
123090	NC_007925	GCA	2	6	5346201	5346206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90426256
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123092	NC_007925	GCCG	2	8	5346247	5346254	0 %	0 %	50 %	50 %	90426256
123093	NC_007925	CGG	2	6	5346303	5346308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90426256
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123099	NC_007925	GTC	2	6	5346604	5346609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90426256
123100	NC_007925	GCGCCG	2	12	5346633	5346644	0 %	0 %	50 %	50 %	90426256
123101	NC_007925	GCC	2	6	5346664	5346669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90426256
123102	NC_007925	CCG	2	6	5346675	5346680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90426256
123103	NC_007925	CGG	2	6	5346690	5346695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90426256
123104	NC_007925	GGA	2	6	5346724	5346729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	90426256
123105	NC_007925	CGT	2	6	5346747	5346752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90426256
123106	NC_007925	GC	3	6	5346761	5346766	0 %	0 %	50 %	50 %	90426256
123107	NC_007925	TCG	2	6	5346866	5346871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90426256
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123110	NC_007925	CTT	2	6	5347359	5347364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90426257
123111	NC_007925	GAT	2	6	5347378	5347383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90426257
123112	NC_007925	GTC	2	6	5347426	5347431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90426257
123113	NC_007925	ACT	2	6	5347436	5347441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90426257
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123230	NC_007925	CGATCG	2	12	5351922	5351933	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	90426261
123231	NC_007925	TGG	2	6	5351952	5351957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90426261
123232	NC_007925	TTC	2	6	5351963	5351968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90426261
123233	NC_007925	GCC	2	6	5351990	5351995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90426261
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123242	NC_007925	CGAGAT	2	12	5352311	5352322	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	90426262
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123331	NC_007925	TGC	2	6	5356414	5356419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162136024
123332	NC_007925	GGC	2	6	5356433	5356438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162136024
123333	NC_007925	GCCG	2	8	5356458	5356465	0 %	0 %	50 %	50 %	162136024
123334	NC_007925	CGA	2	6	5356469	5356474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162136024
123335	NC_007925	GCG	2	6	5356617	5356622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162136024
123336	NC_007925	GCG	2	6	5356651	5356656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162136024
123337	NC_007925	TGA	2	6	5356690	5356695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162136024
123338	NC_007925	CAC	2	6	5356712	5356717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162136024
123339	NC_007925	GCCGC	2	10	5356765	5356774	0 %	0 %	40 %	60 %	162136024
123340	NC_007925	GGT	2	6	5356831	5356836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90426267
123341	NC_007925	CGA	2	6	5356912	5356917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90426267
123342	NC_007925	CAC	2	6	5356960	5356965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90426267
123343	NC_007925	CTC	2	6	5356972	5356977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	90426267
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123345	NC_007925	CGG	2	6	5357008	5357013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90426267
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123462	NC_007925	TTC	2	6	5361917	5361922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90426274
123463	NC_007925	CG	3	6	5362003	5362008	0 %	0 %	50 %	50 %	90426274
123464	NC_007925	G	7	7	5362043	5362049	0 %	0 %	100 %	0 %	90426274
123465	NC_007925	CGA	2	6	5362051	5362056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90426274
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