MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodoferax ferrireducens T118 plasmid1

Total Repeats: 3819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_007901	GCC	2	6	234428	234433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885962
3502	NC_007901	GCT	2	6	234663	234668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885963
3503	NC_007901	GCG	2	6	234991	234996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885963
3504	NC_007901	CG	3	6	234995	235000	0 %	0 %	50 %	50 %	89885963
3505	NC_007901	GCG	2	6	235028	235033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885963
3506	NC_007901	GCAG	2	8	235049	235056	25 %	0 %	50 %	25 %	89885963
3507	NC_007901	CGT	2	6	235064	235069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885963
3508	NC_007901	CGC	2	6	235145	235150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885963
3509	NC_007901	GAT	2	6	235170	235175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885963
3510	NC_007901	AGAT	2	8	235189	235196	50 %	25 %	25 %	0 %	89885963
3511	NC_007901	GCCAG	2	10	235371	235380	20 %	0 %	40 %	40 %	89885964
3512	NC_007901	CGG	2	6	235392	235397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885964
3513	NC_007901	TCAG	2	8	235500	235507	25 %	25 %	25 %	25 %	89885964
3514	NC_007901	ACC	2	6	235592	235597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885964
3515	NC_007901	TGC	2	6	235632	235637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885964
3516	NC_007901	CAA	2	6	235718	235723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89885964
3517	NC_007901	GCG	2	6	235727	235732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885964
3518	NC_007901	GGC	2	6	235735	235740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885964
3519	NC_007901	GC	3	6	235748	235753	0 %	0 %	50 %	50 %	89885964
3520	NC_007901	TCG	2	6	235773	235778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885964
3521	NC_007901	TCA	2	6	235821	235826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885964
3522	NC_007901	CAT	2	6	235846	235851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885964
3523	NC_007901	GCA	2	6	235858	235863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885964
3524	NC_007901	ATG	2	6	235955	235960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885964
3525	NC_007901	TGG	2	6	236049	236054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89885964
3526	NC_007901	CGAT	2	8	236077	236084	25 %	25 %	25 %	25 %	89885964
3527	NC_007901	GAG	2	6	236093	236098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89885964
3528	NC_007901	GCC	2	6	236122	236127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885964
3529	NC_007901	TCG	2	6	236178	236183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885964
3530	NC_007901	GCC	2	6	236210	236215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885964
3531	NC_007901	GCACTG	2	12	236216	236227	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	89885964
3532	NC_007901	GT	3	6	236265	236270	0 %	50 %	50 %	0 %	89885964
3533	NC_007901	TG	3	6	236323	236328	0 %	50 %	50 %	0 %	89885964
3534	NC_007901	CG	3	6	236394	236399	0 %	0 %	50 %	50 %	89885964
3535	NC_007901	GCC	2	6	236477	236482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885964
3536	NC_007901	CTTGG	2	10	236587	236596	0 %	40 %	40 %	20 %	89885965
3537	NC_007901	CGT	2	6	236610	236615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885965
3538	NC_007901	GGC	2	6	236719	236724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885965
3539	NC_007901	CACG	2	8	236751	236758	25 %	0 %	25 %	50 %	89885965
3540	NC_007901	TGCA	2	8	236789	236796	25 %	25 %	25 %	25 %	89885965
3541	NC_007901	GGCGCT	2	12	236841	236852	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	89885965
3542	NC_007901	CTG	2	6	236866	236871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885965
3543	NC_007901	TGC	2	6	236897	236902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885965
3544	NC_007901	AGC	2	6	236936	236941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885965
3545	NC_007901	CGC	2	6	237009	237014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885965
3546	NC_007901	GACC	2	8	237019	237026	25 %	0 %	25 %	50 %	89885965
3547	NC_007901	TTTGAC	2	12	237040	237051	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	89885965
3548	NC_007901	GGC	2	6	237069	237074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885965
3549	NC_007901	GGC	2	6	237126	237131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885965
3550	NC_007901	ACA	2	6	237614	237619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89885966
3551	NC_007901	AGCC	2	8	237728	237735	25 %	0 %	25 %	50 %	89885966
3552	NC_007901	CG	3	6	237809	237814	0 %	0 %	50 %	50 %	89885966
3553	NC_007901	TGG	2	6	237825	237830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89885966
3554	NC_007901	GGCT	2	8	237852	237859	0 %	25 %	50 %	25 %	89885966
3555	NC_007901	ACG	2	6	238180	238185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885966
3556	NC_007901	AG	3	6	238221	238226	50 %	0 %	50 %	0 %	89885966
3557	NC_007901	TG	3	6	238243	238248	0 %	50 %	50 %	0 %	89885966
3558	NC_007901	GATG	2	8	238268	238275	25 %	25 %	50 %	0 %	89885966
3559	NC_007901	AAT	2	6	238380	238385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89885966
3560	NC_007901	CAA	2	6	238403	238408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89885966
3561	NC_007901	TGA	2	6	238450	238455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885966
3562	NC_007901	GGC	2	6	238461	238466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885966
3563	NC_007901	GCA	2	6	238567	238572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885966
3564	NC_007901	GC	3	6	238642	238647	0 %	0 %	50 %	50 %	89885966
3565	NC_007901	TGG	2	6	238705	238710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89885966
3566	NC_007901	GCG	2	6	238746	238751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885966
3567	NC_007901	GCG	2	6	238763	238768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885966
3568	NC_007901	GC	3	6	238844	238849	0 %	0 %	50 %	50 %	89885966
3569	NC_007901	ATG	2	6	238990	238995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885967
3570	NC_007901	GGCT	2	8	239040	239047	0 %	25 %	50 %	25 %	89885967
3571	NC_007901	TGG	2	6	239048	239053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89885967
3572	NC_007901	GGC	2	6	239164	239169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885967
3573	NC_007901	CAG	2	6	239175	239180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885967
3574	NC_007901	TGG	2	6	239252	239257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89885967
3575	NC_007901	CAT	2	6	239277	239282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885967
3576	NC_007901	CAA	2	6	239322	239327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89885967
3577	NC_007901	CGG	2	6	239373	239378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885967
3578	NC_007901	GCT	2	6	239406	239411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885967
3579	NC_007901	CGA	2	6	239419	239424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885967
3580	NC_007901	GTG	2	6	239438	239443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89885968
3581	NC_007901	GAC	2	6	239540	239545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885968
3582	NC_007901	TTTG	2	8	239563	239570	0 %	75 %	25 %	0 %	89885968
3583	NC_007901	CCA	2	6	239583	239588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885968
3584	NC_007901	G	6	6	239612	239617	0 %	0 %	100 %	0 %	89885968
3585	NC_007901	ATC	2	6	239669	239674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885968
3586	NC_007901	GTG	2	6	239730	239735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89885968
3587	NC_007901	GGC	2	6	239944	239949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885968
3588	NC_007901	CTG	2	6	239954	239959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885968
3589	NC_007901	TTGG	2	8	240038	240045	0 %	50 %	50 %	0 %	89885968
3590	NC_007901	CCATGA	2	12	240420	240431	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	89885969
3591	NC_007901	A	6	6	240440	240445	100 %	0 %	0 %	0 %	89885969
3592	NC_007901	GCTTG	2	10	240466	240475	0 %	40 %	40 %	20 %	89885969
3593	NC_007901	ACG	2	6	240546	240551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885969
3594	NC_007901	T	6	6	240568	240573	0 %	100 %	0 %	0 %	89885969
3595	NC_007901	CAG	2	6	240722	240727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885969
3596	NC_007901	GTCC	2	8	240730	240737	0 %	25 %	25 %	50 %	89885969
3597	NC_007901	GC	3	6	240740	240745	0 %	0 %	50 %	50 %	89885969
3598	NC_007901	TGCA	2	8	240789	240796	25 %	25 %	25 %	25 %	89885969
3599	NC_007901	CG	3	6	240807	240812	0 %	0 %	50 %	50 %	89885969
3600	NC_007901	GAA	2	6	240859	240864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89885969
3601	NC_007901	ATGG	2	8	240868	240875	25 %	25 %	50 %	0 %	89885969
3602	NC_007901	CCG	2	6	240888	240893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885969
3603	NC_007901	CAG	2	6	240940	240945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885969
3604	NC_007901	GCCAGC	2	12	240950	240961	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	89885969
3605	NC_007901	CG	3	6	240992	240997	0 %	0 %	50 %	50 %	89885969
3606	NC_007901	GCC	2	6	241001	241006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885969
3607	NC_007901	TCA	2	6	241023	241028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885969
3608	NC_007901	CCG	2	6	241130	241135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885969
3609	NC_007901	GACCA	2	10	241170	241179	40 %	0 %	20 %	40 %	89885969
3610	NC_007901	CGC	2	6	241322	241327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885970
3611	NC_007901	TTGC	2	8	241402	241409	0 %	50 %	25 %	25 %	89885970
3612	NC_007901	CG	3	6	241421	241426	0 %	0 %	50 %	50 %	89885970
3613	NC_007901	GCC	2	6	241469	241474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885970
3614	NC_007901	GCA	2	6	241552	241557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885970
3615	NC_007901	ATG	2	6	241629	241634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885970
3616	NC_007901	CAG	2	6	241691	241696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885970
3617	NC_007901	GC	3	6	241697	241702	0 %	0 %	50 %	50 %	89885970
3618	NC_007901	CG	3	6	241808	241813	0 %	0 %	50 %	50 %	89885970
3619	NC_007901	CCCG	2	8	241822	241829	0 %	0 %	25 %	75 %	89885970
3620	NC_007901	CG	3	6	241828	241833	0 %	0 %	50 %	50 %	89885970
3621	NC_007901	CAT	2	6	241853	241858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885970
3622	NC_007901	CTT	2	6	242171	242176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89885971
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3624	NC_007901	GCTT	2	8	242299	242306	0 %	50 %	25 %	25 %	89885971
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.