MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris HaA2 chromosome

Total Repeats: 129790

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007778	CG	3	6	762	767	0 %	0 %	50 %	50 %	86747128
2	NC_007778	CTG	2	6	870	875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747128
3	NC_007778	TCGC	2	8	918	925	0 %	25 %	25 %	50 %	86747128
4	NC_007778	GC	3	6	930	935	0 %	0 %	50 %	50 %	86747128
5	NC_007778	GCG	3	9	952	960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747128
6	NC_007778	TCG	2	6	972	977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747128
7	NC_007778	GCCAC	2	10	1010	1019	20 %	0 %	20 %	60 %	86747128
8	NC_007778	CGG	2	6	1050	1055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747128
9	NC_007778	CGC	2	6	1058	1063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747128
10	NC_007778	TCG	3	9	1091	1099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747128
11	NC_007778	GCC	3	9	1123	1131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747128
12	NC_007778	GCC	2	6	1148	1153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747128
13	NC_007778	GCG	2	6	1154	1159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747128
14	NC_007778	CTG	2	6	1219	1224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747128
15	NC_007778	CCG	2	6	1280	1285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747128
16	NC_007778	TCG	2	6	1304	1309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747128
17	NC_007778	CTCG	2	8	1329	1336	0 %	25 %	25 %	50 %	86747128
18	NC_007778	CGA	2	6	1377	1382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747128
19	NC_007778	ACC	2	6	1405	1410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86747128
20	NC_007778	GCCG	2	8	1450	1457	0 %	0 %	50 %	50 %	86747128
21	NC_007778	CCG	2	6	1483	1488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747128
22	NC_007778	CGA	2	6	1506	1511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747128
23	NC_007778	CGG	2	6	1533	1538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747128
24	NC_007778	TCG	3	9	1541	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747128
25	NC_007778	CG	3	6	1595	1600	0 %	0 %	50 %	50 %	86747128
26	NC_007778	GC	5	10	1609	1618	0 %	0 %	50 %	50 %	86747128
27	NC_007778	CTG	2	6	1714	1719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747128
28	NC_007778	TCG	2	6	1835	1840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747128
29	NC_007778	CG	3	6	1839	1844	0 %	0 %	50 %	50 %	86747128
30	NC_007778	GTC	2	6	1875	1880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747128
31	NC_007778	GACGCT	2	12	1935	1946	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	86747128
32	NC_007778	GCC	2	6	1967	1972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747128
33	NC_007778	CGG	2	6	1977	1982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747128
34	NC_007778	ACCAC	2	10	1988	1997	40 %	0 %	0 %	60 %	86747128
35	NC_007778	TGC	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747128
36	NC_007778	CGA	2	6	2055	2060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747128
37	NC_007778	CG	3	6	2374	2379	0 %	0 %	50 %	50 %	86747129
38	NC_007778	GC	3	6	2460	2465	0 %	0 %	50 %	50 %	86747129
39	NC_007778	CGAC	2	8	2492	2499	25 %	0 %	25 %	50 %	86747129
40	NC_007778	GCCG	2	8	2526	2533	0 %	0 %	50 %	50 %	86747129
41	NC_007778	ACC	2	6	2554	2559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86747129
42	NC_007778	GCC	2	6	2716	2721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747129
43	NC_007778	CTA	2	6	2814	2819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86747129
44	NC_007778	ATCT	2	8	2830	2837	25 %	50 %	0 %	25 %	86747129
45	NC_007778	CCG	2	6	2843	2848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747129
46	NC_007778	GC	3	6	2871	2876	0 %	0 %	50 %	50 %	86747129
47	NC_007778	CGAC	2	8	2882	2889	25 %	0 %	25 %	50 %	86747129
48	NC_007778	GCC	2	6	2932	2937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747129
49	NC_007778	ACG	2	6	3002	3007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747129
50	NC_007778	GTCG	2	8	3027	3034	0 %	25 %	50 %	25 %	86747129
51	NC_007778	AAC	2	6	3124	3129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86747129
52	NC_007778	TGG	2	6	3140	3145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86747129
53	NC_007778	AAG	2	6	3151	3156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86747129
54	NC_007778	CGA	2	6	3185	3190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747129
55	NC_007778	GAG	2	6	3283	3288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86747129
56	NC_007778	CGC	2	6	3354	3359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747129
57	NC_007778	TGC	2	6	3383	3388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747129
58	NC_007778	TGC	2	6	3743	3748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747130
59	NC_007778	CCG	2	6	3777	3782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747130
60	NC_007778	AGC	2	6	3827	3832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747130
61	NC_007778	GATCGA	2	12	3840	3851	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	86747130
62	NC_007778	CG	3	6	3875	3880	0 %	0 %	50 %	50 %	86747130
63	NC_007778	CTC	2	6	3901	3906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86747130
64	NC_007778	AAC	2	6	3937	3942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86747130
65	NC_007778	TGC	2	6	3947	3952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747130
66	NC_007778	GCG	2	6	4152	4157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747131
67	NC_007778	GAC	2	6	4163	4168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747131
68	NC_007778	GTG	2	6	4182	4187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86747131
69	NC_007778	CGGGG	2	10	4249	4258	0 %	0 %	80 %	20 %	86747131
70	NC_007778	GCG	2	6	4262	4267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747131
71	NC_007778	GAC	2	6	4278	4283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747131
72	NC_007778	GGC	2	6	4319	4324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747131
73	NC_007778	GC	3	6	4336	4341	0 %	0 %	50 %	50 %	86747131
74	NC_007778	GATC	2	8	4367	4374	25 %	25 %	25 %	25 %	86747131
75	NC_007778	CGC	2	6	4375	4380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747131
76	NC_007778	GC	3	6	4379	4384	0 %	0 %	50 %	50 %	86747131
77	NC_007778	CGC	2	6	4388	4393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747131
78	NC_007778	CGG	3	9	4518	4526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747131
79	NC_007778	TTC	2	6	4527	4532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86747131
80	NC_007778	CAGC	2	8	4556	4563	25 %	0 %	25 %	50 %	86747131
81	NC_007778	CTG	2	6	4614	4619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747131
82	NC_007778	CCG	2	6	4669	4674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747131
83	NC_007778	TCGCGG	3	18	4678	4695	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	86747131
84	NC_007778	CGC	2	6	4724	4729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747131
85	NC_007778	CGCGG	2	10	4743	4752	0 %	0 %	60 %	40 %	86747131
86	NC_007778	TGGA	2	8	4791	4798	25 %	25 %	50 %	0 %	86747131
87	NC_007778	GC	3	6	4801	4806	0 %	0 %	50 %	50 %	86747131
88	NC_007778	CGG	2	6	4825	4830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747131
89	NC_007778	GCC	2	6	4864	4869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747131
90	NC_007778	CG	3	6	4870	4875	0 %	0 %	50 %	50 %	86747131
91	NC_007778	CGC	3	9	4877	4885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747131
92	NC_007778	GACC	2	8	4913	4920	25 %	0 %	25 %	50 %	86747131
93	NC_007778	GTC	2	6	4926	4931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747131
94	NC_007778	GC	3	6	4953	4958	0 %	0 %	50 %	50 %	86747131
95	NC_007778	GCT	2	6	4985	4990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747131
96	NC_007778	CGC	2	6	5044	5049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747131
97	NC_007778	TGC	3	9	5050	5058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747131
98	NC_007778	CGA	2	6	5060	5065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747131
99	NC_007778	GGT	2	6	5066	5071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86747131
100	NC_007778	GC	3	6	5093	5098	0 %	0 %	50 %	50 %	86747131
101	NC_007778	CCGG	2	8	5209	5216	0 %	0 %	50 %	50 %	86747131
102	NC_007778	CAA	2	6	5226	5231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86747131
103	NC_007778	CCCG	2	8	5471	5478	0 %	0 %	25 %	75 %	86747132
104	NC_007778	CGA	2	6	5596	5601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747132
105	NC_007778	CAC	2	6	5615	5620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86747132
106	NC_007778	GTC	2	6	5633	5638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747132
107	NC_007778	CGA	2	6	5650	5655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747132
108	NC_007778	GCCAC	2	10	5667	5676	20 %	0 %	20 %	60 %	86747132
109	NC_007778	CGA	2	6	5722	5727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747132
110	NC_007778	CGG	2	6	5772	5777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747132
111	NC_007778	TCA	2	6	5784	5789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86747132
112	NC_007778	CGG	2	6	5806	5811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747132
113	NC_007778	CGG	2	6	5842	5847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747132
114	NC_007778	CGGCGT	2	12	5854	5865	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	86747132
115	NC_007778	GGT	2	6	5869	5874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86747132
116	NC_007778	CAT	2	6	5929	5934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86747132
117	NC_007778	GAG	2	6	6152	6157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86747132
118	NC_007778	GCG	2	6	6171	6176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747132
119	NC_007778	CAA	2	6	6205	6210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86747132
120	NC_007778	GGC	2	6	6241	6246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86747132
121	NC_007778	TGG	2	6	6281	6286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86747132
122	NC_007778	GTGCT	2	10	6308	6317	0 %	40 %	40 %	20 %	86747132
123	NC_007778	CAA	2	6	6322	6327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86747132
124	NC_007778	GGT	2	6	6344	6349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86747132
125	NC_007778	CCGCG	2	10	6367	6376	0 %	0 %	40 %	60 %	86747132
126	NC_007778	AAG	2	6	6416	6421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86747132
127	NC_007778	CGA	2	6	6442	6447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747132
128	NC_007778	TCG	2	6	6503	6508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747132
129	NC_007778	CCGG	2	8	6541	6548	0 %	0 %	50 %	50 %	86747132
130	NC_007778	CCG	2	6	6600	6605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747132
131	NC_007778	TCG	2	6	6618	6623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747132
132	NC_007778	GCC	4	12	6638	6649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86747132
133	NC_007778	CG	3	6	6658	6663	0 %	0 %	50 %	50 %	86747132
134	NC_007778	GC	3	6	6668	6673	0 %	0 %	50 %	50 %	86747132
135	NC_007778	GC	3	6	6693	6698	0 %	0 %	50 %	50 %	86747132
136	NC_007778	TCG	2	6	6771	6776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86747132
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271	NC_007778	AGC	2	6	11872	11877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86747138
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