MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42f

Total Repeats: 13053

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_007766	GCCC	2	8	562109	562116	0 %	0 %	25 %	75 %	86361226
11502	NC_007766	GCC	2	6	562124	562129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361226
11503	NC_007766	CGGC	2	8	562174	562181	0 %	0 %	50 %	50 %	86361226
11504	NC_007766	GCA	2	6	562233	562238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361226
11505	NC_007766	CAC	2	6	562265	562270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86361226
11506	NC_007766	GGC	2	6	562360	562365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361227
11507	NC_007766	TGTT	2	8	562370	562377	0 %	75 %	25 %	0 %	86361227
11508	NC_007766	CGGC	2	8	562401	562408	0 %	0 %	50 %	50 %	86361227
11509	NC_007766	CGC	2	6	562451	562456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361227
11510	NC_007766	GC	3	6	562493	562498	0 %	0 %	50 %	50 %	86361227
11511	NC_007766	GGA	2	6	562518	562523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86361227
11512	NC_007766	CCGG	2	8	562666	562673	0 %	0 %	50 %	50 %	86361227
11513	NC_007766	CCCG	2	8	562707	562714	0 %	0 %	25 %	75 %	86361227
11514	NC_007766	GAA	2	6	562860	562865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86361227
11515	NC_007766	CGA	2	6	562869	562874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361227
11516	NC_007766	CTG	2	6	562927	562932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361227
11517	NC_007766	GCC	2	6	562950	562955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361227
11518	NC_007766	TTCGAG	2	12	563020	563031	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	86361227
11519	NC_007766	AAGC	2	8	563091	563098	50 %	0 %	25 %	25 %	86361227
11520	NC_007766	GAA	2	6	563103	563108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86361227
11521	NC_007766	CGA	2	6	563115	563120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361227
11522	NC_007766	GCA	2	6	563263	563268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361228
11523	NC_007766	GAC	2	6	563288	563293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361228
11524	NC_007766	GCG	2	6	563328	563333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361228
11525	NC_007766	CGAGGC	2	12	563417	563428	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	86361228
11526	NC_007766	TGA	2	6	563440	563445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86361228
11527	NC_007766	GCG	2	6	563466	563471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361228
11528	NC_007766	ATG	2	6	563526	563531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86361228
11529	NC_007766	TCGG	2	8	563561	563568	0 %	25 %	50 %	25 %	86361228
11530	NC_007766	GTAGGC	2	12	563633	563644	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	86361228
11531	NC_007766	GTC	2	6	563678	563683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361228
11532	NC_007766	GCAGAT	2	12	563690	563701	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	86361228
11533	NC_007766	CGG	2	6	563716	563721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361228
11534	NC_007766	TCA	2	6	563752	563757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361228
11535	NC_007766	ACGA	2	8	563766	563773	50 %	0 %	25 %	25 %	86361228
11536	NC_007766	GAT	2	6	563792	563797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86361228
11537	NC_007766	GGC	2	6	563834	563839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361228
11538	NC_007766	ATCG	2	8	563913	563920	25 %	25 %	25 %	25 %	86361228
11539	NC_007766	TTC	2	6	563951	563956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86361229
11540	NC_007766	GGC	2	6	563989	563994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361229
11541	NC_007766	GTC	2	6	564004	564009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361229
11542	NC_007766	AGG	2	6	564044	564049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86361229
11543	NC_007766	AGC	2	6	564065	564070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361229
11544	NC_007766	AGAT	2	8	564083	564090	50 %	25 %	25 %	0 %	86361229
11545	NC_007766	GCC	2	6	564123	564128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361230
11546	NC_007766	GC	4	8	564130	564137	0 %	0 %	50 %	50 %	86361230
11547	NC_007766	ACG	2	6	564193	564198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361230
11548	NC_007766	CGA	2	6	564204	564209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361230
11549	NC_007766	CCG	2	6	564224	564229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361230
11550	NC_007766	GCG	2	6	564236	564241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361230
11551	NC_007766	CG	3	6	564331	564336	0 %	0 %	50 %	50 %	86361230
11552	NC_007766	CGGCA	2	10	564351	564360	20 %	0 %	40 %	40 %	86361230
11553	NC_007766	CGG	2	6	564389	564394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361230
11554	NC_007766	CCTG	2	8	564395	564402	0 %	25 %	25 %	50 %	86361230
11555	NC_007766	GGCG	2	8	564420	564427	0 %	0 %	75 %	25 %	86361230
11556	NC_007766	GCG	2	6	564442	564447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361230
11557	NC_007766	GGGC	2	8	564452	564459	0 %	0 %	75 %	25 %	86361230
11558	NC_007766	CGA	2	6	564593	564598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361230
11559	NC_007766	ATC	2	6	564619	564624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361230
11560	NC_007766	GCG	2	6	564643	564648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361230
11561	NC_007766	GTC	2	6	564687	564692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361230
11562	NC_007766	TTC	2	6	564721	564726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86361230
11563	NC_007766	ACC	2	6	564733	564738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86361230
11564	NC_007766	GCC	2	6	564757	564762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361230
11565	NC_007766	CCG	2	6	564841	564846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361230
11566	NC_007766	CGAAGG	2	12	564866	564877	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	86361230
11567	NC_007766	GGC	2	6	564998	565003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361230
11568	NC_007766	CGA	2	6	565034	565039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361230
11569	NC_007766	ATG	2	6	565084	565089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86361230
11570	NC_007766	CGG	2	6	565093	565098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361230
11571	NC_007766	ACC	2	6	565126	565131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86361230
11572	NC_007766	ACCGCG	2	12	565174	565185	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	86361230
11573	NC_007766	CGC	2	6	565208	565213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361230
11574	NC_007766	AGG	2	6	565235	565240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86361230
11575	NC_007766	ACG	2	6	565258	565263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361230
11576	NC_007766	TGC	2	6	565275	565280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361230
11577	NC_007766	GCC	2	6	565314	565319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361230
11578	NC_007766	GCC	2	6	565324	565329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361230
11579	NC_007766	GAT	2	6	565341	565346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86361230
11580	NC_007766	AAG	2	6	565353	565358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86361230
11581	NC_007766	TCG	2	6	565376	565381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361230
11582	NC_007766	CTGC	2	8	565432	565439	0 %	25 %	25 %	50 %	86361230
11583	NC_007766	GCT	2	6	565455	565460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361230
11584	NC_007766	CGC	2	6	565496	565501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361230
11585	NC_007766	GCCG	2	8	565533	565540	0 %	0 %	50 %	50 %	86361230
11586	NC_007766	TCAGCA	2	12	565604	565615	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	86361230
11587	NC_007766	CG	3	6	565622	565627	0 %	0 %	50 %	50 %	86361230
11588	NC_007766	CGC	2	6	565653	565658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361230
11589	NC_007766	CAG	2	6	565701	565706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361230
11590	NC_007766	CAG	2	6	565713	565718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361230
11591	NC_007766	GC	3	6	565841	565846	0 %	0 %	50 %	50 %	86361230
11592	NC_007766	GAA	3	9	565860	565868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86361230
11593	NC_007766	GCGCCG	2	12	565886	565897	0 %	0 %	50 %	50 %	86361230
11594	NC_007766	ATC	2	6	565900	565905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361230
11595	NC_007766	CG	3	6	565928	565933	0 %	0 %	50 %	50 %	86361230
11596	NC_007766	CGC	2	6	565935	565940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361230
11597	NC_007766	AGC	2	6	565969	565974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361230
11598	NC_007766	ATG	2	6	565975	565980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86361230
11599	NC_007766	CAG	3	9	566013	566021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361230
11600	NC_007766	CGGT	2	8	566035	566042	0 %	25 %	50 %	25 %	86361230
11601	NC_007766	CGC	2	6	566094	566099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361230
11602	NC_007766	CGGA	2	8	566108	566115	25 %	0 %	50 %	25 %	86361230
11603	NC_007766	CGCC	2	8	566121	566128	0 %	0 %	25 %	75 %	86361230
11604	NC_007766	TCC	2	6	566137	566142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86361230
11605	NC_007766	GCC	2	6	566238	566243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361230
11606	NC_007766	TGGC	2	8	566299	566306	0 %	25 %	50 %	25 %	86361230
11607	NC_007766	CTT	2	6	566315	566320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86361230
11608	NC_007766	GGA	2	6	566328	566333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86361230
11609	NC_007766	AGC	2	6	566372	566377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361230
11610	NC_007766	GAC	2	6	566426	566431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361231
11611	NC_007766	CGA	2	6	566458	566463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361231
11612	NC_007766	CGC	2	6	566470	566475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361231
11613	NC_007766	TCG	2	6	566580	566585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361231
11614	NC_007766	C	6	6	566601	566606	0 %	0 %	0 %	100 %	86361231
11615	NC_007766	AG	3	6	566647	566652	50 %	0 %	50 %	0 %	86361231
11616	NC_007766	GGC	2	6	566669	566674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361231
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11618	NC_007766	CTGG	2	8	566711	566718	0 %	25 %	50 %	25 %	86361231
11619	NC_007766	CAC	2	6	566795	566800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86361231
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11621	NC_007766	AGC	2	6	566823	566828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361231
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11982	NC_007766	TGCG	2	8	584957	584964	0 %	25 %	50 %	25 %	86361248
11983	NC_007766	CGC	3	9	584992	585000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361248
11984	NC_007766	GC	3	6	585019	585024	0 %	0 %	50 %	50 %	86361248
11985	NC_007766	CGC	2	6	585048	585053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361248
11986	NC_007766	ACG	2	6	585062	585067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361248
11987	NC_007766	ACCCG	2	10	585127	585136	20 %	0 %	20 %	60 %	86361248
11988	NC_007766	GAT	2	6	585184	585189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86361248
11989	NC_007766	AGA	2	6	585218	585223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86361248
11990	NC_007766	GCA	2	6	585240	585245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361248
11991	NC_007766	GCC	2	6	585312	585317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361248
11992	NC_007766	ATC	2	6	585355	585360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361248
11993	NC_007766	GC	3	6	585400	585405	0 %	0 %	50 %	50 %	86361248
11994	NC_007766	CTC	2	6	585478	585483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86361248
11995	NC_007766	TCG	2	6	585536	585541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361248
11996	NC_007766	CTT	2	6	585556	585561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86361248
11997	NC_007766	CAGC	2	8	585618	585625	25 %	0 %	25 %	50 %	86361248
11998	NC_007766	TGC	2	6	585690	585695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361248
11999	NC_007766	CGA	2	6	585717	585722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361248
12000	NC_007766	CCG	2	6	585723	585728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361248

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