MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42f

Total Repeats: 13053

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_007766	AGC	2	6	535460	535465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361203
11002	NC_007766	GC	3	6	535492	535497	0 %	0 %	50 %	50 %	86361203
11003	NC_007766	CGC	2	6	535602	535607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361203
11004	NC_007766	CCGT	2	8	535622	535629	0 %	25 %	25 %	50 %	86361203
11005	NC_007766	GTC	2	6	535670	535675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361203
11006	NC_007766	TTC	2	6	535708	535713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86361203
11007	NC_007766	GCG	2	6	536010	536015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361204
11008	NC_007766	CTG	2	6	536089	536094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361204
11009	NC_007766	CTG	2	6	536119	536124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361204
11010	NC_007766	CTG	2	6	536197	536202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361204
11011	NC_007766	TGA	2	6	536285	536290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86361204
11012	NC_007766	TCGC	2	8	536318	536325	0 %	25 %	25 %	50 %	86361204
11013	NC_007766	CGC	2	6	536349	536354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361204
11014	NC_007766	TCGA	2	8	536383	536390	25 %	25 %	25 %	25 %	86361204
11015	NC_007766	CGG	2	6	536490	536495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361204
11016	NC_007766	GCC	2	6	536513	536518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361204
11017	NC_007766	CT	4	8	536549	536556	0 %	50 %	0 %	50 %	86361205
11018	NC_007766	GC	3	6	536565	536570	0 %	0 %	50 %	50 %	86361205
11019	NC_007766	ATG	2	6	536581	536586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86361205
11020	NC_007766	CGT	2	6	536634	536639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361205
11021	NC_007766	CGC	2	6	536660	536665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361205
11022	NC_007766	CGG	3	9	536699	536707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361205
11023	NC_007766	CGT	2	6	536708	536713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361205
11024	NC_007766	GCC	2	6	536751	536756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361205
11025	NC_007766	GGAA	2	8	536786	536793	50 %	0 %	50 %	0 %	86361205
11026	NC_007766	TCG	2	6	536851	536856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361205
11027	NC_007766	TCG	2	6	536863	536868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361205
11028	NC_007766	ACG	2	6	536905	536910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361205
11029	NC_007766	CCT	2	6	536945	536950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86361205
11030	NC_007766	CCTG	2	8	536957	536964	0 %	25 %	25 %	50 %	86361205
11031	NC_007766	CTGA	2	8	537021	537028	25 %	25 %	25 %	25 %	86361205
11032	NC_007766	GCC	2	6	537202	537207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361205
11033	NC_007766	GGC	2	6	537274	537279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361205
11034	NC_007766	AT	3	6	537343	537348	50 %	50 %	0 %	0 %	86361205
11035	NC_007766	TG	3	6	537354	537359	0 %	50 %	50 %	0 %	86361205
11036	NC_007766	GCAT	2	8	537386	537393	25 %	25 %	25 %	25 %	86361205
11037	NC_007766	CAG	2	6	537565	537570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361206
11038	NC_007766	CG	3	6	537585	537590	0 %	0 %	50 %	50 %	86361206
11039	NC_007766	GCA	2	6	537680	537685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361206
11040	NC_007766	CAT	2	6	537732	537737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361206
11041	NC_007766	CGA	2	6	537738	537743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361206
11042	NC_007766	GCC	2	6	537794	537799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361206
11043	NC_007766	TCG	2	6	537821	537826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361206
11044	NC_007766	CTG	2	6	537835	537840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361206
11045	NC_007766	TGC	2	6	537848	537853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361206
11046	NC_007766	GTG	2	6	537943	537948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86361206
11047	NC_007766	CGCC	2	8	537981	537988	0 %	0 %	25 %	75 %	86361206
11048	NC_007766	TCG	2	6	538007	538012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361206
11049	NC_007766	ATT	2	6	538028	538033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86361206
11050	NC_007766	TC	3	6	538068	538073	0 %	50 %	0 %	50 %	86361206
11051	NC_007766	ATCC	2	8	538100	538107	25 %	25 %	0 %	50 %	86361206
11052	NC_007766	CG	3	6	538135	538140	0 %	0 %	50 %	50 %	86361206
11053	NC_007766	GCT	2	6	538152	538157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361206
11054	NC_007766	CAA	2	6	538179	538184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86361206
11055	NC_007766	GCA	2	6	538204	538209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361206
11056	NC_007766	GGT	2	6	538213	538218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86361206
11057	NC_007766	CAGC	2	8	538252	538259	25 %	0 %	25 %	50 %	86361206
11058	NC_007766	CCT	2	6	538292	538297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86361206
11059	NC_007766	GCTC	2	8	538313	538320	0 %	25 %	25 %	50 %	86361206
11060	NC_007766	TCG	3	9	538379	538387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361206
11061	NC_007766	CAGC	2	8	538424	538431	25 %	0 %	25 %	50 %	86361206
11062	NC_007766	GGA	2	6	538606	538611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86361207
11063	NC_007766	GCCA	2	8	538640	538647	25 %	0 %	25 %	50 %	86361207
11064	NC_007766	GCC	2	6	538694	538699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361207
11065	NC_007766	ATCG	2	8	538770	538777	25 %	25 %	25 %	25 %	86361207
11066	NC_007766	ACG	2	6	538847	538852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361207
11067	NC_007766	GCA	2	6	538866	538871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361207
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11069	NC_007766	TCAC	2	8	539063	539070	25 %	25 %	0 %	50 %	86361207
11070	NC_007766	CGC	2	6	539094	539099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361207
11071	NC_007766	GAG	2	6	539199	539204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86361207
11072	NC_007766	AAG	2	6	539205	539210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86361207
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11075	NC_007766	CAA	2	6	539334	539339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86361207
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11080	NC_007766	TTCG	2	8	539665	539672	0 %	50 %	25 %	25 %	86361208
11081	NC_007766	CGC	3	9	539703	539711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361208
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11089	NC_007766	CTG	2	6	540254	540259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361209
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11091	NC_007766	TCG	2	6	540333	540338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361209
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11102	NC_007766	TAT	2	6	540746	540751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86361210
11103	NC_007766	GC	3	6	540771	540776	0 %	0 %	50 %	50 %	86361210
11104	NC_007766	GCC	3	9	540813	540821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361210
11105	NC_007766	CGT	2	6	540854	540859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361210
11106	NC_007766	TCGA	2	8	540868	540875	25 %	25 %	25 %	25 %	86361210
11107	NC_007766	TCG	3	9	540883	540891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361210
11108	NC_007766	GGC	2	6	540921	540926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361210
11109	NC_007766	TTG	2	6	540940	540945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86361210
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11111	NC_007766	CGGT	2	8	540983	540990	0 %	25 %	50 %	25 %	86361210
11112	NC_007766	GC	3	6	541004	541009	0 %	0 %	50 %	50 %	86361210
11113	NC_007766	TCGTC	2	10	541013	541022	0 %	40 %	20 %	40 %	86361210
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11116	NC_007766	GAT	2	6	541134	541139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86361210
11117	NC_007766	TGCA	2	8	541153	541160	25 %	25 %	25 %	25 %	86361210
11118	NC_007766	TGC	2	6	541162	541167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361210
11119	NC_007766	CCG	2	6	541233	541238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361210
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11121	NC_007766	CGA	2	6	541373	541378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361210
11122	NC_007766	GCC	2	6	541402	541407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361210
11123	NC_007766	GAA	2	6	541416	541421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86361210
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11222	NC_007766	TGA	2	6	545178	545183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86361213
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11230	NC_007766	TCG	2	6	545334	545339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361213
11231	NC_007766	CTT	2	6	545371	545376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86361213
11232	NC_007766	TCG	2	6	545400	545405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361213
11233	NC_007766	GCT	2	6	545449	545454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361213
11234	NC_007766	CGG	3	9	545476	545484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361213
11235	NC_007766	CGG	2	6	545494	545499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361213
11236	NC_007766	GC	3	6	545529	545534	0 %	0 %	50 %	50 %	86361213
11237	NC_007766	TGACGC	2	12	545535	545546	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	86361213
11238	NC_007766	TCCT	2	8	545564	545571	0 %	50 %	0 %	50 %	86361213
11239	NC_007766	ATC	2	6	545618	545623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361213
11240	NC_007766	CGC	2	6	545672	545677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86361213
11241	NC_007766	GGC	2	6	545799	545804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361214
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11272	NC_007766	GGCG	2	8	546918	546925	0 %	0 %	75 %	25 %	86361215
11273	NC_007766	GC	3	6	546985	546990	0 %	0 %	50 %	50 %	86361215
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11482	NC_007766	GGC	2	6	561225	561230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361225
11483	NC_007766	GGC	2	6	561252	561257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361225
11484	NC_007766	AGC	2	6	561304	561309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361225
11485	NC_007766	GCA	2	6	561338	561343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361225
11486	NC_007766	GGCCGG	2	12	561366	561377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361225
11487	NC_007766	GCGA	2	8	561427	561434	25 %	0 %	50 %	25 %	86361225
11488	NC_007766	GC	3	6	561506	561511	0 %	0 %	50 %	50 %	86361225
11489	NC_007766	CAT	2	6	561540	561545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86361225
11490	NC_007766	GCGAAT	2	12	561599	561610	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	86361225
11491	NC_007766	GAC	2	6	561642	561647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86361225
11492	NC_007766	CATC	2	8	561719	561726	25 %	25 %	0 %	50 %	86361225
11493	NC_007766	CGG	2	6	561742	561747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86361225
11494	NC_007766	CGCCAG	2	12	561786	561797	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	86361225
11495	NC_007766	GAT	2	6	561822	561827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86361225
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11497	NC_007766	GTCG	2	8	561886	561893	0 %	25 %	50 %	25 %	86361226
11498	NC_007766	CCT	2	6	561898	561903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86361226
11499	NC_007766	TGC	2	6	561958	561963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86361226
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