MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42f

Total Repeats: 13053

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007766	GA	3	6	27088	27093	50 %	0 %	50 %	0 %	86360760
502	NC_007766	TGA	2	6	27189	27194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360760
503	NC_007766	ACA	2	6	27342	27347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360761
504	NC_007766	TGC	2	6	27424	27429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360761
505	NC_007766	GC	3	6	27445	27450	0 %	0 %	50 %	50 %	86360761
506	NC_007766	CGG	2	6	27476	27481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360761
507	NC_007766	GCG	2	6	27519	27524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360761
508	NC_007766	ACG	2	6	27582	27587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360761
509	NC_007766	AGCATC	2	12	27618	27629	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	86360761
510	NC_007766	CGA	2	6	27653	27658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360761
511	NC_007766	GGC	2	6	27700	27705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360761
512	NC_007766	CTC	2	6	27756	27761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360761
513	NC_007766	AGG	2	6	27763	27768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360761
514	NC_007766	CTG	2	6	27819	27824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360761
515	NC_007766	GAGC	2	8	27842	27849	25 %	0 %	50 %	25 %	86360761
516	NC_007766	CCT	2	6	27869	27874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360761
517	NC_007766	GCCC	2	8	27971	27978	0 %	0 %	25 %	75 %	86360761
518	NC_007766	ACC	2	6	28515	28520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360762
519	NC_007766	CGAG	2	8	28529	28536	25 %	0 %	50 %	25 %	86360762
520	NC_007766	GCC	2	6	28557	28562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360762
521	NC_007766	CGA	2	6	28565	28570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360762
522	NC_007766	ATTG	2	8	28592	28599	25 %	50 %	25 %	0 %	86360762
523	NC_007766	CTG	2	6	28647	28652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360762
524	NC_007766	TGT	2	6	28661	28666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360762
525	NC_007766	TGC	2	6	28688	28693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360762
526	NC_007766	GCCT	2	8	28759	28766	0 %	25 %	25 %	50 %	86360762
527	NC_007766	GGCGCC	2	12	28782	28793	0 %	0 %	50 %	50 %	86360762
528	NC_007766	CCGTC	2	10	28855	28864	0 %	20 %	20 %	60 %	86360762
529	NC_007766	TTGC	2	8	28881	28888	0 %	50 %	25 %	25 %	86360762
530	NC_007766	TGCT	2	8	28985	28992	0 %	50 %	25 %	25 %	86360762
531	NC_007766	GGC	2	6	29013	29018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360762
532	NC_007766	GCT	2	6	29078	29083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360762
533	NC_007766	ATC	2	6	29091	29096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360762
534	NC_007766	TGG	2	6	29156	29161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360762
535	NC_007766	GCT	2	6	29168	29173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360762
536	NC_007766	TCG	2	6	29229	29234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360762
537	NC_007766	GAAG	2	8	29277	29284	50 %	0 %	50 %	0 %	86360762
538	NC_007766	GCT	2	6	29359	29364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360762
539	NC_007766	CT	3	6	29476	29481	0 %	50 %	0 %	50 %	86360763
540	NC_007766	TCA	3	9	29488	29496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360763
541	NC_007766	GCA	2	6	29515	29520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360763
542	NC_007766	CAG	2	6	29582	29587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360763
543	NC_007766	GAC	2	6	29638	29643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360763
544	NC_007766	CGA	2	6	29659	29664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360763
545	NC_007766	CCGCCA	2	12	29761	29772	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	86360763
546	NC_007766	CGA	2	6	29788	29793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360763
547	NC_007766	GGC	2	6	29795	29800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360763
548	NC_007766	TGC	2	6	29838	29843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360763
549	NC_007766	GGC	2	6	29871	29876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360763
550	NC_007766	ACGAGC	2	12	29877	29888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360763
551	NC_007766	GAC	2	6	29954	29959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360763
552	NC_007766	TCA	2	6	30015	30020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360763
553	NC_007766	AGC	2	6	30021	30026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360763
554	NC_007766	GCT	2	6	30091	30096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360763
555	NC_007766	GCA	2	6	30121	30126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360763
556	NC_007766	CCA	2	6	30154	30159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360763
557	NC_007766	GGC	2	6	30185	30190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360763
558	NC_007766	TGC	2	6	30196	30201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360763
559	NC_007766	GCG	2	6	30216	30221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360763
560	NC_007766	GCA	2	6	30265	30270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360763
561	NC_007766	CCG	2	6	30308	30313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360763
562	NC_007766	CGC	2	6	30323	30328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360763
563	NC_007766	TCA	2	6	30373	30378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360763
564	NC_007766	GAT	2	6	30686	30691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360764
565	NC_007766	GGC	2	6	30700	30705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360764
566	NC_007766	GC	3	6	30736	30741	0 %	0 %	50 %	50 %	86360764
567	NC_007766	AGCG	2	8	30796	30803	25 %	0 %	50 %	25 %	86360764
568	NC_007766	GC	3	6	30899	30904	0 %	0 %	50 %	50 %	86360764
569	NC_007766	GTC	2	6	30910	30915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360764
570	NC_007766	GC	3	6	30953	30958	0 %	0 %	50 %	50 %	86360764
571	NC_007766	GCC	2	6	31019	31024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360764
572	NC_007766	CGG	2	6	31035	31040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360764
573	NC_007766	GCC	3	9	31082	31090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360764
574	NC_007766	TCGCCG	2	12	31121	31132	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	86360764
575	NC_007766	GAT	2	6	31155	31160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360764
576	NC_007766	CG	3	6	31166	31171	0 %	0 %	50 %	50 %	86360764
577	NC_007766	CCT	2	6	31237	31242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360765
578	NC_007766	GAT	2	6	31263	31268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360765
579	NC_007766	TCG	3	9	31286	31294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360765
580	NC_007766	CGCC	2	8	31317	31324	0 %	0 %	25 %	75 %	86360765
581	NC_007766	CGAG	2	8	31329	31336	25 %	0 %	50 %	25 %	86360765
582	NC_007766	CGA	2	6	31350	31355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360765
583	NC_007766	TG	3	6	31360	31365	0 %	50 %	50 %	0 %	86360765
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588	NC_007766	TCG	2	6	31517	31522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360765
589	NC_007766	CG	3	6	31551	31556	0 %	0 %	50 %	50 %	86360765
590	NC_007766	ATCTCC	2	12	31589	31600	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	86360765
591	NC_007766	GC	3	6	31678	31683	0 %	0 %	50 %	50 %	86360765
592	NC_007766	CG	3	6	31699	31704	0 %	0 %	50 %	50 %	86360765
593	NC_007766	AGA	2	6	31727	31732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360765
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595	NC_007766	CGG	2	6	31746	31751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360765
596	NC_007766	TGAAGA	2	12	31755	31766	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	86360765
597	NC_007766	CGC	2	6	31779	31784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360765
598	NC_007766	GCC	2	6	31785	31790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360765
599	NC_007766	TCG	2	6	31823	31828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360765
600	NC_007766	GTC	2	6	31855	31860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360765
601	NC_007766	CCG	2	6	31875	31880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360765
602	NC_007766	TCA	2	6	31893	31898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360765
603	NC_007766	CGC	2	6	31938	31943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360765
604	NC_007766	GATCG	2	10	31969	31978	20 %	20 %	40 %	20 %	86360765
605	NC_007766	GGC	3	9	31979	31987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360765
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607	NC_007766	GCC	3	9	32068	32076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360765
608	NC_007766	CCTTGC	2	12	32091	32102	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	86360765
609	NC_007766	ATG	2	6	32120	32125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360765
610	NC_007766	GC	3	6	32126	32131	0 %	0 %	50 %	50 %	86360765
611	NC_007766	CGT	2	6	32136	32141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360765
612	NC_007766	GCA	2	6	32184	32189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360765
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614	NC_007766	GCG	2	6	32408	32413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360766
615	NC_007766	CGA	2	6	32421	32426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360766
616	NC_007766	GCC	3	9	32517	32525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360766
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620	NC_007766	CGGA	2	8	32798	32805	25 %	0 %	50 %	25 %	86360766
621	NC_007766	TGA	2	6	32811	32816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360766
622	NC_007766	TCG	2	6	32852	32857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360766
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624	NC_007766	GGC	2	6	32980	32985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360766
625	NC_007766	GAGGG	2	10	33010	33019	20 %	0 %	80 %	0 %	86360766
626	NC_007766	TGC	2	6	33033	33038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360766
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