MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42f

Total Repeats: 13053

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_007766	GCC	2	6	280838	280843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360993
5502	NC_007766	ATC	2	6	280854	280859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360993
5503	NC_007766	GCT	2	6	280873	280878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360993
5504	NC_007766	GCG	2	6	280885	280890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360993
5505	NC_007766	CCA	2	6	280951	280956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360993
5506	NC_007766	GA	3	6	280978	280983	50 %	0 %	50 %	0 %	86360993
5507	NC_007766	CCG	3	9	280992	281000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360993
5508	NC_007766	CAG	2	6	281009	281014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360993
5509	NC_007766	CGA	2	6	281072	281077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360993
5510	NC_007766	GGC	2	6	281102	281107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360993
5511	NC_007766	CTC	2	6	281174	281179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360993
5512	NC_007766	TCG	2	6	281214	281219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360993
5513	NC_007766	CAG	2	6	281294	281299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360993
5514	NC_007766	GTCG	2	8	281327	281334	0 %	25 %	50 %	25 %	86360993
5515	NC_007766	GGC	2	6	281415	281420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360993
5516	NC_007766	TGG	2	6	281580	281585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360993
5517	NC_007766	TCG	2	6	281589	281594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360993
5518	NC_007766	CGG	2	6	281715	281720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360993
5519	NC_007766	GAA	2	6	281731	281736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360993
5520	NC_007766	GAA	2	6	281831	281836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360993
5521	NC_007766	ATC	2	6	281844	281849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360993
5522	NC_007766	GCCGTC	2	12	281855	281866	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	86360993
5523	NC_007766	TGA	2	6	281898	281903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360993
5524	NC_007766	GCG	2	6	281914	281919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360993
5525	NC_007766	AGG	2	6	281923	281928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360993
5526	NC_007766	CCA	2	6	282007	282012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360993
5527	NC_007766	CCGG	2	8	282028	282035	0 %	0 %	50 %	50 %	86360993
5528	NC_007766	GAT	2	6	282148	282153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360993
5529	NC_007766	CGAT	2	8	282159	282166	25 %	25 %	25 %	25 %	86360993
5530	NC_007766	AGC	2	6	282196	282201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360993
5531	NC_007766	TCC	2	6	282228	282233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360993
5532	NC_007766	GCCG	2	8	282238	282245	0 %	0 %	50 %	50 %	86360993
5533	NC_007766	CG	3	6	282253	282258	0 %	0 %	50 %	50 %	86360993
5534	NC_007766	GCA	2	6	282273	282278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360993
5535	NC_007766	CACTT	2	10	282287	282296	20 %	40 %	0 %	40 %	86360993
5536	NC_007766	GCT	2	6	283049	283054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360994
5537	NC_007766	GC	3	6	283170	283175	0 %	0 %	50 %	50 %	86360994
5538	NC_007766	GGCAT	2	10	283198	283207	20 %	20 %	40 %	20 %	86360994
5539	NC_007766	TGA	2	6	283214	283219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360994
5540	NC_007766	CCG	2	6	283237	283242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360994
5541	NC_007766	GCC	2	6	283273	283278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360994
5542	NC_007766	TCC	2	6	283300	283305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360994
5543	NC_007766	TCG	3	9	283339	283347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360994
5544	NC_007766	ACG	2	6	283348	283353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360994
5545	NC_007766	CCG	2	6	283409	283414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360994
5546	NC_007766	GTG	2	6	283570	283575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360994
5547	NC_007766	CGG	2	6	283586	283591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360994
5548	NC_007766	CCGG	2	8	283669	283676	0 %	0 %	50 %	50 %	86360994
5549	NC_007766	CCG	2	6	283688	283693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360994
5550	NC_007766	CCG	2	6	283714	283719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360994
5551	NC_007766	GAG	2	6	283755	283760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360994
5552	NC_007766	CCA	2	6	283784	283789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360994
5553	NC_007766	GCGA	2	8	283920	283927	25 %	0 %	50 %	25 %	86360994
5554	NC_007766	GCC	2	6	283966	283971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360994
5555	NC_007766	TTCGC	2	10	283995	284004	0 %	40 %	20 %	40 %	86360994
5556	NC_007766	CCG	2	6	284009	284014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360994
5557	NC_007766	CTT	2	6	284022	284027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360994
5558	NC_007766	TTG	2	6	284065	284070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360994
5559	NC_007766	CGC	2	6	284084	284089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360994
5560	NC_007766	CCT	2	6	284144	284149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360994
5561	NC_007766	CG	3	6	284156	284161	0 %	0 %	50 %	50 %	86360994
5562	NC_007766	CTC	2	6	284187	284192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360994
5563	NC_007766	GCC	2	6	284212	284217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360994
5564	NC_007766	CGG	2	6	284231	284236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360994
5565	NC_007766	CGG	2	6	284417	284422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360994
5566	NC_007766	TGC	2	6	284458	284463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360994
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5569	NC_007766	GCA	2	6	284540	284545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360994
5570	NC_007766	CG	3	6	284561	284566	0 %	0 %	50 %	50 %	86360994
5571	NC_007766	GTC	2	6	284640	284645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360994
5572	NC_007766	GAG	2	6	284649	284654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360994
5573	NC_007766	GCT	2	6	284718	284723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360995
5574	NC_007766	GCC	2	6	284823	284828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360995
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5579	NC_007766	GCT	2	6	284995	285000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360995
5580	NC_007766	CAT	2	6	285021	285026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360995
5581	NC_007766	CGA	2	6	285030	285035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360995
5582	NC_007766	GCA	2	6	285036	285041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360995
5583	NC_007766	GCTT	2	8	285092	285099	0 %	50 %	25 %	25 %	86360995
5584	NC_007766	CGGC	2	8	285102	285109	0 %	0 %	50 %	50 %	86360995
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5589	NC_007766	CCGG	2	8	285238	285245	0 %	0 %	50 %	50 %	86360995
5590	NC_007766	ACC	3	9	285251	285259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360995
5591	NC_007766	TCG	2	6	285281	285286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360995
5592	NC_007766	ATGTCG	2	12	285407	285418	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	86360995
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5595	NC_007766	GCA	2	6	285474	285479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360995
5596	NC_007766	GCT	2	6	285480	285485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360995
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5598	NC_007766	CGT	2	6	285544	285549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360995
5599	NC_007766	TCG	2	6	285602	285607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360995
5600	NC_007766	TGA	2	6	285612	285617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360995
5601	NC_007766	CCA	2	6	285765	285770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360995
5602	NC_007766	CGA	2	6	285801	285806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360995
5603	NC_007766	CGA	3	9	285834	285842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360995
5604	NC_007766	GCA	2	6	285843	285848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360995
5605	NC_007766	GTC	2	6	285877	285882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360995
5606	NC_007766	GCC	2	6	285920	285925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360995
5607	NC_007766	CGA	2	6	285936	285941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360995
5608	NC_007766	CGC	2	6	285946	285951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360995
5609	NC_007766	TGC	2	6	286020	286025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360995
5610	NC_007766	GC	3	6	286035	286040	0 %	0 %	50 %	50 %	86360995
5611	NC_007766	CGC	2	6	286056	286061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360995
5612	NC_007766	GCC	2	6	286108	286113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360995
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5616	NC_007766	ATGCCG	2	12	286184	286195	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	86360995
5617	NC_007766	CGC	2	6	286293	286298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360995
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5621	NC_007766	TGA	2	6	286542	286547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360995
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