MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42e

Total Repeats: 10909

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_007765	CGC	2	6	160471	160476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360409
3502	NC_007765	TGATC	2	10	160563	160572	20 %	40 %	20 %	20 %	86360410
3503	NC_007765	GGAT	2	8	160640	160647	25 %	25 %	50 %	0 %	86360410
3504	NC_007765	CGGCG	2	10	160745	160754	0 %	0 %	60 %	40 %	86360410
3505	NC_007765	TCG	2	6	160757	160762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360410
3506	NC_007765	CCG	2	6	160780	160785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360410
3507	NC_007765	GAC	2	6	160795	160800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360410
3508	NC_007765	TCG	2	6	160811	160816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360410
3509	NC_007765	TGG	2	6	160865	160870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360410
3510	NC_007765	GCC	2	6	160895	160900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360410
3511	NC_007765	GACC	2	8	160956	160963	25 %	0 %	25 %	50 %	86360410
3512	NC_007765	GGA	2	6	160980	160985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360410
3513	NC_007765	CAT	2	6	161046	161051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360410
3514	NC_007765	GC	3	6	161075	161080	0 %	0 %	50 %	50 %	86360410
3515	NC_007765	CCG	2	6	161114	161119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360410
3516	NC_007765	GGA	2	6	161211	161216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360410
3517	NC_007765	GAA	2	6	161241	161246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360410
3518	NC_007765	CATC	2	8	161247	161254	25 %	25 %	0 %	50 %	86360410
3519	NC_007765	CAC	2	6	161403	161408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360410
3520	NC_007765	CG	3	6	161435	161440	0 %	0 %	50 %	50 %	86360410
3521	NC_007765	GAA	2	6	161475	161480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360410
3522	NC_007765	GAT	2	6	161502	161507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360410
3523	NC_007765	GTC	2	6	161542	161547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360410
3524	NC_007765	GCT	2	6	161559	161564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360410
3525	NC_007765	TCG	2	6	161582	161587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360410
3526	NC_007765	GAA	2	6	161604	161609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360410
3527	NC_007765	CGC	2	6	161640	161645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360410
3528	NC_007765	GCC	2	6	161701	161706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360410
3529	NC_007765	GCC	2	6	161725	161730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360410
3530	NC_007765	GGC	2	6	161775	161780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360410
3531	NC_007765	GAAA	2	8	161814	161821	75 %	0 %	25 %	0 %	86360410
3532	NC_007765	GCC	2	6	161848	161853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360410
3533	NC_007765	GGC	2	6	161857	161862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360410
3534	NC_007765	GCC	3	9	161905	161913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360410
3535	NC_007765	GCC	3	9	161920	161928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360410
3536	NC_007765	CAG	2	6	161929	161934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360410
3537	NC_007765	GCC	2	6	161962	161967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360410
3538	NC_007765	TGA	2	6	162101	162106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360410
3539	NC_007765	AGGCCA	2	12	162110	162121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360410
3540	NC_007765	GCCG	2	8	162141	162148	0 %	0 %	50 %	50 %	86360410
3541	NC_007765	CGC	2	6	162168	162173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360410
3542	NC_007765	CGC	2	6	162183	162188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360410
3543	NC_007765	GGC	2	6	162207	162212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360410
3544	NC_007765	GAC	2	6	162267	162272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360410
3545	NC_007765	CCG	2	6	162284	162289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360410
3546	NC_007765	GC	3	6	162412	162417	0 %	0 %	50 %	50 %	86360410
3547	NC_007765	CGGC	2	8	162461	162468	0 %	0 %	50 %	50 %	86360410
3548	NC_007765	TGA	2	6	162494	162499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360410
3549	NC_007765	TCG	2	6	162502	162507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360410
3550	NC_007765	CGG	2	6	162519	162524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360410
3551	NC_007765	TGCA	2	8	162571	162578	25 %	25 %	25 %	25 %	86360410
3552	NC_007765	AGC	2	6	162668	162673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360410
3553	NC_007765	CGA	2	6	162678	162683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360410
3554	NC_007765	ATGG	2	8	162768	162775	25 %	25 %	50 %	0 %	86360410
3555	NC_007765	GAC	2	6	162792	162797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360410
3556	NC_007765	CAT	2	6	162822	162827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360410
3557	NC_007765	CGG	2	6	162858	162863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360410
3558	NC_007765	TCG	2	6	162899	162904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360410
3559	NC_007765	TGG	2	6	162924	162929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360410
3560	NC_007765	CAT	2	6	163977	163982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360411
3561	NC_007765	TTTGC	2	10	164003	164012	0 %	60 %	20 %	20 %	86360411
3562	NC_007765	TGA	2	6	164067	164072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360411
3563	NC_007765	AT	3	6	164101	164106	50 %	50 %	0 %	0 %	86360411
3564	NC_007765	GCC	2	6	164108	164113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360411
3565	NC_007765	TGCG	2	8	164178	164185	0 %	25 %	50 %	25 %	86360411
3566	NC_007765	CGA	2	6	164188	164193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360411
3567	NC_007765	GGCA	2	8	164194	164201	25 %	0 %	50 %	25 %	86360411
3568	NC_007765	GCG	2	6	164239	164244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360411
3569	NC_007765	GCC	2	6	164254	164259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360411
3570	NC_007765	GAT	2	6	164260	164265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360411
3571	NC_007765	CGG	2	6	164676	164681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360412
3572	NC_007765	CGG	2	6	164699	164704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360412
3573	NC_007765	GC	3	6	164728	164733	0 %	0 %	50 %	50 %	86360412
3574	NC_007765	TCG	2	6	164740	164745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360412
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3578	NC_007765	GC	4	8	165118	165125	0 %	0 %	50 %	50 %	86360413
3579	NC_007765	CG	3	6	165177	165182	0 %	0 %	50 %	50 %	86360413
3580	NC_007765	TGG	2	6	165195	165200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360413
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3582	NC_007765	TCG	2	6	165309	165314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360413
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3584	NC_007765	TCG	2	6	165366	165371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360413
3585	NC_007765	CCCG	2	8	165372	165379	0 %	0 %	25 %	75 %	86360413
3586	NC_007765	GGCC	3	12	165434	165445	0 %	0 %	50 %	50 %	86360413
3587	NC_007765	GGA	2	6	165451	165456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360413
3588	NC_007765	GAC	2	6	165460	165465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360413
3589	NC_007765	GCG	2	6	165528	165533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360413
3590	NC_007765	CCA	2	6	165567	165572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360413
3591	NC_007765	GCG	2	6	165581	165586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360413
3592	NC_007765	CTG	2	6	165635	165640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360413
3593	NC_007765	CGC	2	6	165643	165648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360413
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3598	NC_007765	GCG	2	6	165959	165964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360414
3599	NC_007765	TGT	2	6	165974	165979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360414
3600	NC_007765	TGC	2	6	166115	166120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360414
3601	NC_007765	ACC	2	6	166125	166130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360414
3602	NC_007765	TCT	2	6	166144	166149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360414
3603	NC_007765	CGA	2	6	166233	166238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360414
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3606	NC_007765	CGG	2	6	166345	166350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360414
3607	NC_007765	CGA	2	6	166370	166375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360414
3608	NC_007765	TCC	2	6	166560	166565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360415
3609	NC_007765	TC	3	6	166572	166577	0 %	50 %	0 %	50 %	86360415
3610	NC_007765	CGC	2	6	166603	166608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360415
3611	NC_007765	ATC	2	6	166612	166617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360415
3612	NC_007765	GAA	2	6	166689	166694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360415
3613	NC_007765	GCGG	2	8	166713	166720	0 %	0 %	75 %	25 %	86360415
3614	NC_007765	GTC	2	6	166726	166731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360415
3615	NC_007765	ATC	2	6	166852	166857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360415
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3619	NC_007765	AGCC	2	8	167009	167016	25 %	0 %	25 %	50 %	86360416
3620	NC_007765	TGG	2	6	167033	167038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360416
3621	NC_007765	CGG	2	6	167095	167100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360416
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3623	NC_007765	GGT	2	6	167167	167172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360416
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3991	NC_007765	TGA	2	6	185881	185886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360433
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