MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42e

Total Repeats: 10909

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_007765	GAC	2	6	288285	288290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360530
6002	NC_007765	GGT	2	6	288342	288347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360530
6003	NC_007765	TCG	2	6	288427	288432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360530
6004	NC_007765	GCC	2	6	288492	288497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360530
6005	NC_007765	CGG	2	6	288568	288573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360530
6006	NC_007765	GCC	2	6	288590	288595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360530
6007	NC_007765	GC	3	6	288596	288601	0 %	0 %	50 %	50 %	86360530
6008	NC_007765	GCT	2	6	288692	288697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360530
6009	NC_007765	T	6	6	288705	288710	0 %	100 %	0 %	0 %	86360530
6010	NC_007765	GAA	2	6	288729	288734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360530
6011	NC_007765	TCGG	2	8	288745	288752	0 %	25 %	50 %	25 %	86360530
6012	NC_007765	GCA	2	6	288776	288781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360530
6013	NC_007765	GTC	2	6	288784	288789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360530
6014	NC_007765	CGAG	2	8	288842	288849	25 %	0 %	50 %	25 %	86360530
6015	NC_007765	TTCCA	2	10	288906	288915	20 %	40 %	0 %	40 %	86360530
6016	NC_007765	GCC	2	6	288927	288932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360531
6017	NC_007765	CAG	2	6	288967	288972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360531
6018	NC_007765	GAC	2	6	289111	289116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360531
6019	NC_007765	AGC	2	6	289157	289162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360531
6020	NC_007765	CCT	2	6	289248	289253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360531
6021	NC_007765	CGA	2	6	289299	289304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360531
6022	NC_007765	TCG	2	6	289323	289328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360531
6023	NC_007765	TGT	2	6	289365	289370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360531
6024	NC_007765	CGT	2	6	289471	289476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360531
6025	NC_007765	GGC	3	9	289519	289527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360531
6026	NC_007765	CGA	3	9	289566	289574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360531
6027	NC_007765	CGA	2	6	289653	289658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360531
6028	NC_007765	CGG	2	6	289662	289667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360531
6029	NC_007765	CAG	2	6	289678	289683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360531
6030	NC_007765	AGC	2	6	289688	289693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360531
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6032	NC_007765	AGC	2	6	289700	289705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360531
6033	NC_007765	GC	3	6	289726	289731	0 %	0 %	50 %	50 %	86360531
6034	NC_007765	GGT	2	6	289744	289749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360531
6035	NC_007765	TGA	2	6	289831	289836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360532
6036	NC_007765	CGC	2	6	289871	289876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360532
6037	NC_007765	TGA	2	6	289915	289920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360532
6038	NC_007765	CAG	2	6	289925	289930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360532
6039	NC_007765	CGC	2	6	289996	290001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360532
6040	NC_007765	CGGC	2	8	290032	290039	0 %	0 %	50 %	50 %	86360532
6041	NC_007765	GCA	3	9	290050	290058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360532
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6043	NC_007765	CCT	2	6	290113	290118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360532
6044	NC_007765	TCC	2	6	290127	290132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360532
6045	NC_007765	CAC	2	6	290153	290158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360532
6046	NC_007765	CGA	2	6	290170	290175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360532
6047	NC_007765	ACG	2	6	290187	290192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360532
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6049	NC_007765	GCC	2	6	290271	290276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360532
6050	NC_007765	AATGC	2	10	290277	290286	40 %	20 %	20 %	20 %	86360532
6051	NC_007765	GAT	2	6	290381	290386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360532
6052	NC_007765	TGA	2	6	290401	290406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360532
6053	NC_007765	GC	3	6	290497	290502	0 %	0 %	50 %	50 %	86360532
6054	NC_007765	TAT	2	6	290648	290653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86360533
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6056	NC_007765	GCTT	2	8	290711	290718	0 %	50 %	25 %	25 %	86360533
6057	NC_007765	GCC	2	6	290722	290727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360533
6058	NC_007765	GTC	2	6	290731	290736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360533
6059	NC_007765	TGG	2	6	290739	290744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360533
6060	NC_007765	CGG	2	6	290784	290789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360533
6061	NC_007765	GTA	2	6	290809	290814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360533
6062	NC_007765	GCG	2	6	290822	290827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360533
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6064	NC_007765	CTT	2	6	290890	290895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360533
6065	NC_007765	CGA	2	6	290910	290915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360533
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6070	NC_007765	TGC	2	6	291095	291100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360533
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6094	NC_007765	CCGT	2	8	292701	292708	0 %	25 %	25 %	50 %	86360534
6095	NC_007765	GT	3	6	292755	292760	0 %	50 %	50 %	0 %	86360534
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6118	NC_007765	CCGG	2	8	293532	293539	0 %	0 %	50 %	50 %	86360535
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6488	NC_007765	CGC	2	6	308999	309004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360547
6489	NC_007765	GCG	2	6	309105	309110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360547
6490	NC_007765	TGA	2	6	309335	309340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360548
6491	NC_007765	A	6	6	309340	309345	100 %	0 %	0 %	0 %	86360548
6492	NC_007765	CTG	3	9	309355	309363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360548
6493	NC_007765	TCG	3	9	309380	309388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360548
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