MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42c

Total Repeats: 5385

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007764	CCT	2	6	183932	183937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360216
4002	NC_007764	CGG	2	6	183959	183964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360216
4003	NC_007764	CGG	3	9	184006	184014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360216
4004	NC_007764	CAG	2	6	184041	184046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360216
4005	NC_007764	TC	3	6	184067	184072	0 %	50 %	0 %	50 %	86360216
4006	NC_007764	CGC	2	6	184107	184112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360216
4007	NC_007764	AGG	2	6	184153	184158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360216
4008	NC_007764	TGG	2	6	184168	184173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360216
4009	NC_007764	GCC	3	9	184219	184227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360216
4010	NC_007764	TGG	2	6	184231	184236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360216
4011	NC_007764	CG	3	6	184264	184269	0 %	0 %	50 %	50 %	86360216
4012	NC_007764	CGA	2	6	184280	184285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360216
4013	NC_007764	CTC	2	6	184365	184370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360216
4014	NC_007764	CGG	2	6	184433	184438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360216
4015	NC_007764	CGC	2	6	184525	184530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360216
4016	NC_007764	CCG	2	6	184579	184584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360216
4017	NC_007764	CCGC	2	8	184609	184616	0 %	0 %	25 %	75 %	86360216
4018	NC_007764	TCG	2	6	184627	184632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360216
4019	NC_007764	CGG	2	6	184637	184642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360216
4020	NC_007764	CTG	2	6	184668	184673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360216
4021	NC_007764	GCC	2	6	184704	184709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360216
4022	NC_007764	TGC	2	6	184813	184818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360216
4023	NC_007764	CTCG	2	8	184850	184857	0 %	25 %	25 %	50 %	86360216
4024	NC_007764	GGC	2	6	184858	184863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360216
4025	NC_007764	CCGG	2	8	184886	184893	0 %	0 %	50 %	50 %	86360216
4026	NC_007764	GCCC	2	8	184950	184957	0 %	0 %	25 %	75 %	86360216
4027	NC_007764	CGG	2	6	184973	184978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360216
4028	NC_007764	CAG	2	6	184983	184988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360216
4029	NC_007764	CTG	2	6	185031	185036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360216
4030	NC_007764	ATCT	2	8	185082	185089	25 %	50 %	0 %	25 %	86360216
4031	NC_007764	CGC	2	6	185105	185110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360216
4032	NC_007764	TCA	2	6	185122	185127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360216
4033	NC_007764	TCGTG	2	10	185171	185180	0 %	40 %	40 %	20 %	86360216
4034	NC_007764	CGG	2	6	185203	185208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360216
4035	NC_007764	TCG	2	6	185242	185247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360216
4036	NC_007764	CCG	2	6	185266	185271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360216
4037	NC_007764	GGC	2	6	185285	185290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360216
4038	NC_007764	GTC	2	6	185369	185374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360217
4039	NC_007764	CGG	2	6	185425	185430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360217
4040	NC_007764	GCT	2	6	185488	185493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360217
4041	NC_007764	GGC	2	6	185504	185509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360217
4042	NC_007764	CGC	2	6	185554	185559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360217
4043	NC_007764	GAC	2	6	185560	185565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360217
4044	NC_007764	GGC	2	6	185591	185596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360217
4045	NC_007764	CGC	3	9	185608	185616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360217
4046	NC_007764	ATC	2	6	185675	185680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360217
4047	NC_007764	TCA	3	9	185700	185708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360217
4048	NC_007764	CTG	2	6	185726	185731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360217
4049	NC_007764	GGCC	2	8	185776	185783	0 %	0 %	50 %	50 %	86360217
4050	NC_007764	GTG	2	6	185810	185815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360217
4051	NC_007764	CGC	2	6	185847	185852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360217
4052	NC_007764	CGGC	2	8	185871	185878	0 %	0 %	50 %	50 %	86360217
4053	NC_007764	CGTTC	2	10	185895	185904	0 %	40 %	20 %	40 %	86360217
4054	NC_007764	CTG	2	6	185954	185959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360217
4055	NC_007764	TCG	2	6	185979	185984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360217
4056	NC_007764	GCC	2	6	186047	186052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360217
4057	NC_007764	CGG	2	6	186058	186063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360217
4058	NC_007764	CGG	2	6	186076	186081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360217
4059	NC_007764	CTG	2	6	186116	186121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360217
4060	NC_007764	TTC	2	6	186146	186151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360217
4061	NC_007764	CCG	2	6	186161	186166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360217
4062	NC_007764	ATC	2	6	186194	186199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360217
4063	NC_007764	CGC	2	6	186281	186286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360217
4064	NC_007764	TCT	2	6	186297	186302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360217
4065	NC_007764	TCG	2	6	186320	186325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360217
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4067	NC_007764	CGC	2	6	186384	186389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360217
4068	NC_007764	TCG	2	6	186401	186406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360217
4069	NC_007764	CCG	2	6	186407	186412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360217
4070	NC_007764	GGC	2	6	186436	186441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360217
4071	NC_007764	TCA	2	6	186464	186469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360217
4072	NC_007764	CGG	2	6	186536	186541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360217
4073	NC_007764	TCGCCA	2	12	186545	186556	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	86360217
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4075	NC_007764	ATC	2	6	186610	186615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360217
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4077	NC_007764	TCG	2	6	186659	186664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360217
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4081	NC_007764	CAT	2	6	186744	186749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360217
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4083	NC_007764	TGC	2	6	186779	186784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360217
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4085	NC_007764	GCC	2	6	186841	186846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360217
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4087	NC_007764	CTG	2	6	186979	186984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360217
4088	NC_007764	CGC	2	6	186993	186998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360217
4089	NC_007764	CGT	2	6	186999	187004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360217
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4091	NC_007764	CGG	2	6	187026	187031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360217
4092	NC_007764	GACGGC	2	12	187077	187088	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	86360217
4093	NC_007764	CGT	2	6	187098	187103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360217
4094	NC_007764	GC	3	6	187180	187185	0 %	0 %	50 %	50 %	86360217
4095	NC_007764	CAC	2	6	187224	187229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360218
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4099	NC_007764	GGA	2	6	187424	187429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360218
4100	NC_007764	CCGG	2	8	187502	187509	0 %	0 %	50 %	50 %	86360218
4101	NC_007764	GCGGAA	2	12	187530	187541	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	86360218
4102	NC_007764	CGT	2	6	187550	187555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360218
4103	NC_007764	GCGTC	2	10	187605	187614	0 %	20 %	40 %	40 %	86360218
4104	NC_007764	CTGG	2	8	187633	187640	0 %	25 %	50 %	25 %	86360218
4105	NC_007764	CGGG	2	8	187641	187648	0 %	0 %	75 %	25 %	86360218
4106	NC_007764	CGG	2	6	187766	187771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360218
4107	NC_007764	AGG	2	6	187792	187797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360218
4108	NC_007764	AG	3	6	187836	187841	50 %	0 %	50 %	0 %	86360218
4109	NC_007764	TCG	2	6	187870	187875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360218
4110	NC_007764	GCGA	2	8	187962	187969	25 %	0 %	50 %	25 %	86360218
4111	NC_007764	CGA	2	6	188000	188005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360218
4112	NC_007764	CGC	2	6	188030	188035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360218
4113	NC_007764	AGC	2	6	188053	188058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360218
4114	NC_007764	GC	3	6	188057	188062	0 %	0 %	50 %	50 %	86360218
4115	NC_007764	CGA	2	6	188175	188180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360219
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4117	NC_007764	CTG	2	6	188222	188227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360219
4118	NC_007764	CAG	2	6	188236	188241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360219
4119	NC_007764	CACTGC	2	12	188270	188281	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	86360219
4120	NC_007764	TGA	2	6	188321	188326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360219
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4122	NC_007764	GCC	2	6	188452	188457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360219
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4230	NC_007764	ATGCCG	2	12	193095	193106	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	86360224
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4232	NC_007764	ATC	2	6	193134	193139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360224
4233	NC_007764	CCTTGC	2	12	193147	193158	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	86360224
4234	NC_007764	GTC	3	9	193182	193190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360224
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4237	NC_007764	CTG	2	6	193223	193228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360224
4238	NC_007764	TTG	2	6	193278	193283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360224
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4240	NC_007764	ATA	2	6	193400	193405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86360224
4241	NC_007764	GGA	2	6	193620	193625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360224
4242	NC_007764	GCGCA	2	10	193641	193650	20 %	0 %	40 %	40 %	86360224
4243	NC_007764	ATG	2	6	193665	193670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360224
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4491	NC_007764	CAG	2	6	205233	205238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360238
4492	NC_007764	GAT	2	6	205274	205279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360238
4493	NC_007764	GCA	2	6	205286	205291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360238
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4495	NC_007764	CTG	2	6	205384	205389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360238
4496	NC_007764	TTCC	2	8	205416	205423	0 %	50 %	0 %	50 %	86360238
4497	NC_007764	ATCC	2	8	205547	205554	25 %	25 %	0 %	50 %	86360238
4498	NC_007764	GA	3	6	205630	205635	50 %	0 %	50 %	0 %	86360238
4499	NC_007764	CGA	2	6	205691	205696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360238
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