MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42c

Total Repeats: 5385

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007764	GAC	3	9	147	155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360046
2	NC_007764	ATA	2	6	166	171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86360046
3	NC_007764	TTC	2	6	267	272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360046
4	NC_007764	CCG	2	6	314	319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360046
5	NC_007764	GGC	2	6	336	341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360046
6	NC_007764	GAA	2	6	389	394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360046
7	NC_007764	GC	3	6	440	445	0 %	0 %	50 %	50 %	86360047
8	NC_007764	TTC	2	6	536	541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360047
9	NC_007764	GAC	2	6	593	598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360047
10	NC_007764	GAT	2	6	626	631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360047
11	NC_007764	CCT	2	6	913	918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360048
12	NC_007764	CAT	2	6	1040	1045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360048
13	NC_007764	TCT	2	6	1093	1098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360048
14	NC_007764	CGG	2	6	1129	1134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360048
15	NC_007764	TGC	2	6	1140	1145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360048
16	NC_007764	GGC	2	6	1238	1243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360048
17	NC_007764	CG	3	6	1257	1262	0 %	0 %	50 %	50 %	86360048
18	NC_007764	TACC	2	8	1327	1334	25 %	25 %	0 %	50 %	86360048
19	NC_007764	ACG	2	6	1353	1358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360048
20	NC_007764	CCG	2	6	1379	1384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360048
21	NC_007764	GGC	2	6	1532	1537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360048
22	NC_007764	GAG	2	6	1664	1669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360048
23	NC_007764	GAG	2	6	1718	1723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360048
24	NC_007764	TGC	2	6	1737	1742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360048
25	NC_007764	ACGGC	2	10	1743	1752	20 %	0 %	40 %	40 %	86360048
26	NC_007764	CGC	2	6	1787	1792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360048
27	NC_007764	GCT	2	6	1861	1866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360048
28	NC_007764	CGC	2	6	1867	1872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360048
29	NC_007764	TCG	2	6	1887	1892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360048
30	NC_007764	CAT	2	6	1948	1953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360049
31	NC_007764	GGC	2	6	1967	1972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360049
32	NC_007764	TTC	2	6	2030	2035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360049
33	NC_007764	ACG	2	6	2039	2044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360049
34	NC_007764	GC	3	6	2045	2050	0 %	0 %	50 %	50 %	86360049
35	NC_007764	AGGCGG	2	12	2052	2063	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	86360049
36	NC_007764	TC	3	6	2155	2160	0 %	50 %	0 %	50 %	86360049
37	NC_007764	GCC	2	6	2168	2173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360049
38	NC_007764	TCG	2	6	2193	2198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360049
39	NC_007764	CGAT	2	8	2253	2260	25 %	25 %	25 %	25 %	86360049
40	NC_007764	TCA	2	6	2262	2267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360049
41	NC_007764	GCG	2	6	2268	2273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360049
42	NC_007764	GCAGG	2	10	2274	2283	20 %	0 %	60 %	20 %	86360049
43	NC_007764	GAC	3	9	2414	2422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360049
44	NC_007764	CGT	2	6	2551	2556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360049
45	NC_007764	GCG	2	6	2699	2704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360049
46	NC_007764	TCG	2	6	2736	2741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360049
47	NC_007764	GAG	2	6	2753	2758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360049
48	NC_007764	GAG	2	6	2801	2806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360049
49	NC_007764	CTC	2	6	2810	2815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360049
50	NC_007764	CTT	2	6	2827	2832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360049
51	NC_007764	ATC	2	6	2835	2840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360049
52	NC_007764	CCA	2	6	2913	2918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360049
53	NC_007764	GC	3	6	2939	2944	0 %	0 %	50 %	50 %	86360049
54	NC_007764	CGC	2	6	2988	2993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360049
55	NC_007764	CGG	2	6	3012	3017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360049
56	NC_007764	CGA	2	6	3028	3033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360049
57	NC_007764	ATC	2	6	3035	3040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360049
58	NC_007764	GCC	2	6	3059	3064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360049
59	NC_007764	CGC	2	6	3115	3120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360049
60	NC_007764	ATC	2	6	3189	3194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360049
61	NC_007764	CGGC	2	8	3225	3232	0 %	0 %	50 %	50 %	86360049
62	NC_007764	GCA	2	6	3315	3320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360050
63	NC_007764	TGA	2	6	3355	3360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360050
64	NC_007764	ATC	2	6	3362	3367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360050
65	NC_007764	TCC	2	6	3449	3454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360050
66	NC_007764	TCG	2	6	3495	3500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360050
67	NC_007764	GAG	2	6	3569	3574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360050
68	NC_007764	GCGA	2	8	3575	3582	25 %	0 %	50 %	25 %	86360050
69	NC_007764	CAG	2	6	3595	3600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360050
70	NC_007764	CATG	2	8	3613	3620	25 %	25 %	25 %	25 %	86360050
71	NC_007764	CTG	2	6	3650	3655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360050
72	NC_007764	GCC	3	9	3656	3664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360050
73	NC_007764	CCG	2	6	3720	3725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360050
74	NC_007764	CGGCGC	2	12	3733	3744	0 %	0 %	50 %	50 %	86360050
75	NC_007764	GAT	2	6	3751	3756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360050
76	NC_007764	CGG	2	6	3825	3830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360050
77	NC_007764	TCA	2	6	3882	3887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360050
78	NC_007764	TCG	2	6	3891	3896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360050
79	NC_007764	ACCGC	2	10	3919	3928	20 %	0 %	20 %	60 %	86360050
80	NC_007764	GGCTTC	2	12	3946	3957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360050
81	NC_007764	TCA	2	6	3960	3965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360050
82	NC_007764	CGT	2	6	3979	3984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360050
83	NC_007764	GAG	2	6	4106	4111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360050
84	NC_007764	TGC	2	6	4122	4127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360050
85	NC_007764	ATCA	2	8	4217	4224	50 %	25 %	0 %	25 %	86360050
86	NC_007764	GCG	2	6	4277	4282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360050
87	NC_007764	TGC	2	6	4332	4337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360050
88	NC_007764	TCG	2	6	4362	4367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360050
89	NC_007764	GC	3	6	4380	4385	0 %	0 %	50 %	50 %	86360050
90	NC_007764	ACG	2	6	4413	4418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360050
91	NC_007764	ATC	2	6	4421	4426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360050
92	NC_007764	CGG	2	6	4431	4436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360050
93	NC_007764	GAC	2	6	4475	4480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360050
94	NC_007764	TGA	2	6	4487	4492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360050
95	NC_007764	TCC	2	6	4635	4640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360051
96	NC_007764	CGC	2	6	4652	4657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360051
97	NC_007764	CTG	3	9	4672	4680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360051
98	NC_007764	CGG	3	9	4701	4709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360051
99	NC_007764	ACG	2	6	4724	4729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360051
100	NC_007764	GCC	2	6	4775	4780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360051
101	NC_007764	TGG	2	6	4802	4807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360051
102	NC_007764	GGC	2	6	4821	4826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360051
103	NC_007764	GAC	2	6	4854	4859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360051
104	NC_007764	CT	3	6	4913	4918	0 %	50 %	0 %	50 %	86360051
105	NC_007764	CACC	2	8	4974	4981	25 %	0 %	0 %	75 %	86360051
106	NC_007764	CCG	2	6	4987	4992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360051
107	NC_007764	GGC	2	6	5007	5012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360051
108	NC_007764	GAC	2	6	5088	5093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360052
109	NC_007764	CAG	2	6	5118	5123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360052
110	NC_007764	GC	3	6	5170	5175	0 %	0 %	50 %	50 %	86360052
111	NC_007764	CGT	2	6	5211	5216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360052
112	NC_007764	CAT	2	6	5217	5222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360052
113	NC_007764	TTC	2	6	5284	5289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360052
114	NC_007764	TCG	2	6	5303	5308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360052
115	NC_007764	GCC	2	6	5341	5346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360052
116	NC_007764	GGCGCT	2	12	5370	5381	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	86360052
117	NC_007764	CGC	2	6	5399	5404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360052
118	NC_007764	GCT	2	6	5436	5441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360052
119	NC_007764	TGC	2	6	5462	5467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360052
120	NC_007764	CTG	2	6	5563	5568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360052
121	NC_007764	GCC	2	6	5578	5583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360052
122	NC_007764	TTC	2	6	5617	5622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360052
123	NC_007764	CGG	2	6	5637	5642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360052
124	NC_007764	GCC	2	6	5674	5679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360052
125	NC_007764	GCCGC	2	10	5694	5703	0 %	0 %	40 %	60 %	86360052
126	NC_007764	CGC	2	6	5851	5856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360052
127	NC_007764	GCT	2	6	5874	5879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360052
128	NC_007764	ATC	2	6	5905	5910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360052
129	NC_007764	GTCG	2	8	5922	5929	0 %	25 %	50 %	25 %	86360052
130	NC_007764	CGC	2	6	5981	5986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360052
131	NC_007764	T	6	6	6001	6006	0 %	100 %	0 %	0 %	86360052
132	NC_007764	CGT	2	6	6016	6021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360052
133	NC_007764	ATG	2	6	6074	6079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360052
134	NC_007764	GCGGT	2	10	6098	6107	0 %	20 %	60 %	20 %	86360052
135	NC_007764	CGA	2	6	6153	6158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360052
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137	NC_007764	GCT	2	6	6228	6233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360052
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139	NC_007764	CGA	2	6	6261	6266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360052
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164	NC_007764	GCG	2	6	7691	7696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360053
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262	NC_007764	GCA	2	6	12215	12220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360059
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265	NC_007764	ATC	2	6	12450	12455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360060
266	NC_007764	GCCGGC	2	12	12501	12512	0 %	0 %	50 %	50 %	86360060
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269	NC_007764	ATC	2	6	12614	12619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360060
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273	NC_007764	GGC	2	6	12933	12938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360061
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390	NC_007764	GAA	2	6	19085	19090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360067
391	NC_007764	GGGC	2	8	19096	19103	0 %	0 %	75 %	25 %	86360067
392	NC_007764	TTG	2	6	19111	19116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360067
393	NC_007764	GAT	2	6	19175	19180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360067
394	NC_007764	CGGT	2	8	19189	19196	0 %	25 %	50 %	25 %	86360067
395	NC_007764	GCC	2	6	19227	19232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360067
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399	NC_007764	GGGC	2	8	19493	19500	0 %	0 %	75 %	25 %	86360067
400	NC_007764	GATC	2	8	19610	19617	25 %	25 %	25 %	25 %	86360068
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461	NC_007764	AAG	2	6	22352	22357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360070
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