MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42b

Total Repeats: 3889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_007763	AGA	2	6	165121	165126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360028
3502	NC_007763	GAT	2	6	165128	165133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360028
3503	NC_007763	CTG	2	6	165167	165172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360028
3504	NC_007763	TGC	2	6	165197	165202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360028
3505	NC_007763	TCG	2	6	165213	165218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360028
3506	NC_007763	GAT	3	9	165242	165250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360028
3507	NC_007763	GAT	2	6	165287	165292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360028
3508	NC_007763	CGC	2	6	165302	165307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360028
3509	NC_007763	ATC	2	6	165354	165359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360028
3510	NC_007763	TTG	2	6	165360	165365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360028
3511	NC_007763	CGA	2	6	165424	165429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360028
3512	NC_007763	AAG	2	6	165441	165446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360028
3513	NC_007763	GCG	2	6	165478	165483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360028
3514	NC_007763	AGC	2	6	165489	165494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360028
3515	NC_007763	GAT	2	6	165545	165550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360028
3516	NC_007763	AGA	2	6	165589	165594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360028
3517	NC_007763	CAG	2	6	165704	165709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360028
3518	NC_007763	TCAT	2	8	165838	165845	25 %	50 %	0 %	25 %	86360029
3519	NC_007763	GGC	2	6	165884	165889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360029
3520	NC_007763	TCG	2	6	165891	165896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360029
3521	NC_007763	GCC	2	6	165900	165905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360029
3522	NC_007763	CCG	2	6	165921	165926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360029
3523	NC_007763	GAA	2	6	165929	165934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360029
3524	NC_007763	GCC	2	6	166043	166048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360029
3525	NC_007763	AGC	2	6	166095	166100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360029
3526	NC_007763	TGACC	2	10	166132	166141	20 %	20 %	20 %	40 %	86360029
3527	NC_007763	TTG	2	6	166188	166193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360029
3528	NC_007763	CGA	2	6	166217	166222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360029
3529	NC_007763	CCG	2	6	166224	166229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360029
3530	NC_007763	GCC	2	6	166334	166339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360029
3531	NC_007763	CGG	2	6	166363	166368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360029
3532	NC_007763	GTCG	2	8	166487	166494	0 %	25 %	50 %	25 %	86360029
3533	NC_007763	GGC	2	6	166586	166591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360029
3534	NC_007763	TCT	2	6	166597	166602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360029
3535	NC_007763	CGG	2	6	166606	166611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360029
3536	NC_007763	ATC	2	6	166619	166624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360029
3537	NC_007763	CGG	2	6	166674	166679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360029
3538	NC_007763	AGA	2	6	166681	166686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360029
3539	NC_007763	GGCAT	2	10	166710	166719	20 %	20 %	40 %	20 %	86360029
3540	NC_007763	CGG	2	6	166780	166785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360029
3541	NC_007763	AGA	2	6	166834	166839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360029
3542	NC_007763	CGC	2	6	166885	166890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360029
3543	NC_007763	CAGC	2	8	166903	166910	25 %	0 %	25 %	50 %	86360029
3544	NC_007763	TCC	2	6	166941	166946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360029
3545	NC_007763	TTG	2	6	166974	166979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360029
3546	NC_007763	GAT	2	6	167467	167472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360030
3547	NC_007763	TTC	2	6	167509	167514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360030
3548	NC_007763	TGA	2	6	167549	167554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360030
3549	NC_007763	GCT	2	6	167565	167570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360030
3550	NC_007763	TGC	2	6	167586	167591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360030
3551	NC_007763	CG	3	6	167607	167612	0 %	0 %	50 %	50 %	86360030
3552	NC_007763	TGA	2	6	167664	167669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360030
3553	NC_007763	TGC	3	9	167672	167680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360030
3554	NC_007763	GAC	2	6	167715	167720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360030
3555	NC_007763	GAC	2	6	167727	167732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360030
3556	NC_007763	CG	3	6	167781	167786	0 %	0 %	50 %	50 %	86360030
3557	NC_007763	CGC	2	6	167802	167807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360030
3558	NC_007763	CGC	2	6	167847	167852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360030
3559	NC_007763	GCT	2	6	167925	167930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360030
3560	NC_007763	CG	3	6	167939	167944	0 %	0 %	50 %	50 %	86360030
3561	NC_007763	TGA	2	6	167957	167962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360030
3562	NC_007763	TGC	2	6	167978	167983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360030
3563	NC_007763	CAA	2	6	168024	168029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360030
3564	NC_007763	CCG	2	6	168069	168074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360030
3565	NC_007763	GAC	2	6	168090	168095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360030
3566	NC_007763	CCG	2	6	168101	168106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360030
3567	NC_007763	GAC	2	6	168163	168168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360031
3568	NC_007763	CCG	2	6	168344	168349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360031
3569	NC_007763	CGC	2	6	168375	168380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360031
3570	NC_007763	GCCG	2	8	168384	168391	0 %	0 %	50 %	50 %	86360031
3571	NC_007763	CGA	2	6	168395	168400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360031
3572	NC_007763	GCC	2	6	168411	168416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360031
3573	NC_007763	GCAGGC	2	12	168470	168481	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	86360031
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3575	NC_007763	CGG	2	6	168596	168601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360031
3576	NC_007763	TTGC	2	8	168654	168661	0 %	50 %	25 %	25 %	86360031
3577	NC_007763	TC	3	6	168662	168667	0 %	50 %	0 %	50 %	86360031
3578	NC_007763	CGC	2	6	168675	168680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360031
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3580	NC_007763	GGA	2	6	168747	168752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360032
3581	NC_007763	CTG	2	6	168763	168768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360032
3582	NC_007763	CGG	2	6	168786	168791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360032
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3585	NC_007763	CCG	2	6	168931	168936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360032
3586	NC_007763	GCA	2	6	169021	169026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360032
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3588	NC_007763	CGG	2	6	169080	169085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360032
3589	NC_007763	TCT	2	6	169213	169218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360032
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3591	NC_007763	GGC	2	6	169396	169401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360033
3592	NC_007763	GAT	2	6	169462	169467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360033
3593	NC_007763	GGC	2	6	169522	169527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360033
3594	NC_007763	TCG	2	6	169535	169540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360033
3595	NC_007763	GCC	2	6	169727	169732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360033
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3597	NC_007763	CCG	3	9	169847	169855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360033
3598	NC_007763	GCTC	2	8	169857	169864	0 %	25 %	25 %	50 %	86360033
3599	NC_007763	CACGG	2	10	169880	169889	20 %	0 %	40 %	40 %	86360033
3600	NC_007763	TAA	2	6	169892	169897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86360033
3601	NC_007763	CCA	2	6	169909	169914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360033
3602	NC_007763	TCG	2	6	169926	169931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360033
3603	NC_007763	CAG	2	6	169966	169971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360033
3604	NC_007763	CGAG	2	8	170039	170046	25 %	0 %	50 %	25 %	86360033
3605	NC_007763	TCG	2	6	170060	170065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360033
3606	NC_007763	CGG	2	6	170155	170160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360033
3607	NC_007763	TCG	2	6	170186	170191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360033
3608	NC_007763	TCA	2	6	170267	170272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360033
3609	NC_007763	GCA	2	6	170336	170341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360033
3610	NC_007763	GC	3	6	170408	170413	0 %	0 %	50 %	50 %	86360034
3611	NC_007763	GGC	2	6	170440	170445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360034
3612	NC_007763	TGCG	2	8	170481	170488	0 %	25 %	50 %	25 %	86360034
3613	NC_007763	CGG	2	6	170500	170505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360034
3614	NC_007763	AAT	2	6	170518	170523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86360034
3615	NC_007763	CGGC	3	12	170594	170605	0 %	0 %	50 %	50 %	86360034
3616	NC_007763	AT	3	6	170613	170618	50 %	50 %	0 %	0 %	86360034
3617	NC_007763	TA	3	6	170630	170635	50 %	50 %	0 %	0 %	86360034
3618	NC_007763	CGTC	2	8	170661	170668	0 %	25 %	25 %	50 %	86360034
3619	NC_007763	CTG	2	6	170719	170724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360034
3620	NC_007763	GCA	3	9	170737	170745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360034
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3622	NC_007763	GCC	2	6	170882	170887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360034
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3856	NC_007763	GAT	2	6	182759	182764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360043
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3861	NC_007763	AGGCC	2	10	183182	183191	20 %	0 %	40 %	40 %	86360044
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3865	NC_007763	GC	4	8	183315	183322	0 %	0 %	50 %	50 %	86360044
3866	NC_007763	GGC	2	6	183357	183362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360044
3867	NC_007763	GCT	2	6	183474	183479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360044
3868	NC_007763	GC	4	8	183481	183488	0 %	0 %	50 %	50 %	86360044
3869	NC_007763	GGC	2	6	183507	183512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360044
3870	NC_007763	TGCAGC	2	12	183533	183544	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	86360044
3871	NC_007763	TCG	2	6	183659	183664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360044
3872	NC_007763	GCC	2	6	183700	183705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360044
3873	NC_007763	CGA	2	6	183711	183716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360044
3874	NC_007763	GAA	2	6	183733	183738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360044
3875	NC_007763	CACTA	2	10	183829	183838	40 %	20 %	0 %	40 %	86360044
3876	NC_007763	GAC	2	6	183883	183888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360044
3877	NC_007763	GCCGA	2	10	183904	183913	20 %	0 %	40 %	40 %	86360044
3878	NC_007763	AGG	2	6	183932	183937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360044
3879	NC_007763	CGG	3	9	183981	183989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360044
3880	NC_007763	TGC	2	6	184016	184021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360044
3881	NC_007763	CGC	2	6	184038	184043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360044
3882	NC_007763	GGC	3	9	184086	184094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360044
3883	NC_007763	GTC	2	6	184096	184101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360044
3884	NC_007763	GCGT	2	8	184186	184193	0 %	25 %	50 %	25 %	86360044
3885	NC_007763	AGGGC	2	10	184201	184210	20 %	0 %	60 %	20 %	86360044
3886	NC_007763	CCG	2	6	184220	184225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360044
3887	NC_007763	TGACC	2	10	184239	184248	20 %	20 %	20 %	40 %	86360044
3888	NC_007763	CGC	2	6	184249	184254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360044
3889	NC_007763	GA	3	6	184258	184263	50 %	0 %	50 %	0 %	86360044

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.