MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42b

Total Repeats: 3889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007763	CCA	2	6	144859	144864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360007
3002	NC_007763	TCG	2	6	144865	144870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360007
3003	NC_007763	GGC	2	6	144890	144895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360007
3004	NC_007763	CTTTC	2	10	144897	144906	0 %	60 %	0 %	40 %	86360007
3005	NC_007763	GAT	2	6	144944	144949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360007
3006	NC_007763	TGC	2	6	144967	144972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360007
3007	NC_007763	GCC	2	6	144978	144983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360007
3008	NC_007763	TC	3	6	144986	144991	0 %	50 %	0 %	50 %	86360007
3009	NC_007763	CGG	3	9	145073	145081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360007
3010	NC_007763	GGC	2	6	145085	145090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360007
3011	NC_007763	GCG	3	9	145154	145162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360008
3012	NC_007763	ATC	2	6	145208	145213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360008
3013	NC_007763	CTG	2	6	145262	145267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360008
3014	NC_007763	GCT	2	6	145588	145593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360008
3015	NC_007763	CGA	2	6	145600	145605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360008
3016	NC_007763	GC	3	6	145614	145619	0 %	0 %	50 %	50 %	86360008
3017	NC_007763	TGG	2	6	145626	145631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360008
3018	NC_007763	GCT	2	6	145651	145656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360008
3019	NC_007763	CGA	2	6	145657	145662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360008
3020	NC_007763	TCA	2	6	145695	145700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360008
3021	NC_007763	TCG	2	6	145728	145733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360008
3022	NC_007763	GAG	2	6	145769	145774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360008
3023	NC_007763	GCC	2	6	145809	145814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360008
3024	NC_007763	CCG	2	6	145818	145823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360008
3025	NC_007763	GCCA	2	8	145832	145839	25 %	0 %	25 %	50 %	86360008
3026	NC_007763	GCGAC	2	10	145850	145859	20 %	0 %	40 %	40 %	86360008
3027	NC_007763	TCG	2	6	145924	145929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360009
3028	NC_007763	GCCG	2	8	145930	145937	0 %	0 %	50 %	50 %	86360009
3029	NC_007763	TCG	2	6	145997	146002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360009
3030	NC_007763	TC	3	6	146052	146057	0 %	50 %	0 %	50 %	86360009
3031	NC_007763	GGCTGA	2	12	146096	146107	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	86360009
3032	NC_007763	GC	3	6	146121	146126	0 %	0 %	50 %	50 %	86360009
3033	NC_007763	CG	4	8	146131	146138	0 %	0 %	50 %	50 %	86360009
3034	NC_007763	CGC	2	6	146166	146171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360009
3035	NC_007763	TCGGT	2	10	146192	146201	0 %	40 %	40 %	20 %	86360009
3036	NC_007763	GAT	2	6	146206	146211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360009
3037	NC_007763	CGT	2	6	146229	146234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360009
3038	NC_007763	CGA	2	6	146253	146258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360009
3039	NC_007763	CTC	2	6	146269	146274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360009
3040	NC_007763	CCG	2	6	146291	146296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360009
3041	NC_007763	GCC	2	6	146302	146307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360009
3042	NC_007763	CGG	2	6	146328	146333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360009
3043	NC_007763	GCT	2	6	146382	146387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360009
3044	NC_007763	CGA	2	6	146394	146399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360009
3045	NC_007763	CTGT	2	8	146481	146488	0 %	50 %	25 %	25 %	86360009
3046	NC_007763	TCG	2	6	146558	146563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360009
3047	NC_007763	GCCGC	2	10	146590	146599	0 %	0 %	40 %	60 %	86360009
3048	NC_007763	GCC	2	6	146608	146613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360009
3049	NC_007763	CG	3	6	146614	146619	0 %	0 %	50 %	50 %	86360009
3050	NC_007763	TTG	2	6	146621	146626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360009
3051	NC_007763	CGG	2	6	146753	146758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360010
3052	NC_007763	TGA	2	6	146764	146769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360010
3053	NC_007763	ACG	2	6	146776	146781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360010
3054	NC_007763	GCAG	2	8	146792	146799	25 %	0 %	50 %	25 %	86360010
3055	NC_007763	GGCGGT	2	12	146819	146830	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	86360010
3056	NC_007763	GC	3	6	146838	146843	0 %	0 %	50 %	50 %	86360010
3057	NC_007763	GTC	2	6	146865	146870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360010
3058	NC_007763	GCG	2	6	146906	146911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360010
3059	NC_007763	GTG	2	6	146914	146919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360010
3060	NC_007763	GATCGA	2	12	146957	146968	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	86360010
3061	NC_007763	TGGCGC	2	12	147070	147081	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	86360010
3062	NC_007763	GGC	2	6	147126	147131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360010
3063	NC_007763	CGG	2	6	147194	147199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360010
3064	NC_007763	CCGG	2	8	147201	147208	0 %	0 %	50 %	50 %	86360010
3065	NC_007763	GCC	2	6	147229	147234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360010
3066	NC_007763	CGC	2	6	147265	147270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360010
3067	NC_007763	CGC	2	6	147346	147351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360010
3068	NC_007763	TTC	2	6	147357	147362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360010
3069	NC_007763	GGC	2	6	147431	147436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360010
3070	NC_007763	ACGG	2	8	147446	147453	25 %	0 %	50 %	25 %	86360010
3071	NC_007763	CAC	2	6	147557	147562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360010
3072	NC_007763	CCT	2	6	147617	147622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360010
3073	NC_007763	CA	3	6	147633	147638	50 %	0 %	0 %	50 %	86360010
3074	NC_007763	CG	3	6	147643	147648	0 %	0 %	50 %	50 %	86360010
3075	NC_007763	CAGG	2	8	147698	147705	25 %	0 %	50 %	25 %	86360010
3076	NC_007763	CCAT	2	8	147710	147717	25 %	25 %	0 %	50 %	86360010
3077	NC_007763	CGC	2	6	147725	147730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360010
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3079	NC_007763	TGCGCG	2	12	147997	148008	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	86360011
3080	NC_007763	CGG	2	6	148013	148018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360011
3081	NC_007763	TCG	2	6	148021	148026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360011
3082	NC_007763	TGC	2	6	148027	148032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360011
3083	NC_007763	ATG	2	6	148033	148038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360011
3084	NC_007763	AAG	2	6	148080	148085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360011
3085	NC_007763	GCC	2	6	148155	148160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360011
3086	NC_007763	ATG	2	6	148161	148166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360011
3087	NC_007763	CTG	2	6	148188	148193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360011
3088	NC_007763	GGC	2	6	148233	148238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360011
3089	NC_007763	CGC	2	6	148271	148276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360011
3090	NC_007763	ATC	2	6	148284	148289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360011
3091	NC_007763	GCG	2	6	148291	148296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360011
3092	NC_007763	TCG	2	6	148312	148317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360011
3093	NC_007763	CTG	2	6	148341	148346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360011
3094	NC_007763	CGACC	2	10	148355	148364	20 %	0 %	20 %	60 %	86360011
3095	NC_007763	GGCG	2	8	148384	148391	0 %	0 %	75 %	25 %	86360011
3096	NC_007763	GC	3	6	148421	148426	0 %	0 %	50 %	50 %	86360011
3097	NC_007763	CCGA	2	8	148440	148447	25 %	0 %	25 %	50 %	86360011
3098	NC_007763	GCC	2	6	148488	148493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360011
3099	NC_007763	AG	3	6	148494	148499	50 %	0 %	50 %	0 %	86360011
3100	NC_007763	GAG	2	6	148590	148595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360011
3101	NC_007763	GATCA	2	10	148635	148644	40 %	20 %	20 %	20 %	86360011
3102	NC_007763	CGA	2	6	148649	148654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360011
3103	NC_007763	GC	3	6	148670	148675	0 %	0 %	50 %	50 %	86360011
3104	NC_007763	CGG	2	6	148683	148688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360011
3105	NC_007763	TCG	2	6	148737	148742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360012
3106	NC_007763	GAT	2	6	148763	148768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360012
3107	NC_007763	GCA	2	6	148893	148898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360012
3108	NC_007763	GGC	2	6	148925	148930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360012
3109	NC_007763	ATG	2	6	149025	149030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360012
3110	NC_007763	CGT	2	6	149051	149056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360012
3111	NC_007763	GCC	3	9	149090	149098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360012
3112	NC_007763	CGG	2	6	149125	149130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360012
3113	NC_007763	CGT	2	6	149131	149136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360012
3114	NC_007763	GAC	2	6	149138	149143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360012
3115	NC_007763	CGA	3	9	149164	149172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360012
3116	NC_007763	GATCG	2	10	149228	149237	20 %	20 %	40 %	20 %	86360012
3117	NC_007763	CTC	2	6	149276	149281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360012
3118	NC_007763	CTCTC	2	10	149286	149295	0 %	40 %	0 %	60 %	86360012
3119	NC_007763	GCC	2	6	149439	149444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360012
3120	NC_007763	CCGC	2	8	149482	149489	0 %	0 %	25 %	75 %	86360012
3121	NC_007763	GC	3	6	149488	149493	0 %	0 %	50 %	50 %	86360012
3122	NC_007763	GCA	2	6	149499	149504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360012
3123	NC_007763	CATT	2	8	149518	149525	25 %	50 %	0 %	25 %	86360012
3124	NC_007763	CTT	2	6	149534	149539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360013
3125	NC_007763	GTC	2	6	149654	149659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360013
3126	NC_007763	GTC	2	6	149692	149697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360013
3127	NC_007763	GCG	3	9	149715	149723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360013
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3152	NC_007763	CTTGTC	2	12	150511	150522	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	86360014
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3234	NC_007763	GCCCG	2	10	153380	153389	0 %	0 %	40 %	60 %	86360017
3235	NC_007763	TGG	2	6	153394	153399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360017
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3239	NC_007763	CTG	2	6	153500	153505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360017
3240	NC_007763	TCGC	2	8	153528	153535	0 %	25 %	25 %	50 %	86360017
3241	NC_007763	CGA	2	6	153569	153574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360017
3242	NC_007763	ACG	2	6	153621	153626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360017
3243	NC_007763	TTC	2	6	153663	153668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360017
3244	NC_007763	G	6	6	153669	153674	0 %	0 %	100 %	0 %	86360017
3245	NC_007763	GAC	2	6	153749	153754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360017
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3253	NC_007763	GC	3	6	154194	154199	0 %	0 %	50 %	50 %	86360017
3254	NC_007763	CCG	2	6	154204	154209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360017
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3348	NC_007763	CCGC	2	8	158857	158864	0 %	0 %	25 %	75 %	86360023
3349	NC_007763	CGG	2	6	158876	158881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360023
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3351	NC_007763	GAT	2	6	159001	159006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360023
3352	NC_007763	AGCGGC	2	12	159009	159020	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	86360023
3353	NC_007763	GCG	2	6	159042	159047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360023
3354	NC_007763	GCC	2	6	159069	159074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360023
3355	NC_007763	CGA	2	6	159091	159096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360023
3356	NC_007763	CGA	2	6	159193	159198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360023
3357	NC_007763	TCC	2	6	159228	159233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360023
3358	NC_007763	GC	3	6	159302	159307	0 %	0 %	50 %	50 %	86360023
3359	NC_007763	CGA	2	6	159358	159363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360023
3360	NC_007763	CCCTC	2	10	159405	159414	0 %	20 %	0 %	80 %	86360023
3361	NC_007763	CGA	2	6	159454	159459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360023
3362	NC_007763	GAC	2	6	159533	159538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360023
3363	NC_007763	TGT	2	6	159574	159579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360023
3364	NC_007763	AGGC	2	8	159616	159623	25 %	0 %	50 %	25 %	86360023
3365	NC_007763	GCG	2	6	159649	159654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360023
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3490	NC_007763	CGA	2	6	164723	164728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360027
3491	NC_007763	CAT	2	6	164799	164804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360027
3492	NC_007763	GCG	2	6	164834	164839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360027
3493	NC_007763	GGCG	2	8	164864	164871	0 %	0 %	75 %	25 %	86360027
3494	NC_007763	TCCC	2	8	164904	164911	0 %	25 %	0 %	75 %	86360028
3495	NC_007763	ACG	2	6	164937	164942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360028
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