MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42b

Total Repeats: 3889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007763	TCG	3	9	46426	46434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359923
1002	NC_007763	TCA	2	6	46510	46515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359923
1003	NC_007763	CGT	2	6	46580	46585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359923
1004	NC_007763	GCT	2	6	46631	46636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359923
1005	NC_007763	ATGC	2	8	46638	46645	25 %	25 %	25 %	25 %	86359923
1006	NC_007763	GTTC	2	8	46702	46709	0 %	50 %	25 %	25 %	86359923
1007	NC_007763	CGG	2	6	46778	46783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359923
1008	NC_007763	GCC	2	6	46788	46793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359923
1009	NC_007763	GCC	2	6	46869	46874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359923
1010	NC_007763	CTA	2	6	46895	46900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359923
1011	NC_007763	TCG	2	6	46954	46959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359923
1012	NC_007763	GCC	2	6	46986	46991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359923
1013	NC_007763	CGC	2	6	47072	47077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359923
1014	NC_007763	TCA	3	9	47260	47268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359923
1015	NC_007763	ACT	2	6	47353	47358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359923
1016	NC_007763	GCC	2	6	47417	47422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359923
1017	NC_007763	ATG	2	6	47497	47502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359923
1018	NC_007763	GGA	2	6	47529	47534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359923
1019	NC_007763	GAA	2	6	47589	47594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359923
1020	NC_007763	CGC	2	6	47600	47605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359923
1021	NC_007763	GCC	2	6	47618	47623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359923
1022	NC_007763	GTG	2	6	47753	47758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86359923
1023	NC_007763	CTG	2	6	47766	47771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359923
1024	NC_007763	CAGGG	2	10	47780	47789	20 %	0 %	60 %	20 %	86359923
1025	NC_007763	CGG	2	6	47816	47821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359923
1026	NC_007763	AGG	2	6	47872	47877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359923
1027	NC_007763	ACA	2	6	48255	48260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359924
1028	NC_007763	GGA	2	6	48290	48295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359924
1029	NC_007763	GACG	2	8	48300	48307	25 %	0 %	50 %	25 %	86359924
1030	NC_007763	CGG	2	6	48310	48315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359924
1031	NC_007763	GGC	2	6	48336	48341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359924
1032	NC_007763	CGA	2	6	48380	48385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359924
1033	NC_007763	TTC	2	6	48402	48407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359924
1034	NC_007763	CGA	2	6	48416	48421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359924
1035	NC_007763	CAA	2	6	48479	48484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359924
1036	NC_007763	TCG	2	6	48487	48492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359924
1037	NC_007763	GA	3	6	48502	48507	50 %	0 %	50 %	0 %	86359924
1038	NC_007763	TTC	2	6	48644	48649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359925
1039	NC_007763	GAC	2	6	48658	48663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359925
1040	NC_007763	CCAT	2	8	48674	48681	25 %	25 %	0 %	50 %	86359925
1041	NC_007763	CAT	2	6	48687	48692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359925
1042	NC_007763	GC	3	6	48700	48705	0 %	0 %	50 %	50 %	86359925
1043	NC_007763	GAA	2	6	48769	48774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359925
1044	NC_007763	CTC	2	6	48832	48837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359925
1045	NC_007763	TGA	2	6	48861	48866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359925
1046	NC_007763	CAG	2	6	48931	48936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359925
1047	NC_007763	ACCG	2	8	49097	49104	25 %	0 %	25 %	50 %	86359925
1048	NC_007763	TCCGC	2	10	49119	49128	0 %	20 %	20 %	60 %	86359925
1049	NC_007763	GCC	3	9	49205	49213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359925
1050	NC_007763	CGG	2	6	49233	49238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359925
1051	NC_007763	ATG	2	6	49241	49246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359925
1052	NC_007763	ATCC	2	8	49254	49261	25 %	25 %	0 %	50 %	86359925
1053	NC_007763	TGCT	2	8	49333	49340	0 %	50 %	25 %	25 %	86359925
1054	NC_007763	ATG	2	6	49349	49354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359925
1055	NC_007763	TGA	2	6	49489	49494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359926
1056	NC_007763	GATT	2	8	49591	49598	25 %	50 %	25 %	0 %	86359926
1057	NC_007763	CGA	2	6	49642	49647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359926
1058	NC_007763	GCA	2	6	49670	49675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359926
1059	NC_007763	GCA	2	6	49690	49695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359926
1060	NC_007763	GCGG	2	8	49699	49706	0 %	0 %	75 %	25 %	86359926
1061	NC_007763	GCCG	2	8	49877	49884	0 %	0 %	50 %	50 %	86359926
1062	NC_007763	TCG	2	6	50082	50087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359926
1063	NC_007763	CCG	2	6	50095	50100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359926
1064	NC_007763	CCG	2	6	50154	50159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359926
1065	NC_007763	GCC	2	6	50165	50170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359926
1066	NC_007763	AGA	2	6	50281	50286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359926
1067	NC_007763	CGC	2	6	50293	50298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359926
1068	NC_007763	ACG	3	9	50316	50324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359926
1069	NC_007763	CCA	2	6	50365	50370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86359926
1070	NC_007763	CGC	2	6	50401	50406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359926
1071	NC_007763	CGT	2	6	50428	50433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359926
1072	NC_007763	GATCC	2	10	50443	50452	20 %	20 %	20 %	40 %	86359926
1073	NC_007763	TGA	2	6	50476	50481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359926
1074	NC_007763	ACC	2	6	50854	50859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86359927
1075	NC_007763	GAC	2	6	50884	50889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359927
1076	NC_007763	TCGTC	2	10	50915	50924	0 %	40 %	20 %	40 %	86359927
1077	NC_007763	GAC	2	6	50929	50934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359927
1078	NC_007763	ACG	2	6	50983	50988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359927
1079	NC_007763	GCG	2	6	50996	51001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359927
1080	NC_007763	CAA	2	6	51027	51032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359927
1081	NC_007763	GCC	2	6	51127	51132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359928
1082	NC_007763	GCA	2	6	51288	51293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359928
1083	NC_007763	CGA	2	6	51294	51299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359928
1084	NC_007763	CTC	2	6	51349	51354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359928
1085	NC_007763	CGC	2	6	51382	51387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359928
1086	NC_007763	CGAGC	2	10	51397	51406	20 %	0 %	40 %	40 %	86359928
1087	NC_007763	CCG	2	6	51422	51427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359928
1088	NC_007763	CGA	2	6	51444	51449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359928
1089	NC_007763	GCC	2	6	51470	51475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359928
1090	NC_007763	CGT	2	6	51522	51527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359928
1091	NC_007763	TCGC	2	8	51596	51603	0 %	25 %	25 %	50 %	86359928
1092	NC_007763	CCT	2	6	51615	51620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359928
1093	NC_007763	CCG	2	6	51741	51746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359928
1094	NC_007763	CGC	2	6	51811	51816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359929
1095	NC_007763	CTG	2	6	51914	51919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359929
1096	NC_007763	CAG	2	6	51935	51940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359929
1097	NC_007763	CAG	2	6	51947	51952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359929
1098	NC_007763	TCGG	2	8	51975	51982	0 %	25 %	50 %	25 %	86359929
1099	NC_007763	GAG	2	6	52001	52006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359929
1100	NC_007763	GAG	2	6	52013	52018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359929
1101	NC_007763	CAG	2	6	52046	52051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359929
1102	NC_007763	CAT	2	6	52108	52113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359929
1103	NC_007763	GACCA	2	10	52143	52152	40 %	0 %	20 %	40 %	86359929
1104	NC_007763	TCGG	2	8	52155	52162	0 %	25 %	50 %	25 %	86359929
1105	NC_007763	GC	3	6	52202	52207	0 %	0 %	50 %	50 %	86359929
1106	NC_007763	GTC	2	6	52220	52225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359929
1107	NC_007763	GGA	2	6	52247	52252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359929
1108	NC_007763	CTTCGA	2	12	52312	52323	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	86359929
1109	NC_007763	GC	3	6	52358	52363	0 %	0 %	50 %	50 %	86359929
1110	NC_007763	CGA	2	6	52471	52476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359929
1111	NC_007763	GTT	3	9	52556	52564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86359929
1112	NC_007763	TCG	2	6	52594	52599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359929
1113	NC_007763	GGACA	2	10	52675	52684	40 %	0 %	40 %	20 %	86359930
1114	NC_007763	CGT	2	6	52728	52733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359930
1115	NC_007763	GC	3	6	52745	52750	0 %	0 %	50 %	50 %	86359930
1116	NC_007763	GGA	2	6	52779	52784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359930
1117	NC_007763	GCT	2	6	52932	52937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359930
1118	NC_007763	CGA	2	6	52950	52955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359930
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1120	NC_007763	T	6	6	53467	53472	0 %	100 %	0 %	0 %	86359931
1121	NC_007763	TCG	2	6	53503	53508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359931
1122	NC_007763	G	7	7	53508	53514	0 %	0 %	100 %	0 %	86359931
1123	NC_007763	AGG	2	6	53591	53596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359931
1124	NC_007763	CCTC	2	8	53599	53606	0 %	25 %	0 %	75 %	86359931
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1126	NC_007763	GCC	2	6	53654	53659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359931
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