MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42a

Total Repeats: 3114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007762	TGCA	2	8	345	352	25 %	25 %	25 %	25 %	86359706
2	NC_007762	ACG	2	6	387	392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359706
3	NC_007762	CGA	2	6	459	464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359706
4	NC_007762	TCT	2	6	510	515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359706
5	NC_007762	TA	3	6	650	655	50 %	50 %	0 %	0 %	86359706
6	NC_007762	ACGG	2	8	671	678	25 %	0 %	50 %	25 %	86359706
7	NC_007762	CGCGC	2	10	683	692	0 %	0 %	40 %	60 %	86359706
8	NC_007762	TCC	2	6	768	773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359706
9	NC_007762	AAAT	2	8	810	817	75 %	25 %	0 %	0 %	86359706
10	NC_007762	ACAA	2	8	846	853	75 %	0 %	0 %	25 %	86359706
11	NC_007762	GAG	2	6	866	871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359706
12	NC_007762	CAA	2	6	978	983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359706
13	NC_007762	GAT	2	6	1049	1054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359706
14	NC_007762	TCT	2	6	1070	1075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359706
15	NC_007762	CCA	2	6	1077	1082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86359706
16	NC_007762	AAG	2	6	1130	1135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359706
17	NC_007762	T	6	6	1145	1150	0 %	100 %	0 %	0 %	86359706
18	NC_007762	GAC	2	6	1214	1219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359706
19	NC_007762	TTC	2	6	1242	1247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359706
20	NC_007762	GCCC	2	8	1355	1362	0 %	0 %	25 %	75 %	86359707
21	NC_007762	CGA	2	6	1367	1372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359707
22	NC_007762	TGT	2	6	1380	1385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86359707
23	NC_007762	GCT	2	6	1394	1399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359707
24	NC_007762	CGAT	2	8	1598	1605	25 %	25 %	25 %	25 %	86359707
25	NC_007762	CCGG	3	12	1668	1679	0 %	0 %	50 %	50 %	86359707
26	NC_007762	GAGGG	2	10	1745	1754	20 %	0 %	80 %	0 %	86359707
27	NC_007762	CGT	2	6	1761	1766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359707
28	NC_007762	GCT	2	6	1794	1799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359707
29	NC_007762	GGCC	2	8	1809	1816	0 %	0 %	50 %	50 %	86359707
30	NC_007762	CGG	2	6	1829	1834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359707
31	NC_007762	CCG	2	6	1835	1840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359707
32	NC_007762	AGGCGA	2	12	1842	1853	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	86359707
33	NC_007762	CGC	2	6	1896	1901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359707
34	NC_007762	GCG	3	9	1954	1962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359707
35	NC_007762	GCC	2	6	2070	2075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359707
36	NC_007762	GGA	2	6	2112	2117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359707
37	NC_007762	GAT	2	6	2199	2204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359707
38	NC_007762	CGA	2	6	2208	2213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359707
39	NC_007762	CAG	3	9	2218	2226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359707
40	NC_007762	CAGGG	2	10	2243	2252	20 %	0 %	60 %	20 %	86359707
41	NC_007762	CGC	2	6	2263	2268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359707
42	NC_007762	GCA	2	6	2412	2417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359707
43	NC_007762	CCG	2	6	2446	2451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359707
44	NC_007762	TGC	2	6	2467	2472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359707
45	NC_007762	GAT	2	6	2485	2490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359707
46	NC_007762	GCG	2	6	2521	2526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359707
47	NC_007762	ATCA	2	8	2585	2592	50 %	25 %	0 %	25 %	86359707
48	NC_007762	GAC	2	6	3374	3379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359708
49	NC_007762	TTC	2	6	3459	3464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359708
50	NC_007762	GCAT	2	8	3475	3482	25 %	25 %	25 %	25 %	86359708
51	NC_007762	AT	3	6	3505	3510	50 %	50 %	0 %	0 %	86359708
52	NC_007762	TTC	2	6	3678	3683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359708
53	NC_007762	GGC	2	6	3731	3736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359708
54	NC_007762	GCG	2	6	3784	3789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359708
55	NC_007762	GTTT	2	8	3955	3962	0 %	75 %	25 %	0 %	86359708
56	NC_007762	CAA	2	6	4030	4035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359708
57	NC_007762	TCC	2	6	4095	4100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359708
58	NC_007762	CAG	2	6	4215	4220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359708
59	NC_007762	TGC	2	6	4266	4271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359708
60	NC_007762	GCG	2	6	4272	4277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359708
61	NC_007762	ACC	2	6	4284	4289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86359708
62	NC_007762	TCCA	2	8	4482	4489	25 %	25 %	0 %	50 %	86359708
63	NC_007762	CGA	2	6	4537	4542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359708
64	NC_007762	GCT	2	6	4630	4635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359708
65	NC_007762	A	6	6	4649	4654	100 %	0 %	0 %	0 %	86359708
66	NC_007762	GAT	2	6	4722	4727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359708
67	NC_007762	ATG	2	6	4811	4816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359709
68	NC_007762	GATC	2	8	4824	4831	25 %	25 %	25 %	25 %	86359709
69	NC_007762	TGC	2	6	4955	4960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359709
70	NC_007762	GAA	2	6	5037	5042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359709
71	NC_007762	CGC	2	6	5076	5081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359709
72	NC_007762	CG	3	6	5100	5105	0 %	0 %	50 %	50 %	86359709
73	NC_007762	GGC	2	6	5119	5124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359709
74	NC_007762	GCT	2	6	5130	5135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359709
75	NC_007762	CGC	2	6	5169	5174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359709
76	NC_007762	GGC	2	6	5388	5393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359709
77	NC_007762	CAG	2	6	5419	5424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359709
78	NC_007762	CAT	2	6	5493	5498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359709
79	NC_007762	GAAT	2	8	5525	5532	50 %	25 %	25 %	0 %	86359709
80	NC_007762	CTT	2	6	5620	5625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359709
81	NC_007762	GAA	2	6	5694	5699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359709
82	NC_007762	GCG	2	6	5717	5722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359709
83	NC_007762	TGG	2	6	5745	5750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86359709
84	NC_007762	T	6	6	5752	5757	0 %	100 %	0 %	0 %	86359709
85	NC_007762	GAA	2	6	5804	5809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359709
86	NC_007762	ATTG	2	8	5834	5841	25 %	50 %	25 %	0 %	86359710
87	NC_007762	AAG	2	6	5898	5903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359710
88	NC_007762	CT	3	6	5914	5919	0 %	50 %	0 %	50 %	86359710
89	NC_007762	CG	3	6	6049	6054	0 %	0 %	50 %	50 %	86359710
90	NC_007762	ACA	3	9	6061	6069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359710
91	NC_007762	CCCGA	2	10	6087	6096	20 %	0 %	20 %	60 %	86359710
92	NC_007762	TCA	2	6	6127	6132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359710
93	NC_007762	CGA	2	6	6142	6147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359710
94	NC_007762	CGA	2	6	6163	6168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359710
95	NC_007762	TCC	2	6	6207	6212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359710
96	NC_007762	CGG	2	6	6320	6325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359710
97	NC_007762	CGC	2	6	6347	6352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359710
98	NC_007762	TAA	2	6	6368	6373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86359710
99	NC_007762	CAA	2	6	6445	6450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359710
100	NC_007762	CCTG	2	8	6502	6509	0 %	25 %	25 %	50 %	86359711
101	NC_007762	GCG	2	6	6573	6578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359711
102	NC_007762	AAC	2	6	6579	6584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359711
103	NC_007762	TTG	2	6	6591	6596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86359711
104	NC_007762	TCG	2	6	6731	6736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359711
105	NC_007762	GCG	2	6	6812	6817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359711
106	NC_007762	TC	3	6	6857	6862	0 %	50 %	0 %	50 %	86359711
107	NC_007762	TGGC	2	8	7000	7007	0 %	25 %	50 %	25 %	86359711
108	NC_007762	CGG	2	6	7051	7056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359711
109	NC_007762	CGA	2	6	7144	7149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359711
110	NC_007762	TCCT	2	8	7161	7168	0 %	50 %	0 %	50 %	86359711
111	NC_007762	AAC	2	6	7173	7178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359711
112	NC_007762	GCACA	2	10	7291	7300	40 %	0 %	20 %	40 %	86359711
113	NC_007762	GCA	2	6	7302	7307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359711
114	NC_007762	CGT	2	6	7325	7330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359711
115	NC_007762	A	6	6	7368	7373	100 %	0 %	0 %	0 %	86359711
116	NC_007762	TCC	2	6	7374	7379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359711
117	NC_007762	TGA	2	6	7399	7404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359711
118	NC_007762	ATT	2	6	7488	7493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86359711
119	NC_007762	GCTG	2	8	7498	7505	0 %	25 %	50 %	25 %	86359711
120	NC_007762	ACC	2	6	7646	7651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86359712
121	NC_007762	CGGG	2	8	7657	7664	0 %	0 %	75 %	25 %	86359712
122	NC_007762	AGC	2	6	7725	7730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359712
123	NC_007762	CCCAT	2	10	7741	7750	20 %	20 %	0 %	60 %	86359712
124	NC_007762	ACC	2	6	7760	7765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86359712
125	NC_007762	GCT	2	6	7876	7881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359712
126	NC_007762	GGC	2	6	7929	7934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359712
127	NC_007762	CGG	2	6	7960	7965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359712
128	NC_007762	GCC	2	6	7977	7982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359712
129	NC_007762	GGC	2	6	8036	8041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359712
130	NC_007762	CTG	2	6	8065	8070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359712
131	NC_007762	G	6	6	8102	8107	0 %	0 %	100 %	0 %	86359712
132	NC_007762	TCG	2	6	8161	8166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359712
133	NC_007762	TGA	2	6	8171	8176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359712
134	NC_007762	TGACGA	2	12	8225	8236	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	86359712
135	NC_007762	GCG	2	6	8313	8318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359712
136	NC_007762	GCC	2	6	8342	8347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359712
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267	NC_007762	CGG	2	6	17414	17419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359719
268	NC_007762	CTC	2	6	17430	17435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359719
269	NC_007762	GAA	2	6	17472	17477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359719
270	NC_007762	CAA	2	6	17510	17515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359719
271	NC_007762	GAT	2	6	17536	17541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359719
272	NC_007762	GCGA	2	8	17547	17554	25 %	0 %	50 %	25 %	86359719
273	NC_007762	TTGA	2	8	17569	17576	25 %	50 %	25 %	0 %	86359719
274	NC_007762	T	6	6	17608	17613	0 %	100 %	0 %	0 %	86359719
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280	NC_007762	GA	3	6	17932	17937	50 %	0 %	50 %	0 %	86359720
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391	NC_007762	TCA	2	6	24710	24715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359726
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395	NC_007762	GCT	2	6	24830	24835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359726
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431	NC_007762	CCGG	3	12	26618	26629	0 %	0 %	50 %	50 %	86359728
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472	NC_007762	CGC	2	6	28797	28802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359730
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