MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 chromosome

Total Repeats: 90379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_007761	AAT	2	6	614982	614987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86356246
13002	NC_007761	CGC	2	6	615041	615046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356246
13003	NC_007761	CGC	2	6	615057	615062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356246
13004	NC_007761	GGCG	2	8	615063	615070	0 %	0 %	75 %	25 %	86356246
13005	NC_007761	GCG	2	6	615081	615086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356246
13006	NC_007761	GCC	2	6	615113	615118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356247
13007	NC_007761	TGC	2	6	615132	615137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356247
13008	NC_007761	CCGG	2	8	615145	615152	0 %	0 %	50 %	50 %	86356247
13009	NC_007761	TCA	2	6	615165	615170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356247
13010	NC_007761	ACGC	2	8	615171	615178	25 %	0 %	25 %	50 %	86356247
13011	NC_007761	CAA	2	6	615214	615219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86356247
13012	NC_007761	TCG	2	6	615225	615230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356247
13013	NC_007761	TCG	2	6	615276	615281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356247
13014	NC_007761	CGC	2	6	615339	615344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356247
13015	NC_007761	CGA	2	6	615361	615366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356247
13016	NC_007761	TCG	2	6	615378	615383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356247
13017	NC_007761	GCC	2	6	615440	615445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356247
13018	NC_007761	CGC	2	6	615463	615468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356247
13019	NC_007761	GC	3	6	615474	615479	0 %	0 %	50 %	50 %	86356247
13020	NC_007761	CTC	2	6	615536	615541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86356247
13021	NC_007761	GGTT	2	8	615580	615587	0 %	50 %	50 %	0 %	86356247
13022	NC_007761	GGT	2	6	615613	615618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86356247
13023	NC_007761	GCC	2	6	615694	615699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356247
13024	NC_007761	GCC	3	9	615716	615724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356247
13025	NC_007761	CGC	2	6	615733	615738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356247
13026	NC_007761	GGC	2	6	615751	615756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356247
13027	NC_007761	GGC	2	6	615760	615765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356247
13028	NC_007761	GCTGCC	2	12	615901	615912	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	86356248
13029	NC_007761	GCT	2	6	615936	615941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356248
13030	NC_007761	CGCTGC	2	12	615959	615970	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	86356248
13031	NC_007761	CTT	2	6	615999	616004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356248
13032	NC_007761	GCC	2	6	616138	616143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356248
13033	NC_007761	CTG	2	6	616171	616176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356248
13034	NC_007761	CTG	3	9	616213	616221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356248
13035	NC_007761	GGC	2	6	616281	616286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356248
13036	NC_007761	CGG	2	6	616311	616316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356248
13037	NC_007761	GCT	2	6	616592	616597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356249
13038	NC_007761	CGG	2	6	616700	616705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356249
13039	NC_007761	TCG	2	6	616714	616719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356249
13040	NC_007761	TTC	2	6	616739	616744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356249
13041	NC_007761	GCC	2	6	616756	616761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356249
13042	NC_007761	CAG	2	6	616770	616775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356249
13043	NC_007761	CGCCT	2	10	616783	616792	0 %	20 %	20 %	60 %	86356249
13044	NC_007761	GAAC	2	8	616800	616807	50 %	0 %	25 %	25 %	86356249
13045	NC_007761	CTT	2	6	616841	616846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356249
13046	NC_007761	TCG	2	6	616852	616857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356249
13047	NC_007761	ATG	2	6	616858	616863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356249
13048	NC_007761	CAT	2	6	616866	616871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356249
13049	NC_007761	GAC	2	6	617072	617077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356250
13050	NC_007761	TCG	2	6	617149	617154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356250
13051	NC_007761	CAC	2	6	617243	617248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86356250
13052	NC_007761	CGA	2	6	617302	617307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356250
13053	NC_007761	CGAGGC	2	12	617339	617350	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	86356250
13054	NC_007761	CAGC	2	8	617356	617363	25 %	0 %	25 %	50 %	86356250
13055	NC_007761	GA	3	6	617370	617375	50 %	0 %	50 %	0 %	86356250
13056	NC_007761	CGA	2	6	617407	617412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356250
13057	NC_007761	GGT	2	6	617507	617512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86356250
13058	NC_007761	CAA	2	6	617524	617529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86356250
13059	NC_007761	CATG	2	8	617551	617558	25 %	25 %	25 %	25 %	86356250
13060	NC_007761	CAG	2	6	617588	617593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356250
13061	NC_007761	TGC	2	6	617637	617642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356250
13062	NC_007761	CGG	2	6	617647	617652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356250
13063	NC_007761	TCT	2	6	617661	617666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356250
13064	NC_007761	GCG	2	6	617675	617680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356250
13065	NC_007761	CGA	2	6	617710	617715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356250
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13068	NC_007761	GCG	2	6	617761	617766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356250
13069	NC_007761	CCG	2	6	617775	617780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356250
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13074	NC_007761	CAC	2	6	617921	617926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86356250
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13082	NC_007761	GAGCAG	2	12	618164	618175	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	86356250
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13085	NC_007761	CTT	2	6	618555	618560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356251
13086	NC_007761	TCG	2	6	618581	618586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356251
13087	NC_007761	GCG	2	6	618619	618624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356251
13088	NC_007761	TTC	2	6	618712	618717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356251
13089	NC_007761	GACA	2	8	618739	618746	50 %	0 %	25 %	25 %	86356251
13090	NC_007761	CGC	2	6	618901	618906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356252
13091	NC_007761	GGC	2	6	618916	618921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356252
13092	NC_007761	AGCGC	2	10	618926	618935	20 %	0 %	40 %	40 %	86356252
13093	NC_007761	AGC	2	6	618941	618946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356252
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13095	NC_007761	ATC	2	6	619159	619164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356252
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13098	NC_007761	CAGT	2	8	619296	619303	25 %	25 %	25 %	25 %	86356252
13099	NC_007761	GCG	2	6	619316	619321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356252
13100	NC_007761	GGC	2	6	619351	619356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356252
13101	NC_007761	TCC	2	6	619379	619384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86356252
13102	NC_007761	GCC	2	6	619632	619637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356253
13103	NC_007761	TCT	2	6	619652	619657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356253
13104	NC_007761	GGCT	2	8	619726	619733	0 %	25 %	50 %	25 %	86356253
13105	NC_007761	GAC	2	6	619779	619784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356253
13106	NC_007761	GAC	2	6	619796	619801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356253
13107	NC_007761	GCC	2	6	619868	619873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356253
13108	NC_007761	CTGG	2	8	619904	619911	0 %	25 %	50 %	25 %	86356253
13109	NC_007761	ATG	2	6	619955	619960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356253
13110	NC_007761	GAT	2	6	620016	620021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356254
13111	NC_007761	CG	5	10	620024	620033	0 %	0 %	50 %	50 %	86356254
13112	NC_007761	CTT	2	6	620051	620056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356254
13113	NC_007761	TCG	2	6	620059	620064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356254
13114	NC_007761	GCA	2	6	620308	620313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356254
13115	NC_007761	TGG	2	6	620341	620346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86356254
13116	NC_007761	CGT	2	6	620402	620407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356254
13117	NC_007761	GCG	2	6	620495	620500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356254
13118	NC_007761	TTCC	2	8	620522	620529	0 %	50 %	0 %	50 %	86356254
13119	NC_007761	GCC	2	6	620530	620535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356254
13120	NC_007761	CG	3	6	620541	620546	0 %	0 %	50 %	50 %	86356254
13121	NC_007761	CCA	2	6	620583	620588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86356254
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13241	NC_007761	AGC	2	6	624970	624975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356259
13242	NC_007761	TGA	2	6	624998	625003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356259
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13244	NC_007761	CG	3	6	625074	625079	0 %	0 %	50 %	50 %	86356259
13245	NC_007761	GCC	2	6	625188	625193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356259
13246	NC_007761	GACC	2	8	625232	625239	25 %	0 %	25 %	50 %	86356259
13247	NC_007761	GC	3	6	625241	625246	0 %	0 %	50 %	50 %	86356259
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13250	NC_007761	GAT	2	6	625353	625358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356259
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13252	NC_007761	CAG	2	6	625383	625388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356259
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13254	NC_007761	GCA	2	6	625613	625618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356259
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13265	NC_007761	TGC	2	6	626069	626074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356260
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13350	NC_007761	CGT	2	6	629958	629963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356263
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13352	NC_007761	GGCG	2	8	630015	630022	0 %	0 %	75 %	25 %	86356263
13353	NC_007761	TCA	2	6	630029	630034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356263
13354	NC_007761	CGATGC	2	12	630051	630062	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	86356263
13355	NC_007761	AAG	2	6	630064	630069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86356263
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13357	NC_007761	TTC	2	6	630091	630096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356263
13358	NC_007761	AAGG	2	8	630217	630224	50 %	0 %	50 %	0 %	86356263
13359	NC_007761	GCT	2	6	630258	630263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356263
13360	NC_007761	GAA	2	6	630292	630297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86356263
13361	NC_007761	GCC	2	6	630355	630360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356263
13362	NC_007761	CGT	2	6	630381	630386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356263
13363	NC_007761	GTC	2	6	630427	630432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356263
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13464	NC_007761	TCGA	2	8	635043	635050	25 %	25 %	25 %	25 %	86356267
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13467	NC_007761	AAGGCA	2	12	635209	635220	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	86356267
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13471	NC_007761	TGA	2	6	635314	635319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356267
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13475	NC_007761	AGA	2	6	635413	635418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86356267
13476	NC_007761	GAA	2	6	635423	635428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86356267
13477	NC_007761	GGC	2	6	635429	635434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356267
13478	NC_007761	TCA	2	6	635476	635481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356267
13479	NC_007761	GAA	2	6	635498	635503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86356267
13480	NC_007761	GGCG	2	8	635520	635527	0 %	0 %	75 %	25 %	86356267
13481	NC_007761	CTT	3	9	635566	635574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356268
13482	NC_007761	CGC	2	6	635587	635592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356268
13483	NC_007761	CCG	2	6	635715	635720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356268
13484	NC_007761	CCGTGC	2	12	635728	635739	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	86356268
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13486	NC_007761	TCC	2	6	635796	635801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86356268
13487	NC_007761	TCG	2	6	635817	635822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356268
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13497	NC_007761	TCCG	2	8	636274	636281	0 %	25 %	25 %	50 %	86356268
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