MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 chromosome

Total Repeats: 90379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_007761	CAT	2	6	545862	545867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356181
11503	NC_007761	GCA	2	6	545883	545888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356181
11504	NC_007761	GGA	2	6	545922	545927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86356181
11505	NC_007761	CCG	2	6	545933	545938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356181
11506	NC_007761	CGT	2	6	546051	546056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356181
11507	NC_007761	TTGG	2	8	546080	546087	0 %	50 %	50 %	0 %	86356181
11508	NC_007761	TCG	2	6	546098	546103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356181
11509	NC_007761	CCGTT	2	10	546113	546122	0 %	40 %	20 %	40 %	86356181
11510	NC_007761	CGT	2	6	546132	546137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356181
11511	NC_007761	TCA	2	6	546143	546148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356181
11512	NC_007761	CCGG	2	8	546158	546165	0 %	0 %	50 %	50 %	86356181
11513	NC_007761	TTC	2	6	546166	546171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356181
11514	NC_007761	CGA	2	6	546219	546224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356181
11515	NC_007761	ATC	2	6	546229	546234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356181
11516	NC_007761	TGG	2	6	546248	546253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86356181
11517	NC_007761	GGC	2	6	546285	546290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356181
11518	NC_007761	GCC	2	6	546313	546318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356181
11519	NC_007761	ATC	2	6	546346	546351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356181
11520	NC_007761	CCG	2	6	546383	546388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356181
11521	NC_007761	TCT	2	6	546407	546412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356181
11522	NC_007761	TCGTG	2	10	546434	546443	0 %	40 %	40 %	20 %	86356181
11523	NC_007761	GGC	2	6	546511	546516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356181
11524	NC_007761	GAT	2	6	546561	546566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356181
11525	NC_007761	GGT	2	6	546603	546608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86356181
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11527	NC_007761	TTC	2	6	546661	546666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356181
11528	NC_007761	GCA	3	9	546768	546776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356181
11529	NC_007761	CTT	3	9	546825	546833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86356181
11530	NC_007761	TCG	2	6	546875	546880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356181
11531	NC_007761	CA	3	6	546898	546903	50 %	0 %	0 %	50 %	86356181
11532	NC_007761	GC	3	6	546927	546932	0 %	0 %	50 %	50 %	86356181
11533	NC_007761	GCTC	2	8	546948	546955	0 %	25 %	25 %	50 %	86356181
11534	NC_007761	CAT	2	6	547023	547028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356181
11535	NC_007761	TGC	2	6	547139	547144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356181
11536	NC_007761	CGG	2	6	547190	547195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356181
11537	NC_007761	GCC	2	6	547198	547203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356181
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11539	NC_007761	TGC	2	6	547217	547222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356181
11540	NC_007761	GTC	2	6	547273	547278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356181
11541	NC_007761	TGA	2	6	547334	547339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356181
11542	NC_007761	GCC	2	6	547349	547354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356181
11543	NC_007761	GAG	2	6	547396	547401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86356181
11544	NC_007761	CGA	2	6	547455	547460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356181
11545	NC_007761	C	6	6	547471	547476	0 %	0 %	0 %	100 %	86356181
11546	NC_007761	CAG	2	6	547486	547491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356181
11547	NC_007761	TATCG	2	10	547537	547546	20 %	40 %	20 %	20 %	86356181
11548	NC_007761	GAG	2	6	547564	547569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86356181
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11550	NC_007761	GAT	2	6	547611	547616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356181
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11552	NC_007761	TGATCG	2	12	547628	547639	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	86356181
11553	NC_007761	TGC	2	6	547640	547645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356181
11554	NC_007761	GACCAT	2	12	547662	547673	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	86356181
11555	NC_007761	CTG	2	6	547720	547725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356181
11556	NC_007761	CGA	2	6	547845	547850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86356181
11557	NC_007761	TGA	2	6	548003	548008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356181
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11559	NC_007761	CT	3	6	548027	548032	0 %	50 %	0 %	50 %	86356181
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11562	NC_007761	GCAT	2	8	548194	548201	25 %	25 %	25 %	25 %	86356182
11563	NC_007761	GC	3	6	548260	548265	0 %	0 %	50 %	50 %	86356182
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11571	NC_007761	TCA	3	9	548576	548584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356182
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11601	NC_007761	AGGT	2	8	550162	550169	25 %	25 %	50 %	0 %	86356184
11602	NC_007761	GGC	2	6	550171	550176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356184
11603	NC_007761	TGC	2	6	550367	550372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356185
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11606	NC_007761	CGGG	2	8	550428	550435	0 %	0 %	75 %	25 %	86356185
11607	NC_007761	GC	3	6	550482	550487	0 %	0 %	50 %	50 %	86356185
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11615	NC_007761	GCC	2	6	550870	550875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356185
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11620	NC_007761	GAT	2	6	551016	551021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86356185
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11981	NC_007761	TGG	2	6	567662	567667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86356203
11982	NC_007761	CTG	2	6	567673	567678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356203
11983	NC_007761	ATCA	2	8	567962	567969	50 %	25 %	0 %	25 %	86356204
11984	NC_007761	CTG	3	9	567981	567989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356204
11985	NC_007761	CG	3	6	568006	568011	0 %	0 %	50 %	50 %	86356204
11986	NC_007761	CTG	2	6	568026	568031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356204
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11989	NC_007761	CAT	2	6	568109	568114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86356204
11990	NC_007761	ATCG	2	8	568167	568174	25 %	25 %	25 %	25 %	86356204
11991	NC_007761	CCG	2	6	568191	568196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86356204
11992	NC_007761	GCG	2	6	568313	568318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86356204
11993	NC_007761	TCG	2	6	568355	568360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86356204
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12000	NC_007761	CAC	2	6	568773	568778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86356205

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