MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid D

Total Repeats: 1801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_007490	CA	3	6	84271	84276	50 %	0 %	0 %	50 %	77404851
1502	NC_007490	GAGG	2	8	84475	84482	25 %	0 %	75 %	0 %	77404851
1503	NC_007490	GCT	2	6	84490	84495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404851
1504	NC_007490	TTGG	2	8	84567	84574	0 %	50 %	50 %	0 %	77404851
1505	NC_007490	GCC	2	6	84587	84592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404851
1506	NC_007490	GGC	2	6	84595	84600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404851
1507	NC_007490	GCA	2	6	84607	84612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404851
1508	NC_007490	TAC	2	6	84656	84661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404851
1509	NC_007490	GCC	2	6	84696	84701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404851
1510	NC_007490	CGA	2	6	84715	84720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404851
1511	NC_007490	TCG	2	6	84728	84733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404851
1512	NC_007490	TGC	2	6	84771	84776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404851
1513	NC_007490	GCC	2	6	84833	84838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404851
1514	NC_007490	GGC	2	6	84859	84864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404851
1515	NC_007490	CGGA	2	8	84963	84970	25 %	0 %	50 %	25 %	77404851
1516	NC_007490	TCG	2	6	84984	84989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404851
1517	NC_007490	GGC	2	6	85009	85014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404851
1518	NC_007490	GC	3	6	85021	85026	0 %	0 %	50 %	50 %	77404851
1519	NC_007490	ACT	3	9	85089	85097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404851
1520	NC_007490	CCGG	2	8	85100	85107	0 %	0 %	50 %	50 %	77404851
1521	NC_007490	TGG	2	6	85119	85124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77404851
1522	NC_007490	CCG	2	6	85190	85195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404851
1523	NC_007490	CGG	2	6	85204	85209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404851
1524	NC_007490	GAT	2	6	85242	85247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77404851
1525	NC_007490	TGA	2	6	85995	86000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77404852
1526	NC_007490	TGA	2	6	86173	86178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77404852
1527	NC_007490	TCA	2	6	86234	86239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404852
1528	NC_007490	TGG	2	6	86277	86282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77404852
1529	NC_007490	CCA	2	6	86283	86288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77404852
1530	NC_007490	CGT	2	6	86318	86323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404852
1531	NC_007490	AGA	2	6	86384	86389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77404852
1532	NC_007490	TAC	2	6	86413	86418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404852
1533	NC_007490	CGG	2	6	86479	86484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404852
1534	NC_007490	CGA	2	6	86495	86500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404852
1535	NC_007490	TGATG	2	10	86565	86574	20 %	40 %	40 %	0 %	552530970
1536	NC_007490	GTT	2	6	86600	86605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	552530970
1537	NC_007490	GGT	2	6	86612	86617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	552530970
1538	NC_007490	GCGG	2	8	86635	86642	0 %	0 %	75 %	25 %	552530970
1539	NC_007490	GCTG	2	8	86652	86659	0 %	25 %	50 %	25 %	552530970
1540	NC_007490	CTC	2	6	86704	86709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	552530970
1541	NC_007490	CTGG	2	8	86712	86719	0 %	25 %	50 %	25 %	552530970
1542	NC_007490	CGGAGG	2	12	86723	86734	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	552530970
1543	NC_007490	CGT	2	6	86778	86783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	552530970
1544	NC_007490	AAG	2	6	86815	86820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	552530970
1545	NC_007490	AAT	2	6	86860	86865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	552530970
1546	NC_007490	ATTGAA	2	12	86965	86976	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	552530970
1547	NC_007490	CATT	2	8	86984	86991	25 %	50 %	0 %	25 %	552530970
1548	NC_007490	TCA	2	6	87008	87013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	552530970
1549	NC_007490	TAA	2	6	87100	87105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77404853
1550	NC_007490	CGT	2	6	87250	87255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404853
1551	NC_007490	ATA	2	6	87336	87341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77404853
1552	NC_007490	ACA	2	6	87390	87395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77404853
1553	NC_007490	GCC	2	6	87405	87410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404853
1554	NC_007490	CGT	2	6	87451	87456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404853
1555	NC_007490	AG	3	6	87470	87475	50 %	0 %	50 %	0 %	77404853
1556	NC_007490	CACG	2	8	87519	87526	25 %	0 %	25 %	50 %	77404853
1557	NC_007490	CCA	2	6	87542	87547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77404853
1558	NC_007490	TGG	2	6	87558	87563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77404853
1559	NC_007490	CT	3	6	87634	87639	0 %	50 %	0 %	50 %	77404853
1560	NC_007490	CAT	2	6	87745	87750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404853
1561	NC_007490	CGA	2	6	87778	87783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404853
1562	NC_007490	CGG	2	6	87861	87866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404853
1563	NC_007490	ACA	2	6	87867	87872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77404853
1564	NC_007490	CAG	2	6	87873	87878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404853
1565	NC_007490	CCTT	2	8	87939	87946	0 %	50 %	0 %	50 %	77404853
1566	NC_007490	CGA	2	6	88045	88050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404853
1567	NC_007490	CGG	2	6	88093	88098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404853
1568	NC_007490	ACGG	2	8	88107	88114	25 %	0 %	50 %	25 %	77404853
1569	NC_007490	ACTGA	2	10	88139	88148	40 %	20 %	20 %	20 %	77404853
1570	NC_007490	GC	3	6	88188	88193	0 %	0 %	50 %	50 %	77404853
1571	NC_007490	CA	3	6	88217	88222	50 %	0 %	0 %	50 %	77404853
1572	NC_007490	CT	3	6	88228	88233	0 %	50 %	0 %	50 %	77404853
1573	NC_007490	GAC	2	6	88300	88305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404853
1574	NC_007490	GCC	2	6	88310	88315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404853
1575	NC_007490	TTG	2	6	88316	88321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77404853
1576	NC_007490	CAC	2	6	88351	88356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77404853
1577	NC_007490	GGC	2	6	88361	88366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404853
1578	NC_007490	TGG	2	6	88594	88599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77404853
1579	NC_007490	GAGG	2	8	88601	88608	25 %	0 %	75 %	0 %	77404853
1580	NC_007490	GTG	2	6	88623	88628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77404853
1581	NC_007490	TGT	2	6	88641	88646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77404853
1582	NC_007490	AC	3	6	88692	88697	50 %	0 %	0 %	50 %	77404853
1583	NC_007490	TGC	2	6	88708	88713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404853
1584	NC_007490	CGG	2	6	88738	88743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404853
1585	NC_007490	GGA	2	6	88777	88782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404853
1586	NC_007490	GTC	2	6	88784	88789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404853
1587	NC_007490	GGC	2	6	88816	88821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404853
1588	NC_007490	CGG	2	6	88825	88830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404853
1589	NC_007490	GC	3	6	88854	88859	0 %	0 %	50 %	50 %	77404853
1590	NC_007490	TGA	2	6	88924	88929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77404853
1591	NC_007490	GTG	2	6	88938	88943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77404853
1592	NC_007490	GAG	2	6	88965	88970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404853
1593	NC_007490	GAT	2	6	89033	89038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77404853
1594	NC_007490	AGG	2	6	89074	89079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404853
1595	NC_007490	CGG	2	6	89101	89106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404853
1596	NC_007490	ACG	2	6	89115	89120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404853
1597	NC_007490	TGA	2	6	89121	89126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77404853
1598	NC_007490	TGA	2	6	89158	89163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77404853
1599	NC_007490	CCT	2	6	89230	89235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77404853
1600	NC_007490	TGGCG	2	10	89240	89249	0 %	20 %	60 %	20 %	77404853
1601	NC_007490	CGTT	2	8	89283	89290	0 %	50 %	25 %	25 %	77404853
1602	NC_007490	GCCA	2	8	89318	89325	25 %	0 %	25 %	50 %	77404853
1603	NC_007490	TCA	2	6	89337	89342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404853
1604	NC_007490	GTC	2	6	89462	89467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404853
1605	NC_007490	CAA	2	6	89511	89516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77404853
1606	NC_007490	GCC	2	6	89597	89602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404853
1607	NC_007490	GTT	2	6	89638	89643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77404853
1608	NC_007490	ATG	2	6	89675	89680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77404853
1609	NC_007490	TCG	2	6	89681	89686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404853
1610	NC_007490	TGG	2	6	89725	89730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77404853
1611	NC_007490	GCG	2	6	89760	89765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404853
1612	NC_007490	GGGT	2	8	89806	89813	0 %	25 %	75 %	0 %	77404853
1613	NC_007490	CGG	2	6	89860	89865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404853
1614	NC_007490	CTG	2	6	89879	89884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404853
1615	NC_007490	TGG	2	6	89910	89915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77404853
1616	NC_007490	GGC	2	6	89942	89947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404853
1617	NC_007490	GCG	2	6	89973	89978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404853
1618	NC_007490	GATCT	2	10	89979	89988	20 %	40 %	20 %	20 %	77404853
1619	NC_007490	CGG	2	6	89995	90000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404853
1620	NC_007490	GGA	2	6	90023	90028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404853
1621	NC_007490	GGC	2	6	90053	90058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404853
1622	NC_007490	GAC	2	6	90062	90067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404853
1623	NC_007490	CGA	2	6	90079	90084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404853
1624	NC_007490	G	6	6	90157	90162	0 %	0 %	100 %	0 %	77404853
1625	NC_007490	GAT	4	12	90191	90202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77404853
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1627	NC_007490	AC	3	6	90228	90233	50 %	0 %	0 %	50 %	77404853
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.