MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid D

Total Repeats: 1801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007490	CTGGC	2	10	60192	60201	0 %	20 %	40 %	40 %	77404829
1002	NC_007490	GGCT	3	12	60245	60256	0 %	25 %	50 %	25 %	77404829
1003	NC_007490	CG	3	6	60260	60265	0 %	0 %	50 %	50 %	77404829
1004	NC_007490	GC	3	6	60322	60327	0 %	0 %	50 %	50 %	77404829
1005	NC_007490	CGG	2	6	60457	60462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404829
1006	NC_007490	GGTG	2	8	60478	60485	0 %	25 %	75 %	0 %	77404829
1007	NC_007490	GCT	2	6	60488	60493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404829
1008	NC_007490	GAA	2	6	60503	60508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77404829
1009	NC_007490	CTT	2	6	60527	60532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77404829
1010	NC_007490	GCC	2	6	60540	60545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404829
1011	NC_007490	GCTGGC	2	12	60548	60559	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	77404829
1012	NC_007490	GGC	2	6	60569	60574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404829
1013	NC_007490	GGC	2	6	60587	60592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404829
1014	NC_007490	GGC	2	6	60599	60604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404829
1015	NC_007490	CTG	2	6	60609	60614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404829
1016	NC_007490	GGT	2	6	60617	60622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77404829
1017	NC_007490	CCTGC	2	10	60641	60650	0 %	20 %	20 %	60 %	77404829
1018	NC_007490	CG	3	6	60685	60690	0 %	0 %	50 %	50 %	77404829
1019	NC_007490	CCG	2	6	60694	60699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404829
1020	NC_007490	GC	4	8	60736	60743	0 %	0 %	50 %	50 %	77404829
1021	NC_007490	GTG	2	6	60756	60761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77404829
1022	NC_007490	GTCC	2	8	60782	60789	0 %	25 %	25 %	50 %	77404829
1023	NC_007490	CCG	2	6	60802	60807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404829
1024	NC_007490	CTT	2	6	60824	60829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77404829
1025	NC_007490	CGG	2	6	60836	60841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404829
1026	NC_007490	ATC	2	6	60858	60863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404829
1027	NC_007490	CGC	2	6	60911	60916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404829
1028	NC_007490	CGC	2	6	60927	60932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404829
1029	NC_007490	GGC	2	6	60983	60988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404829
1030	NC_007490	GCTGAC	2	12	61007	61018	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	77404829
1031	NC_007490	TGG	2	6	61021	61026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77404829
1032	NC_007490	TCG	2	6	61065	61070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404829
1033	NC_007490	CTA	2	6	61133	61138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404829
1034	NC_007490	CGC	2	6	61148	61153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404829
1035	NC_007490	GCT	2	6	61172	61177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404829
1036	NC_007490	GGC	2	6	61200	61205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404829
1037	NC_007490	GCC	2	6	61239	61244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404829
1038	NC_007490	ACG	2	6	64007	64012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404832
1039	NC_007490	GCA	2	6	64078	64083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404832
1040	NC_007490	C	6	6	64085	64090	0 %	0 %	0 %	100 %	77404832
1041	NC_007490	CA	4	8	64142	64149	50 %	0 %	0 %	50 %	77404832
1042	NC_007490	GCC	2	6	64152	64157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404832
1043	NC_007490	GCCG	2	8	64276	64283	0 %	0 %	50 %	50 %	77404832
1044	NC_007490	TCGG	2	8	64370	64377	0 %	25 %	50 %	25 %	77404832
1045	NC_007490	T	7	7	64389	64395	0 %	100 %	0 %	0 %	77404832
1046	NC_007490	CCGC	2	8	64444	64451	0 %	0 %	25 %	75 %	77404832
1047	NC_007490	GCGG	2	8	64454	64461	0 %	0 %	75 %	25 %	77404832
1048	NC_007490	GGA	2	6	64475	64480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404832
1049	NC_007490	ACAG	2	8	64487	64494	50 %	0 %	25 %	25 %	77404832
1050	NC_007490	GGAA	2	8	64528	64535	50 %	0 %	50 %	0 %	77404832
1051	NC_007490	GAA	2	6	64551	64556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77404832
1052	NC_007490	CTG	2	6	64559	64564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404832
1053	NC_007490	AGC	2	6	64592	64597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404832
1054	NC_007490	AGG	2	6	64614	64619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404832
1055	NC_007490	CGT	2	6	64645	64650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404832
1056	NC_007490	GCC	2	6	64707	64712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404832
1057	NC_007490	GC	3	6	64742	64747	0 %	0 %	50 %	50 %	77404832
1058	NC_007490	AC	3	6	64753	64758	50 %	0 %	0 %	50 %	77404832
1059	NC_007490	CGG	2	6	64786	64791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404832
1060	NC_007490	GCT	2	6	64798	64803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404832
1061	NC_007490	GCA	2	6	64813	64818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404832
1062	NC_007490	TCCG	2	8	64895	64902	0 %	25 %	25 %	50 %	77404832
1063	NC_007490	GC	3	6	64940	64945	0 %	0 %	50 %	50 %	77404832
1064	NC_007490	GCC	2	6	64986	64991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404832
1065	NC_007490	CTG	2	6	65000	65005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404832
1066	NC_007490	TCG	2	6	65053	65058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404832
1067	NC_007490	CAA	2	6	65072	65077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77404832
1068	NC_007490	GAC	2	6	65126	65131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404832
1069	NC_007490	AGGG	2	8	65166	65173	25 %	0 %	75 %	0 %	77404832
1070	NC_007490	TGGA	2	8	65202	65209	25 %	25 %	50 %	0 %	77404832
1071	NC_007490	AAG	2	6	65774	65779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	552530968
1072	NC_007490	CCA	2	6	65784	65789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	552530968
1073	NC_007490	CG	3	6	65855	65860	0 %	0 %	50 %	50 %	552530968
1074	NC_007490	GC	3	6	65941	65946	0 %	0 %	50 %	50 %	552530968
1075	NC_007490	AGT	2	6	65967	65972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	552530968
1076	NC_007490	CGA	2	6	66860	66865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	552530969
1077	NC_007490	CGT	2	6	66973	66978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	552530969
1078	NC_007490	CCGG	2	8	67025	67032	0 %	0 %	50 %	50 %	552530969
1079	NC_007490	GCA	2	6	67078	67083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	552530969
1080	NC_007490	CTG	2	6	67235	67240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404833
1081	NC_007490	CGGC	2	8	67245	67252	0 %	0 %	50 %	50 %	77404833
1082	NC_007490	ATG	2	6	67253	67258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77404833
1083	NC_007490	GCCG	2	8	67267	67274	0 %	0 %	50 %	50 %	77404833
1084	NC_007490	CCA	2	6	67290	67295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77404833
1085	NC_007490	CAC	2	6	67324	67329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77404833
1086	NC_007490	ACG	2	6	67337	67342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404833
1087	NC_007490	CCGGCG	2	12	67350	67361	0 %	0 %	50 %	50 %	77404833
1088	NC_007490	TCA	2	6	67374	67379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404833
1089	NC_007490	TCG	2	6	67386	67391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404833
1090	NC_007490	GGC	2	6	67393	67398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404833
1091	NC_007490	TCA	2	6	67434	67439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404833
1092	NC_007490	CCG	2	6	67440	67445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404833
1093	NC_007490	TCGG	2	8	67490	67497	0 %	25 %	50 %	25 %	77404833
1094	NC_007490	TCGA	2	8	67511	67518	25 %	25 %	25 %	25 %	77404833
1095	NC_007490	GCCC	2	8	67531	67538	0 %	0 %	25 %	75 %	77404833
1096	NC_007490	ACCC	2	8	67555	67562	25 %	0 %	0 %	75 %	77404833
1097	NC_007490	TCA	2	6	67647	67652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404834
1098	NC_007490	CTG	2	6	67688	67693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404834
1099	NC_007490	CGA	2	6	67702	67707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404834
1100	NC_007490	CCG	2	6	67728	67733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404834
1101	NC_007490	CAT	2	6	67768	67773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77404834
1102	NC_007490	CCG	2	6	67863	67868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404834
1103	NC_007490	GC	3	6	67958	67963	0 %	0 %	50 %	50 %	77404835
1104	NC_007490	GC	3	6	67965	67970	0 %	0 %	50 %	50 %	77404835
1105	NC_007490	CGT	2	6	67977	67982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404835
1106	NC_007490	CCT	3	9	68016	68024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77404835
1107	NC_007490	TCAG	2	8	68036	68043	25 %	25 %	25 %	25 %	77404835
1108	NC_007490	GT	3	6	68075	68080	0 %	50 %	50 %	0 %	77404835
1109	NC_007490	TGG	2	6	68090	68095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77404835
1110	NC_007490	G	6	6	68099	68104	0 %	0 %	100 %	0 %	77404835
1111	NC_007490	AT	3	6	68118	68123	50 %	50 %	0 %	0 %	77404835
1112	NC_007490	CCA	2	6	68174	68179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77404835
1113	NC_007490	CGG	2	6	68213	68218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404835
1114	NC_007490	CTC	2	6	68236	68241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77404835
1115	NC_007490	GAC	2	6	68251	68256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404835
1116	NC_007490	CGA	2	6	68262	68267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404835
1117	NC_007490	TCCG	2	8	68297	68304	0 %	25 %	25 %	50 %	77404835
1118	NC_007490	GTG	2	6	68341	68346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77404835
1119	NC_007490	ACCT	2	8	68362	68369	25 %	25 %	0 %	50 %	77404835
1120	NC_007490	ACC	2	6	68374	68379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77404835
1121	NC_007490	GCG	3	9	68394	68402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404835
1122	NC_007490	GAA	2	6	68422	68427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77404835
1123	NC_007490	CTC	2	6	68430	68435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77404835
1124	NC_007490	CCG	2	6	68494	68499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404836
1125	NC_007490	GGC	2	6	68504	68509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404836
1126	NC_007490	CGT	2	6	68510	68515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404836
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1128	NC_007490	TCGGCC	2	12	68577	68588	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	77404836
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