MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid B

Total Repeats: 2835

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_007488	CGG	3	9	101387	101395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404680
2502	NC_007488	GGC	2	6	101397	101402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404680
2503	NC_007488	AGG	2	6	101428	101433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404680
2504	NC_007488	GAGGC	2	10	101434	101443	20 %	0 %	60 %	20 %	77404680
2505	NC_007488	CTGA	2	8	101540	101547	25 %	25 %	25 %	25 %	77404681
2506	NC_007488	TCC	2	6	101565	101570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77404681
2507	NC_007488	GAA	2	6	101582	101587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77404681
2508	NC_007488	CGA	2	6	101608	101613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404681
2509	NC_007488	CTC	2	6	101699	101704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77404681
2510	NC_007488	GCGA	2	8	101706	101713	25 %	0 %	50 %	25 %	77404681
2511	NC_007488	TCG	2	6	101769	101774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404681
2512	NC_007488	AGCG	2	8	101802	101809	25 %	0 %	50 %	25 %	77404681
2513	NC_007488	CG	3	6	101808	101813	0 %	0 %	50 %	50 %	77404681
2514	NC_007488	GCT	3	9	101824	101832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404681
2515	NC_007488	GCC	2	6	101834	101839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404681
2516	NC_007488	GCCTCG	2	12	101910	101921	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	77404681
2517	NC_007488	CGG	2	6	102021	102026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404681
2518	NC_007488	GCG	2	6	102044	102049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404681
2519	NC_007488	TGG	2	6	102127	102132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77404681
2520	NC_007488	CCCGAA	2	12	102138	102149	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	77404681
2521	NC_007488	TCT	2	6	102166	102171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77404681
2522	NC_007488	GCA	2	6	102202	102207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404681
2523	NC_007488	TTG	2	6	102228	102233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77404681
2524	NC_007488	CCCG	2	8	102518	102525	0 %	0 %	25 %	75 %	77404682
2525	NC_007488	GCG	2	6	102643	102648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404682
2526	NC_007488	GCG	3	9	102745	102753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404682
2527	NC_007488	GGA	2	6	102810	102815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404682
2528	NC_007488	GGC	2	6	102816	102821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404682
2529	NC_007488	CTT	2	6	102822	102827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77404682
2530	NC_007488	CTCG	2	8	102831	102838	0 %	25 %	25 %	50 %	77404682
2531	NC_007488	GTG	2	6	102862	102867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77404682
2532	NC_007488	GC	3	6	102872	102877	0 %	0 %	50 %	50 %	77404682
2533	NC_007488	GGC	2	6	102927	102932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404682
2534	NC_007488	CGC	2	6	102939	102944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404682
2535	NC_007488	TCG	3	9	102974	102982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404682
2536	NC_007488	CGG	2	6	103083	103088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404682
2537	NC_007488	CGC	2	6	103110	103115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404682
2538	NC_007488	CG	3	6	103120	103125	0 %	0 %	50 %	50 %	77404682
2539	NC_007488	GCG	3	9	103187	103195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404682
2540	NC_007488	GTG	2	6	103243	103248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77404682
2541	NC_007488	GC	3	6	103277	103282	0 %	0 %	50 %	50 %	77404682
2542	NC_007488	CGG	2	6	103288	103293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404682
2543	NC_007488	GAG	2	6	103312	103317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404682
2544	NC_007488	GTC	2	6	103327	103332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404682
2545	NC_007488	CG	3	6	103340	103345	0 %	0 %	50 %	50 %	77404682
2546	NC_007488	GTG	2	6	103357	103362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77404682
2547	NC_007488	ACG	2	6	103376	103381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404682
2548	NC_007488	GCCGC	2	10	103403	103412	0 %	0 %	40 %	60 %	77404682
2549	NC_007488	CTG	2	6	103432	103437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404682
2550	NC_007488	GCC	2	6	103450	103455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404682
2551	NC_007488	CG	3	6	103459	103464	0 %	0 %	50 %	50 %	77404682
2552	NC_007488	GAT	2	6	103572	103577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77404683
2553	NC_007488	GAG	2	6	103579	103584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404683
2554	NC_007488	CCGA	2	8	103612	103619	25 %	0 %	25 %	50 %	77404683
2555	NC_007488	GCT	2	6	103677	103682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404683
2556	NC_007488	AGG	2	6	103688	103693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404683
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2558	NC_007488	GC	3	6	103739	103744	0 %	0 %	50 %	50 %	77404683
2559	NC_007488	CG	3	6	103755	103760	0 %	0 %	50 %	50 %	77404683
2560	NC_007488	AGC	2	6	103798	103803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404683
2561	NC_007488	CCG	2	6	103850	103855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404683
2562	NC_007488	TGGCCG	2	12	103877	103888	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	77404683
2563	NC_007488	GGC	2	6	103930	103935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404683
2564	NC_007488	CG	3	6	103969	103974	0 %	0 %	50 %	50 %	77404683
2565	NC_007488	GCTC	2	8	104015	104022	0 %	25 %	25 %	50 %	77404683
2566	NC_007488	CTC	2	6	104029	104034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77404683
2567	NC_007488	GCG	2	6	104046	104051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404683
2568	NC_007488	GC	3	6	104076	104081	0 %	0 %	50 %	50 %	77404683
2569	NC_007488	CGA	2	6	104094	104099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404683
2570	NC_007488	GAG	2	6	104122	104127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404683
2571	NC_007488	GCT	2	6	104139	104144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404683
2572	NC_007488	GAG	2	6	104149	104154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404683
2573	NC_007488	CG	3	6	104177	104182	0 %	0 %	50 %	50 %	77404683
2574	NC_007488	GGC	2	6	104255	104260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404684
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2577	NC_007488	GCT	2	6	104428	104433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404684
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2580	NC_007488	CGC	2	6	104560	104565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404684
2581	NC_007488	CG	3	6	104583	104588	0 %	0 %	50 %	50 %	77404684
2582	NC_007488	GC	3	6	104648	104653	0 %	0 %	50 %	50 %	77404684
2583	NC_007488	GCC	2	6	104671	104676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404684
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2588	NC_007488	TCG	2	6	104871	104876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404684
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2590	NC_007488	GCCC	2	8	104935	104942	0 %	0 %	25 %	75 %	77404684
2591	NC_007488	GC	3	6	104947	104952	0 %	0 %	50 %	50 %	77404684
2592	NC_007488	GCA	2	6	104983	104988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404684
2593	NC_007488	CG	3	6	104996	105001	0 %	0 %	50 %	50 %	77404684
2594	NC_007488	CGG	2	6	105009	105014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404684
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2596	NC_007488	GC	3	6	105204	105209	0 %	0 %	50 %	50 %	77404684
2597	NC_007488	GAC	2	6	105248	105253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404684
2598	NC_007488	CCGG	2	8	105408	105415	0 %	0 %	50 %	50 %	77404685
2599	NC_007488	CGA	2	6	105423	105428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404685
2600	NC_007488	TCTCGA	2	12	105461	105472	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	77404685
2601	NC_007488	TGCGGA	2	12	105479	105490	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	77404685
2602	NC_007488	GGCGC	2	10	105492	105501	0 %	0 %	60 %	40 %	77404685
2603	NC_007488	GC	4	8	105507	105514	0 %	0 %	50 %	50 %	77404685
2604	NC_007488	CGG	2	6	105534	105539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404685
2605	NC_007488	GGC	2	6	105548	105553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404685
2606	NC_007488	GC	3	6	105552	105557	0 %	0 %	50 %	50 %	77404685
2607	NC_007488	GTC	2	6	105588	105593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404685
2608	NC_007488	GAGC	2	8	105696	105703	25 %	0 %	50 %	25 %	77404685
2609	NC_007488	GCC	2	6	105816	105821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404685
2610	NC_007488	CCGG	2	8	105824	105831	0 %	0 %	50 %	50 %	77404685
2611	NC_007488	CGCC	2	8	105898	105905	0 %	0 %	25 %	75 %	77404685
2612	NC_007488	CGC	2	6	105956	105961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404685
2613	NC_007488	CCAGC	2	10	105966	105975	20 %	0 %	20 %	60 %	77404685
2614	NC_007488	CGA	2	6	106007	106012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404685
2615	NC_007488	CCA	2	6	106022	106027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77404685
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2618	NC_007488	CAGCGC	2	12	106191	106202	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	77404685
2619	NC_007488	CG	4	8	106242	106249	0 %	0 %	50 %	50 %	77404685
2620	NC_007488	AGG	2	6	106268	106273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77404685
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2622	NC_007488	TCC	2	6	106300	106305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77404685
2623	NC_007488	CGCC	2	8	106334	106341	0 %	0 %	25 %	75 %	77404685
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.