MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia eutropha JMP134 megaplasmid

Total Repeats: 10495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007336	GTC	2	6	374	379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72383732
2	NC_007336	GGC	2	6	391	396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72383732
3	NC_007336	GCG	2	6	433	438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72383732
4	NC_007336	CAG	2	6	455	460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72383732
5	NC_007336	CTT	2	6	461	466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	72383732
6	NC_007336	GCG	2	6	484	489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72383732
7	NC_007336	TCG	2	6	504	509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72383732
8	NC_007336	GCCG	2	8	583	590	0 %	0 %	50 %	50 %	72383732
9	NC_007336	GCG	2	6	596	601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72383732
10	NC_007336	TCT	2	6	643	648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	72383732
11	NC_007336	CG	3	6	654	659	0 %	0 %	50 %	50 %	72383732
12	NC_007336	GCC	2	6	662	667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72383732
13	NC_007336	GGT	2	6	713	718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	72383732
14	NC_007336	GTGG	2	8	719	726	0 %	25 %	75 %	0 %	72383732
15	NC_007336	GGC	2	6	788	793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72383732
16	NC_007336	TGC	2	6	805	810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72383732
17	NC_007336	GTC	2	6	941	946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72383732
18	NC_007336	GGGC	2	8	1010	1017	0 %	0 %	75 %	25 %	72383732
19	NC_007336	GAT	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72383732
20	NC_007336	GCT	2	6	1090	1095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72383732
21	NC_007336	CGT	2	6	1129	1134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72383732
22	NC_007336	GAA	2	6	1156	1161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72383733
23	NC_007336	GCCG	2	8	1185	1192	0 %	0 %	50 %	50 %	72383733
24	NC_007336	GCG	2	6	1200	1205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72383733
25	NC_007336	CG	3	6	1256	1261	0 %	0 %	50 %	50 %	72383733
26	NC_007336	GGCC	2	8	1379	1386	0 %	0 %	50 %	50 %	72383733
27	NC_007336	GA	3	6	1417	1422	50 %	0 %	50 %	0 %	72383733
28	NC_007336	CGG	2	6	1436	1441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72383733
29	NC_007336	CGC	3	9	1454	1462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72383733
30	NC_007336	TGA	2	6	1463	1468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72383733
31	NC_007336	CGT	2	6	1571	1576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72383733
32	NC_007336	CGC	2	6	1607	1612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72383733
33	NC_007336	GAT	2	6	1623	1628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72383733
34	NC_007336	CG	3	6	1740	1745	0 %	0 %	50 %	50 %	72383733
35	NC_007336	AAC	2	6	1795	1800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	72383733
36	NC_007336	CGC	2	6	1848	1853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72383733
37	NC_007336	CAG	2	6	1914	1919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72383733
38	NC_007336	CTG	2	6	1977	1982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72383733
39	NC_007336	CGCA	2	8	2005	2012	25 %	0 %	25 %	50 %	72383733
40	NC_007336	CCA	2	6	2027	2032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	72383733
41	NC_007336	AGC	2	6	2044	2049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72383733
42	NC_007336	CGC	2	6	2099	2104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72383733
43	NC_007336	GCG	3	9	2137	2145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72383733
44	NC_007336	GGC	2	6	2159	2164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72383733
45	NC_007336	GGT	2	6	2187	2192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	72383733
46	NC_007336	GTC	2	6	2220	2225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72383733
47	NC_007336	GCC	2	6	2289	2294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72383733
48	NC_007336	GCG	2	6	2332	2337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72383733
49	NC_007336	CGCA	2	8	2401	2408	25 %	0 %	25 %	50 %	72383733
50	NC_007336	GC	3	6	2431	2436	0 %	0 %	50 %	50 %	72383733
51	NC_007336	AGG	2	6	2521	2526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	72383733
52	NC_007336	CGG	2	6	2561	2566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72383733
53	NC_007336	GC	3	6	2580	2585	0 %	0 %	50 %	50 %	72383733
54	NC_007336	CAG	3	9	2604	2612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72383733
55	NC_007336	CGA	2	6	2621	2626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72383733
56	NC_007336	GTC	2	6	2705	2710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72383734
57	NC_007336	CGG	2	6	2757	2762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72383734
58	NC_007336	CGA	2	6	2763	2768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72383734
59	NC_007336	TGCC	2	8	2877	2884	0 %	25 %	25 %	50 %	72383734
60	NC_007336	GTG	2	6	2908	2913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	72383734
61	NC_007336	CG	3	6	2949	2954	0 %	0 %	50 %	50 %	72383734
62	NC_007336	CAGG	2	8	3010	3017	25 %	0 %	50 %	25 %	72383734
63	NC_007336	CG	3	6	3020	3025	0 %	0 %	50 %	50 %	72383734
64	NC_007336	CGTG	2	8	3081	3088	0 %	25 %	50 %	25 %	72383734
65	NC_007336	CAG	2	6	3124	3129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72383734
66	NC_007336	CG	3	6	3132	3137	0 %	0 %	50 %	50 %	72383734
67	NC_007336	TCG	2	6	3194	3199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72383734
68	NC_007336	CGC	2	6	3200	3205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72383734
69	NC_007336	GC	3	6	3228	3233	0 %	0 %	50 %	50 %	72383734
70	NC_007336	CCT	2	6	3257	3262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	72383735
71	NC_007336	GGC	2	6	3296	3301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72383735
72	NC_007336	GC	3	6	3308	3313	0 %	0 %	50 %	50 %	72383735
73	NC_007336	CGT	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72383735
74	NC_007336	GC	3	6	3332	3337	0 %	0 %	50 %	50 %	72383735
75	NC_007336	GCCTT	2	10	3376	3385	0 %	40 %	20 %	40 %	72383735
76	NC_007336	CGC	2	6	3425	3430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72383735
77	NC_007336	CGT	2	6	3449	3454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72383735
78	NC_007336	GC	4	8	3525	3532	0 %	0 %	50 %	50 %	72383735
79	NC_007336	GCC	2	6	3536	3541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72383735
80	NC_007336	CCA	2	6	3563	3568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	72383735
81	NC_007336	CG	4	8	3581	3588	0 %	0 %	50 %	50 %	72383735
82	NC_007336	TCA	2	6	3590	3595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	72383735
83	NC_007336	GAA	2	6	3606	3611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72383735
84	NC_007336	CGG	2	6	3614	3619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72383735
85	NC_007336	GCA	2	6	3623	3628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72383735
86	NC_007336	CGG	3	9	3631	3639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72383735
87	NC_007336	GCA	2	6	3650	3655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72383735
88	NC_007336	GCGAGC	2	12	3775	3786	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	72383735
89	NC_007336	TCG	2	6	3796	3801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72383735
90	NC_007336	GC	3	6	3811	3816	0 %	0 %	50 %	50 %	72383735
91	NC_007336	CGG	2	6	3839	3844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72383735
92	NC_007336	CAC	2	6	3849	3854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	72383735
93	NC_007336	TCT	2	6	3865	3870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	72383735
94	NC_007336	CGG	2	6	3890	3895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72383735
95	NC_007336	GA	3	6	3899	3904	50 %	0 %	50 %	0 %	72383735
96	NC_007336	CAG	2	6	3912	3917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72383735
97	NC_007336	GCC	2	6	3963	3968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72383735
98	NC_007336	TG	3	6	4021	4026	0 %	50 %	50 %	0 %	72383735
99	NC_007336	GC	3	6	4033	4038	0 %	0 %	50 %	50 %	72383735
100	NC_007336	CGG	2	6	4052	4057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72383735
101	NC_007336	CAG	2	6	4085	4090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72383736
102	NC_007336	GCGA	2	8	4091	4098	25 %	0 %	50 %	25 %	72383736
103	NC_007336	GCC	2	6	4124	4129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72383736
104	NC_007336	TGCC	2	8	4130	4137	0 %	25 %	25 %	50 %	72383736
105	NC_007336	AAC	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	72383736
106	NC_007336	GCA	2	6	4162	4167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72383736
107	NC_007336	GCC	2	6	4196	4201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72383736
108	NC_007336	GCC	2	6	4206	4211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72383736
109	NC_007336	CGAG	2	8	4306	4313	25 %	0 %	50 %	25 %	72383736
110	NC_007336	GCG	2	6	4345	4350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72383736
111	NC_007336	GC	3	6	4385	4390	0 %	0 %	50 %	50 %	72383736
112	NC_007336	GCCCAC	2	12	4400	4411	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	72383736
113	NC_007336	GCC	2	6	4574	4579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72383736
114	NC_007336	TGC	2	6	4595	4600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72383736
115	NC_007336	CGC	2	6	4607	4612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72383736
116	NC_007336	ATC	2	6	4656	4661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	72383736
117	NC_007336	GGCG	2	8	4673	4680	0 %	0 %	75 %	25 %	72383736
118	NC_007336	TGT	2	6	4753	4758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	72383736
119	NC_007336	GCG	2	6	4786	4791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72383736
120	NC_007336	GAT	2	6	4820	4825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72383736
121	NC_007336	TGG	2	6	4846	4851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	72383736
122	NC_007336	CTC	2	6	4910	4915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	72383736
123	NC_007336	GCGCC	2	10	4921	4930	0 %	0 %	40 %	60 %	72383736
124	NC_007336	AGC	2	6	4983	4988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72383736
125	NC_007336	CGC	2	6	5056	5061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72383736
126	NC_007336	GCG	2	6	5191	5196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72383736
127	NC_007336	GCG	2	6	5203	5208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72383736
128	NC_007336	GGC	2	6	5216	5221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72383736
129	NC_007336	GC	3	6	5327	5332	0 %	0 %	50 %	50 %	72383736
130	NC_007336	AGT	2	6	5401	5406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72383736
131	NC_007336	CTG	2	6	5530	5535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72383736
132	NC_007336	GCG	2	6	5624	5629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72383736
133	NC_007336	GGT	2	6	5648	5653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	72383736
134	NC_007336	CGA	2	6	5683	5688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72383736
135	NC_007336	GCA	2	6	5691	5696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72383736
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137	NC_007336	GCCG	2	8	5822	5829	0 %	0 %	50 %	50 %	72383736
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270	NC_007336	ACG	2	6	12771	12776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72383741
271	NC_007336	GAAG	2	8	12800	12807	50 %	0 %	50 %	0 %	72383741
272	NC_007336	CCGGC	2	10	12836	12845	0 %	0 %	40 %	60 %	72383741
273	NC_007336	CGG	2	6	12862	12867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72383741
274	NC_007336	TGG	2	6	12871	12876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	72383741
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278	NC_007336	TGG	2	6	13063	13068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	72383741
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284	NC_007336	GGCC	2	8	13223	13230	0 %	0 %	50 %	50 %	72383741
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393	NC_007336	CAT	2	6	19144	19149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	72383746
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395	NC_007336	TTC	2	6	19175	19180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	72383746
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397	NC_007336	TCCC	2	8	19281	19288	0 %	25 %	0 %	75 %	72383747
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