MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Rickettsia felis URRWXCal2 plasmid pRFdelta

Total Repeats: 756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007111	TA	3	6	780	785	50 %	50 %	0 %	0 %	67459863
2	NC_007111	ATC	2	6	886	891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459863
3	NC_007111	CTTT	2	8	982	989	0 %	75 %	0 %	25 %	67459863
4	NC_007111	ATT	2	6	1349	1354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459864
5	NC_007111	AGT	2	6	1374	1379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459864
6	NC_007111	TAA	2	6	1425	1430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459864
7	NC_007111	T	6	6	1467	1472	0 %	100 %	0 %	0 %	67459864
8	NC_007111	ATA	2	6	1493	1498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459864
9	NC_007111	TTAT	2	8	1506	1513	25 %	75 %	0 %	0 %	67459864
10	NC_007111	A	7	7	1537	1543	100 %	0 %	0 %	0 %	67459864
11	NC_007111	T	6	6	1554	1559	0 %	100 %	0 %	0 %	67459864
12	NC_007111	TTA	2	6	1598	1603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459864
13	NC_007111	ATT	2	6	1616	1621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459864
14	NC_007111	GT	3	6	1817	1822	0 %	50 %	50 %	0 %	67459865
15	NC_007111	ATT	2	6	1864	1869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459865
16	NC_007111	AAT	2	6	1872	1877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459865
17	NC_007111	GGT	2	6	1888	1893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	67459865
18	NC_007111	CTA	2	6	1904	1909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459865
19	NC_007111	TA	3	6	1934	1939	50 %	50 %	0 %	0 %	67459865
20	NC_007111	A	7	7	1939	1945	100 %	0 %	0 %	0 %	67459865
21	NC_007111	TA	3	6	1995	2000	50 %	50 %	0 %	0 %	67459865
22	NC_007111	TAA	2	6	2049	2054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459865
23	NC_007111	AGAT	2	8	2057	2064	50 %	25 %	25 %	0 %	67459865
24	NC_007111	TAA	2	6	2067	2072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459865
25	NC_007111	AAT	2	6	2110	2115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459865
26	NC_007111	ATT	2	6	2122	2127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459865
27	NC_007111	TAG	2	6	2166	2171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459865
28	NC_007111	AGAA	2	8	2184	2191	75 %	0 %	25 %	0 %	67459865
29	NC_007111	A	7	7	2217	2223	100 %	0 %	0 %	0 %	67459865
30	NC_007111	GATTAT	2	12	2224	2235	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	67459865
31	NC_007111	CCA	2	6	2251	2256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	67459865
32	NC_007111	AT	3	6	2284	2289	50 %	50 %	0 %	0 %	67459865
33	NC_007111	AAT	2	6	2301	2306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459865
34	NC_007111	TTA	2	6	2353	2358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459865
35	NC_007111	T	6	6	2398	2403	0 %	100 %	0 %	0 %	67459865
36	NC_007111	A	6	6	2409	2414	100 %	0 %	0 %	0 %	67459865
37	NC_007111	A	7	7	2426	2432	100 %	0 %	0 %	0 %	67459865
38	NC_007111	AT	3	6	2448	2453	50 %	50 %	0 %	0 %	67459865
39	NC_007111	TTA	2	6	2485	2490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459865
40	NC_007111	TAT	2	6	2496	2501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459865
41	NC_007111	A	6	6	2505	2510	100 %	0 %	0 %	0 %	67459865
42	NC_007111	TAA	2	6	2535	2540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459865
43	NC_007111	TTA	2	6	2593	2598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459865
44	NC_007111	AAAT	2	8	2631	2638	75 %	25 %	0 %	0 %	67459866
45	NC_007111	TAG	2	6	2643	2648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459866
46	NC_007111	AAT	2	6	2677	2682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459866
47	NC_007111	A	6	6	2700	2705	100 %	0 %	0 %	0 %	67459866
48	NC_007111	TTA	2	6	2712	2717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459866
49	NC_007111	AAT	2	6	2726	2731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459866
50	NC_007111	AAC	2	6	2734	2739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459866
51	NC_007111	ATT	2	6	2798	2803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459866
52	NC_007111	TTA	2	6	2853	2858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459866
53	NC_007111	A	7	7	2902	2908	100 %	0 %	0 %	0 %	67459866
54	NC_007111	TTC	2	6	2926	2931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459866
55	NC_007111	ATT	2	6	3447	3452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
56	NC_007111	GA	3	6	3688	3693	50 %	0 %	50 %	0 %	67459867
57	NC_007111	TCTAAA	2	12	3703	3714	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	67459867
58	NC_007111	AGA	2	6	3738	3743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459867
59	NC_007111	TA	4	8	3759	3766	50 %	50 %	0 %	0 %	67459867
60	NC_007111	AAT	2	6	3790	3795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459867
61	NC_007111	TAC	3	9	3807	3815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459867
62	NC_007111	ATTTA	2	10	3861	3870	40 %	60 %	0 %	0 %	67459867
63	NC_007111	TCAG	2	8	3912	3919	25 %	25 %	25 %	25 %	67459867
64	NC_007111	ACA	2	6	3972	3977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459867
65	NC_007111	TTA	2	6	3998	4003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
66	NC_007111	TAT	2	6	4070	4075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
67	NC_007111	GTA	2	6	4136	4141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459867
68	NC_007111	ATT	2	6	4166	4171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
69	NC_007111	AAATTC	2	12	4179	4190	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	67459867
70	NC_007111	CAT	2	6	4199	4204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459867
71	NC_007111	CAA	2	6	4216	4221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459867
72	NC_007111	TTA	2	6	4283	4288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
73	NC_007111	TTA	2	6	4304	4309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
74	NC_007111	ATT	2	6	4319	4324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
75	NC_007111	CAG	2	6	4329	4334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67459867
76	NC_007111	ATG	2	6	4427	4432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459867
77	NC_007111	GAA	2	6	4438	4443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459867
78	NC_007111	TTA	2	6	4462	4467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
79	NC_007111	ACA	2	6	4483	4488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459867
80	NC_007111	CCT	2	6	4573	4578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	67459867
81	NC_007111	TA	3	6	4598	4603	50 %	50 %	0 %	0 %	67459867
82	NC_007111	ATA	3	9	4622	4630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459867
83	NC_007111	TAA	2	6	4632	4637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459867
84	NC_007111	TA	3	6	4648	4653	50 %	50 %	0 %	0 %	67459867
85	NC_007111	GAA	2	6	4666	4671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459867
86	NC_007111	TAC	2	6	4764	4769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459867
87	NC_007111	AAT	2	6	4891	4896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459867
88	NC_007111	TTA	2	6	4909	4914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
89	NC_007111	ACA	2	6	5029	5034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459867
90	NC_007111	GAA	2	6	5145	5150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459867
91	NC_007111	AGG	2	6	5195	5200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	67459867
92	NC_007111	ACAA	2	8	5212	5219	75 %	0 %	0 %	25 %	67459867
93	NC_007111	ATA	2	6	5222	5227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459867
94	NC_007111	AGCG	2	8	5266	5273	25 %	0 %	50 %	25 %	67459867
95	NC_007111	TTA	2	6	5325	5330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
96	NC_007111	A	6	6	5395	5400	100 %	0 %	0 %	0 %	67459867
97	NC_007111	AATGA	2	10	5422	5431	60 %	20 %	20 %	0 %	67459867
98	NC_007111	AAGAG	2	10	5556	5565	60 %	0 %	40 %	0 %	67459867
99	NC_007111	CAA	2	6	5651	5656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459867
100	NC_007111	AAT	2	6	5680	5685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459867
101	NC_007111	ATTA	2	8	5725	5732	50 %	50 %	0 %	0 %	67459867
102	NC_007111	ATT	2	6	5759	5764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
103	NC_007111	GAA	2	6	5793	5798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459868
104	NC_007111	ACAA	2	8	5854	5861	75 %	0 %	0 %	25 %	67459868
105	NC_007111	GTA	2	6	5896	5901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459868
106	NC_007111	ATA	2	6	5929	5934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459868
107	NC_007111	TGA	2	6	5936	5941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459868
108	NC_007111	TTATTG	2	12	5947	5958	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	67459868
109	NC_007111	AAGCG	2	10	5959	5968	40 %	0 %	40 %	20 %	67459868
110	NC_007111	GAA	2	6	6111	6116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459868
111	NC_007111	ATT	2	6	6126	6131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459868
112	NC_007111	CAA	2	6	6132	6137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459868
113	NC_007111	AT	3	6	6152	6157	50 %	50 %	0 %	0 %	67459868
114	NC_007111	TGA	2	6	6182	6187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459868
115	NC_007111	CAA	2	6	6236	6241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459868
116	NC_007111	AGTA	2	8	6260	6267	50 %	25 %	25 %	0 %	67459868
117	NC_007111	GAATT	2	10	6280	6289	40 %	40 %	20 %	0 %	67459868
118	NC_007111	TCT	2	6	6299	6304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459868
119	NC_007111	TAG	2	6	6328	6333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459868
120	NC_007111	ATTC	2	8	6348	6355	25 %	50 %	0 %	25 %	67459868
121	NC_007111	ATAAA	2	10	6379	6388	80 %	20 %	0 %	0 %	67459868
122	NC_007111	A	6	6	6392	6397	100 %	0 %	0 %	0 %	67459868
123	NC_007111	GAT	2	6	6402	6407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459868
124	NC_007111	ATT	2	6	6439	6444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459868
125	NC_007111	ATT	2	6	6455	6460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459868
126	NC_007111	GAT	2	6	6547	6552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459869
127	NC_007111	GGA	2	6	6619	6624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	67459869
128	NC_007111	TTA	2	6	6746	6751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459869
129	NC_007111	TTTAAG	2	12	6777	6788	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	67459869
130	NC_007111	A	7	7	6813	6819	100 %	0 %	0 %	0 %	67459869
131	NC_007111	TTA	2	6	6956	6961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459869
132	NC_007111	GTA	2	6	7006	7011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459869
133	NC_007111	ATA	2	6	7124	7129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459869
134	NC_007111	TTTG	2	8	7170	7177	0 %	75 %	25 %	0 %	67459869
135	NC_007111	AG	3	6	7183	7188	50 %	0 %	50 %	0 %	67459869
136	NC_007111	TA	3	6	7255	7260	50 %	50 %	0 %	0 %	67459869
137	NC_007111	ATT	2	6	7272	7277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459869
138	NC_007111	TG	3	6	7297	7302	0 %	50 %	50 %	0 %	67459869
139	NC_007111	TC	3	6	7332	7337	0 %	50 %	0 %	50 %	67459869
140	NC_007111	AGC	2	6	7359	7364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67459869
141	NC_007111	CTA	2	6	7384	7389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459869
142	NC_007111	ATC	2	6	7396	7401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459869
143	NC_007111	CTT	2	6	7416	7421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459869
144	NC_007111	TTA	2	6	7479	7484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459869
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146	NC_007111	TA	3	6	7558	7563	50 %	50 %	0 %	0 %	67459870
147	NC_007111	AGT	2	6	7564	7569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459870
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149	NC_007111	TAT	2	6	7636	7641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459870
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151	NC_007111	AAT	2	6	7957	7962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459871
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153	NC_007111	TA	3	6	8046	8051	50 %	50 %	0 %	0 %	67459871
154	NC_007111	TAA	2	6	8077	8082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459871
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162	NC_007111	TTG	2	6	8453	8458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	67459872
163	NC_007111	ATA	2	6	8480	8485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459872
164	NC_007111	TAC	2	6	8504	8509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459872
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167	NC_007111	ATTT	2	8	8579	8586	25 %	75 %	0 %	0 %	67459872
168	NC_007111	CAT	2	6	8600	8605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459872
169	NC_007111	ATT	2	6	8659	8664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459872
170	NC_007111	CTA	2	6	8669	8674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459872
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172	NC_007111	T	6	6	8695	8700	0 %	100 %	0 %	0 %	67459872
173	NC_007111	CT	3	6	8707	8712	0 %	50 %	0 %	50 %	67459872
174	NC_007111	TTGTT	2	10	8736	8745	0 %	80 %	20 %	0 %	67459872
175	NC_007111	ATTA	2	8	8781	8788	50 %	50 %	0 %	0 %	67459872
176	NC_007111	TGA	2	6	8817	8822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459872
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178	NC_007111	ATA	3	9	8902	8910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459872
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182	NC_007111	CT	3	6	9628	9633	0 %	50 %	0 %	50 %	67459873
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185	NC_007111	ATA	2	6	9835	9840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459873
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401	NC_007111	ATT	2	6	19768	19773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459882
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