MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia felis URRWXCal2 chromosome

Total Repeats: 31425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007109	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458393
2	NC_007109	GCA	2	6	58	63	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67458393
3	NC_007109	TAT	2	6	182	187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458393
4	NC_007109	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458393
5	NC_007109	T	6	6	293	298	0 %	100 %	0 %	0 %	67458393
6	NC_007109	ATG	2	6	392	397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458393
7	NC_007109	ATA	2	6	433	438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458393
8	NC_007109	TAG	3	9	572	580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458393
9	NC_007109	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458393
10	NC_007109	CAG	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67458393
11	NC_007109	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458393
12	NC_007109	AT	3	6	787	792	50 %	50 %	0 %	0 %	67458393
13	NC_007109	A	6	6	801	806	100 %	0 %	0 %	0 %	67458393
14	NC_007109	ATA	2	6	812	817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458393
15	NC_007109	AG	3	6	948	953	50 %	0 %	50 %	0 %	67458394
16	NC_007109	A	6	6	970	975	100 %	0 %	0 %	0 %	67458394
17	NC_007109	TAC	2	6	1032	1037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67458394
18	NC_007109	TAACG	2	10	1066	1075	40 %	20 %	20 %	20 %	67458394
19	NC_007109	ATA	2	6	1172	1177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458394
20	NC_007109	AAAGTA	2	12	1205	1216	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	67458394
21	NC_007109	TGA	2	6	1231	1236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458394
22	NC_007109	GTA	2	6	1269	1274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458394
23	NC_007109	A	7	7	1335	1341	100 %	0 %	0 %	0 %	67458394
24	NC_007109	CT	3	6	1342	1347	0 %	50 %	0 %	50 %	67458394
25	NC_007109	TAA	2	6	1360	1365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458394
26	NC_007109	T	6	6	1473	1478	0 %	100 %	0 %	0 %	67458395
27	NC_007109	A	6	6	1483	1488	100 %	0 %	0 %	0 %	67458395
28	NC_007109	TTTCTC	2	12	1493	1504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67458395
29	NC_007109	AAG	2	6	1544	1549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458395
30	NC_007109	A	6	6	1553	1558	100 %	0 %	0 %	0 %	67458395
31	NC_007109	CT	3	6	1593	1598	0 %	50 %	0 %	50 %	67458395
32	NC_007109	AT	3	6	1618	1623	50 %	50 %	0 %	0 %	67458395
33	NC_007109	TGC	2	6	1662	1667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	67458395
34	NC_007109	TA	3	6	1736	1741	50 %	50 %	0 %	0 %	67458395
35	NC_007109	ATA	3	9	1739	1747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458395
36	NC_007109	TAA	2	6	1806	1811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458395
37	NC_007109	A	6	6	1827	1832	100 %	0 %	0 %	0 %	67458395
38	NC_007109	TGA	2	6	1905	1910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458395
39	NC_007109	TTAAT	2	10	1952	1961	40 %	60 %	0 %	0 %	67458395
40	NC_007109	ATA	2	6	1993	1998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458395
41	NC_007109	TCA	2	6	2004	2009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67458395
42	NC_007109	AGA	2	6	2010	2015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458395
43	NC_007109	TTA	2	6	2047	2052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458395
44	NC_007109	CTT	2	6	2113	2118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67458395
45	NC_007109	T	8	8	2275	2282	0 %	100 %	0 %	0 %	67458396
46	NC_007109	A	6	6	2285	2290	100 %	0 %	0 %	0 %	67458396
47	NC_007109	T	6	6	2350	2355	0 %	100 %	0 %	0 %	67458396
48	NC_007109	T	6	6	2410	2415	0 %	100 %	0 %	0 %	67458396
49	NC_007109	T	6	6	2419	2424	0 %	100 %	0 %	0 %	67458396
50	NC_007109	GA	3	6	2437	2442	50 %	0 %	50 %	0 %	67458396
51	NC_007109	CGG	2	6	2464	2469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	67458396
52	NC_007109	AGC	2	6	2495	2500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67458396
53	NC_007109	ATA	2	6	2540	2545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458396
54	NC_007109	A	7	7	2545	2551	100 %	0 %	0 %	0 %	67458396
55	NC_007109	T	7	7	2569	2575	0 %	100 %	0 %	0 %	67458396
56	NC_007109	TA	3	6	2601	2606	50 %	50 %	0 %	0 %	67458396
57	NC_007109	TTTTA	2	10	2641	2650	20 %	80 %	0 %	0 %	67458396
58	NC_007109	ATA	2	6	2678	2683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458396
59	NC_007109	TAA	2	6	2709	2714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458396
60	NC_007109	TG	3	6	2717	2722	0 %	50 %	50 %	0 %	67458396
61	NC_007109	TTAT	2	8	2802	2809	25 %	75 %	0 %	0 %	67458396
62	NC_007109	A	7	7	2855	2861	100 %	0 %	0 %	0 %	67458396
63	NC_007109	ATG	2	6	2939	2944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458396
64	NC_007109	TAT	2	6	2959	2964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458396
65	NC_007109	TTA	2	6	2973	2978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458396
66	NC_007109	ATTTA	2	10	2994	3003	40 %	60 %	0 %	0 %	67458396
67	NC_007109	TTAT	2	8	3024	3031	25 %	75 %	0 %	0 %	67458396
68	NC_007109	A	6	6	3088	3093	100 %	0 %	0 %	0 %	67458397
69	NC_007109	CTC	2	6	3170	3175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	67458397
70	NC_007109	TC	3	6	3174	3179	0 %	50 %	0 %	50 %	67458397
71	NC_007109	ATT	2	6	3181	3186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458397
72	NC_007109	ATT	2	6	3194	3199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458397
73	NC_007109	T	6	6	3237	3242	0 %	100 %	0 %	0 %	67458397
74	NC_007109	AAG	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458397
75	NC_007109	ATT	2	6	3307	3312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458397
76	NC_007109	A	7	7	3351	3357	100 %	0 %	0 %	0 %	67458397
77	NC_007109	A	6	6	3368	3373	100 %	0 %	0 %	0 %	67458397
78	NC_007109	CAAA	2	8	3453	3460	75 %	0 %	0 %	25 %	67458397
79	NC_007109	AGC	2	6	3510	3515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67458397
80	NC_007109	GCGA	2	8	3572	3579	25 %	0 %	50 %	25 %	67458397
81	NC_007109	AAG	2	6	3584	3589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458397
82	NC_007109	CTC	2	6	3641	3646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	67458397
83	NC_007109	CCTC	2	8	3723	3730	0 %	25 %	0 %	75 %	67458397
84	NC_007109	A	7	7	3763	3769	100 %	0 %	0 %	0 %	67458397
85	NC_007109	A	7	7	3782	3788	100 %	0 %	0 %	0 %	67458397
86	NC_007109	GA	3	6	3790	3795	50 %	0 %	50 %	0 %	67458397
87	NC_007109	T	6	6	3819	3824	0 %	100 %	0 %	0 %	67458397
88	NC_007109	ATT	2	6	3854	3859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458397
89	NC_007109	TATT	2	8	3861	3868	25 %	75 %	0 %	0 %	67458397
90	NC_007109	GAG	2	6	3931	3936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	67458397
91	NC_007109	A	6	6	4034	4039	100 %	0 %	0 %	0 %	67458397
92	NC_007109	TAT	2	6	4092	4097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458397
93	NC_007109	GCA	2	6	4120	4125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67458397
94	NC_007109	AGA	2	6	4218	4223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458397
95	NC_007109	AT	3	6	4252	4257	50 %	50 %	0 %	0 %	67458397
96	NC_007109	CTT	2	6	4261	4266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67458397
97	NC_007109	A	6	6	4306	4311	100 %	0 %	0 %	0 %	67458397
98	NC_007109	CTA	2	6	4313	4318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67458397
99	NC_007109	TAT	2	6	4369	4374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458397
100	NC_007109	TTA	2	6	4375	4380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458397
101	NC_007109	GGTCA	2	10	4382	4391	20 %	20 %	40 %	20 %	67458397
102	NC_007109	GGA	2	6	4510	4515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	67458397
103	NC_007109	AT	3	6	4562	4567	50 %	50 %	0 %	0 %	67458397
104	NC_007109	AG	3	6	4581	4586	50 %	0 %	50 %	0 %	67458397
105	NC_007109	GGA	2	6	4777	4782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	67458397
106	NC_007109	CTAATA	2	12	4799	4810	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	67458397
107	NC_007109	GGC	2	6	4840	4845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	67458397
108	NC_007109	GCA	2	6	4864	4869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67458397
109	NC_007109	TA	3	6	4921	4926	50 %	50 %	0 %	0 %	67458397
110	NC_007109	A	7	7	4951	4957	100 %	0 %	0 %	0 %	67458397
111	NC_007109	GAA	2	6	4963	4968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458397
112	NC_007109	ATT	2	6	4986	4991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458397
113	NC_007109	AAG	2	6	4994	4999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458397
114	NC_007109	GAA	2	6	5011	5016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458397
115	NC_007109	TAA	2	6	5031	5036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458397
116	NC_007109	GGA	2	6	5041	5046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	67458397
117	NC_007109	TAT	2	6	5056	5061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458397
118	NC_007109	TCG	2	6	5080	5085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	67458397
119	NC_007109	TAAAT	2	10	5091	5100	60 %	40 %	0 %	0 %	67458397
120	NC_007109	AT	3	6	5113	5118	50 %	50 %	0 %	0 %	67458397
121	NC_007109	TGA	2	6	5361	5366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458397
122	NC_007109	AATA	2	8	5368	5375	75 %	25 %	0 %	0 %	67458397
123	NC_007109	TAG	2	6	5433	5438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458397
124	NC_007109	AAG	2	6	5441	5446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67458397
125	NC_007109	TAA	2	6	5460	5465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458397
126	NC_007109	AAT	2	6	5476	5481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67458397
127	NC_007109	ATT	2	6	5528	5533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458397
128	NC_007109	TAG	2	6	5541	5546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458397
129	NC_007109	ATAAA	2	10	5552	5561	80 %	20 %	0 %	0 %	67458397
130	NC_007109	GAT	2	6	5569	5574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67458397
131	NC_007109	ATTC	2	8	5593	5600	25 %	50 %	0 %	25 %	67458397
132	NC_007109	TGC	2	6	5607	5612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	67458397
133	NC_007109	T	6	6	5635	5640	0 %	100 %	0 %	0 %	67458397
134	NC_007109	ATT	2	6	5651	5656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458397
135	NC_007109	TTAA	2	8	5725	5732	50 %	50 %	0 %	0 %	67458397
136	NC_007109	CTA	2	6	5759	5764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67458397
137	NC_007109	CGC	2	6	5822	5827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	67458397
138	NC_007109	A	7	7	5845	5851	100 %	0 %	0 %	0 %	67458397
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140	NC_007109	TTA	2	6	5887	5892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67458397
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