MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 megaplasmid

Total Repeats: 9642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_006569	AAC	2	6	417012	417017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56709155
8002	NC_006569	CCA	2	6	417019	417024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56709155
8003	NC_006569	GCA	2	6	417031	417036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709155
8004	NC_006569	CGG	2	6	417079	417084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709155
8005	NC_006569	GAA	2	6	417086	417091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56709155
8006	NC_006569	CGA	2	6	417133	417138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709155
8007	NC_006569	GCC	2	6	417150	417155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709155
8008	NC_006569	GAT	2	6	417212	417217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56709155
8009	NC_006569	CGC	2	6	417221	417226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709155
8010	NC_006569	GCAG	2	8	417247	417254	25 %	0 %	50 %	25 %	56709155
8011	NC_006569	CAG	2	6	417305	417310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709155
8012	NC_006569	CAG	2	6	417347	417352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709155
8013	NC_006569	GGC	2	6	417371	417376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709155
8014	NC_006569	ATG	3	9	417378	417386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56709155
8015	NC_006569	GTT	2	6	417434	417439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56709155
8016	NC_006569	CCA	2	6	417508	417513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56709155
8017	NC_006569	AGC	2	6	417561	417566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709155
8018	NC_006569	GAT	2	6	417650	417655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56709155
8019	NC_006569	TGA	2	6	417661	417666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56709155
8020	NC_006569	TCA	2	6	417667	417672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56709155
8021	NC_006569	GCA	2	6	417673	417678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709155
8022	NC_006569	ATG	2	6	417687	417692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56709155
8023	NC_006569	GCC	2	6	417704	417709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709155
8024	NC_006569	ATC	2	6	417756	417761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56709155
8025	NC_006569	CGG	2	6	417770	417775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709155
8026	NC_006569	GAT	2	6	417776	417781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56709155
8027	NC_006569	GCC	2	6	417782	417787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709155
8028	NC_006569	ACTG	2	8	417797	417804	25 %	25 %	25 %	25 %	56709155
8029	NC_006569	CGC	3	9	417812	417820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709155
8030	NC_006569	CGG	2	6	417827	417832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709155
8031	NC_006569	GAA	2	6	417914	417919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56709155
8032	NC_006569	ATC	2	6	417969	417974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56709155
8033	NC_006569	TGG	2	6	418006	418011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56709155
8034	NC_006569	TCA	2	6	418018	418023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56709155
8035	NC_006569	GAA	2	6	418040	418045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56709155
8036	NC_006569	CTGG	2	8	418088	418095	0 %	25 %	50 %	25 %	56709155
8037	NC_006569	ATC	2	6	418104	418109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56709155
8038	NC_006569	GATCAG	2	12	418145	418156	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	56709155
8039	NC_006569	CAG	2	6	418187	418192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709155
8040	NC_006569	ATCG	2	8	418442	418449	25 %	25 %	25 %	25 %	56709156
8041	NC_006569	CTC	2	6	418472	418477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56709156
8042	NC_006569	GCC	4	12	418575	418586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709156
8043	NC_006569	TCGA	2	8	418638	418645	25 %	25 %	25 %	25 %	56709156
8044	NC_006569	CCG	2	6	418668	418673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709156
8045	NC_006569	TGC	2	6	418716	418721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709156
8046	NC_006569	GCACCG	2	12	418795	418806	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	56709156
8047	NC_006569	GCGCA	2	10	418895	418904	20 %	0 %	40 %	40 %	56709156
8048	NC_006569	GCC	2	6	418922	418927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709156
8049	NC_006569	CGG	2	6	418966	418971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709156
8050	NC_006569	GCCA	2	8	418992	418999	25 %	0 %	25 %	50 %	56709156
8051	NC_006569	AG	3	6	419064	419069	50 %	0 %	50 %	0 %	56709156
8052	NC_006569	AGC	2	6	419115	419120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709156
8053	NC_006569	CGC	2	6	419137	419142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709156
8054	NC_006569	CGC	2	6	419152	419157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709156
8055	NC_006569	GCC	2	6	419195	419200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709156
8056	NC_006569	CCT	2	6	419206	419211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56709156
8057	NC_006569	ACCAC	2	10	419556	419565	40 %	0 %	0 %	60 %	56709157
8058	NC_006569	CCGC	2	8	419663	419670	0 %	0 %	25 %	75 %	56709157
8059	NC_006569	CG	3	6	419767	419772	0 %	0 %	50 %	50 %	56709157
8060	NC_006569	GGT	2	6	419897	419902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56709157
8061	NC_006569	CCTATC	2	12	419923	419934	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	56709157
8062	NC_006569	GCA	2	6	420071	420076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709157
8063	NC_006569	CTG	2	6	420090	420095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709157
8064	NC_006569	CG	3	6	420100	420105	0 %	0 %	50 %	50 %	56709157
8065	NC_006569	GAC	2	6	420120	420125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709157
8066	NC_006569	CGATGG	2	12	420281	420292	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56709157
8067	NC_006569	CAC	2	6	420335	420340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56709157
8068	NC_006569	CCA	2	6	420347	420352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56709157
8069	NC_006569	ATC	2	6	420429	420434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56709157
8070	NC_006569	GAT	2	6	420438	420443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56709157
8071	NC_006569	TCG	2	6	420571	420576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709157
8072	NC_006569	CAT	2	6	420587	420592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56709157
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8074	NC_006569	CG	3	6	420608	420613	0 %	0 %	50 %	50 %	56709157
8075	NC_006569	TGA	2	6	420619	420624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56709157
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8085	NC_006569	CGG	2	6	421281	421286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709158
8086	NC_006569	GC	3	6	421369	421374	0 %	0 %	50 %	50 %	56709158
8087	NC_006569	TGA	2	6	421466	421471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56709158
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8091	NC_006569	CCCG	2	8	421610	421617	0 %	0 %	25 %	75 %	56709158
8092	NC_006569	GCG	2	6	421706	421711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709158
8093	NC_006569	GCG	2	6	421718	421723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709158
8094	NC_006569	CCAT	2	8	421769	421776	25 %	25 %	0 %	50 %	56709158
8095	NC_006569	GATCA	2	10	421855	421864	40 %	20 %	20 %	20 %	56709158
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8103	NC_006569	GCT	2	6	422060	422065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709158
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8106	NC_006569	GCG	2	6	422094	422099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709158
8107	NC_006569	GGCG	2	8	422107	422114	0 %	0 %	75 %	25 %	56709158
8108	NC_006569	TGC	2	6	422180	422185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56709158
8109	NC_006569	GCC	2	6	422190	422195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709158
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8111	NC_006569	TGA	2	6	422292	422297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56709158
8112	NC_006569	GCC	2	6	422384	422389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56709159
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8119	NC_006569	GC	3	6	422790	422795	0 %	0 %	50 %	50 %	56709159
8120	NC_006569	CGG	2	6	422817	422822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709159
8121	NC_006569	GCTG	2	8	422890	422897	0 %	25 %	50 %	25 %	56709159
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8123	NC_006569	AGG	2	6	422970	422975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56709159
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8495	NC_006569	GCG	2	6	439878	439883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56709172
8496	NC_006569	CGGGG	2	10	440034	440043	0 %	0 %	80 %	20 %	56709172
8497	NC_006569	TTC	2	6	440084	440089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56709172
8498	NC_006569	GC	3	6	440198	440203	0 %	0 %	50 %	50 %	56709172
8499	NC_006569	AGC	2	6	440234	440239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56709172
8500	NC_006569	C	6	6	440460	440465	0 %	0 %	0 %	100 %	56709172

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