MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia typhi str. Wilmington

Total Repeats: 22278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_006142	ACC	2	6	191090	191095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51473359
4002	NC_006142	TAT	2	6	191101	191106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473359
4003	NC_006142	AGA	2	6	191126	191131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473359
4004	NC_006142	TCA	2	6	191142	191147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473359
4005	NC_006142	CAT	2	6	191161	191166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473359
4006	NC_006142	CTTTAG	2	12	191173	191184	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	51473359
4007	NC_006142	AGCTA	2	10	191189	191198	40 %	20 %	20 %	20 %	51473359
4008	NC_006142	AAT	2	6	191215	191220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473359
4009	NC_006142	AT	3	6	191253	191258	50 %	50 %	0 %	0 %	51473359
4010	NC_006142	CTT	2	6	191278	191283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473359
4011	NC_006142	CTT	2	6	191298	191303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473359
4012	NC_006142	TTA	2	6	191328	191333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473359
4013	NC_006142	ATA	2	6	191334	191339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473359
4014	NC_006142	TTA	2	6	191346	191351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473359
4015	NC_006142	AAT	2	6	191375	191380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473359
4016	NC_006142	T	6	6	191473	191478	0 %	100 %	0 %	0 %	51473359
4017	NC_006142	ATC	2	6	191486	191491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473359
4018	NC_006142	TTC	2	6	191496	191501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473359
4019	NC_006142	TTA	2	6	191538	191543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473359
4020	NC_006142	TAT	2	6	191572	191577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473359
4021	NC_006142	AATAG	2	10	191618	191627	60 %	20 %	20 %	0 %	51473359
4022	NC_006142	TC	3	6	191715	191720	0 %	50 %	0 %	50 %	51473359
4023	NC_006142	TACTC	2	10	191736	191745	20 %	40 %	0 %	40 %	51473359
4024	NC_006142	ATT	2	6	191765	191770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473359
4025	NC_006142	A	6	6	191775	191780	100 %	0 %	0 %	0 %	51473359
4026	NC_006142	AAAT	2	8	191853	191860	75 %	25 %	0 %	0 %	51473359
4027	NC_006142	TGT	2	6	191914	191919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473359
4028	NC_006142	TAG	2	6	191950	191955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473359
4029	NC_006142	TAC	2	6	192095	192100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473359
4030	NC_006142	ACT	2	6	192101	192106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473359
4031	NC_006142	CAT	2	6	192145	192150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473359
4032	NC_006142	TA	3	6	192155	192160	50 %	50 %	0 %	0 %	51473359
4033	NC_006142	ATATTT	2	12	192162	192173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473359
4034	NC_006142	AAGTG	2	10	192179	192188	40 %	20 %	40 %	0 %	51473359
4035	NC_006142	TCT	2	6	192213	192218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473359
4036	NC_006142	ATT	2	6	192224	192229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473359
4037	NC_006142	TAG	2	6	192268	192273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473359
4038	NC_006142	ATA	2	6	192341	192346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473359
4039	NC_006142	A	6	6	192346	192351	100 %	0 %	0 %	0 %	51473359
4040	NC_006142	TAA	3	9	192356	192364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473359
4041	NC_006142	TAA	2	6	192628	192633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473360
4042	NC_006142	T	6	6	192640	192645	0 %	100 %	0 %	0 %	51473360
4043	NC_006142	TAA	2	6	192668	192673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473360
4044	NC_006142	ATT	3	9	192679	192687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473360
4045	NC_006142	GTA	2	6	192701	192706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473360
4046	NC_006142	CCA	2	6	192775	192780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51473360
4047	NC_006142	GTA	2	6	192797	192802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473360
4048	NC_006142	TAA	2	6	192807	192812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473360
4049	NC_006142	ATA	2	6	192842	192847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473360
4050	NC_006142	CCT	2	6	192907	192912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51473360
4051	NC_006142	ATT	2	6	192940	192945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473360
4052	NC_006142	TAG	2	6	192983	192988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473360
4053	NC_006142	TCC	2	6	193008	193013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51473360
4054	NC_006142	T	6	6	193073	193078	0 %	100 %	0 %	0 %	51473360
4055	NC_006142	CTTT	2	8	193082	193089	0 %	75 %	0 %	25 %	51473360
4056	NC_006142	T	6	6	193087	193092	0 %	100 %	0 %	0 %	51473360
4057	NC_006142	AGA	2	6	193170	193175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473360
4058	NC_006142	TTAA	2	8	193186	193193	50 %	50 %	0 %	0 %	51473360
4059	NC_006142	CTT	2	6	193259	193264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473360
4060	NC_006142	CTG	2	6	193280	193285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473360
4061	NC_006142	TGA	2	6	193287	193292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473360
4062	NC_006142	TAT	2	6	193308	193313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473360
4063	NC_006142	AGG	2	6	193314	193319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51473360
4064	NC_006142	ATT	2	6	193360	193365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473360
4065	NC_006142	GCAA	2	8	193369	193376	50 %	0 %	25 %	25 %	51473360
4066	NC_006142	TAAT	2	8	193378	193385	50 %	50 %	0 %	0 %	51473360
4067	NC_006142	CTG	2	6	193394	193399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473360
4068	NC_006142	T	6	6	193446	193451	0 %	100 %	0 %	0 %	51473360
4069	NC_006142	TGT	2	6	193461	193466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473360
4070	NC_006142	ATCA	2	8	193470	193477	50 %	25 %	0 %	25 %	51473360
4071	NC_006142	ACC	2	6	193509	193514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51473360
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4073	NC_006142	T	6	6	193548	193553	0 %	100 %	0 %	0 %	51473360
4074	NC_006142	TCC	2	6	193597	193602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51473360
4075	NC_006142	CAATA	2	10	193625	193634	60 %	20 %	0 %	20 %	51473360
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4081	NC_006142	TAA	2	6	194143	194148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473361
4082	NC_006142	TTA	2	6	194246	194251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473361
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4084	NC_006142	AGT	2	6	194275	194280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473361
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4090	NC_006142	ACT	2	6	194544	194549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473362
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4094	NC_006142	TTA	2	6	194645	194650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473362
4095	NC_006142	ATA	2	6	194660	194665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473362
4096	NC_006142	ATA	2	6	194672	194677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473362
4097	NC_006142	AAT	2	6	194679	194684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473362
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4099	NC_006142	GAGTT	2	10	194720	194729	20 %	40 %	40 %	0 %	51473362
4100	NC_006142	T	7	7	194742	194748	0 %	100 %	0 %	0 %	51473362
4101	NC_006142	GAA	2	6	194761	194766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473362
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4103	NC_006142	TAT	2	6	194867	194872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473362
4104	NC_006142	ATT	2	6	194961	194966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473362
4105	NC_006142	ATTT	2	8	195040	195047	25 %	75 %	0 %	0 %	51473362
4106	NC_006142	A	6	6	195061	195066	100 %	0 %	0 %	0 %	51473362
4107	NC_006142	TAT	2	6	195686	195691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473363
4108	NC_006142	TGA	2	6	195736	195741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473363
4109	NC_006142	ATT	2	6	195769	195774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473363
4110	NC_006142	AT	3	6	196073	196078	50 %	50 %	0 %	0 %	51473364
4111	NC_006142	T	6	6	196086	196091	0 %	100 %	0 %	0 %	51473364
4112	NC_006142	CTA	2	6	196208	196213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473365
4113	NC_006142	ATC	2	6	196215	196220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473365
4114	NC_006142	TCT	2	6	196249	196254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473365
4115	NC_006142	TTG	2	6	196430	196435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473366
4116	NC_006142	TCA	3	9	196488	196496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473366
4117	NC_006142	CAT	2	6	196525	196530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473366
4118	NC_006142	TTC	2	6	196589	196594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473366
4119	NC_006142	ATT	2	6	196655	196660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473366
4120	NC_006142	TTA	2	6	196677	196682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473366
4121	NC_006142	TA	3	6	196729	196734	50 %	50 %	0 %	0 %	51473366
4122	NC_006142	C	6	6	196741	196746	0 %	0 %	0 %	100 %	51473366
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4124	NC_006142	ATT	2	6	196778	196783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473366
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4250	NC_006142	TAC	2	6	202181	202186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473370
4251	NC_006142	TA	3	6	202212	202217	50 %	50 %	0 %	0 %	51473370
4252	NC_006142	AT	3	6	202276	202281	50 %	50 %	0 %	0 %	51473370
4253	NC_006142	A	8	8	202365	202372	100 %	0 %	0 %	0 %	51473370
4254	NC_006142	TCC	2	6	202374	202379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51473370
4255	NC_006142	A	9	9	202929	202937	100 %	0 %	0 %	0 %	51473371
4256	NC_006142	AT	3	6	202960	202965	50 %	50 %	0 %	0 %	51473371
4257	NC_006142	ATA	3	9	202980	202988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473371
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4265	NC_006142	TA	3	6	203408	203413	50 %	50 %	0 %	0 %	51473372
4266	NC_006142	AGA	2	6	203463	203468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473372
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4325	NC_006142	A	6	6	206250	206255	100 %	0 %	0 %	0 %	51473374
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4350	NC_006142	TAT	2	6	207407	207412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473374
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4356	NC_006142	ATA	2	6	207760	207765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473374
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4360	NC_006142	A	6	6	207882	207887	100 %	0 %	0 %	0 %	51473374
4361	NC_006142	CATCT	2	10	207888	207897	20 %	40 %	0 %	40 %	51473374
4362	NC_006142	ACC	2	6	207900	207905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51473374
4363	NC_006142	TTAC	2	8	207949	207956	25 %	50 %	0 %	25 %	51473374
4364	NC_006142	T	6	6	207972	207977	0 %	100 %	0 %	0 %	51473374
4365	NC_006142	T	8	8	207983	207990	0 %	100 %	0 %	0 %	51473374
4366	NC_006142	ATC	2	6	208086	208091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473374
4367	NC_006142	T	6	6	208173	208178	0 %	100 %	0 %	0 %	51473374
4368	NC_006142	TTGC	2	8	208199	208206	0 %	50 %	25 %	25 %	51473374
4369	NC_006142	CTT	2	6	208268	208273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473374
4370	NC_006142	TAT	3	9	208310	208318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473374
4371	NC_006142	TAA	2	6	208344	208349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473374
4372	NC_006142	AAT	2	6	208350	208355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473374
4373	NC_006142	CATT	2	8	208656	208663	25 %	50 %	0 %	25 %	51473375
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4375	NC_006142	GTA	2	6	208711	208716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473375
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