MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia typhi str. Wilmington

Total Repeats: 22278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_006142	TAT	2	6	167159	167164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473340
3503	NC_006142	TAT	2	6	167196	167201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473340
3504	NC_006142	GAT	2	6	167237	167242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473340
3505	NC_006142	TA	3	6	167275	167280	50 %	50 %	0 %	0 %	51473340
3506	NC_006142	TAC	2	6	167366	167371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473340
3507	NC_006142	TGGT	2	8	167386	167393	0 %	50 %	50 %	0 %	51473340
3508	NC_006142	TTA	2	6	167397	167402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473340
3509	NC_006142	TAA	2	6	167435	167440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473340
3510	NC_006142	CTAA	2	8	167445	167452	50 %	25 %	0 %	25 %	51473340
3511	NC_006142	A	6	6	167451	167456	100 %	0 %	0 %	0 %	51473340
3512	NC_006142	AT	3	6	167458	167463	50 %	50 %	0 %	0 %	51473340
3513	NC_006142	TTC	2	6	167558	167563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473340
3514	NC_006142	AAC	2	6	167653	167658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473340
3515	NC_006142	AGT	2	6	167702	167707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473340
3516	NC_006142	ATG	2	6	167748	167753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473340
3517	NC_006142	CCA	2	6	167769	167774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51473340
3518	NC_006142	ATC	2	6	167791	167796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473340
3519	NC_006142	TA	4	8	167810	167817	50 %	50 %	0 %	0 %	51473340
3520	NC_006142	CAG	2	6	167850	167855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473340
3521	NC_006142	AGC	2	6	167860	167865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473340
3522	NC_006142	GGT	2	6	167868	167873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473340
3523	NC_006142	TAT	2	6	167921	167926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473340
3524	NC_006142	AAGG	2	8	167937	167944	50 %	0 %	50 %	0 %	51473340
3525	NC_006142	TAT	2	6	168068	168073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473340
3526	NC_006142	GA	3	6	168133	168138	50 %	0 %	50 %	0 %	51473340
3527	NC_006142	CTG	2	6	168175	168180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473340
3528	NC_006142	AT	3	6	168187	168192	50 %	50 %	0 %	0 %	51473340
3529	NC_006142	TTA	2	6	168235	168240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473340
3530	NC_006142	AGT	2	6	168315	168320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473340
3531	NC_006142	AGG	2	6	168458	168463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51473340
3532	NC_006142	TGC	2	6	168464	168469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473340
3533	NC_006142	TCT	2	6	168489	168494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473340
3534	NC_006142	GTT	2	6	168540	168545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473340
3535	NC_006142	GAA	2	6	168555	168560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473340
3536	NC_006142	ATT	3	9	168590	168598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473340
3537	NC_006142	TGA	2	6	168602	168607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473340
3538	NC_006142	TTG	2	6	168658	168663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473340
3539	NC_006142	ATG	2	6	168664	168669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473340
3540	NC_006142	TATAC	2	10	168714	168723	40 %	40 %	0 %	20 %	51473340
3541	NC_006142	ATT	2	6	168726	168731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473340
3542	NC_006142	TGA	2	6	168797	168802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473340
3543	NC_006142	TTA	2	6	168826	168831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473340
3544	NC_006142	GTG	2	6	168853	168858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473340
3545	NC_006142	TTAC	2	8	168938	168945	25 %	50 %	0 %	25 %	51473340
3546	NC_006142	AGA	2	6	168968	168973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473340
3547	NC_006142	ACT	3	9	169026	169034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473340
3548	NC_006142	TGG	2	6	169046	169051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473340
3549	NC_006142	GTAGA	2	10	169123	169132	40 %	20 %	40 %	0 %	51473340
3550	NC_006142	TAT	3	9	169163	169171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473340
3551	NC_006142	AT	3	6	169202	169207	50 %	50 %	0 %	0 %	51473340
3552	NC_006142	TGT	2	6	169226	169231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473340
3553	NC_006142	A	6	6	169254	169259	100 %	0 %	0 %	0 %	51473340
3554	NC_006142	ATTG	2	8	169268	169275	25 %	50 %	25 %	0 %	51473340
3555	NC_006142	TAC	2	6	169288	169293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473340
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3557	NC_006142	TGA	2	6	169385	169390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473340
3558	NC_006142	TTA	2	6	169405	169410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473340
3559	NC_006142	GGT	2	6	169449	169454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473340
3560	NC_006142	TAG	2	6	169465	169470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473340
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3562	NC_006142	TGA	2	6	169496	169501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473340
3563	NC_006142	CTG	2	6	169537	169542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473340
3564	NC_006142	CAT	2	6	169609	169614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473340
3565	NC_006142	ACT	2	6	169623	169628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473340
3566	NC_006142	CTG	2	6	169714	169719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473340
3567	NC_006142	AGC	2	6	169751	169756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473340
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3569	NC_006142	TGAA	2	8	170836	170843	50 %	25 %	25 %	0 %	51473341
3570	NC_006142	ATC	2	6	170846	170851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473341
3571	NC_006142	CAA	2	6	170922	170927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473341
3572	NC_006142	TTA	2	6	171010	171015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473341
3573	NC_006142	TAA	2	6	171037	171042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473341
3574	NC_006142	TAG	2	6	171043	171048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473341
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3579	NC_006142	GTG	2	6	171208	171213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473341
3580	NC_006142	CTT	2	6	171223	171228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473341
3581	NC_006142	ACC	2	6	171249	171254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51473341
3582	NC_006142	AAG	2	6	171259	171264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473341
3583	NC_006142	AAT	2	6	171306	171311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473341
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3586	NC_006142	T	6	6	171363	171368	0 %	100 %	0 %	0 %	51473341
3587	NC_006142	AGG	2	6	171569	171574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51473341
3588	NC_006142	TAG	2	6	171575	171580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473341
3589	NC_006142	GAT	2	6	171582	171587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473341
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3591	NC_006142	GGT	2	6	171630	171635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473341
3592	NC_006142	GATAT	2	10	171673	171682	40 %	40 %	20 %	0 %	51473341
3593	NC_006142	GCA	2	6	171693	171698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473341
3594	NC_006142	TTG	2	6	171766	171771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473341
3595	NC_006142	TGT	2	6	171809	171814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473341
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3602	NC_006142	ATG	2	6	172072	172077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473341
3603	NC_006142	TGC	2	6	172139	172144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473341
3604	NC_006142	CTG	2	6	172156	172161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473341
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3606	NC_006142	TTA	2	6	172180	172185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473341
3607	NC_006142	TAA	2	6	172235	172240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473341
3608	NC_006142	TCA	2	6	172300	172305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473341
3609	NC_006142	TAAT	2	8	172313	172320	50 %	50 %	0 %	0 %	51473341
3610	NC_006142	ATA	2	6	172420	172425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473342
3611	NC_006142	TA	3	6	172435	172440	50 %	50 %	0 %	0 %	51473342
3612	NC_006142	ATT	2	6	172520	172525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473342
3613	NC_006142	ATT	2	6	172571	172576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473342
3614	NC_006142	A	6	6	172578	172583	100 %	0 %	0 %	0 %	51473342
3615	NC_006142	CAA	2	6	172600	172605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473342
3616	NC_006142	CTA	2	6	172610	172615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473342
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3618	NC_006142	TAC	2	6	172746	172751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473342
3619	NC_006142	ATT	2	6	172786	172791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473342
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3621	NC_006142	ATA	2	6	172939	172944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473342
3622	NC_006142	TAAA	2	8	172976	172983	75 %	25 %	0 %	0 %	51473342
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3624	NC_006142	AT	3	6	173062	173067	50 %	50 %	0 %	0 %	51473342
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3863	NC_006142	ATACC	2	10	183826	183835	40 %	20 %	0 %	40 %	51473351
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3870	NC_006142	CAT	2	6	184006	184011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473351
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3872	NC_006142	TTG	2	6	184057	184062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473351
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